First implementation of PropagateBack and RefitInward

modified code for MCtruth only running (centrality implementation missing)

updates for charge independent analysis per-trigger yields (for comparison to DHC)

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

many small bug fixes:

  works on a mac now
  fixed a problem with creating temporary directories
  fixed running the profiling
  ...

 changes from darius

 stati chelper functions

 static functions to compute confidence intervals

-leg values and sparse for HF  -new var cuts

fixed addTask pp

Changes for final plots

Helper functions to draw legends in few different cases
Helper function to save plots and move them to the analysis note folder
NewLegendQM can handle split lines for pA
Correlated uncertainty removed only for K*/K and phi/K in PbPb (to be consistent with paper)
Few addition/changes to DrawRatio to support all final plots

Added method to recompute chi2 and stddev + cosmetics

Added a new pad to plot ratio data/model
Improved cosmetics of labels
Added method to compute chi2 and std dev
Moved some labels around

Disabled subtraction of correlated uncertainties

Added interpolation for the 20-40% bin

Added averages for the 20-40 centrality bin

Version used for the plots shown in the QM14 approval session

- Added functions to draw markers for particles extrapolated and/or
  not used in fits
- More flexible legend for thermal parameters (accepts list of comma separated
  values)
- Filled shortcuts for all plots shown in the approval session in the
  DrawRatio function
- Fixes to Preparethermalmodelsinputfiles

Trying to fix missing particles in GSI input file creation

Modifications to plot thermal fits vs data comparisons + cosmetics

Added functions to plot results in GSI or THERMUS format
Changed way labels are plotted (both for ratios and yields). Now they
are added by hand at the top of the macro.
Added markers for extrapolated and not-in-fit particles.
Improved GetHistoyields
Added possibility to overwrite defualt shift of histograms
Added shorthands for the different yields vs thermal plots

Improved drawing of ratios

Improving style and export of GSI input files

Better printout and helper method for averages

Added bit for average of particle and antiparticle

* AliParticleYield.h: Added type bit for average of particles and antiparticles
* AliParticleYield.cxx (CheckTypeConsistency): Fixed problem: was not returning kFALSE when needed
  (CheckTypeConsistency): Added check on part anti part average.

Generous constant tracking roads

added histos for JC eff. reweighting

Corrected warning from coverity notifications in AliFemto

updated macro for fig 3

Charged jets (pPb): Allow arbitrary eta ranges

Charged jets (pPb): Fix warning

Charged jets (pPb): Update

avoid warnings with modern compilers due to unused variables or wrong comparison of pointers

switch ON KFusage for ME and AODs

fixed addTask for tree running pp

Coverity fixes

- Updates
- possibility to read one OADB file or anther, depending if the analysis is performed on data or MC.
Giacomo Volpe

ALIROOT-5347 Change StreamLevel for the tracker debugging

CRLF -> LF

check/connect to grid if the file is on the alien

 Geometry initialization corrected

A first rough implementation of the main tracking functions

Fixes for compilation with Root6

A dummy implementation of the Use() function

set the default infinity value for run ranges, remove SM type dependency, consider all SM with same size

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Added

Updates for cleaning database and fixes for making local QA passes

Cleaned up and updated DB

- changes in Addtasks for pp by Lucia

put near all histos inside switches, updated binning, added additional sparse, fixed PID tally histo

add macro used to recreate the calibration OCDB files for Run1 from old OCDB files, adding the original online calibration parameter, small improvements in printing macros

Added macro used to produce fig3 of pA forward UPC paper

Macro to test the CA tracker

Get $ALIEN_ROOT from the environment.

Preparing for pushing the track seeds

ALIROOT-5442 Important fix to AliESDFMD object

AddTask macro commit for 4-pion femto

Add compile line

Update compile code for 4-pion analysis

Update compile code for 4-pion analysis

Add 4-pion femto analysis code

New binning for Mass e+e- histos

Updated macros from Massimo

N_clus as function of Phi histogram added in TrackQA

LHC14b2 sample added in GetWeightForMeson function

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

phi trklets between 0 and 2Pi

Add option for systematics in pPb vs mult.

- Added monitoring output to check jetPt dependence of dEdx - Final bug fix: Introduced TAxis member that is used to set the range for the convoluted gauss (instead of using the data THnSparse - checked that outcome is the same)

update of the tracker

update from Prabhat

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Fixed a potential problem when ALIROOT_BRANCH isn't defined

Fixed leak in reading ESD friends with AliESDInputHandler

moved StoreUsedCDB to the end of Run() to have complete cache of the CDB

new default compliant with the modifications in AliEMCALCalibData splitting the calibration parameters in EMCal and DCal separately

add calibration parameters arrays specific to DCal, avoid backward incompatibility reading newly created files with old aliroot version

remove classdef, avoid compilation warning

New flag for ntuple filling in Ds task

update the default histogram ranges for delta phi and delta eta histograms axis

put initialization of pure track histograms in the right place

Config-file for generating the Run 2 geometry

Making the cooked tracks sortable

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Whoops, perhaps a little fast on previous commit.  Code relies on
patch for STEER/ESD/AliESDFMD.{h,cxx}.  This fixes it until
Peter patches up the files above.  Sorry for the inconvinence.

