Update the PHOS ideal alignment

Update timestamps for new amanda simulation

PHOS run2 geometry with CPV updated

Updated macros for PHOS alignment calculation

Update by Raphaelle for missing objects

ZDC added as number 15

CPV DA for mad channel map calculation (S.Evdokimov)

CPV DA updates (S.Evdokimov)

accept tracks in DCal acceptance for cluster-track matching

ALIROOT-5780 - Add comments about which OCDB entries are required in the two involved functions - Add more verbose information in case chamber or parts of chambers are deactivated with hints what to check - Change default behaviour of the active state testing to true in case no scaler information are present

ALIROOT-5780 o Check that scaler time is withing the GRP start and stop time - issue warning and skip o Display info massage if bad HV detected for a ROC o Issue Fatal in case ALL ROCs would be dactivated o Add info massages if chamber was deactivated o Add info massages how many channels per chamber were deactivated

Fixes for FMD DAs

Add macro for local gain table OCDB entry

Add AD CDB objects

Apply some little cosmetic modification to some AD/macros/Make*.C
Use the same macros to (re)generate the corresponding objects.

Moving misalignment macro to AD/macros

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

Fixs for the the DAs.  Prevent tiresome clean-up and
double deletes by calling _exit at end of process.  Base DA
exists earlier.

Add shell script to build DAs with dynamic linking.

Setting correctly secondary flag

Correct AliTPCPreprocessor (include STANDALONE runs for initialisation of
pressure maps)

doxy: MUON macros, refs, src links, no coll graph

doxy: no more mainpage artifact on left menu

Improved documentation: adding all subpages via \subpage instead of \ref

Add DCS OCDB macro

Cleanup of ocdb macros:sjena

adding cmake option HLT_COMPONENT_STATISTICS to enable build with the HLT component statistics functionality

bugfix AliHLTCompStatCollector: filling entry 'Level' of the component statistics from the binary statistics structure

doxy: added MUON

Removed obsolete Doxygen configuration files

Updated Doxygen documentation:
- Added MUON in titles for all README pages
- Rename Doxymain.h in README.txt

Online-Offline channel correspondence

AliTPCSpaceCharge3D: fixed wrong calib maps paths

doxy: converted remaining macro images in TPCbase

Merge branch 'feature-doxygen'

doxy: multiple ClassImp/Def() supported

doxy: fixed problem when infile is in cur dir

doxy: correctly consider macro blocks in methods

doxy: fixed problem with mismatching comm indent

doxy: install THtml converter

PHOS: CPV PED DA added

o remove usage of obsolte kTOFpid bit for TPC+TOF histograms

o adapt Macro to new TPC structure (Benjamin Hess)

Merge branch 'feature-malturan'

Set cmake-policy to new for clang compiler and rpath on MAC OS

use cdash.cern.ch

Update z position of ADA (Z=1699.7)
23 mm from wall, wall located at 1705.0 cm

CMake: option to generate documentation only

With -DDOXYGEN_ONLY=ON, cmake prepares only the doxygen target, and no
additional checks on the environment are performed. With this build
mode it is not possible to build AliRoot, but only the documentation.

Fixed ClassDef() accidentally removed

Merge branch 'feature-doxygen'

doxy: install-doxygen target

doxy: minor structure changes

doxy: TPC/TPCbase converted

doxy: remove the $Id$ line

doxy: mixed multi- and single-line classdesc

doxy: ignore //#include... on classdesc search

doxy: do not show whitespace diffs on bulk edit

doxy: images from TPCbase

doxy: consider comments after last line

doxy: re-refactor comment after adding brief

doxy: lower indentation level threshold

doxy: quit from helper conversion script

doxy: helper script prints top-level gPad

TPCcalib: install missing mapfiles

doxy: automatic \brief guess

doxy: improvements to helper conversion script

doxy: helper script to generate imgs from macros

doxy: debug messages on restored lines

doxy: support multiple ClassImp()/ClassDef()

doxy: support more comments per line

doxy: fixed wrong condition when handling prepends

doxy: code cleanup: comments and clarifications

doxy: relative path for image from macro

doxy: scale indent level, suppress too high indent

doxy: fixed regexp erasing lines containing dashes

doxy: support both ClassImp() and ClassDef()

doxy: some classes use Origin: instead of Author:

doxy: in member comment, array size can be var

doxy: TPC/testMC converted

doxy: TPC/stressTest/testSparse converted

doxy: TPC/macros/scripts converted

doxy: TPC/macros/data2011 converted

doxy: TPC/macros/clusterMacros converted

doxy: TPC/macros root converted

doxy: TPC/fastSimul

doxy: TPC/DA

doxy: more commands to the helper script

doxy: do not look too much for class desc

doxy: TPC/CalibMacros

doxy: all TPC/Cal converted

doxy: all TPC/Base converted

doxy: all TPC root converted

doxy: all TPC/Attic converted

doxy: better conversion handler script

doxy: do not double-add \cond CLASSIMP .. \endcond

doxy: make Doxygen ignore the confusing ClassImp()

doxy: support prepending comments

doxy: no trailing empty spaces in comments

doxy: do not comment vardecl inside functions

protection for division by zero
Giacomo Volpe

Add processing of STANDALONE runs in TPC preprocessor

Bad Chunk Checker train macros copied over to install