Enabled the rawreader to deal with ddl=-1 in a reasonable manner

bug fix with dcs delay (found due to a temporary distortion of mind, i.e. feeling in the future, of Chiara)

fix setting of the reconstructor in constructor

Default recoparam object

Use reco param from OCDB.

runReconstruction.C

  Get the reconstruction parameters from OCDB

AliMUONCDB

  More generic Write method

MakeMUONSingleRecoParam, MakeMUONRecoParamArray

  New macros to populate the Calib/RecoParam OCDB

added AOD support for single tracks ; refit flags replaced by status flag in
quality cuts.

New file, to match subversion with CDB entry Id.

Restoration of earlier checked in version of the DataMaker

Fix tension box position, and wire overlap

Updates in SSD QA data maker (Panos)

Track matching improved.

Several fixes (the Make-Federico-Happy-Commit):

- Calibration:  Redid calibration - sample rates where wrong.
- Alignment: Fixed bug in AliFMDAlignFaker and made new alignment
          objects.
- Digitisation:
* Implemented digitisation from SDigits->Digits
* Reimplemented Hit->Digit conversion using loaders
  only.
* Reimplemented Hit->SDigit conversion using loaders
  only.
- Display:  Fixed few problems here and there.

Note, this was completed a little a head of time of when I thought it would.
Basically, I managed to fix an urgent Hardware task quicker than I originally
thought.   I guess patience is a virtue.

Small patch for file copying for special outputs in proof mode (M.Vala)

M

New macros to display the SDD calibration parameters from OCDB files (F. Prino)

Saving the esd-friend file on each esd-tree auto-save. Thanks to Philippe for the hint.

Removal of out-of-event-loop QA. Correlation QA. Some clean-up in QA code (Yves)

ACORDEv1 is now the default

New classes to manage new (compressed) format of SDD raw data (F. Prino)

SPD calibration parameters used only in simulation moved to AliITSSimuParam (G. Bruno)

Changing name according to different EventSpecie, fixing value of fApplyPbPbCuts
in case of PbPb collisions.

corrected minimum alpha cut for track-matching

correct setting of alphaMax for track-matching

Channel mapping applied to output pedestal file sent to FXS

Update of libraries that includes v0 version of the ACORDE's Geometry (Only the array of modules)

redoing of TPC vertex when flag is set

Adding missing Alias.

Parameters of AliITSVertexer3D added in AliITSRecoParam (F.Prino)

Offline to FEE mapping implemented in Digits2Raw

Offline to FEE mapping propagated for RAW Data Writing

ADC value taken as maximum value in the train of LHC clocks - FEE to Offline mapping implemented when converting RAW to Digits

correct TRD PID status settings in AliESDtrack

Adding readout list to the HLT trigger component base class and adding the class to the build system.

Updates in ldif files from LDAP configuration for production.

remove debugging MC label calculations

Adding fiducial volume to the list of settable cuts (Andrea)

further update on the HLT fast track finding

corrections to fitting of overflow channels from Raphaelle Ichou for testbeam data

Makefile, make_base.inc
-----------------------
Remove obsolete files for stand-alone build of EVE.

reve-genclass.pl
----------------

Remove obsolete skeleton-generation utility. This functionality is now
available as a separate package from:

  https://root.cern.ch/svn/root/branches/dev/matevz/eve-genclass

Updated AliITSRecoParam object in ITS/Calib

new flag for HLT tracking

Bug in AliZDCReconstructor::Reconstruct corrected

Typo in coordinate over detector front face determination corrected

Bug in reco object filling corrected

Added Getter used for offline channel mapping

Correct auto-load, external control and everything (Cvetan and Matevz)

Proof-enabled version of the CheckESD.C macro (Seforo, Muhammad)

Write the jet header information to the UserInfo of the output AOD

Decide whenever to run or not the vertex-finder on tracks accoring to the found ITS vertex (cosmic or not) - Andrea

Read aod from OutputHandler in of no aod input

AliEveEventManager
------------------

Make handling of auto event-loading timer more transparent:
 - add methods to manipulate the timer;
 - add members that allow to check its state in event-navigation functions.

AliEveEventManagerEditor
------------------------

Do not call SetAutoLoad() when only timeout has changed.

IsPhysicalPrimary(): Check status code > 1, this works for Pythia and Phojet

Options for ITS reconstruction moved to AliITSRecoParam (Dainese, Prino)

PedestalSSD moved from Calib to Ref (E. Fragiacomo)

Validity for the run range is ok.

