bug #61669: Request to have the interaction time in AliGenEventHeader

mprovements of the bad channel treatment in the DA. New features for test purposes (S. Borysov)

Speedup of the TransportBz() method (S. Gorbunov)

Updates for new ADD + ZDC modules

 Reco Param with Latency window, L1 latency & vertex shift

- cleaning up debug output
- fixing compilation warnings

- fixes in the handling of the AliHLTCaloClusterStructs

- starting implementation of the clusterizer component in the EMCAL library

- improvements in the clusterisation process
- still missing the cells in the final ESD cluster

- fixing mistake

- moved digit struct to BASE/util to facilitate for ESD conversion in the global ESD converter
- small bug fixes in the clusterizer to get the ESD conversion working
- the cluster maker now takes into account the digits

- moving the cluster parameter evalution from own component to clusterizer
- fixing nasty bug in clusterizer
- cosmetics
- adding geometry classes to build system

- adding geometry classes to facilitate for having a CALO class for evaluating cluster parameters

- fixing protection against writing outside of buffer

Argghh... small typo... corrected

Update AddTaskPerformanceStrange: MC and PID flags

1. speed up
2. histograms are removed

Mip-track distance cut set to 6 cm

Introduce new NtimeBin consistency checks

Minor updates in macros for SDD calibration monitoring

FMD settings uncommented and med ids decreased by 1

Fixing warning.

Adding new track structure for full tracker.

Added reading of ESDFriends for QA TPC task

Adding the possiblity to replay v0 online trigger, in the same way as it is done for MC.

Enlarging the beam-beam time windows in order to minimize the impact of the V0AND offline trigger.

Changes by Arian
1- Correction of scaling in Terminate()
2- Distribution of ptsum in max zones in transverse region. (Aimed to perform corrections to jet pt spectrum).

New DA to run as a monitoring DA on PHSYICS and STANDALONE runs, it creates a noise map

new method (ProcessNoiseMap) added , it saves a new object in OCDB (OCDB/HMPID/Calib/NoiseMap), map will be created by HMPIDphysda.cxx for PHYSICS and STANDALONE runs

Updates in SDD drift speed calculation from injector runs (F. Prino)

Bug fix in checking if MUON module is loaded.

bugfix: reading the run number from OCDB if the run description is not set, which is the case when running in aliroot mode
This is a very old bug, and potentially responsible for bug
https://savannah.cern.ch/bugs/?62546

implementing helper function to get the run number from the OCDB setup

Update testing macro with access to geometry to get cell indices, correct place of parenthesis when getting the list of primaries contributing to the cluster

Adding libSTAT library as request by TRD.

final Armenteros-Podolanski resolution

Update of the SSD on-line clusterfinder:

1. Real data is read in a proper way

2. More checks and warnings added

3. Cosmetics

Reintroduce changes of revision 38787, previous committed version modified from non updated code.

Corrections for the secondaries - knocked out from the material

Move initizalization of fiitting algorithm RawAnalyzer to SetFittingAlgorithm, now the selection of the algorithm can be done again via de OCDB.

Update for running on 2010 data (S. Beole')

Protection to execute 2 PartCorr Tasks if one of them do not needs the AODTrack or AODCaloClusters output branch

fixed track selection from AOD, added new tasks to the train

minor fixes, plotting ranges in eta

Corrected makrolon rod length

Remove for the moment the QA analysis from the PartCorr wagon and move it to its own wagon.

AliAnaPi0: Add possibility to cut on opening angle of pairs, to reject background. Opening angle histograms added.

AliAnaCalorimeterQA:
 - Histograms to display cells energies for different fractions of the super modules
 - Histograms to calculate the measured time  of a cell in a cluster minus the time of cell with highest energy
 -Histogram to accumulate time measured in cells, fill grid of SuperModule. Only for cell energy larger than 0.5 GeV
- Corrected loop of invariant mass calculation, maximum index in second loop was wrongly set to one unit less.

