add jet shape analysis classes

load AddTaskEmcalJet.C

print cuts for debugging

Adding FJ3 functionality:
    - AliFJWrapper: interface to generic and constituent subtractor
    - AliEmcalJetTask: flags to execute generic and constituent subtractor if requested + writing info to event and/or AliEmcalJet
    - AliEmcalJet: variables for generic subtraction method (derivatives and subtracted jet shape) -> only implemented for jet mass
    - AliJetShape: jet shape object inheriting from FunctionFromPseudoJet -> only implemented jet mass (AliJetShapeMass)

add FJ3 subtractors from contrib functionality

add pyquen quenching strength

Changing range of histograms for 2011 data and making histograms I think are unused have fewer bins, later will go back and try to remove unused histograms but this needs to be done carefully

overwrite existing files when unzipping archives

another fix to implementation of 2011 geometry

removing debugging statement

non-jet-events TH2F replaced by THnSparse

fix unzipping

Update from Satyajit

Extra variables for cascade task: exploration/debugging

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Coverity fixes

Added virtual methods to AliVEvent AliVHeader for AOD/ESD interface uniformity

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

PHOS code for automatic trending of QA data.

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Added energy loss fits for a large fraction of LHC10h
as well as some for LHC13b and f.  Also energy loss fits for
single runs in pp @ 900, 2760 (LHC13g), 7000, and 8000GeV.

Secondary map from 118506 (pp @ 900GeV) from latest simulation
(LHC14c1b) added and copied to other systems (runNo==0).

New start time: Fri, 20 Jun 2014 12:03:00 (GMT)

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

HigherMoment task from satyajit

- Load dedicated splines (and also more appropriate MC splines) for LHC12g, LHC12i (and LHC12j)

o Add temporary splines for LHC12b-d anchored MC o Add first splines for LHC12h and LH12i pass1 (Benjamin)

o revert changes to previous version -> Wrong commit to TRDPIDResponse.root instead of TPCPIDResponse.root

Update from Prabhat

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Small changes

Made timing conditional on pre-processor symbol TIMING

Coverity fixes

Use TApplication instead of TGApplication

New Config Macro to the train (many parameters to set avaliable)

changes to function calculating Pair Fractions

add distance to bad channel cut as input parameter

Putting back accidentally removed lines.

add track matching residual cut to the list of parameters

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Added missing file

Fix event server's preferences. Now, it reads them correctly from $ALICE_ROOT/MONITOR/

Added support for dylib in test mode

Fix event server's preferences. Now, it reads them correctly from /home/alieve/alice/trunk-git/MONITOR/

Fixing anti-aliasing problem on MacOSX

 minor interface fixes and additions

 jet v2 analysis : give user control over random seed in toy mc event generator (default is determining it from TUUID)

 moving and extending documentation source

 new macro to accompany the flow package manual: out of the box example of local pion v2 analysis

 cleanup of flow package documentation

 restore accientally removed macro

- changes to the Material budget, resolution and QA code
  QA code modified to deal correctly with track mult in AODs
  Material & Resolution task changed to contain the track mult in the photon tree as well

Modified EveBase to compile with zmq<3.0. Corrected ThreadedSocket implementation.

Coverity warning during the compilation

RelVal: defaults now to a non-volatile directory

Update from Nirbhay Higher Moment Study

Fix to the V1 geometry

fixing logic error in modification of hadronic correction

remove 100 GeV/c track cut in jet spectra task (the cut can be applied afterwards on the THnSparse)

fix compilation warnings

MPD signals with pile-up

MPD signals with pile-up

bugfix IsRCinJC, init for isRCoutJC, implementation of cocktail splitting for La and ALa particles

setting things up to look at 2011 data including cutting added signals from MC

removing cout statement

Fix compilation warnings

Fix compilation warnings

Wrong ACORDE aliases fixed

removing the remaining class of Xiangrong's deprecated task

- changes by Annika concerning the shift in eta for pPb

removing old Xiangrong's task (unused and "coverity active")

Smearing for the virtual photons, new e+e- histos added

Commit for Simone
 - Change of binning

Include cubic interpolator option

Include cubic interpolator option, fix Rcoh=Rch weighting

ATO-1, ATO-47 added protection against incomplete input files
                                              fixed copy & paste bug, now correct setting of all variables
                                              removed obsolete variables
(Theo)

improved GenEventHeader() method in case of AOD

coverity fixes - Part II

coverity fixes - Part I (compilation warnings: set but not used)

Remove typo

coverity warning fixed - HigherMoment Task from Nirbhay

Update from Prabhat : Dpt-Dpt Corr

fix coverity 24307 and change some prints by AliFatal or AliInfo

Reading of Cross-section and Trials Fixed

change axis title style to italics

remove unnecessary conversion from rad to degree, add histogram filling primary phi

remove unnecessary conversion from rad to degree

change axis title style to italics

comment out unused variable

change wrong histogram name setting

change title lable style to italics

comment out unused variable

comment out unused variable

remove unused variable

use unused absID to check the goodness of the cell finding

update passing of settings

coverity fixes

Added THn for eta-phi debbuging

Enable TouchFile for empty SHUTTLE_DONE AliEn dir too.

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Warnigs fixed

fix variable filling AOD