New branches with run number and OCDB file ITS/Align/Data in spTree

Added missing forward declarations

changed way of setting event info in AliCFManager and cuts in order to reduce
log messages

Time spectrum for cosmic data: increased range to fit the used matching window, i.e. 2 microSeconds (G.Scioli request)

Obsolete code removed.

Move to the CommoonFileName output

track alpha angle normalized to [-Pi,+Pi]

checking if the QA data object inherits from TH1 rather than isA during Checking

Obsolete code removed.

Changing the name of the outputfile for the common output folders

Unregistering CINT callback in destructor for proper cleanup.

- data member was shadowed (fTree)
- avoiding crash in ReadFromTree when tree has been cleaned.

Move ITS-related tasks  to ITS dir

Move macro to ITS dir

protection for string length in container name

correct handling of status word (unset before set) and conversion form int to EventSpecie_t

Fixing problem with CINT callback routine.

small corrections

Correction coding violations from FC

LTM data payload change from 33 to 48 words propagated into decoder + coding conventions

LTM data payload change from 33 to 48 words propagated into decoder + coding conventions

Fixes given by Lizardo to include FEE boxes in V0A geometry

* esd_spd_tracklets
  Prepare hooks for Domenico.

* AliEveTracklet
  Add tracklet index to ctor args.

* AliEveTrack
  Add convenience functions GetESD/AODTrack().

* AliEveTrackCounter
  Use track/tracklet label for storing before/after scan status.

correcting compilation errors
some functions and members have been declared duplicated, probably to a malfunction of gid

correct wrong test in InitRaws

- protect against bug from stand alone tracker which reports tracklets
crossing pad row but no clusters attached to the second row defined
- add debug verbosity

Fix over the QA Histogram in AliACORDEQADataMaker::MakeRaws

- fixing compilation errors
- file included two times in build system

- adding the new histogram producer classes to the component

- fixing compilation errors

- changing the digit format to now come as a linked list instead of an array
  - will slow down digit maker, but give a significant speed up of the clusterizer at high multiplicities
  - also need to always ship the full list of digits, even after clusterisation, but
    this is anyway needed if one is to provide AliESDCaloCells in the ESDs
- now sorting the digits

Renaming histo production classes to introduce order,
added Cell histo class

Cosmetic updates

Updated documentation

-Added fTracksMatched array member in AliHLTCaloClusterDataStruct.h
-Modified AliHLTGlobalTrackMatcher to fill in this array.

Adding couple of histograms classes

- fixing compilation errors/warnings
- changing from AliCaloRawStream to AliAltroRawStream, causing a speed up of a factor ~100
- small bug fixes

Fleshed out the functionality of the class

- adding checking of sanity to raw analyzer

- starting implementing ocdb access

Moved AliHLTPHOSConstant.h back to original name AliHLTPHOSConstants.h
Changed by mistake in earlier commit.

Added the most important Calo files, changed dependent files. Compiles. Calo library loads fine

- fixing bug in digitmaker
- option to push raw data in raw analyzer
- protection in clusterizer

- fixing typo

- fixing compilation errors

- adding digit reader to build system

- adding digit readers to assist with the linked list of digits

- changing the digit format to now come as a linked list instead of an array
  - will slow down digit maker, but give a significant speed up of the clusterizer at high multiplicities
  - also need to always ship the full list of digits, even after clusterisation, but
    this is anyway needed if one is to provide AliESDCaloCells in the ESDs
- now sorting the digits

Renaming histo production classes to introduce order,
added Cell histo class

Cosmetic updates

Updated documentation

-Added fTracksMatched array member in AliHLTCaloClusterDataStruct.h
-Modified AliHLTGlobalTrackMatcher to fill in this array.

