ANALYSIS/AliAnalysisGoodies.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 //_________________________________________________________________________
  16 // Various utilities usefull for analysis
  17 //
  18 //*-- Yves Schutz
  19 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  20
  21 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
  22 #include "AliTagAnalysis.h"
  23 #include "AliEventTagCuts.h"
  24 #include "AliRunTagCuts.h"
  25 #include "AliXMLCollection.h"
  26 #include "AliAnalysisGoodies.h"
  27 #include "AliAnalysisManager.h"
  28 #include "AliAnalysisTask.h"
  29   //#include "AliPhotonAnalysisTask.h"
  30 #include "AliLog.h"
  31
  32 #include <Riostream.h>
  33 #ifdef WITHALIEN
  34 #include <TAlienCollection.h>
  35 #endif
  36 #include <TChain.h>
  37 #include <TFileMerger.h>
  38 #include <TGrid.h>
  39 #include <TROOT.h>
  40 #include <TSystem.h>
  41 #include <TEntryList.h>
  42
  43 //______________________________________________________________________________
  44 AliAnalysisGoodies::AliAnalysisGoodies() :
  45   fESDTreeName("esdTree"),
  46   fnumberOfTasks(0),
  47   fTaskList(0),
  48   fTaskInType(0),
  49   fTaskOuType(0)
  50 {
  51   fTimer.Reset() ;
  52
  53   TString token = gSystem->Getenv("GRID_TOKEN") ;
  54
  55   if ( token == "OK" )
  56     TGrid::Connect("alien://");
  57   else
  58     AliInfo("You are not connected to the GRID") ;
  59 }
  60
  61 //______________________________________________________________________________
  62 void AliAnalysisGoodies::Help() const
  63 {
  64   AliInfo("Analysis utilities:\n") ;
  65   printf("                ***  Alien2Local  : copy files ESD files listed in an xml collection from AliEn catalog to local storage and creates a local xml collection  \n") ;
  66   printf("                                        usage: Alien2Local(in, out)\n") ;
  67   printf("                                                in: a xml esd collection file name    \n") ;
  68   printf("                                                ou: the local directory where to save the esd root files   \n") ;
  69   printf("                ***  Make  : makes esd collection from tags  \n") ;
  70   printf("                                        usage: Make(tags, esds)\n") ;
  71   printf("                                                tags: is either a tag root file or an xml tag collection   \n") ;
  72   printf("                                                esds: is an esd collection     \n") ;
  73   printf("                ***  Merge  : merges files listed in a xml collection \n") ;
  74   printf("                                        usage Merge(collection, outputDile)\n") ;
  75   printf("                                               collection: is a xml collection \n") ;
  76   printf("                ***  Process : process the events with an Analysis Task \n") ;
  77   printf("                                        usage: Process(esdFile, tagCuts) \n") ;
  78   printf("                                                esdFile: can be a root file with the ESD Tree ( ex: esd?AliESDs.root) \n") ;
  79   printf("                                                        or a root file with the Tag Tree ( ex: tag?Run100.Event0_100.ESD.tag.root) \n") ;
  80   printf("                                                        or a local or alien xml file with the ESD collection ( ex: esd?esdCollection.xml) \n") ;
  81   printf("                                                        or a local or alien xml file with the TAG collection ( ex: tag?tagCollection.xml) \n") ;
  82   printf("                                                        or a TChain of esd TTrees \n") ;
  83   printf("                                               tagCuts: is the AliEventTagCuts (needed only for tag? cases \n") ;
  84   printf("                ***  Register: register files already stored in a MSS into the AliEn catalog\n") ;
  85   printf("                                        usage: Register(lfndir, pfndir, pfnFileName) \n") ;
  86   printf("                                                lfndir : AliEn directory ( ex:  /alice/data/2006/LHC06c/PHOS_TestBeam/\n") ;
  87   printf("                                                pfndir : MSS directory   ( ex: /castor/cern.ch/alice/testbeam/phos/2006 \n") ;
  88   printf("                                                file   : text file with a list of the file names to be registered\n ") ;
