Fixing some problems for the QA
 - uniformized color scheme used for info, warning, error (for Pt2)
 - quality bit was not correctly set (important for Pt2)
 - some expert trigger histo were unfortunately "masked" by a previous commit, now hopefully fixed
 - allow checking to run properly even if only MCH or only MTR QA is activated.

(Laurent)

small change when running standalone

Coverity fix

C0OB0-D-NOPF-ALLNOTRD trigger added to the cosmic list.

Coverity warning fix attempt

Adding the ShowCapacitances method

- reverting the unnecessary increment of the class version

Modified misaligment errors along Z for LowFlux and HighFlux cases: SPD, SDD reduced to 50 um, SSD increased to 1 mm (A. Dainese, R. Shahoian)

Fix a Coverity warning: missing array deletion under certain circumstances (M. van Leeuwen)

Possibility to recalculate cluster position and correct for the non linearity of the clusters energy in EMCAL added

AliEMCALRecoUtils: new class for cluster correction during analysis
AliEMCALGeoUtils: Add a method for cluster position recalculation with different alignment shifts and particle depths

Coverity ... next iteration ...

- set the time stamp for the correct application of the calibration values

macro to add ITS-TPC matching components

bug fix

Fixes for coverity 13053

Fixes for coverity 10061, 10064, 10179, 10201, 10211

Fixes for coverity 13337, 13338, 15749, 15750, 15751, 15752

Fixes for coverity reports 10168, 10200, 10209, 10210

Coverity bug corrected.

Coverity bugs corrected.

Coverity bugs corrected.

Coverity errors corrected/avoided.

moving the string part corresponding to the detector from the pattern to the folder field in the query inside GetEntryId, which should speed up the searches (spurred by Pablo)

PYTHIA8 independent from root.

Updates.x

Coverity ...

coverity defects fixed

defects fixed

Update of ExB efect simulation for SPD (G. Bruno)

Fix events in file counting

Fix filename extraction for the GRID

Changes for request #72243: ESD friend filtering: Calibration events and tracks for TPC calibration

defects fixed

more info added to the mapping file

Updated production macros

Added buzzer task.

bugfix on TOF management

Supress MC output block when it is empty (bug https://savannah.cern.ch/bugs/?73685)

Updates from Jocelyn: new cut on number of clusters in the event, new histograms, change on the calculation of pi0 opening angle, correct labeling of some histograms.

Fixes for #73467: Corrupted MUON hits when using AliRoot with Root v5.27/05 and v5.27/06. Using default split level 99

Fixed list of files to be registered, merged, validated.

Protection added if fESD not set. Run number set locally is streamed to the remote worker.

Updated gamma jet task.

adding extra histo for alfa of pi0

alfa histo for pi0s

Implemented new multiplicity estimator (tracks+tracklets-made-of-clusters-not-used-in-tracks)

AliPWG0Helper
- added new analysis mode kTPCSPD
- changed all methods where the analysisMode is used
CreateStandardCuts
- same cuts for kTPC and KTPCITS
- disabled DCA in case of 2009 kTPCSPD

run.C
- changed CAF initialization for new caf+number of workers

AliMultiplicityTask
- changed order of tracklets and tracks loop in Exec (tracks have to be processed first when using TPCSPD mode)

Removed unnecessary printout

bug fixed

load classes.

Added an equivalent to the cuts 2010 for AODs and adapted the primary vertex cut for that

Disabled ACORDE raw data (still can be activated locally)
- requested by Federico Antinori for first PbPb

Copy method implemented as requested by HLT

Fix for compilation problem with icc.

Removed as it violates rules

Added V0 and SPDF0 information to the selectioninfo in the helper, removed streaming of histograms for the spectrum task

Removed maxinitFailed for plugin, updated cut for Gamma Conversion, some verbosity added to AddTaskJets

Fix in kOneTrack trigger selection.

Bugfix: moved the initialization of 4-vectors for daughters before cut checking, in order to allow to cut also on the 4-momentum of daughters and mother, which previously didn't work (other cuts are not affected)

Added the possibility to cut in dip angle, to reject electrons close to the kinematic limit

Added some new values used for checking outputs

Modified some standards, added a cut in pseudo-rapidity

Latest DataChecker from git, plus minor changes

Latest version corresponding to new trees

Update (A. Grelli)

plot v_n versus multiplicity

a patch for adding v2(pt). AddV2(TF1)

correcting improper use of volatile string objects returned by TObjString::GetString()

Second set of modifications to include SDD time zero in simulations. The time zero used in simulation is read from the same OCDB object used in reconstruction

remove print

New macro to display ITS Hits

DDL info added to the database

DDL info database file

added a few prototypes for AOD analysis

From eulogio: Remove bghandler from dalitz code

Speed up of Expand function (Hermes)

Updated object with Pb-Pb +3 production

changing the option for background cluster

Added Albericas code

correcting baryon mass subtraction for visible energy in MC

Fix

Changes from Tomas:
AliAnaElectron: Use positve track labels. Removed condition that the momentum vector should point to the emcal. Should be if only the track itself points to the emcal.
B-field problem solved.

parmaker: in PWG4/macros/electrons is not working properly. Changed it
and added new script to make it work properly. New file is
makeparfilesproperly

makeparfilesproperly:  new bash script to make parfiles in PWG4/macros/electrons

AliAnaBtag: cleaned it up a bit and added btagging to tracks not only associated to the
geometry of the EMCAL.

Histos for DQM shifter further reduced + changes in checker

added V0 trigger state histogram to online display

Update of the default cut

- complying to changes in the offline code regarding non-linearity corrections.

new non linearity corrections in PHOS (Dmitri)

Several nonlinearity corrections implemented

Bug fix in filling BB and BG flags in the ESD friend.

Fix compilation

Protection agains zero misalignment matrix added

Use rapidity instead of pseudo-rapidity (better quantity when comparing with theory). Remove cuts for reference muon (all the information needed to compute it is already in the CORRFW). Allow for selection of trigger classes to be analysed (Diego)

Printout event info if duplicate event found

Remove noti

Updates from Eulogio:
-Only run chic if set to true
-fixed bug in ConfigGammaConversion.C

removed renamed macro

renamed dalitz macro,
updated config macro

Add plot macro for results

Take from git

Added macro to check run properties.