Splitting the different PWG2 libraries

added missing file acinclude.m4 from previous commit

- integration of libHLTbase into AliRoot prepared
- SampleLib as stand-alone package
- library development tutorial
- TPCLog bugfix -> include C++ style header

after renaming

New version of event reader with TSelector-compliance

Example macro on how to use selector

Updated for compatibility with CVS AliRsnEvent

Example of setting the cuts for the V0 and cascade finding.

Adding a new method for the vertex reconstruction using just one track (F.Prino)

small fix that were forgotten in last commit

Calling the V0 and cascade finders from AliReconstruction, and the possibility to set the cuts from outside (Yuri)

fStripX11 properly initialized in LocalTrigger (Valerie)

fixed bug in method RelPosCellInSModule for 3x3 case, fixed bug in AliEMCALDigitizer.cxx

- setup scripts for running environment added
- bugfix in configure which caused the check for PubSub components
  to fail on some architectures
- ComponentHandler takes ROOT dynamic library loader as fallback if
  dlopen is not available
- minor changes to avoid effC++ and other warnings
- work on the Task chain processing

adapting dndeta analysis to new AliCorrection schema
introducing vertexreco and trigger correction on track-level
adapting the corresponding selectors

adding class AliCorrection that comprises a correction on the event-level and on track-level
do not attach histograms to the directory while creating them

HMPIDTestShuttle.C renamed as Hshuttle.C

HMPIDGeom.C renamed as Hgeom.C

HMPIDConfig.C renamed as Hconfig.C

HMPIDMake renamed as Hmake

HMPIDMenu.C renamed as Hmenu.C

HMPIDAlign.C removed, functionality in MakeHMPIDXXXAlignment.C

HMPIDAna.C removed as all functionality now in AliHMPIDSelector.C

Bug fix (Yuri)

Restoring the original alignment files

25-sep-2006 NvE AliSample extended with memberfunction GetSpread() and also
                support for providing minimum and maximum values introduced.
12-oct-2006 NvE New memberfunction GetNsignals introduced in AliJet and jet
                ordering w.r.t. number of signals added in AliVertex.
19-oct-2006 NvE AliJet::GetNsignals modified to prevent double counting of
                multiple occurrences of the same signal.
24-oct-2006 NvE AliJet and AliVertex extended with ordering w.r.t. charge.
26-oct-2006 NvE Energy/Momentum scale indicator introduced in AliTrack and AliJet
                and support for chi2 and ndf datamembers removed from AliTrack.
                The latter can be achieved in a more flexible way via the fit
                details facility of AliTrack.
07-nov-2006 NvE Default unit scale changed from cm to meter in AliPosition
                and support introduced for user selectable unit scale
                in retrieval of position coordinates, errors and distances.
08-nov-2006 NvE User selectable unit scale introduced for retrieval of
                physics parameters and distances in AliTrack and AliJet.
                Also the track and jet sorting memberfunctions of AliJet
                and AliVertex have been updated to use this new feature.
                Also AliHelix has been updated to use this new feature and the
                default meter metric scale.
09-nov-2006 NvE AliCollider updated to use new standard 1 meter metric units
                and generator parameters stored in a device named "AliCollider".
                Also beam/target datamembers removed from AliEvent and storage
                of these beam/target parameters performed via a device named "Beam".
10-nov-2006 NvE Bug fixed in AliHelix.cxx such that the original reference point
                of the track itself is not modified when the user had specified
                a different scale. Also GetLastPoint() used in AliHelix to obtain
                the index of the last point instead of relying on the dimension
                of the points array as obtained with GetN(). This increases the
                accuracy of extrapolation (and drawing) resuls since no undefined
                points are now used anymore.
01-dec-2006 NvE AliTimestamp::Add() updated to allow specification of large time differences
                also by giving e.g. only a certain number of seconds instead of explicitly
                giving the time difference in elapsed days, remaining elapsed seconds etc...
                This is very convenient by time manipulations based on GPS data.
                The extension has been realised by just replacing the relevant if()
                statements by while() loops in determining the remaining fractional counts.
                Furthermore, some modulo operations have been introduced to prevent
                integer overflows.
22-sep-2006 NvE IceDwalk extended for specification of maximum number of hits per OM,
                to allow comparison with Sieglinde (which only uses the first OM hit).
                Also IceDwalk now introduces a device into the event named "IceDwalk"
                which contains the values of all the used reconstruction parameters.
25-oct-2006 NvE Spread of Psi median included in track fit statistics of IceChi2
                and IcePandel.
                Processing parameters of IceCalibrate, IceXtalk, IceCleanHits, IceChi2
                and IcePandel included as the corresponding devices in the event structure.
15-nov-2006 NvE Separate treatment of v_phase and v_group introduced in IceDwalk, IceChi2
                and IcePandel to improve time residuals (thanks to George Japaridze).
                Also IceLinefit extended for specification of maximum number of hits per OM
                and automatic introduction of a device into the event named "IceLinefit"
                which contains the values of all the used reconstruction parameters and
                the beta value (v/c) of the reconstructed track.
16-nov-2006 NvE Class IceDwalk renamed to IceDwalkx to provide a Sieglinde-like direct
                walk-II approach. The remaining class IceDwalk will provide a more
                sophisticated approach with more physics driven selection criteria.
23-nov-2006 NvE Improved version of IceDwalk installed. Note that the old algorithm is
                still available as IceDwalkx.
13-sep-2006 NvE IceF2k updated for multiple waveforms per OM by making use of the
                new AliAttrib::AddNamedSlot facility.
                Also some calibration constants dropped from OM data words in IceF2k
                and IceCal2Root, since these values are also stored as parameters in
                the corresponding (de)calibration functions.
                Also for TWR data the values stored in the histos are (baseline-amp),
                so that all pulses appear as positive instead of negative and the
                resulting histos are baseline corrected.
25-oct-2006 NvE IceF2k updated to include an IceF2k device into the event structure
                containing the processor parameters.

