Bugfix to use cylindrical coordinates consitently (in Marian creation of the residual maps)

bugfix: arguments have been skipped by accident

make method const, as it does not change the object

fix for mac

Implemented subproject division

revert changes in CookdEdx to rev 42826 until Markus Heide and Matus Kalisky
determine the best way to calculate PID raw signals

fix codding convention (Markus)

update for modifications in AliTRDpwg1Helper

correct overloading SetMCReactionPlaneAngle

cleanup of obsolete code

fixing of warnings and adding a custom NSD trigger

fix codding conventions (Markus)

delte emty dir

cleanup of structure

Added a cut to select physical primaries in a simple way when analyzing MC

cleanup

fix codding conventions. Still to be done:
info/AliTRDv0Info.viol  : 11
AliTRDcheckDET.viol  : 3
AliTRDcheckESD.viol  : 12
AliTRDpidRefMakerNN.viol  : 6

examples and documentation

RecoParam limits were not taken into account (Matthieu)

CombineSpectra: added systematic errors are function to draw them
AliBWTools: improvements to Combine3Histos + 2 new helper functions needed to handle systematics

The previous commit 43117 was done by Stefan. This is a test commit to see if everything is OK now

AliTPCCorrection.h             ... additional funtionality to deal with 3D problem (e.g. 3D-poisson solver) + calculation of dz distortions
AliTPCCorrection.cxx ... additional funtionality to deal with 3D problem (e.g. 3D-poisson solver) + calculation of dz distortions

AliTPCInverseCorrection.cxx     ... updated desctructor
AliTPCComposedCorrection.cxx    ... updated destructor and additional protectections

AliTPCBoundaryVoltError.h       ... minor bugfix plus calculation of z distortions due to E field changes
AliTPCBoundaryVoltError.cxx     ... minor bugfix plus calculation of z distortions due to E field changes
AliTPCGGVoltError.cxx

AliTPCFCVoltError3D.h           ... new class to calculate distortions due to Field cage imperfections (e.g ROD movements)
AliTPCFCVoltError3D.cxx     ... new class to calculate distortions due to Field cage imperfections (e.g ROD movements)
AliTPCROCVoltError3D.h ... new class to calculate distortions due to ReadOut chamber misalignments in z
AliTPCROCVoltError3D.cxx ... new class to calculate distortions due to ReadOut chamber misalignments in z
AliTPCSpaceCharge.h ... new class to calculate distortions due to a fixed 2D Space Charge distribution
AliTPCSpaceCharge.cxx ... new class to calculate distortions due to a fixed 2D Space Charge distribution

Calib/maps ... new folder for lookup tables (e.g. ROC z misalignments)
Calib/maps/TPCROCdzSurvey.root ... Look up table for ROC z misalignments (taken from survey in 2006)

TPCbaseLinkDef.h ... included the new classes (see above)
libTPCbase.pkg ... included the new classes (see above)
AliTPCcalibAlign.cxx            ... corrected warning

Adding option to skip leading tracks in randomized events

Fix compiler warnings

Adding an extra spectrum analysis to compare two fast jet outputs (cluster and AliFastJetFinder)

Adding an extra spectrum analysis to compare two fast jet outputs (cluster and AliFastJetFinder), extra track cut with rel. error on 1/p_T

declaring member functions const

bugfix: handle arguments having only whitespaces

- adding FileWriter option to write a configuration file for FilePublisher
- enhanced argument scan in FilePublisher, option '-datafilelist' implemented

Disabling default rootification of MUON HLT raw data.

