Avoid warning messages.

Coding conventions, clean-up and related changes

Truncate Z vertex at 3 sigma (was at one sigma)

20-apr-2006 NvE Several small modifications to prevent gcc warnings.
21-apr-2006 NvE TFile.h included in header files of IceCalibrate and IceXtalk to prevent
                compiler error with new ROOT 5.11 version.

Correct EMCAL version according to Marco van Leeuwen

GetEvent() - do not skip the event if the current event is the same, because by default this is event 0

Avoid numerical instabilities

Moving non-persistent data to AliESDfriend (Yu.Belikov)

Effective C++ initialization of data members in the default constructor

Corrected delete (Panos)

Long_t instead of UInt_t for the trigger mask

Fix in the event loop

Fix from Laurent

Corrected class name in the class description (Ivana)

Do not calculate special motif dimensions in GetDimensions() but only when building motif (Ivana)

Set REPEAT_BRIEF to YES; adding EVGEN to documentation (Ivana)

Doxygen configuration file: initial version (Ivana)

Improved version of the vertexer used  currently in production.
It uses different settings for protons and Pb-Pb interactions. The
distinction between the 2 is done automatically on the basis of the number
of clusters on SPD layers. The observed bias in p-p events has been
removed.
Massimo

Coding Convention (C.Blume)

Correct init of the raw reader in case of using directly AliAltroRawStream

Additional setter in case of using AliAltroRawStream directly

Avoid redeclaration of HEPEVT (Mac)

Initialization of RICH mip position in the copy constructor. Clean-up

Additional protection. The origin of clusters with wrong sector numbers should be investigated...

Introducing the ESD friend classes for storing complementary to ESD information in a separate file (Yu.Belikov)

Incremented class version

Using symbolic constants instead of hardwired numbers (Yu.Belikov)

Using AliPID class (Yu.Belikov)

Effective C++ initialization of data members in the default constructor

Effective C++ initialization of data members in the default constructor

Effective C++ initialization of data members in the default constructor

Initialization of indexes to -1

Verbose printout commented out

Additional values for the mip position in ESD and corresponding changes in RICH (K.Shileev)

Efficient C++ initialization of data members

Add fEnergy to AliPHOSDigit and operate with EMC amplitude in energy units (Yu.Kharlov)

Correct raw data fitting for digit amplitude in energy units. Coding conventions (Yu.Kharlov)

Coding conventions (Yu.Kharlov)

Remove setting primary index to ESDCaloCluster because it has no sence for raw data (Yu.Kharlov)

Coding conventions (J.Klay)

Fixing memory leak (L.Gaudichet)

Coding conventions (Laurent)

Coding conventions

Corrected initialization

Bugfix (C.Cheshkov)

Illegal calls to ReadHeader method of the raw reader. The raw reader was not reset afterward and therefore the pointer to the raw data payload was broken (C.Cheshkov)

Coding Violations

Coding conventions (Annalisa)

Double precision (Marian). Coding conventions (Federico)

Corrected method to get the XY rotation angle of a space-point

Updated version of the TRD trigger (Bogdan)

Coding violations in HLT/MUON

Additional protection to avoid rare problem related to the simulation of
coupling between the pixels. More investigations are needed...

Coding rule violations corrected

Copy/paste error fixed (Panos)

Updated trigger code (Alla)

Correct application of alignment objects in case of invalid volume paths

New version of the calibration to take into accout the changes after the cleaning of violated coding conventions (A.Colla)

Initialization of some arrays

default mag. field setttings

Classes for reading of the old RCU TPC raw data

Coding rule violations corrected

Coding conventions for PHOS

Additional protection

Coding conventions (Annalisa)

Removing wrong inline from the implementation file

Patch from Christian Holm

New FMD calibrations from Christian Holm

Additional protection

Fix to avoid problems in the fit of clusters (K.Shileev)

Coding conventions (C.Blume)

Corrected initialization of time and adc arrays in a loop

Coding conventions (A.Pavlinov)

Corrected path to the default CDB storage (A.Colla)

Removing memory leak in case of cached CDB entries

Coding conventions

Additional protection

Improved, numerically stable, formula (Yu.Belikov)

Removing obsolete classes (J.Klay)

Coding conventions (J.Klay)

Zero misalignment

Fix warning

Zero misalignment

Using AliVZEROv7 by default

Getters needed by the visalization (Matevz)

Updated version of the TRD calibration files (Alberto)

Set of modifications:
- Besides the overlapped 4x4 cells sum, now we consider also the not
overlapped 2x2 sum, necessary to do the selection of the L0 trigger.
- The maximum sums and cell positions for the 2x2 and 4x4 sums are
calculated and they are kept.
- The maximum amplitudes are transformed in Raw adc samples. Each time
bin of the sample is compared to the trigger threshold until the bin
sample is larger. The adc sample array is also kept.
- Defined a bool, fSimulation, if True, it loads the digits from the
trigger code, if False, the TClonesArray with the digits must be
provided to the Trigger when we call it.
Gustavo

Trigger method FillTRU (for PHOS it is in AliPHOSTrigger) modified and
added new method GetCellPhiEtaIndexInSModuleFromTRUIndex()
Gustavo

- Constructors: Correctly charge the geometry to avoid crash when opening a
different aliroot session from RecPoints to ESD
- New method GetPrimaryIndex that finds the index of the particle in the
kinematics tree that probably generated the reconstructed cluster.
Gustavo

RawSampledResponse() made public because it is needed by the trigger (Gustavo)

The modification of the loader requires to change calls loader->LoadDigits() to loader->LoadDigits(EMCAL) (Gustavo)

Calls to LoadXXX() modified to try to avoid  wrong 0 event (Gustavo)

- FillESD: Reject digits with time larger than 256*256/1e9*100 and diminish
correspondingly digits multiplicity)
- FillESD: Fill the methods GetM02 = lambda02 and GetM20=lambda12
- FillESD: Added the call to AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex to fill
the AliESDCaloCluster::GetPrimaryIndex.
- FillESD: Shower Shape methods only filled if the cluster is not a pseudo
cluster.
Gustavo

Default calibration parameters generatedd using macros/CalibrationDB/AliEMCALSetCDB.C (Gustavo)

Correct the zero calibration parameters, they were the PHOS ones (Gustavo)

Additional protection (Yu.Belikov)

Temporary fixes in case the Minutit fit doesn't converge (K.Shileev)

Streamlining polynomial evaluation

Simplification of Makefile and some small corrections

Optional stream level for debugging purpose. By defualt no debug output. Enable it by calling AliTRDreconstructor::SetStreamLevel(1) (M.Ivanov)