Added more checks at s/digitization level (to keep bug#47098 under control)

Added PWG3/vertexingHF task and PWG4/Gamma jet finder (Mihaela)

Header file corresponding to 32066

Typo

Complete path for LoadLibraries.C

Delete macro CreateStandardAODfromESD.C

Possibility to create AOD+AODVertexingHF in the same train, starting from ESD (A. Gheata)

Possibility to create AOD+AODVertexingHF in the same train, starting from ESD (A. Gheata)

Fixes to memory leaks. New option for gauss fits (F. Prino)

Charge info in Fast Point set to KeV. Removing unused classes (F. Prino)

New tracklet and vertex selection in 3D (F. Prino)

Correctly retrieve the number of events per run during event generation.

Fix to Savannah bug 49014 (A. Mastroserio)

Added support for creating both standard AOD and several deltaAOD's in the same
ESD-based analysis. Producing a deltaAOD using AliAODHandler::SetNonStandardAOD()
in an analysis on input AOD is still possible. To use the new feature:
- use a standard AOD handler (no call to SetNonStandardAOD)
- in the AliAnalysisTaskSE-derived task, call AddAODBranch(cname, addobj, fname)
where the newly added fname is the file name where the branch(es) is(are) to be
written.

Added AliAnalysisTaskSE::IsStandardAOD() to check from the user code if the AOD
handler is configured for standard AOD or not. Check first via AODEvent() if there
is any AOD handler at all.

Added support for creating both standard AOD and several deltaAOD's in the same
ESD-based analysis. Producing a deltaAOD using AliAODHandler::SetNonStandardAOD()
in an analysis on input AOD is still possible. To use the new feature:
- use a standard AOD handler (no call to SetNonStandardAOD)
- in the AliAnalysisTaskSE-derived task, call AddAODBranch(cname, addobj, fname)
where the newly added fname is the file name where the branch(es) is(are) to be
written.

Added AliAnalysisTaskSE::IsStandardAOD() to check from the user code if the AOD
handler is configured for standard AOD or not. Check first via AODEvent() if there
is any AOD handler at all.

modify "Add" macro names accordingly

follow up on name change of QA tasks

follow up on name change of TRD tasks

- prepare train for merging with TPC.
- rename some of the tasks

Corrected Glitch filter.
In case the digits was removed the label corresponding to non existing digits
used, before label for noise used

(Marian)

Updated list of files (cmake)

full monitor of track in TRD region

Go back to working dir if par compilation fails, this helps debugging (AndreaR)

Glitch filter added. For a time being by default.

use a seperate config file to set the cuts and options for the flow analysis

Go back to working dir if par compilation fails, this helps debugging (AndreaR)

small bug fix

Changes required by adding of perfomrance tasks (Jacek)

Adding perfomrance tasks (Jacek)

bug fix

Fix in ITS FastRecPoints tree filling (F. Prino)

For the first event the number of events is set 1.
Fixes Savannah 49536

From Antonin:

Update the detailed views for the "V0" to do proper 2D projection
onto the bending plane view.

update resolution task with a full characterization of the track entering
the TRD from below

In AliMUONClusterInfo:
- Added new data members and methods
- Added the possibility get info from clusters not attached to a track (recPoints)
- Updated macro MUONClusterInfo.C
(Philippe P., Javier)

fix ordering of tasks

Fix bug in the macro to create FastRecPoints from Hits

Moved the random geration to the macro

Jet Jet Production 3 p_T hard bins

change aliroot version

Macro computing VZERO efficiencies

Adding class AliVZEROMisAligner

Adding class AliVZEROMisAligner

Adding class AliVZEROMisAligner

Merging of the three alignment macros into one

Merging of the three alignment macros into one

Updates (Leticia)
- corrected boosts
- corrected glauber

Added new filter cuts and MC particle filter. Muon filter activated by default as in CreateAODfromESD.
Macros AddTaskGammaHadronCorr.C and AddTaskPi0.C replaced with PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C (M.Gheata)

Added like-sign 3Prong

From Antonin:

Cascade visualisation upgrade (V0 daughter display, inv mass
selection, detailed views).

update

update

added methods to simulate fluctuations in multiplicity and flow

Some fixes to output structure tp avoid crashes on CAF

the filter needs the OutputContainer, not the exchange

The cluster index "0" was used to indicate that a track has no cluster
on a given layer. But there is a cluster with index "0" (the first cluster
of the event).Now using "-1" instead of "0".

A Dainese

Added the include to cstdlib in several places to avoid compilation problems with abort(); Added to some printfs "\n" when necessary; Example configuration file to execute AliAnaChargedParticles.

