Adding missing HLT .pkg in dependency

macro for plotting MC rates for PPR

Adding functionality to retrieve logbook_trigger_config.alignmentFile from
daq logbook. Analogous method added for the Test Setup.

Printout fixed.

Bug #56232: Providing access to the altro channel payload size as requested by PHOS HLT.

Technical fix: reducing the virtual memory consumption

Usage of all components of mag field
in the track propagation
(Marian)

Update from Mikolaj: make class sortable + small updates.

Task for offline calibration CALIBRATION_EMD runs

Several updates in implementation of pileup algo 2 (F. Prino) + fine tuning of the parameters of pileup algo 2 (G. M. Innocenti)

Update of B->Jpsi->ee analysis classes

fill trials in the event loop to avoid wrong numbers on proof

Phys DA with variable number of reference PMT

update P/Pt resolution plots for trending

Bugfix, fixed memory leaks.
Added functionality to run CF through commandline

- removed wrong cluster coordinate transformation (x,y,z) back to row, pad, time.

with new EMCAL pid, relax default p/E max from 1.1 to 1.2

changes to EMCAL pid, fix bug in MC conversion plots as well as add a few for QA purposes

AliTPCcalibDB.cxx AliTPCcalibDB.h         - spline fit creation
AliTPCcalibDButil.cxx AliTPCcalibDButil.h - adding more robust oultyer removal algorithm. + alternative CreatePadTime0
CalibMacros/CalibEnv.C                    - cleaning of the macro
                                          - adding pad gain
                                          - restructuring of the loops

A bulk of changes to calculate statistical values corresponding to
DCS DPs according to the number of values ('nentries', hereafter)
falling in the time interval [DAQ_time_start, DAQ_time_end]:

- if (nentries > 1): considering only them
- if (nentries = 1): considering the only entry in this interval, plus
 the measurement immediately before DAQ_time_start
- if (nentries = 0): considering only the entry immediately before DAQ_start_time
and the one immediately after DAQ_time_end

Adding dump and analysis of syswatch logs
(Marian)

Adding ranges <startRun, endRun>
for scan as optional parameters.
(Marian)

Extending trobleshouting part
(Marian)

1. Extended documantation.
2. Check of the environment script.
   Presence of aliroot. Read write access ...
(Marian Ivanov)

Classes for CTP time parameters added (Plamen)

filling of mc info from stack or AliAODMCParticles updated

Fix in path for simulated files + typo fixed.

saving updates: new histograms for IPSig tagging and EMCAL only histogram

Obsolete mapping objects removed

Updating macro to test GRP preprocessor with new input files.
Adding possibility to check behaviour when L3 polarity changes.

Reverting rev. 35427 and 35428 until new classes are committed
in SVN.

Bug#56740: Fix related to socket timeout in case of longer raw-data runs.

Classes for CTP time parameters (Plamen)

Classes for CTP time parameters (Plamen)

Corrected directory name for the root archive file registered in a dataset in PROOF mode. #if should be removed as soon as we switch to v5-25-02 or latter root release.

typo corrected

Adding a method for the pileup tagging using SPD (Sadhana, Francesco, Massimo).

updates for selecting a specific electron cut set

split parts of CalibAbs off into new class CalibReference

redefine pt range and remove two cuts from configuration

obtain the number of trials on event by event basis from the header and not in notify from external file, the latter caused a problem when running on proof since Notify  an be called more than once per file

infrared save clusterizer

Including MUON/mapping directory for the generation of the PWG3/muondep library via a par file (Gines)

Change name of output containers depending on flag

- copy constructor and assignment operator implemented.
- printout added for ProcessTOFTriggerData - specifying it is a fake one for the time being.

Fix: In case the function to process trigger data for a certain detector
has not yet been implemented, but the detector is in the trigger mask, using an empty one.

