Fixed leak in reading ESD friends with AliESDInputHandler

moved StoreUsedCDB to the end of Run() to have complete cache of the CDB

new default compliant with the modifications in AliEMCALCalibData splitting the calibration parameters in EMCal and DCal separately

add calibration parameters arrays specific to DCal, avoid backward incompatibility reading newly created files with old aliroot version

remove classdef, avoid compilation warning

New flag for ntuple filling in Ds task

update the default histogram ranges for delta phi and delta eta histograms axis

put initialization of pure track histograms in the right place

Config-file for generating the Run 2 geometry

Making the cooked tracks sortable

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Whoops, perhaps a little fast on previous commit.  Code relies on
patch for STEER/ESD/AliESDFMD.{h,cxx}.  This fixes it until
Peter patches up the files above.  Sorry for the inconvinence.

coverity fix

Important bug fixes for the PWGLF/FORWARD directory

modified:   ../../../OADB/PWGLF/FORWARD/CORRECTIONS/data/fmd_corrections.root
modified:   ../../../OADB/PWGLF/FORWARD/CORRECTIONS/data/spd_corrections.root

Updated corrections and include new noise-gain correction for all possible runs

modified:   ../../CMakelibPWGLFforward2.pkg
modified:   ../../PWGLFforward2LinkDef.h

New classes added

modified:   AddTaskFMDELoss.C

Minor fixes for new AliFMDESDFixer

modified:   AliAODForwardMult.cxx

Allow trigger mask "CENT"

modified:   AliBaseESDTask.cxx
modified:   AliBaseESDTask.h

New method PreCorrections - meant to do stuff when we know the run number etc.,
but before reading the corrections

new file:   AliFMDCorrNoiseGain.h

A new type of correction.  This is used to add in the additional noise that
the reconstruction failed to add because of a bug in the AliFMDRawReader.  With
this, we can process old data with out fear of corruption.

modified:   AliFMDDensityCalculator.cxx
modified:   AliFMDDensityCalculator.h

Moved re-calculation of eta to new AliFMDESDFixer class

new file:   AliFMDESDFixer.cxx
new file:   AliFMDESDFixer.h

A class that fixes up the FMD ESD object for various flaws, including
bad values for 0's, missing noise from reconstruction, and possibly
re-calculation of eta.  This class takes an AliESDFMD object and
modifies the content in-place.  Unfortunately we cannot re-calculate
the phis in this, because we never store the phis in the ESD object.

modified:   AliFMDEnergyFitter.cxx
modified:   AliFMDEnergyFitter.h

Minor stuff

modified:   AliFMDEnergyFitterTask.cxx
modified:   AliFMDEnergyFitterTask.h

Use new class AliESDFMDFixer to fix up ESDs before processing

modified:   AliFMDEventInspector.cxx
modified:   AliFMDEventInspector.h
modified:   AliFMDMCEventInspector.cxx

Added new method for 2013 pA data.  Updated the method for
selecting which vertex method to use.

modified:   AliFMDSharingFilter.cxx
modified:   AliFMDSharingFilter.h

Moved ESD corrections into new class AliFMDESDFixer.

modified:   AliForwardCorrectionManager.cxx
modified:   AliForwardCorrectionManager.h

Possiblity for new correction object AliFMDCorrNoiseGain.

modified:   AliForwardMCMultiplicityTask.cxx
modified:   AliForwardMCMultiplicityTask.h
modified:   AliForwardMultiplicityBase.cxx
modified:   AliForwardMultiplicityBase.h
modified:   AliForwardMultiplicityTask.cxx
modified:   AliForwardMultiplicityTask.h

Updates for new correction ALiFMDCorrNoiseGain

modified:   DrawdNdeta.C

Minor things

modified:   ForwardAODConfig.C

Updates for changes in the code

new file:   corrs/Browse.C
modified:   corrs/ForwardOADBGui.C

New file and fixes for browsing corrections database

modified:   corrs/CorrDrawer.C

Updates for new noise-gain correction

modified:   corrs/RunTestF.C

Run test of Landau*Gaus shift of Delta_p

new file:   corrs/Upload.C

Generic script to upload corrections

modified:   qa/QAPlotter.C
modified:   qa/QATrender.C
modified:   qa/RunQAMT.sh
modified:   qa/runQA.sh

Updates for new centralized QA framework

modified:   scan/Trend.C
modified:   trains/MakeFMDELossTrain.C

Minor things.

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Script to extract noise gain corrections

A class that find noise-gain corrections

Important bug fixes for the FMD reconstruction.  The amount of noise
suppressed by the front-end was wrongly decoded from the data.   This
update fixes that problem.

It also includes minor updates to calibration drawing and some
test sripts

This commit needs to be ported to the release ASAP.

