adding libEMCALUtils to libAliHLTCalo dependencies

correcting unresolved symbols of libAliHLTTrigger:
classes AliHLTTriggerCaloClusterEnergy and AliHLTTriggerEmcalClusterEnergy added
to build system and LinkDef

Bugfixes and code clean-up (Felix)

Obsolete classes removed.

- Init exchange containers independently needed for usage of the task
outside the analysis train
- comment out tracklet exchanged containers for the moment

updating HLT TRD ESDWriter follow reorganization of the friends in AliESDs.root (Theo)

adding option to skip particular component libraries from the default libs by specifying prependedg '!'-mark, e.g. '!libAliHLTITS.so'

old unused alipmdv3.cxx deleted

Task uses now the new cuts class (Chiara)

Fixing coding violations

New analysis taks for muon-dimuon analysis (Livio)

modification from Per Thomas

Removing non existing emcal trigger class from build system

New task for extraction of a particle's pt distribution from the decay daughter pt distribution (F. Fionda)

New task for extraction of a particle's pt distribution from the decay daughter pt distribution (F. Fionda)

Initializing a rawanalyzer object in
the PeakFinder component.

Dplus and Ds tasks use the new cuts classes (Francesco, Renu, Giacomo)

Updated cuts classes (Rossella, Renu, Francesco, Giacomo, Chiara)

foo

Changing that data identifier for EMCAL from EMCL to EMCA
( The HLT framework assumes the  latter ).

Neural Network component

Component for fast fitting ( Alexei )

- corrected the ingroup to alihlt_qa for the documentation creation

Merge branch 'histocomp'

* histocomp:
  bugix in calohistcomponent. Must clear histo array

Correct setter/getter methods for fgPedestalValue

- follow the changes of the input of the drift velocity component

move AliEMCALHistoUtilities from base to Utils library, remove call of this class in AliEMCALReconstructor

added histograms

Coding convention fixes

Skipping PHYSICS and STANDALONE runs when the recording is OFF.

Merge branch 'histocomp'

* histocomp:
  Changed calo histo component to send histograms in one block
  Added error message in configuration string parsing

In AliMUONTriggerQADataMakerRec:
Adding protection against sqrt from negative value
(bug report #65815)

Fix in the printout of the validity time-stamps

Move pretrigger simulation to TRDsim

Change  names of the output conatainer and files
Adding MakeReportTPC.C macro

(Marian)

adding argument for specifying options for the HLT

- macros for running the analysis tasks for the HLT-offline ESD tree comparison on the GRID

- removed unnecessary variables and change the default detector task to 'global'.

coding conventions

display HLT TPC clusters from a specific digit file

adding handler for {'CLUSTERS':'TPC '} blocks, stored in a file HLT.TPC.Clusters.root in HOMER format

- adding possibility to open an AliHLTOUTDigitReader for a specific digit file
- some code cleanup, using AliHLTMisc to create intances

- moved the writing of the data to DumpEvent() instead of FillESD()
- bugfix: handle the SOR correctly if only one DDL link is defined as output
- bugfix: argument scan - use correct function call of the base class

changed histogram binning

limit printout of Event Plane for MC

 change histo range, remove setter

Added calculation of edge positions of module, needing for geometry checking and geometry corrections

fixed coding violations + added errors for non-isotropic terms

free resources for skipped events in DA and require that EMC was in readout for LED DA

Update of the DA for DAQ (Raphaelle)

Fix in operator=

Moving AliDAQ to libSTEERBase.

Incremented ClassDef

Following the commit for AliGRPPreprocessor.cxx.

Remake TOF-PID with event-time resolution calculated event-by-event (T0 fill or T0-TOF) -F.Noferini

Following bug report 52151, Offline Weekly Meeting of 12 April 2010, and SRC Meeting
of 13 April 2010:

- for Energy, BeamMode (-->LHCState), MachineMode, BeamType: using only the last
value before the SOR.
- for BeamMode (-->LHCState), MachineMode, BeamType: keeping track if somethng changes.

Changes for report #65804: technical fix for AliGRPPreprocessor.cxx (Chiara)

- cleaned up macro for local running

- fixed momentum range for dEdx
- applied the condition #TPC clusters>0 for filling the relevant histograms
- included public constructor without argument

adding more option to the HLTOUT component:
-digitfile <name>
-rawout[=[on,off]]
-digitout[=[on,off]]

- feed data to mcmSim in pads, write back in channels
- additional MC information for simulated tracklets
- bugfix for label 0

Allow to reject clusters with less than n cells

Error corrected

ZEM histos not considered (no laser data yet)

Change the digitization of amplitudes using Ceil to Floor, more in accordance with what is done in hardware

Macros to plot SDD QA histograms (Melinda)

Update the Tag framework to correspond to current datataking conditions

Protection against trying to fit histos with mean<0

Added methods for chi2 calculation

addd RelateToVertex before checking track cuts

add exception handling around TH1/Minuit fit

Delete of fAnalyzerPtr in destructor and reimplemented ::DoDeinit - calling base class ::DoDeinit for proper memory cleanup.

Removing of the delete of fAnalyzerPtr - fix of mem corruption. RawWriter destructor implemented - fix of unresolved symbol. Additional deletes in destructor. Check DoDeinit for more.

suggestion from Mateusz: no using namespace std in header files

Fixes for report #65711: changes in ITSVertexer and AliMultiplicity (Annalisa)

Do not read the ESD friends

Barth and Yaxian: fix to avoid generic EMC QA gui crashes

bug fix in histogram filling (displaying histograms) A. Mastroserio

modified ESDfriend reading

TRD pretrigger simulation based on digits of T0, V0 and TOF, simulation control is done by class AliTRDptrgCBB for now

Fixes to cure warnings

updated dndeta analysis

a/ AliTRDCalibChamberStatus (in ProcessEvent the warning and in Check trying to fix bugs (still not ready but anyway not yet used online)). I added one protection more in case the status of DCS is 3, Julian but let see what is the result without it first.

b/ AliTRDCalChamberStatus.cxx and .h in the Cal directory for the plot function.

AliCFGridSparse : propagate the bin labels during projections
AliCFEffGrid    : fix delete []

update in default cuts (Andrea Dainese)

Possibility to disable diamond constraint for primary vertex

- fixed coding violations

remove include fstream and Riostream

New task for impact parameter resolution study

Coding conventions.

comment out debugging in Calibration task settings

Coding conventions

book bad channel map histograms only once

Plot of pT for D0 added (Gaute)

extend functionality also for calibration files

second interation on implementing variable detector segmentation
- make variables class specific from static

Fixes to cure warnings

adding prediction processor for the GRP, moving some functions to the PredictionProcessor base class for common use, deleting deprecated code in the PredictionProcessorHLT

Removed class that depends on AliRunLoader. To be rewritten as AliAnalysisTask

New classes for the cuts on charm candidates