Adding couple of histograms classes

- fixing compilation errors/warnings
- changing from AliCaloRawStream to AliAltroRawStream, causing a speed up of a factor ~100
- small bug fixes

- cosmetics

Fleshed out the functionality of the class

- small fixes

- adding checking of sanity to raw analyzer

- adding more features for loading configurations from CDB

Adding first unfinished version of AliHLTGlobalTrackMatcher class

- small fixes

- components look for configurations in OCDB. (not fully ready yet)

- starting implementing ocdb access

Moved AliHLTPHOSConstant.h back to original name AliHLTPHOSConstants.h
Changed by mistake in earlier commit.

added last file in libAliHLT.pkg

Last commit, completing addition of AliHLTCaloClusterizer, AliHLTCaloDigitMaker, AliHLTCaloClusterAnalyser to the CALO library. New instance of AliHLTCaloConstants created with interface class AliHLTCaloConstantsHandler.

Added some more component and structs that were needed, compiles and load beautifully

Added the most important Calo files, changed dependent files. Compiles. Calo library loads fine

- fixing bug in digitmaker
- option to push raw data in raw analyzer
- protection in clusterizer

deactivating generation of the default detector/ddl list in the FXS header
the calibration component has to generate the list explicitely.
only ddls for one detector can be set

AliTPCcalibDB    - Applying filters for calration graphs using AliTPCcalibDButil
                 + algorithm to choose the v drift calibration
                   vdriftCE, vdriftLT or vdriftP
                 + fixed bug extrapolation of the calibration values
AliTPCcalibDButil - Implementation of filters

Marian.

AliTPCTempMap.h AliTPCTempMap.cxx - Filter values before fits - range 15-25 C
(Marian)

checking if event specie set in SetQA

Changes to run also without reading the MC (Chiara B)

Sergey modified the code to release the memory of the pad vectors. Useful when processing meny events on a local machine.This feature can be turned on by using the argument -release-memory

Technical fix for bug #58138: VZERO breaks in AliVZEROTrending::~AliVZEROTrending()

Adapt wagons in case of AOD analysis and analysis with AliAnaCalorimeterQA where no access to the mcparticle branch is implemented yet.

Moved the call to AliAODHandler::StoreMCParticles to AnalysisTaskMCParticleFilter to allow on the fly analysis of AODMC after the MCfilter. All Tasks/Filters selecting AODMCParticles have to run BEFORE

Moved the call to StoreMCParticles to ANALYSIS/AnalysisTaskMCParticleFilter to allow on the fly analysis of AODMC after filter

added method to check the whoole filter mask, not just one bit

Fix for dumb variable redefinition in my last commit.

minor bugfix to compile in debug mode

forbidding copy constructor and assignment operator

Fix trivial syntax error

Bug#56919: Fixing correct number of muon trk ldcs.

TOF/RecPar repository removed

added functions to define uniform axis binning
cf savannah https://savannah.cern.ch/bugs/?58112

Improved default cut ranges.

Adding MUONChamberMaterialBudget.C:
New macro to display the tracking chamber material budget:
Here we display for each chamber its thickness in x0 unit (used in the
computation of MCS effets) and evaluate <x/x0> in a limited area to avoid
edge effects.
(Philippe P.)

example of configuration file of analysis to identify omega

remove old analysis class now in AliAnaOmegaToPi0Gamma

new analysis for omega identification

updating to new Shuttle processing logic

MC reading in AOD not implemented yet in AliAnaCalorimeterQA, change the train wagon

Added support for putting the analysis results in directories inside the output file.
The only change from the user side is in the format of the file name specified in:
AliAnalysisManager::CreateContainer().
Ex:
   mgr->CreateContainer("my_cont", TList::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer,
                        "AnalysisOutput.root:mySpectra")
will write the output for this container in the folder mySpectra of the file AnalysisFile.root

Added a common file name as static data member to the analysis manager to be able
to communicate to user code a common choice for the output file name. Analysis wagons
will have to use this like:

  TString outputfile = AliAnalysisManager::GetCommonFileName();
  outputfile += ":myOutputFolder";
  mgr->CreateContainer(..., outputfile);

Produce/Read delta AODs by default

Fixed typo

bug fix of bug fix

Using the cosmic analysis task from the PWG1 library avoiding the compilation with aclic.

AliMUONTriggerQADataMakerRec:
Change in order to increase the number of LUT and Decision tests.
(Aurelien)