Updated version (Ernesto)

Update in HP decoders:

Added:
A new high performance decoder for the MUON trigger detector (AliMUONTriggerDDLDecoder).
The corresponding stream interface class AliMUONRawStreamTriggerHP has been created
to interface the decoder with AliRoot.
Also added the abstract class AliMUONVRawStreamTrigger and made both AliMUONRawStreamTrigger
and AliMUONRawStreamTriggerHP inherit from that. This allows easy exchange of the decoders.

Bug fix:
AliMUONRawStreamTrackerHP was not working for mixtures of empty events and partial events. This is now fixed.

Minor changes:
Made some documentation corrections to AliMUONRawStreamTrackerHP.
Also added static methods to the AliMUONTrackerDDLDecoder to be able to read out the raw data structure key constants from other classes, similarly to what is now done in AliMUONTriggerDDLDecoder.

(Artur)

Update in HP decoders:

Added:
A new high performance decoder for the MUON trigger detector (AliMUONTriggerDDLDecoder).
The corresponding stream interface class AliMUONRawStreamTriggerHP has been created
to interface the decoder with AliRoot.
Also added the abstract class AliMUONVRawStreamTrigger and made both AliMUONRawStreamTrigger
and AliMUONRawStreamTriggerHP inherit from that. This allows easy exchange of the decoders.

Bug fix:
AliMUONRawStreamTrackerHP was not working for mixtures of empty events and partial events. This is now fixed.

Minor changes:
Made some documentation corrections to AliMUONRawStreamTrackerHP.
Also added static methods to the AliMUONTrackerDDLDecoder to be able to read out the raw data structure key constants from other classes, similarly to what is now done in AliMUONTriggerDDLDecoder.

(Artur)

Updated serial number for station345
(Christian)

Corrected rounded shapes and their placements
(Javier)

New version with sample rate map and progress meter

Made method to obtain the transformations public. Required for event display

New version to incorporate use of daqDAlib

New version to incorporate use of daqDAlib

New version to incorporate use of daqDAlib

Updates to include status maps for high voltage sensors

Added histogram container (TObjArray)

bugfix: making HLT reconstruction work for more than the first event

include AliEMCAL.h

fixed redeclare the member data fHits(thanks Andreas)

included adjustments to better fit saturated channels which should have been committed some time ago

removing unneeded HLT directory

Pointer to a TClonesArray changed to a TObjArray. fDriftSpeedParam changed to a Double32_t

Changes needed to properly add and subtract the SDD low threshold with data compressed to 8 bits (F. Prino)

Version number incremented

Adding abstract class for comparison components

Changes needed to properly add and subtract the SDD low threshold with data compressed to 8 bits (F. Prino)

Update of Macros
Connected to the Creation of the base class (Jacek)

Example macro with Calibration (Marian)

Removed compilation warnings (Marian)

Use abstract inteface for the calibration components using tracks

Implementation of the task which use the the Calibration components
AliAnaTPCTrackCalib

Bug fix (H. Tydesjo)

Adding task encapsulated TPC calibration components using tracks (Marian)

(Jens, Marian)
Adding check routines to the agent
- Check availability of SE

Adding staging status information
- Enable staging
- Check if the file is staged

geometry.root from GRP causes problem; take mine

typo

typo

added loading of geomerey for rawqa

Implement interface of the Base class (Marian)

Use the inteface from AliTPCcalibBase (Magnus)

(Marian, Magnus)
-Added functions
+   Int_t AcceptTrack(const AliTPCseed * track) const;
+   Int_t AcceptTrack(const AliESDtrack * track) const;
static  AliTPCcalibTracksCuts  *CreateCuts(char* ctype);
Removed function
chain related
OutputFileName related

-This line, and those below, will be ignored--

M    AliTPCcalibTracksCuts.h
M    AliTPCcalibTracksCuts.cxx

Remove compilation warnings (Marian)

Spelling change (Marian)
-  virtual void     Process(AliESDevent *event){return;}
+  virtual void     Process(AliESDEvent *event){return;}

remoce setting of default OCDB directory

adding event statistics

In AliMUONRegHeader.h:
Adding missing include (needed for inline function)

In AliMUONQADataMakerRec:
- AliFatal changed to AliError, so that we do not break other detectors
- Adding checking the results from InitXYZ before executing MakeXYZ

Krypton CF: publish histograms as individual objects; bugfix: reset candidate history (Kenneth)

Fixes in documentation only
(Artur)

Changed back the page title

In MUONTRKda:
New option without FES. Cleaning of unused options
(Alberto, Jean-Luc)

Fix memory leak

char_t* replaced by const char_t* in constructor (A. Naumann)

Updated field map (R. Shahoyan)

Map update. (R. Shahoyan)

Temporary removed information from the event HEADER (Marian)

Fix memory leak

A step forward towards accuracy : now using dep files generated during compilation (an alternative, but much slower, is to rerun the preprocessing of files, using gcc -MM, kept in getIncludeFiles function, but what is used is getInfludeFiles2)

Clearing SDigits TClonesArray instead of deleting it and recreating a new one.

