Update on trigger code (Rachid)

Fixing warnings

update by Simone Schuchmann

Fix missing variable

Update the Tag system classes. Reduce memory footprint. Add information from RCT

New VZERO tender supply which can be used in order to correct for the LHC clock phase in case the last is not applied during the time of the reconstruction.

Impementation of the validation
(Jacek)

Bug fix - Dummy copy constructor as a private function

Marian

If merging is complete, the method CheckMerging will delete also the zip archives for previous stages only.

Adding setter for z alignment (Marian)

Two minor bugfixes

Fixed selection of events by default if no offline trigger selection was requested by the task.

Sign of L1phase changed

AliAnaPi0EbE:Add histograms with pi0 background and shower shape of selected pairs, modify train macro with PHOS updated cuts

array bound warnings are removed

 version number

 Removed += and -+ from ESDfriends filling. Due to executing FillESD 2 times += gives wrong results.

Bug fix

First MB calibration object for 1.38 TeV

15 minutes interval for calculation of drift correction
Store the fit value of the laser calibration event by event

(Marian)

Adding more jet finders to fragmentation task, adding correct retrieval of number of trias

Changing the list of chunks used to validate

correct inverse momentum histograms, just weight no entry, add new parameters to print and cuts folder

Warning removal

solving https://savannah.cern.ch/bugs/?72266 by introducing a map
of dependencies for HLT component libraries in the AliHLTComponentHandler
this issues needs to solved later in a generic way, either generating this
dependency map automatically, or including dependencies in the linker also
in the aliroot build system.

Added GetCurrentRun(). This is filled correctly in the remote analysis during merging.

adjust sample macros to the newest changes: disable MultFinder
set GRP specific storage according to test bench layouts

bugfix: adjust memory page size between 50 and 500 MByte, correcting warning
solves https://savannah.cern.ch/bugs/?72239

Update good runs lists, added LHC10d

Fixes against warnings

Correcting  warning: array subscript is above array bounds for Kinks

Fix compiler warning (=operator)

Fix compiler warning (=operator)

Fix compiler warning (=operator)

Removed small bug in doxy comments

Merge branch 'QAdevel'

* QAdevel:
  Updated EMCAL analysis task with constructor
  Added support for EMCAL on grid
  -Added separeate dXY and dZ histograms

AliAnaPi0: Added option to fill mass histograms with different cuts
AliCaloPID: PHOS shower shape selection updated, matching of tracks checking method moved from AliAnaPartCorrBase to this class
Few COVERITY bad reports corrected.

Fixing error on gcc 4.5.1

- add decoding of GTU tracks
- add methods to set arrays for storage of tracklets, GTU tracks and markers
- add storing of HC active markers (if activated)

- update AliTRDtrackletMCM to carry 3 labels and assign them in AliTRDmcmSim
- bugfix in AliTRDtrackletMCM::GetLocalZ(), was wrong for stack 2
- retrieve layer-specific position LUT (as given in TRAPconfig)

Compilation warning

Increased size of arrays for container

-Added separeate dXY and dZ histograms
-Removed dR histogram

compilation warnings

Add Fatal in case the EMCAL supermodule or tower indexes are negative, clean up the class from commented code

Moving CounterCollection class to PWG3/base (Gines)

COVERITY reports many FORWARD_NULL, corrected; AliEMCALv2: initialization of fHits array and deletion alredy done in mother class

New dependancy introduced into libAliHLTUtil.so

updates for running with plugin

Corrections for reconnection of event in case of event mixing.

HLT TRD bugfix: correct calculation of the total charge of the cluster (Theo)

Fixes for Coverity reports

Correct leak in AliCaloCalibPedestal

Introduction of the LTU config class.

Coverty fixes in AliTPCCorrection
plus the extension of AliTPCFCVoltError3D to also model an copper rod shift on the IFC

Added protection, fixed dynamic cast

Fix of minor issues, which were discovered by Coverty
plus fix of coding violations

Removed obsolete warning

AliAnaPi0: remove print, AliCaloUtils: in case of usage of MC reader, need to get the PHOS module number via the TParticle and not the created VCluster

Changing the /tmp directory pointing to the sanbox earlier in the generated analysis macro.

Filtering away BX 11 and 2834 for run range 130148-130375 and changed the way the string for trigger classes after aug2010 is produced

Fixes for not filled histograms and calculation of Dijet binning

First version of a class to correct for 3D Space Charges

Warning fixed, thanks  Cvetan

Correct MCReader: do not fill created AODCaloClusters to AODEvent
AliAnaPhoton: Use cell cut only for data, not for MC data
All: Remove declaration, usage of AliAODCaloClusters and move to AliVClusters
AliCaloTrackESD/AODReader: Clean up a bit the classes, move the track status initizalization to the AliCaloTrackReader
Declare as virtual in AliCaloTrackReader some setters only used in AliCaloTrackMCReader

Reverting partially revision 42389. The absolute path is needed by the DA compilation.

swapping order of checks: valid entry/ valid object inside the entry

Reduced number of debug messages

Fixed typo

fix branch name

error fixed

Cannot remove the zip for the last merged stage.

fix coverty report

fix coverty report

fixing some minor coverty reports

Fixing some problems reported by Coverity

added option for variable binning depending on the dataset for high pt QA and spectra task

fixed variable name

Fixed few minor coverity issues. Output files are opened the first time with the option RECREATE and only after with UPDATE. Outputs in memory are nor written in proof mode to a file anymore.

Adding histogram for bookkeeping of the number of events that do not pass event cuts on top of physics selection

Macros for running Et analysis

Update variable description file
Marian

AliTPCcalibDButil and Summary text:
Extract occupancy, Qmax, and Qtot per sector from QA OCDB entry.

Peter Christiansen

Fix to restore functionality.
Will request port to close bug 69989.

Peter Christiansen

Corrected hopefully a bug which causes problem with variable-size HNSPARSE

Made the aliRsnValue in a way that allows to inherit from it and implement custom values

Removed old files with old QA output (AliTPCdataQA object). Added new file
with validity for all runs with reference histograms.
Will request port to close bug 69379.

Peter Christiansen

Removed old files with old QA output (AliTPCdataQA object). Added new file
with validity for all runs with reference histograms.
Will request port to close bug 69379.

Peter Christiansen

totEt updates from Christine

Correct initialization of static variable

Cleanup also intermediate .zip files during merging.

Add MC config for fragmentation task

Bastian Bathen:

* changed Configuration with new jet branch for gen

* New function UsePhysicsSelection(Bool_t):
Allows to ignore the physics selection (argument kFALSE), by default the physics selection is used. Since our task expects the physics selection running we were not able to switch it off so far.

* new histograms:
 - mean cross section (fh1Xsec) and sum of number of trials (fh1Trials) (both for weight of pt hard bins)
 - pt hard

* new function Notify() (copy from AliAnalysisTaskJetSpectrum):
 - is automatically called by analysis manager
 - fills fh1Xsec and fh1Trials

* change of (default) binning of some histograms, especially pt range (please check if new range is fine, I also modified ranges of IJ and DJ histograms)

* made the track and jet type constants ( enum{kTrackUndef=0, ...} ) public
(Since the constants were private in previous implementions they were not known in the AddTask. I do not understand why this problem did not occur earlier.)

Warning fixes and minor update on IFC radius to render the 18-manifold

Adding new data block type for trigger counters.

Adding corruption component used for testing processing component behaviour under data corruption.
Used to have various custom ways of performing such tests. Now the corruption component can be used to test all components in the same way.

afterburner

Fixes (Chiara)

Added a getter

Reverting revision 43247.