Moving changes in AliTestShuttle.cxx/h in $ALICE_ROOT/SHUTTLE/TestShuttle

Fix in pileup algo 0 (F. Prino)

adjusting the statistics printout to the new evaluation scheme of the HLTGlobalTrigger menu

applying a temporary solution for a new processing scheme of trigger menu items
all items are evaluated, both decision and domain is or'ed
This implementation fits teh current requirements, there will be a proper implementation in the future.

appying a first patch to allow the '-' character in trigger symbols. This is not
according to C++ conventions, but is a wish to use the names of CTP classes directly.
Later on this execption will be restricted to predefined symbols.

put defaults back to ESD and showing stats

Added two missing includes to allow macro compilation (thanks to Laurent for remarking it).

Added several set methods and some minor corrections for testing fast
fitting procedure

improved mult cuts for POI

Reseting the MC label to a default value of -1 before evaluating them (Philippe P., Roberta)

Invert bits in regional response according to hardware

Analysis of muon and dimuon kinematical distribution for the official analysis train ESD->AOD (Roberta)

Add default value for tracklet line width argument.

Generation of muon filtered AOD files from standard AOD files (Roberta)

Update of Single Muon analysis to be included in the official ESD->AOD analysis train (Diego)

Update of Single Muon analysis to be included in the official ESD->AOD analysis train (Diego)

updated errors

fix compilation warnings (Markus Heide)

Added extra histograms and some functions to fill them. (Ana)

Using AliExternalTrackParam::PropagateBxByBz(). Savannah bug 55857. (A.Dainese)

New version of SPD tracklet visualization.
Each tracklet is represented by an individual Eve element.
Somewhat preliminary - requires input from Domenico.

Reverting commit 35237, it causes crash in the reconstruction of simulated data

Technical fix: reducing the virtual memory consumption

Missing protection added.

Visualization scripts (Jens Wiechula)

Adding helper macros for calibration visualization
(Jens Wiechula)

Class version increased.

Better handling of preferred storage

Small fixes

-fixing typo in libAliHLTTPC.pkg

- fixing wrong naming in class
- adding files to build system

Small change in filling weights for consistency with D0Mass task (Chiara B)

Added possibility to read like-sign pairs (Chiara B)

== instead of & gives more flexibility

It sets the existing but unused before AliAODHeader::fMuonMagFieldScale
by the value from the updated AliESDRun.
 Ruben Shahoyan <ruben.shahoyan@cern.ch>

Remove extra comma gcc 3.4 does not like

Adding configuration for Trigger in the test setup.

Upgrading mchview with new features :

- adding Status and StatusMap as possible sources (from OCDB)
- adding one convenience computed dimension for the Gains (=1/a1/0.2 in mV/fC)
- adding --de and --chamber options to start the display on a given part of the detector, instead of the global view of all the chambers
- chamberId in the text label is now starting at 1, to avoid confusing (as anywhere else we're used to start at 1 when naming those chambers)

Also fix a bug for the contour computation (AliMUONContourMaker), and reorganized it a bit (AliMUONContourHandler, AliMUONPainterHelper)

Replacements of "new AliMagF(..." with accessing field
via AliGRPManager - Savannah bugs 56450
(Alessandro)

Forgotten files from the last commit

- refactoring code to CALO library (Per Thomas)
- bug fixes (Per Thomas)

Eliminating gsi specific lines
Also from examples
(Marian)

Fix.

Updating the RecPoints QA to detect more easily illegitimate mono-cathode clusters

Bug #55488 (Technical fix): Resizing of the event info tab so that one can see all the lines.

Changing the number of lines in the DAQ logbook_shuttle table
(was reset to the old value by mistake in the latest commit).

Cosmetics

EMCAL specific shared memory interface

Default constructor needed by the plugin manager

- added histograms for track multiplicity, multiplicity averaged over a certain number of events and energy deposition as a function of p (Zhongbao Yin)
- added function for calculating track length (needed for the latter histogram)
- the cluster residuals still take bizarre values, the respective function needs further investigation or even replacement by the offline one

update calibration macros

Autorun functionality added (Matevz)

Autorun functionality added (Matevz)

gpu patch