Coding conventions: comments added (G. Bruno)

QA for pixels: completed DataMakerRec with Raws. Implemented Digits and Hits QA for DataMakerSim (D. Elia and M. Nicassio)

Check array ranges

Adding Optional Output
TObjArray of clusters (Marian)

Adding new hidden info class for decay products

Default constructor corrected.

Keep correct id of mother particles

Implementation of eventdisplay in AliEve

Do the correct unit conversion

Removed obsolete anaysis - FFT, Pedestal/Noise, CE, Gating Grid (Marian)
Code impleented in the calibration components - AliTPCcalibXXX

typo

do all in simrun.C rather than in simrun.sh

Bug fix: corrected file name (Levente)

using separate loop to fill ESD tree instead of TChain::Merge

Calculate the weighted mean of the shape factor (Marian)

Increase the frequency of the usage GetShape
Add more (optional) debug information to the debug stream (Marian)

UPdate & fixes in St1 geometry:
- Quandrant layers replaced with assemblies, middle layer
  splitted in two assemblies: one for inner volumes and one
  for frame
- Fixed overlaps for Spacer volumes
- Shifted SCHL, SCDB for special motifs to solve overlaps
- Fixed positions of SQ18, SQ20, SQ22, SQ24 frame volumes
- Removed STL implementation for special motifs map

Do the proper unit conversion

Adding check for mapping; try to load it if it is not yet available
and give Fatal if loading failed

Implementing a way to store freeze-out information for generated particles. Final state particles are stored twice - one copy (not tracked) is stored with original freeze-out point, the other one (the tracked one) is stored with the position of a primary vertex

Default constructor corrected.

Create TClonesArray of CPV digits once in constructor instead of each time per CPV hit

fSDigits changed from pointer to a TClonesArray to a TClonesArray

Bad modules and chip treatment added (E. Fragiacomo)

New Class AliITSTrackleterSPDEff:
 - This is the class to build a tracklet prediction using
   only 2 points: (1) primary vertex and (2) one SPD cluster
   It is used to estimate SPD efficiency with tracklets.

 - Inherits from AliITSMultReconstructor

The following classes have been modified:

- AliITSPlaneEffSPD.cxx: AliError call changed into AliDebug to reduce output

- AliITSRecoParam.cxx; AliITSRecoParam.h
Bool_t fReadPlaneEffFromOCDB introduced to allow reading of
PlaneEff statistics from CDB

- AliITStrackerMI.cxx: new control on AliITSRecoParam special settings for
PlaneEff

Giuseppe Eugenio Bruno

AliFatal changed to AliError in InitRaws when DDL map is not found on the OCDB. In this case, also MakeRaws returns an error message and exits

Using new factory method AliRawReader::Create whenever possible

Select primary track candidates on their bending slope instead of their bending momentum when there is no magnetic field, and use linear extrapolation instead of Rungekutta (Philippe P.)

code documantation and minor cleanup

Typo corrected.

Particles() return const TObjArray*

Particles() return const TObjArray*

In AliStack: TClonesArray* fParticles replaced by TClonesArray
TObjArray* fParticleMap replaced by TObjArray
Particles() return const TObjArray*

Adding description about using high performance decoder
and its options.
(Artur)

Correct the PWG2femtoscopy par file

Obsolete TrackReferences related code removed.

Double declaration of fParticles removed.

fParticles-> replaced by fParticles.

TClonesArray* repaced by TClonesArray

Fix in documentation
(Artur)

Adding a protection to survive trigger shower events in the case we bypass stations 4 and 5

Correcting GetSize method

Implemented GetChipFromChannel and GetChipFromLocal (E.Fragiacomo)

TClonesArray* replaced by TClonesArray.

Adding protection - "fake tracks" signed with negative values
(Marian)

Adding missing comma