Overlaps removed down to 10 microns

Use equipment id in error dump (MinJung)

Corrected overlaps

Added possibility to introduce downscaling in the selection of raw-data event based on a logical expression of trigger classes. The syntax is <logical expression> followed by % and N, where N is a integer downscaling factor.

fix for bug #62663

clean up the code; count errors(no fit) and warnings separately (Alexei)

Change digitization threshold to >=3 ACD units, now cut on ADC value of digit after conversion from energy to amplitude with the calibration constants in the OCDB.

add some comments

New task for building efficiency matrices with CORRFW for single muon analysis (Xavier)

Improvements to hit reco component for reconstruction on stations 1 and 2.
Fixes for full tracker component.
(Indra)

V0 trigger calculation from ESD data

Apply corrections

Corrections for scondaries kicked out of the material

added posibility to include error to theraw sampled function; default is no errors included

Update of ACORDE-QA-Raw data histograms (now they go from -0.5 to 59.5)

Code clean-up and bug fixes (Melinda)

Implementing ResetDetector method in the QA data maker rec classes (Melinda)

Coding of supporting cylinders, cone nad rings, previously missing. (M. Sitta)

Correct typo in SetPretrigger()

Correct typo in SetPretrigger()

- updated documentation
- removed redundant variables

Updated trigger configuration OCDB entry. To be used in MC productions (Raphael)

Error corrected

Removing LHC Luminosity and Beam Intensity from the GRP object.

Added same task for ITS standalone tracks

Updated class to include collimator

- arithmetic fix
- new method

bugfix: more verbose output also for reconstruction from raw data

update in jet correl

AliEMCALGeometry: Correct the calculation of the position of the cells for cluster calculation, avoid swap in phi for A side and swap in eta for C side; AliEMCALv2, same correction to have simulation and reconstruction following the same convention

Eqs. for non-isotropic terms for automatic correction for non-uniform acceptance for 2nd and 4th order differential flow when particle weights are used.

Merge branch 'devel'

index order bug fix - from Paola

p[3] corrected (Ivana)

Adding the possibility to use or not the online/offline trigger in the data analysis

Use Doubl_t version of PushTrack.

Pass the name of the EMCAL geometry as an input to the macro to create the correct alignment objects

bug fix: put "else if" instead of "if" in the initialization

updating LinkDef according to recently added classes

QASym task runs separately for TPC tracks and global tracks, additional histograms

Bug fix of FPE caused by large trigger amplitudes in rare cases

Implementing better the kSigma2 approach - dEdx(measured)/dEdx(theory)

AliTPCcalibDB.cxx AliTPCcalibDB.h - Adding AliFatal in case of missing critical calibration entries
                                  - Adding non linear field distortion calibration
                                       partially
                                       bug #62183: DCA of TPC tracks is different for A/C side in pass3
                                  - Do not cache enties which are not used yet in the reconstruction
                                       bug #62535: ppbench breaks in TPC
AliTPCTransform.cxx               - Usage of the Non linear distortion correction due to the field

The digits are stored in units of ns now. The trigger mask class was not changed last time when the units changed in MC. This fixes bug #62529.

Adding field distrotion OCDB entry

Usage in the reco, according switch
AliTPCRecoParam::SetUseFieldCorrection()

Eta-y dependent ratios for each pT bin

fixes for bug 62512

default: run all methods

enable setting of subevents

AliTPCcalibBase  - use of the current event, track and seed innthe base class
AliTPCcalibTime  - Using the ITS standalone track for alingment and calibration - if possible
AliTPCcalibAlign - Storing the local residuals in order to calculate distrotions due to the field distortions

(Marian)

Adding the normalized dE/dx vs P plot

HLT (temporary?) excluded from processing, as no files are produced by HLT DA for a long time
and the absence of files at FES now cause a preprocessor crash (not a warning as before!).

Fixing naming so that it looks in the right directory of OCDB to find the RecoParam