- adding new print mode for DataType2Text and some documentation
- extending ConfigureFromArgumentString to handle newlines and quoted arguments

AliTPCAnalysisTaskcalib.cxx - Disable creation of debug streamers (Jacek)
AliTPCcalibDB.cxx           - a) Use ITS only if close measurement in time
                            - b) use global y gradient of vd from ITS if available
AliTPCcalibDButil.cxx       - a) Accept one entry graphs
                              b) Filtering onli in case of suficient number of points
AliTPCcalibTime.cxx         - using average time as a reference time
AliTPCTransform.cxx         - a) caching of the global y gradient of drift velocity
                            - b) disabling pad time 0 correction
CalibViewer:

AliTPCcalibSummary.cxx      - Adding attachment to trend graphs
                            - Use constant for eval outside of range

AliTPCcalibAlign.cxx        - increase the error for edge clusters
AliTPCkalmanAlign.h AliTPCkalmanAlign.cxx - update of matrix with one measurement

two more example macros, which will be described in the documentation

avoid warning '... has a non-virtual destructor' for data structures designated for data exchange (thanks to Constantin)

avoid warning '... has a non-virtual destructor' for data structures designated for data exchange (thanks to Constantin)

Out of boundaries error fix

Added a ResetStats in the Reset method

fixing warnings

update to AliTRDpwg1Helper class by Markus

another codechecker warning fixed

fixed warnings

fixed warning

fix use of enum

fixes warnings

Added TOBject::SetObjectStat(kFALSE); on workers.

Fixed warning

correcting compilation warning

correcting typo

fix warnings

Tweaks

restoring bachward compatibility for r42837

restoring bachward compatibility for r42844

restoring bachward compatibility for r42844

adding checks for availability of r42844 (AliESDcaloCluster) and r42837 (AliTRDclusterizer)

enable component substitution
replace a component of the chain configuration by another component and corresponding component arguments
useful to write the input of components to files for subsequent stand-alone studies

Suppressed root warnings from HLT.

move general OCDB services to the level of AliTRDinfoGen
1. geometry initialization
2. reco param initialization according to event species

make reconstructor and geometry publicly availbale from the level of
AliTRDinfoGen thus avoiding recreation of same objects in memory

fix a small memory leak

- adding AliHLTRecoParamHandler to link def

- adding some logging

- fixing bug in application of gain calibration

- adding some logging

- adding some logging

- adding check that digits contain data from HG channel, if not
we might get high energy clusters from noisy LG channels

Changing definition of neighbour to also include digits with
only a shared corner

- Adding check and flagging for HG present

- adding a flag for whether a the crystal contained signal from
  from a high gain channel. Necessary to remove noise from LG

bug fix

correcting compilation warnings, enable keyword substitution

adding functionality for component substitution

declaring member function const

Cmake generated makefiles are now silent. If u need to see verbose output type make VERBOSE=1

more text

documented a simple example

example macro how to make flowevent and run two flow methods

added directory which holds small examples macros

suppressed ROOT warnings while building

cleanup

Fixed a bug which caused build to fail on systems with DATE installed

modified ctor

count the events skipped due to vertex requirement, AddTaskJetSpectrum2: different background branch, AddTaskJets set minimum p_T of 150 MeV, Train: Adding the LeadinUE task

Enable writing of a AOD cluster branch (of tpe AliAODJet) with track references, added tresholds and switches for writing. Default is no writing

removing unused variable fPtCut to avoid confusion, same is uses in the ReaderHeader

Correction.

From M.Knichel: I have reduced the output size of TPC QA to well below 100 MByte and
tested it (running the train + merging).

Adding energy object to reenable FMD analysis in QA train

Making background map generation more compatible with phojet

setters for tasks which limit the multiplicity of events, which are used in comparison of different trigger settings.

additional sub task using global tracks with a high multiplicity trigger AliVEvent::kHighMult instead of min bias trigger, additional histograms for comparison at different pt bins

different binning

setting some defaults

Attemting bug fix, again

Changes to allow the Shuttle preprocessor understand it should not fail for too short physics runs

protect for invalid detector numbers

remove printf

Attemting bug fix, again

Fix for bug #71737 DELETE_ARRAY reported by Coverity

Updated cmake readme file

Fixes for report #71652 BAD_FREE reported by Coverity

Fixed some bugs with cmakelists. Added more tests.

fix steering of (all) individual TRD tasks by AddTrainPerformanceTRD.C