In reconstruction classes:
- Improve track candidate selection by taking into account the resolution
  on the track parameters.
- Add a flag into RecoParam to switch between track selection on their
  slope or on their impact parameter at vertex (default).
- UPdate REcoParam in OCDB
- Take into account the chamber/cluster resolution when defining
  the "fixed" area to quickly look for new cluster to be attached to the track.
- AliMUONDigitCalibrator: Do not use digit saturation information from
  calibration file when using the calibration option NOGAIN.
(Philippe P.)

misalignment from Tomek

more documentation + minor corrections

Filling residuals (GlobalQA) only for tracks with kTPCin

Adding pileup algorithm 2

Missing protection in case no interactions are generated within the orbit. Thanks to Christian for spotting it!

compilation error fixed by Matthias

added setters for nonflow, flow and multiplicity in kine tree reader
removed left over else in LYZ

correction of the magnetic field scale

remove directory

rename dir

rename directory

- siimplify and unify task management using the common "Add" macro
- simplify naming
-This line, and those below, will be ignored--

M    TRDqaRecLinkDef.h
M    libTRDqaRec.pkg
A    qaRec/AliTRDefficiencyMC.cxx
A    qaRec/AliTRDinfoGen.cxx
D    qaRec/AliTRDtrackingEfficiency.cxx
M    qaRec/AliTRDmultiplicity.cxx
M    qaRec/run.h
D    qaRec/AliTRDtrackInfoGen.h
M    qaRec/AliTRDrecoTask.h
M    qaRec/AliTRDresolution.cxx
A    qaRec/AliTRDefficiency.cxx
M    qaRec/AliTRDcheckDetector.cxx
A    qaRec/AliTRDefficiencyMC.h
A    qaRec/AliTRDinfoGen.h
D    qaRec/AliTRDtrackingEfficiency.h
D    qaRec/AliTRDtrackInfo
A    qaRec/macros/EVE
A    qaRec/macros/EVE/nclusters.C
A    qaRec/macros/EVE/PH.C
D    qaRec/macros/chargeDistr.C
D    qaRec/macros/runTraining.C
D    qaRec/macros/makeTrainingData.C
D    qaRec/macros/PH.C
A    qaRec/macros/AddTRDinfoGen.C
D    qaRec/macros/ConvertMLPs.C
D    qaRec/macros/nclusters.C
D    qaRec/macros/MonitorTraining.C
A    qaRec/macros/AddTRDpidChecker.C
A    qaRec/macros/AddTRDresolution.C
A    qaRec/macros/AddTRDefficiency.C
D    qaRec/macros/clusterSelection.C
A    qaRec/macros/AddTRDcheckDetector.C
A    qaRec/macros/PID
A    qaRec/macros/PID/runTraining.C
A    qaRec/macros/PID/MonitorTraining.C
A    qaRec/macros/PID/makeTrainingData.C
A    qaRec/macros/PID/ConvertMLPs.C
A    qaRec/macros/AddTRDcheckESD.C
D    qaRec/macros/clusterResiduals.C
M    qaRec/run.C
M    qaRec/AliTRDcalibration.cxx
D    qaRec/AliTRDtrackingEfficiencyCombined.cxx
A    qaRec/AliTRDefficiency.h
M    qaRec/AliTRDpidRefMaker.cxx
M    qaRec/AliTRDcheckESD.h
M    qaRec/AliTRDpidChecker.cxx
M    qaRec/AliTRDclusterResolution.cxx
D    qaRec/AliTRDtrackInfoGen.cxx
M    qaRec/AliTRDrecoTask.cxx
D    qaRec/AliTRDtrackingEfficiencyCombined.h

Task creation via macro AddTaskVertexinHF.C

Updated list of files

Include cstdlib to declare abort()

Init with values, to satisfy CINT compilation

Macro to be attached to the analysis train

Several changes:
1) AddTaskPartCorr.C: The analysis train will call this macro to execute the tasks
2) Readers: Memory transient objects removed, now clusters and tracks selected and used in analysis are in TRefArrays.
3) AliAnaPi0.cxx: Protection added agains floating point exception when calculating the rapidity for MC particles
4)AliChargedParticles: New class for charged tracks selection for correlations.
5) Few coding violations  removed
6) In AliAnaParticleHadron* and AliAnaParticleJet* added option to fill histograms when trigger particle is isolated
7)AliAnaParticle* and AliIsolationCut: When adding clusters or tracks to reference lists in AliAODParticleCorrelation, use new with placement.

Protection against empty events.

Allow reconnection. Needed for efficient mixing.

- add TPC performance train (Alex & Jacek)
- protect against dummy MC labels
- fix plots array definition in the PID checker task

add PRF calibration object to the transform class (Theodor)

Fixes to class structrure and methos names, avoid conflicts with TaskSE

AddTask macros for all tasks, to run on CAF with with old root5-22-00 version, added flag for old input/output container handling, added also PID task

Removing the separate misalignments at inner and outer SSD barrel + minor improvememnts (R. Grosso)

Ideal ITS misalignment; it includes now the SSD survey for ladders and modules (R. Grosso)

change of copyright notice

AliHLTTPCCAUsedHitInitialiser removed from the compilation list

New class for charm hadrons invariant mass fit (Chiara B)

New class for charm hadrons invariant mass fit (Chiara B)

adds to the compilation

array class from Matthias

changes from Matthias

Remove compilser warnings

SPD multiplicity analysis (Domenico, Mariella)

correctly handling the output directory path

Float_t -> Double_t in projection for axis consistency (C. Zampolli)

Updated to use AliMultiEventHandler

Updated geometry (rev 31976) including in particular the changes in SSD which speed up overlaps' check, introduced with rev.31872

update by Theodor
AliHLTTRDUtils.cxx
- fast bugfix, error to be investigated

AliHLTTRDClusterizerComponent.cxx
- follow changes in offline TRD
- support for new valgrind versions

AliHLTTRDTrackerV1Component.cxx
- support for new valgrind versions

Track length update removed from the tracker code,since it is done in the track code (A. Dainese)

bin counting bug fixed