With Magali: improve handling of static data members with frame and palette data.

Fixing bug in AliHLTRunSummary and AliHLTEventSummary, need to have version number in CalssDef non-zero to propagate the objects through an HLT chain properly.
Fixing bug in AliHLTGlobalTriggerComponent to generate correctly trigger menu evaluation logic for trailing operators.
Fixing AliHLTGlobalTriggerWrapper to catch CINT errors correctly.
Fixing bug removing registrations in AliHLTConfiguration.
Adding more documentation.

GPU framework update from David Rohr

Fix needed to correct compilation warning

output data type was not properly set

Make copy of temperature array before adding to CE array

protection for module number against crash in QAMaker

Suppressed setting the Bfield to NULL in the post-reconstruction cleanup.

Atlas Tune MC09 added.

* AliEveEMCALSModule
  - Remove palette management that was cut-n-pasted from TPC code and
    was not used in EMCAL code at all.
  - Comment out manual destruction of (shared!) reference counted objects.
    This needs to be improved further as static objects seem to be used
    in a wrong way.

* AliEveEMCALData
  - Reduce debug output, set debug to 0 by default.
  - Do not delete AliEMCAL object - it is deleted by run-loader.

ESD friend is deleted together with ESD tree - do not deleti it directly in Close().

From Magali: small modifications.

Build reco and log dir if needed

missing file

Adding config for acr caf

activating initialization of Streamer Info from the OCDB

Reverting previous change

move production scripts out of test

move production scripts out of test

segmentation fault in daq machine is fixed

Obsolete macros

Obsolete macros

Obsolete macros

Obsolete macros

correct initialization warnings (fca)

updae of the GPU framework

Use of .so libs instead than .dylib

Bug fix.

The ratio filled in the opposite way - Max and Tot exchanged.

(Marian)

data transport between the tracker and the merger is optimized

one more change (from P.Ganoti pganoti@phys.uoa.gr)

mrst pdfs restored.

- Signature if CompVtx changed
- direct comparison of floatwith 0. corrected.
Romita Rossella

TOF/AliTOFDigitMap.h -- make enum {kMaxDigitsPerPad = 10 }; public as this constant also needs to be known in EVE. EVE/EveDet/AliEveTOFDigitsInfo.cxx -- use kMaxDigitsPerPad instead of hard-coded value 3 (which was wrong after a change to 10 in liTOFDigitMap) (Matevz)

Fixing doxygen warnings

change of a range of a histogram

Updating doc

change a default cut

Pi0 histogram range changed

Pi0 finder added

hard-coded cuts are moved to the parameter set

final plotting macros

Add protection for missing pressure sensors

changes related to PWG1 train and small cleaning (A. Bercuci)

vertex finder moved from GlobalESDConverter to a separate component GlobalVertexer
It has to be called after the ESD converter
The component produces primary vertex histograms

fix compilation

fix BxByBz - testing

better ESD performance plot

fix compilation mismatches in the new framework

Process kPyMbAtlasTuneMC09 added

Fix in LoadCTPTimeParamsCDB() (Plamen)

QA for shifters revisited - Custom object removed

Changed logging level

Init event before deleting it !

Add example of how to assign lines to a module.

Oups. We probably do not want the memory leak checks part of the production version

Fixing a serious memory leak

Limited printout

Extended the set of deltaAOD jets and added general SISCONE config

copy TRD performance train to PWG1

Release the error coming from HLT

New class for SSD QA checker (Panos)

 added high p_T track cut, standard loose cuts + ITSRefit

Protection reinforced

Added setter for jet "radius" in DA

AliAnaCalorimeterQA: add PWG1 validation train wagon, remove prints on screen, implement a switch for the plots made in Terminate

add pid comparison macro

* Adding explicit priority settings for the global trigger menu items.
  This allows one to form priority groups which allows trigger menus to be operated in 3 modes:
  1) The trigger menu is evaluated until the first entry matches the trigger condition and further evaluation is stopped.
  2) All entries in the trigger menu are evaluated.
  3) A mixture of the above two extremes.
  A default merging operator for the trigger condition and domain merging expressions can now be specified in the trigger menu.
  In addition, one can add trailing operators to the trigger condition and domain merging expressions,
  which are used implicitly to concatenate sub-expressions from each trigger menu for case 2 and 3 above.
  This gives more flexibility than just having a default merging operator.
* Had to significantly change how the generated trigger logic is loaded, in particular to be able to use CINT to interpret the code.
  Got rid of the class factory concept in AliHLTGlobalTrigger and simplified the class.
  This was necessary because the factory concept did not want to work with CINT.
  Had to add the AliHLTGlobalTriggerWrapper class which interfaces between compiled code and an interpreted AliHLTGlobalTrigger class.
* Interpreting of trigger menu logic rather than on the fly compilation now works (however compilation is default for speed).
* Adding proper unit tests for the global trigger component in testGlobalTriggerComponent.C
* Added a comparison operator to the AliHLTTriggerDomain that can be used to compare if two domains are equivalent.
* Also improved the class documentation.

Fix coding violations

Fixing bug in destruction of global instance.

Rulechecker-complying update from P.Ganoti (pganoti@phys.uoa.gr)

Possibility to read as input the AOD that was just created from the ESD, in the same train

Added method to add a default set of jet fidners for a deltaAOD

Fix compiler warning

change clashing names

warning fix

new performance graph for energy loss in different TRD layers

Adding GRP/CTP/CTPtiming OCDB entry in AliRoot, from the file
used to generate the dummy one.

move trending variables from ASCII to binary (TList) (Federico
suggestion)
minimize number of output debug files to only one
TRD.DebugPerformance.root. reorganize debug printouts/data

Bug fix

Creating the detector-specific subdirectories

AliCTPTimeParams added (Plamen,Cvetan)

Updating dummy file for CTPtime params, and file used in the nightly tests
(Plamen).

function to create the standard jets added

account for limits of thrust variable (Sona)

Fix for the merged xml file name to be copied in alien in case of individual run numbers input (J.Castillo)

major updates to plotting macros

Bug fix: the TObjArray of input objects was not properly cleaned, because GetEntries() returns the number of non-zero pointers, not the array
size. Now this is changed to GetEntriesFast().

Fixed bug in NoCutV0s and moved the xy calculation to correct place

OCDB map, OCDB file list and Bz written to UserInfo of spTree

Fixing compilation warnings

GPU update from David Rohr

Store list of fired trigger classes.

Adding a fast parametric fitter

PreReading of MC information on demand.

Warnings...

coding violations fix (changed naming, added comments, made methods const)

Warning corrected.

Updating Strange tasks (by H.Ricaud, hricaud@gsi.de)

In AliMUONTriggerQADataMakerRec:
Adding missing comments.
(Diego)

Warning corrected