added selector for TPC cluster analysis

Added classes to analyse TPC data from reconstructed clusters (not on tracks) and modified the AliTPCClusterHistogram class accordingly.

Close histo file in destructor. Load libPHOSshuttle in macro.

Corrected order of loading

First version of the glossary (Gerhard)

Adding the missing lib*.pkg files

Do not ignore lib*.pkg files

L3 becomes HLT

New version of SPD raw-data reconstruction. The format now correponds to the actual format coming from the readout. The raw stream class now can be used to read the real data from SPD detector (Cvetan and Henrik)

New version of SPD raw-data simulation. The format now correponds to the actual format coming from the readout

Backward compatibility using typedef

CRT becomes ACORDE

This commit was generated by cvs2svn to compensate for changes in r15989,
which included commits to RCS files with non-trunk default branches.

START becomes T0

This commit was generated by cvs2svn to compensate for changes in r15986,
which included commits to RCS files with non-trunk default branches.

Backward compatibility using typedef, removing some debug printout

RICH becomes HMPID, the old module RICH is removed

RICH becomes HMPID

Corrected include

RICH becomes HMPID

This commit was generated by cvs2svn to compensate for changes in r15977,
which included commits to RCS files with non-trunk default branches.

Makefile for the ANALYSIS_NEW.par (Panos)

Possibility to create an independent par file containing the new analysis framework. Using standard IO functions to avoid dependence on AliLog header file (Panos)

Change in the cocktail to avoid interference with Pythia MB (Andreas)

Using assert in a way compatible with Root v5-13-06

Correction to the ALTRO mapping inside the inner ROC (Stefan Kniege)

Removing warnings for missing symbolic names in non-sensitive modules (Raffaele)

Removing warnings (Panos)

Bug fix (Gustavo)

Modified classes for ODCB access in AliReconstruction, and the file
TPC/AliTPCcalibDB.cxx where the parameter needed for the tracker is cloned.
Alberto

Fixes related the event range and run method. The event range now can be specified only by SetEventRange method (Cvetan)

Common class for raw data reading and ALTRO mappiing for PHOS and EMCAL (Gustavo, Cvetan)

Updated calibration (Brigitte)

Removing obsolete macro

New test macros for the analysis framework

New platform: linuxalphagcc

Additional dependences in the ANALYSIS module

New developments of the analysis framework - selectorised version of the manager (Andrei)

Temporary replacement of Form by sprintf to avoid problems on some platforms (alpahlinuxgcc, SolarisCC5) where variable size arguments are not accepted by CINT

Temporary replacement of Form by sprintf to avoid problems on some platforms (alpahlinuxgcc, SolarisCC5) where variable size arguments are not accepted by CINT

Code for jet finding using TPC and EMCAL ESD information.
(Moved from EMCAL + updates by M. Estienne)

Jet reconstruction and analysis class deriving from TSelector

Correct initialization of ann array

Time calculation improved

AliCDBManager added

macro to convert raw to sdigits

Renamed vector and methods by removing Geant3 from the names
(Christian)

AliMUONTrackExtrap.h

Record changes.

Fix handling of AliESDfriends.root.

Scripts for the AliRoot primer

Pictures for the AliRoot primer

Adding documentation: AliRoot primer

Library for jet analysis using MC truth.

Jet analysis using MC information.

Replaced by JETANLinkDef.h

ESD jet analysis.

- The part of JETAN dealing with ESD data has been separated from the one using MC information.
- Methods to use AliJetFinder together with a TSelector have been implemented.

New methods in geometry, update geometry for 3x3 case

Record changes.

Fix handling of AliESDfriends.root.

Use new naming conventions from QuadSet.

Record changes.

Use new naming conventions from QuadSet; increase x-width of SDD digits.

Style/comment changes.

Use better names for QuadTypes (enum and internal structs).

Some points were duplicated during track construction.

Register new classes.

Derive Track from Line (before was TPolyLine3D, RenderElement); this allowed me to remove a lot of code actually shared with PointSet.

New files: allow interaction with the track, more configurability (render as line, points or both).

New files: line representation with per-point selection.

Adding the bitmap of the clusters assigned in ITS.

new function

dummy gain file