Adding EMCal jet pid hadron correlation task for Joel

from Ante: more MPC changes

Fix multiplicity bining with VZEROA estimator

Add multiplicity estimators: Ntrk |eta|<0.5, Ntrk |eta|<0.3, VZEROA

Add the possibility to use pPb Ntracklets vs zvtx correction profiles (J.Wilkinson)

Remove extraneous nProfiles variable on the class. Add a fatal if correction profiles not properly loaded on the AddTask (J.Wilkinson)

can run without a config file (with sane defaults)
input format changed: no positional parameters anymore
to see docs, just run the script without args

coverity fix

Add universality for MC access in ESD and AOD formats (B,Polishchuk, P.Batzing).

add counter histogram before event rejections, switch track BC control histograms if not selected in reader

add switch for track TOF checking in case of problems with some data samples, move mixed event trigger selection to trigger checking method, cosmetics

prettier output

added: log validation
       safe updates
       excluding of detectors in config
       mail in case of trouble

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

https://savannah.cern.ch/bugs/?101683
Hans Beck

Fixing a nasty typo

Compilation of DA on SLC6

another update, + TOF script, still expecting the TOF
macros to change

Temporary fix, set to 60 the number of FALTROS in phi, do not take the default DCAL value yet

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Fix printout issue when redirecting pythia printout to AliDebug

some updates

automatic setting of the geometry.root file to be retrieved

Using ENV since ROOTSYS is not set anymore

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

debug message removed

Adding -lssl

avoid creation and keeping of MC histograms when MC option is off

update libraries

- change static instantiation for proper clean-up

from Ante Bilandzic:
  MPC updates

OpenCL tracker bug fix

explicitely link against libamdocl64.so

removing pre-package cxxflags

add some extra protections and a locking mechanism

initial version if the central QA producing script
to be extended and documented
for now it contains basic fuctionality and a detector
script template

Update for classes of Simone

Updating Analysis Task

New vertexer with IB tracklets

remove calls to Clone() and add a standalone macro for highPt filtering

post pid corrections TF1->TH1

update of analysis macro

- changes in Dalitz code
- modified 3 particle decay code

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

TOFtrackerV2 cpu usage optimezed

implement v0and selection for ESD and AOD, remove dependency on AliTriggerAnalysis

implement v0and selection for ESD and AOD, remove dependency on AliTriggerAnalysis

Updated macros for D0 (Massimo) + new macros for L* analysis in pp (Serguei)

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

modified Task to reduce memory consumption, reduced bin number, static added

Fixed addition of FIT (clashed with HLT)

added new signature for GetGlobalXYZ

variable width for LCC

Updates for the pPb Ntrk ZVtx corrrections (J.Wilkinson)

updated to check fake issue

PID Higher Moemnt from Nirbhay

fix coverity

change the EventSelection switch to Pile-Up event rejection switch

remove event selection bool for pileup and v0and, add own pile-up rejection bool, reoder a bit the logic in FillInputEvent and the debug prints

fix name of trigger threshold setting, comment it

Take into account different MC/raw Uri structure

pplying cell threshold for the QA histos

- Added loose rejection of light nuclei - Better treatment of PID probs w.r.t. light nuclei - Replaced most probable PID in data at low pT to some manual TPC only approach to get pure dEdx templates this way

- Special treatment if most prob PID is light nucleus only if well above el expectation (in order not to mix up at ID at very high pT)

update from Prabhat

Added macros for D0 analysis config with rsn package (Massimo)

Added new class for D0 daughter cuts (Massimo)

Added DCA of daughters and DCA product computation (Massimo)

New array for PDG code for K* and antiK* + added histos for phase space check + added sparse for reflections

Fix bug: di-muons in Z invariant mass were rejected in simulations even when it was not explicitly required (Diego)

Reweight muons from B decays (Diego)

add proper selection of primary vertex reconstruction for AODs

add proper selection of primary vertex reconstruction for AODs

add setter for the L1 trigger bits, in case automatic configuration does not work

fix finding of pad neighbours; remove methods to write them in OCDB

Round slates are rotated compared to others so the pad density
increases instead of decreasing when going from left to right:
--> increased number of possible neighbours from 10 to 12 to be
full symmetric (also consider increasing density from bottom to top)
--> corrected possibility to store the neighbours at their
corresponding position in the array (holes filled with invalid pads)

cosmetics, fix comments

#103626: Commit DCal geometry to master

Initial implementation of the DCAL Geometry (work done by Mengliang WANG for his service task). 3 versions have been implemented: - EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL: 12 EMCAL SM + 6 DCAL SM - EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL_DEV: 12 EMCAL SM shifted and 10 DCAL SM (this is a possible future DCAL geometry) - EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL_8SM: 12 EMCAL SM and 8 DCAL SM (the current DCAL geometry)

add setters for L1 trigger threshold and Bits, in case the automatic ones are not correct, change how the L1 automatic threshold is recovered in case of old AOD format

changes in STEER for FIT

changes for FIT

fixing output type

fix in trackerV2 DeltaX

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

fix in trackerV2 DeltaX

Check CVMFS_OCDB and deal with storages accordingly

In SetDefaultStorage check environment variable triggering cvmfs case:
CVMFS_OCDB. It is supposed to be set to the cvmfs path, containing
OCDB tags (list of all files seen in each OCDB at the moment when
the AliRoot tag was created) and two scripts, to get the year from the
run number and to extract the files valid for the given run.

The method ValidateCvmfsCase validates the $OCDB_PATH path
    // and modify Uri if it is "raw://"
The "alien://" uri passed to GetStorage is converted into a
"local:///cvmfs" uri inside CreateParameter called by GetStorage, via
AlienToCvmfsUri.

E.g.: OCDB_PATH="/cvmfs/alice.cern.ch/Packages/v5-04-Rev-12"
Example of expected subtree inside OCDB_PATH:
     Ideal.list.gz
  MC/Residual.list.gz
     Full.list.gz

     2009.list.gz
data/.......
     2013.list.gz

 bin/getUriFromYear.sh
     getOCDBFilesPerRun.sh

In addition:
Set indent to standard two spaces
Fixed indentation of comments foll. method header

Get only highest sub+version in L::QueryValidFiles

Let AliCDBLocal::GetId look in the list of valid fileIds and let
AliCDBLocal::GetEntry get from the list of valid FileIds

SetRun sets AliEn URI via SetDefaultStorageFromRun also in
CVMFS case, via getUriFromYear.sh script

small changes to D0-h code (Fabio C.)
)

changes to DStar code (Sandro B.)
)

update on MC tasks by Markus

Register only requested branches to cache

Create JDL from list of local files, not template (they may differ) (Diego)

Use trigger tracks to estimate efficiencies in QA (to remove dependence on tracking) (Diego)

In Terminate: get track source based on output (Diego)

recover the L1 trigger threshold from data, set the L1 trigger for the selected trigger, set L0 by hand

Adding CORRFW to EINCLUDE

adding electron rejection to eff cont task (same way as for default BF analysis)

including some debugging and checks on the cell array and cluster cells

correcting neutral energy isolation (not included in this code before)
including option to run the task twice in the same legotrain run, with different trigger types

parametrizing the output containers names according to trigger type

Check the SPI7 and SPI8 online trigger names to fill the 2D histos (was only checked for the counter)

fix AOD class def number where change in trigger format occurred

add switches to reduce number of histograms, specially for simulations; add switch for V0 histograms since AOD does not contain v0 signal