Typo corrected.

silvermy@ornl.gov - adding maps that account for differences between EMCAL A and C sides, and also now include the channels for LED reference and \"fake-ALTRO\" TRU data

Last micron overlaps corrected. (Lizardo)

adding first version of common HLT track data struct for barrel tracks

adding block data types for array of common AliHLTExternalTrackParam struct and TClonesArray of AliExternalTrackParam

correcting compilation warnings

AliEveEventManager
------------------

Add 3 new state-variables:
  Bool_t   fIsOpen;        // Are event-files opened.
  Bool_t   fHasEvent;      // Is an event available.
  Bool_t   fExternalCtrl;  // Are we under external event-loop.
and use them in all API functions to enforce consistency and avoid surprises.

Remove 'Bool_t fIsOnline' - it was replaced with fExternalCtrl.

AliEveEventManagerEditor
------------------------

Remove all GUI but the next-event button and event-info text-box. All
controls now available from AliEveEventManagerWindow.

AliEveEventManagerWindow
------------------------

Add controls for Refresh (Close/Open event) and auto-load.

Disable parts of event-navigation GUI that should not be used when under
external event-control or auto-load.

Fixed uncorrect resetting of status flags

The check for the list of active detectors takes into account possible concurrent DAQ runs. A correspodning check is added.

Options for tracker, vertexer, cluster finder and pid selection included in AliITSRecoParam (A. Dainese)

Print reco-params only in case the debug level of AliReconstruction is > 0. Unloading of the alignment objects after they have been applied to the geometry.

Fixing the name of the field-map object so that it can't get lost in the selector's input list.

AliVertexerTracks: all parameters are now data members. Two setters added - one for ITS mode (tracks) and one for TPC mode (TPC only track parameters). TPC cuts optimized so that to increase the eff (Andrea)

File Exchange Server file Id (fesfileid) corrected.

printf replaced by AliInfo

Some more tiny overlaps corrected.

Added function to calculate distance deltaR to jet axis

corrected conversion of simulated digits to raw data

a) The dead pixels are now retrieved and saved in the daqDetDB for each run. This makes it possible to run the DA in different working directories for different runs.
b) Check added to make sure no empty tar archives are created.
c) Printout of number of events collected (used) at end of run.

Code revisited after debugging. Optimization for functions in V3. Calculations of RefIdx of C6F14 from OCDB as a function of temperature. Algorithm to find the mean photon energy from the Transparency system in Preprocessor completed and tested.

Code revisited after debugging. Optimization for functions in V3. Calculations of RefIdx of C6F14 from OCDB as a function of temperature. Algorithm to find the mean photon energy from the Transparency system in Preprocessor completed and tested.

Code revisited after debugging. Optimization for functions in V3. Calculations of RefIdx of C6F14 from OCDB as a function of temperature. Algorithm to find the mean photon energy from the Transparency system in Preprocessor completed and tested.

Code revisited after debugging. Optimization for functions in V3. Calculations of RefIdx of C6F14 from OCDB as a function of temperature. Algorithm to find the mean photon energy from the Transparency system in Preprocessor completed and tested.

minors

Add check for proof case in Terminate, otherwise aodTree is not written to the file in local case when SpecialOutput is set

Remove unecessary access to the galice.root file

Added missing QA histograms for ESD

Hopefully sorting out the local board id versus index problems once for all...

Changing file paths to point to afs, in order to ease testing

Fixes for not loading of the defuncted esd friends in case of esd file is being written and autosaved (Matevz and Cvetan)

K0l and K0s added (A. Kalweit)

Correcting list of libs needed

Retrieval of the entries from the cache if one is available. So the class is still the owner of the object inside, but the entry is kept in case of cache retrieval.

Removal of the check for the default cdb storage - anyway it is done inside cdb manager Get() method. (Cvetan)

minors

MIP cluster size added (compacted word) and infos re-arranganged in HMPID

3d parameter to Add2RawsList in  AliT0QADataMakerRec, 1st draft

No semicolon after ClassDef

VEventPool moved to STEERBase

Added macros for analysis of SDD calibration runs (F. Prino)

New check for bad SDD modules (F. Prino)

Adding example - in comments (Marian)

Using  + visualization of the output of calibration

AliEveEventManager
------------------
Replicate GetEventInfo() into two methods
  TString GetEventInfoHorizontal();
  TString GetEventInfoVertical();
Return TString instead of const char*.

AliEveEventManagerWindow
------------------------
Add event-info text.

AliEveTrackCounterEditor
------------------------
Connect to new-event signal to update current event information.
Call AliEveEventManager directly, not via event_prev/next/goto macros.

binalieve.pkg  - link against libMONITOR.
-------------

anyscan_init.C - instantiate Mikolaj's QA viewer in a dedicated tab.
--------------

Adding class to refit the tracks
using the specified OCDB entry

Just for check purposes
(Marian)

Update xyz calculation - Sin and cos change (Marian)