Ashutosh analysis update

New version of AliAnalysisAlien::DirectoryExists using TAlien::Cd

Fixed formula for the par[2]

Correct error messages and better Hijing header readout

Adding cuts on vertex contributors (for pA and PileUp rejection) to AliFemto (ESD and AOD EventReaders).
Also got rid off one small warning.

form Jan Wagner: some fixes

add PostData in UserCreateOutputObjects

Incrementing class version.

Update of syst. unc. due to background subtraction (Sandro) and optimizing error calculation on average of D0,D+,D*+ correlations

- load TRD on-line gain tables together with TRAP configuration

remove unnecessary AliEmcalJet include

Update of Tab values and uncertainties

Updates of pPb systematics (pPb crew)

Adding different ways to extract the systematic uncertainties from the envelopes, allowing for flat assumption (1/sqrt(3) from max spread), smoothing, and averaging (0.pi) and (pi,2pi).

Adding using::std...

Restore optimization

Merge branch 'master' into TPCdev

Conflicts:
PWGPP/CalibMacros/CPass0/runCPass0.sh

Revert "Streamer level can be specified by the static function fro AliTRDreconstructor"

This reverts commit d0177bb64755aa2321c9652eb9bebbbc070998d8.

Revert "IsDebugStreaming using static function"

This reverts commit 1ba0214675e9bd40f7cd8c428f46c6129e9b235b.

Optimizing the seeding combinatorics

- modified AddTasks for pp

updates from Ashutosh  for pion femtoscopy analysis

fill corresponding pt hard bin, bug fix

adding color reconnection option for Pythia6 generator (from Leticia Cunqueiro Mendez <leticia.cunqueiro.mendez@cern.ch>):
- cr=1: standard perugia tunes with CR are called.
- cr=0: the corresponding retuned versions w/o CR are called.

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Bool_t AliMCEvent::GetCocktailGenerator(Int_t index,TClonesArray *arrayMC,TString &nameGen)
if(kFALSE) no cocktail header was found
if(kTRUE) it returns the name of the generator for particle with label index (or for it's mother)

Leticia Cunqueiro

A skeleton of the "cooked covariance" standalone tracker

changes to be able to run on train:
- PID only switched on for non MC truth
- output file = AnalysisResults.root

Little numerical protection

Modifications needed to use EXODUS Decayer
Irem Erdemir

AliDecayerExodus based on EXODUS code
Irem Edemir
Ralf Averbeck

Typo

Avoid conflict with global enum in Root6

Adding ANALYSIS

Changes to compile with Root6 on macosx64

 moved some files, added generator function to addtask macro

update from Prabhat

Possibility to get the rotation angle of cluster's reference plane

Bug fix

Added histograms for the centrality bias.

new code: Chiral Magnetic Wave analysis (from Ron Belmont)

Fixing typo (Jitendra)

Adding description

Removing comment

Improving comments and specifying author of the analyses (S. Bjelogrlic, F. Colamaria, S. Kar, J. Kumar)

Classes for:
- subtraction of feed-down for D-hadron angular correlations
- average of D-hadron angular correlations

Values for correlations in pp collisions for D+ and for D0 and D* for pt(assoc)>0.5,1 GeV/c added.
Correct values for correlations in p-Pb for all mesons.

protection

add bookkeeping for on-the-fly pythia events

add xsec from header

 minor cosmetics

 moved files

 cleanup: remove unused classes and dependencies

fix file location for distributed computing

Little fix in counting good reconstructed tracks

- changes in AddTask requested by Lucia

- changes by Jason for his AddTask

Commented out unused TProfile

Fix triggering for ESDs (Enrico)

Using defaults2011 cuts for pions from SigmaStar + new monitors added (Enrico)

New types added (kV0Radius, kV0Mass, kV0P, kV0Pt) needed for V0 monitoring (Enrico)

Added cut on fiducial volume + fix cosine pointing angle for AODv0

Macros update (by Massimo)

From Massimo:added check on feed-down for MC for low-pT D0 (only b->c feeddown so far)

putting the exotic test into one function. Including QA cluster removing exotics

fix warnings

increase ClassDef

Exclude non-Hijing particles in PWG4HighPtSpectra Task and minor changes

fix mem leak. Open all files

PWG4HighPtSpectra Task compatible with AOD analysis and added to the TrackQA AOD Task

New cut for No psipair added

phi correction from Evgeny

Coverity 22681

Coverity 22682

Coverity 22683

Charged jets (pPb): Different default background method

minor fix

Cellular Automaton based SA tracker - first skeleton

 Cellular Automaton based SA tracker - first skeleton

Fixes for wrong use of const causing PW.CAST_TO_QUALIFIED_TYPE defect in Coverity

Fixes for wrong use of const causing PW.CAST_TO_QUALIFIED_TYPE defect in Coverity

Removing additional 0MQ dependency