coverity fix

Important bug fixes for the PWGLF/FORWARD directory

modified:   ../../../OADB/PWGLF/FORWARD/CORRECTIONS/data/fmd_corrections.root
modified:   ../../../OADB/PWGLF/FORWARD/CORRECTIONS/data/spd_corrections.root

Updated corrections and include new noise-gain correction for all possible runs

modified:   ../../CMakelibPWGLFforward2.pkg
modified:   ../../PWGLFforward2LinkDef.h

New classes added

modified:   AddTaskFMDELoss.C

Minor fixes for new AliFMDESDFixer

modified:   AliAODForwardMult.cxx

Allow trigger mask "CENT"

modified:   AliBaseESDTask.cxx
modified:   AliBaseESDTask.h

New method PreCorrections - meant to do stuff when we know the run number etc.,
but before reading the corrections

new file:   AliFMDCorrNoiseGain.h

A new type of correction.  This is used to add in the additional noise that
the reconstruction failed to add because of a bug in the AliFMDRawReader.  With
this, we can process old data with out fear of corruption.

modified:   AliFMDDensityCalculator.cxx
modified:   AliFMDDensityCalculator.h

Moved re-calculation of eta to new AliFMDESDFixer class

new file:   AliFMDESDFixer.cxx
new file:   AliFMDESDFixer.h

A class that fixes up the FMD ESD object for various flaws, including
bad values for 0's, missing noise from reconstruction, and possibly
re-calculation of eta.  This class takes an AliESDFMD object and
modifies the content in-place.  Unfortunately we cannot re-calculate
the phis in this, because we never store the phis in the ESD object.

modified:   AliFMDEnergyFitter.cxx
modified:   AliFMDEnergyFitter.h

Minor stuff

modified:   AliFMDEnergyFitterTask.cxx
modified:   AliFMDEnergyFitterTask.h

Use new class AliESDFMDFixer to fix up ESDs before processing

modified:   AliFMDEventInspector.cxx
modified:   AliFMDEventInspector.h
modified:   AliFMDMCEventInspector.cxx

Added new method for 2013 pA data.  Updated the method for
selecting which vertex method to use.

modified:   AliFMDSharingFilter.cxx
modified:   AliFMDSharingFilter.h

Moved ESD corrections into new class AliFMDESDFixer.

modified:   AliForwardCorrectionManager.cxx
modified:   AliForwardCorrectionManager.h

Possiblity for new correction object AliFMDCorrNoiseGain.

modified:   AliForwardMCMultiplicityTask.cxx
modified:   AliForwardMCMultiplicityTask.h
modified:   AliForwardMultiplicityBase.cxx
modified:   AliForwardMultiplicityBase.h
modified:   AliForwardMultiplicityTask.cxx
modified:   AliForwardMultiplicityTask.h

Updates for new correction ALiFMDCorrNoiseGain

modified:   DrawdNdeta.C

Minor things

modified:   ForwardAODConfig.C

Updates for changes in the code

new file:   corrs/Browse.C
modified:   corrs/ForwardOADBGui.C

New file and fixes for browsing corrections database

modified:   corrs/CorrDrawer.C

Updates for new noise-gain correction

modified:   corrs/RunTestF.C

Run test of Landau*Gaus shift of Delta_p

new file:   corrs/Upload.C

Generic script to upload corrections

modified:   qa/QAPlotter.C
modified:   qa/QATrender.C
modified:   qa/RunQAMT.sh
modified:   qa/runQA.sh

Updates for new centralized QA framework

modified:   scan/Trend.C
modified:   trains/MakeFMDELossTrain.C

Minor things.

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Script to extract noise gain corrections

A class that find noise-gain corrections

Important bug fixes for the FMD reconstruction.  The amount of noise
suppressed by the front-end was wrongly decoded from the data.   This
update fixes that problem.

It also includes minor updates to calibration drawing and some
test sripts

This commit needs to be ported to the release ASAP.

Ashutosh analysis update

New version of AliAnalysisAlien::DirectoryExists using TAlien::Cd

Fixed formula for the par[2]

Correct error messages and better Hijing header readout

Adding cuts on vertex contributors (for pA and PileUp rejection) to AliFemto (ESD and AOD EventReaders).
Also got rid off one small warning.

form Jan Wagner: some fixes

add PostData in UserCreateOutputObjects

Incrementing class version.

Update of syst. unc. due to background subtraction (Sandro) and optimizing error calculation on average of D0,D+,D*+ correlations

- load TRD on-line gain tables together with TRAP configuration