  89
  90 }
  91
  92 //______________________________________________________________________
  93 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Alien2Local(const TString collectionNameIn, const TString localDir)
  94 {
  95   // copy files ESD files listed in an xml collection from AliEn catalog to local storage and creates a local xml collection
  96   // usage: Alien2Local(in, out)
  97   //        in: a xml esd collection file name
  98   //        ou: the local directory where to save the esd root files
  99
 100   Bool_t rv = kTRUE ;
 101
 102   fTimer.Start() ;
 103
 104   AliXMLCollection * collectionIn = AliXMLCollection::Open(collectionNameIn) ;
 105   collectionIn->Reset() ;
 106
 107   AliXMLCollection * collectionOu = new AliXMLCollection() ;
 108   TString collectionNameOu(collectionIn->GetCollectionName()) ;
 109   collectionNameOu.Append("Local") ;
 110   collectionOu->SetCollectionName(collectionNameOu) ;
 111   collectionOu->WriteHeader() ;
 112
 113   TFileMerger merger ;
 114
 115   const char* ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
 116
 117   Int_t counter = 1 ;
 118   while ( collectionIn->Next() ) {
 119     gSystem->ChangeDirectory(localDir) ;
 120     TString fileTURL = collectionIn->GetTURL("") ;
 121
 122     TString tempo(fileTURL) ;
 123     tempo.Remove(tempo.Last('/'), tempo.Length()) ;
 124     TString evtsNumber = tempo(tempo.Last('/')+1, tempo.Length())+"/";
 125     tempo.Remove(tempo.Last('/'), tempo.Length()) ;
 126     TString runNumber = tempo(tempo.Last('/')+1, tempo.Length())+"/" ;
 127     TString dir = localDir + runNumber ;
 128     dir += evtsNumber ;
 129     char line[1024] ;
 130     sprintf(line, ".! mkdir -p %s", dir.Data()) ;
 131     gROOT->ProcessLine(line) ;
 132     printf("***************************%s\n", line) ;
 133     TEntryList * list = collectionIn->GetEventList("") ;
 134     if (!list)
 135      list = new TEntryList() ;
 136     tempo = fileTURL ;
 137     TString filename = tempo(tempo.Last('/')+1, tempo.Length()) ;
 138     dir += filename ;
 139     AliInfo(Form("Copying %s to %s\n", fileTURL.Data(), dir.Data())) ;
 140     collectionOu->WriteBody(counter, collectionIn->GetGUID(""), collectionIn->GetLFN(""), dir, list) ;
 141     counter++ ;
 142     merger.Cp(fileTURL, dir) ;
 143   }
 144   collectionOu->Export() ;
 145   gSystem->ChangeDirectory(ocwd) ;
 146
 147   fTimer.Stop();
 148   fTimer.Print();
 149
 150   return rv ;
 151 }
 152
 153 //______________________________________________________________________
 154 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Make(AliRunTagCuts *runCuts, AliEventTagCuts *evtCuts, const char * in, const char * out) const
 155 {
 156   // makes esd collection from tags
 157   // usage Make(tags, esds)
 158   //              tags: is either a tag root file or an xml tag collection
 159   //              esds: is an esd collection
 160
 161   Bool_t rv = kTRUE ;
 162
 163   if ( !evtCuts && !runCuts ) {
 164     AliError("No Tag cuts provided") ;
 165     return kFALSE ;
 166   }
 167
 168   TString file(in) ;
 169   if ( file.Contains(".root") )
 170     rv = MakeEsdCollectionFromTagFile(runCuts, evtCuts, file.Data(), out) ;
 171   else  if ( file.Contains(".xml") )
 172     rv = MakeEsdCollectionFromTagCollection(runCuts, evtCuts, file.Data(), out) ;
 173   else {
 174     AliError(Form("%s is not a valid file format", in)) ;
 175     rv = kFALSE ;
 176   }
 177
 178   return rv ;
 179 }
 180
 181 //______________________________________________________________________
 182 const Bool_t AliAnalysisGoodies::MakeEsdCollectionFromTagFile(AliRunTagCuts *runCuts, AliEventTagCuts *evtCuts, const char * in, const char * out) const
 183 {
 184   // Makes an esd collection from a root tag file
 185   Bool_t rv = kTRUE ;
 186     // Open the file collection
 187   printf("*** Create Collection       ***\n");
 188   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 189   printf("***  file   = |%s|             \n",in);
 190
 191   AliTagAnalysis * tagAna = new AliTagAnalysis();
 192   rv = tagAna->AddTagsFile(in);
 193   if ( ! rv )
 194     return rv ;
 195
 196   tagAna->CreateXMLCollection(out, runCuts, evtCuts) ;
 197
 198   return rv ;
 199
 200 }
 201
 202 //______________________________________________________________________
 203 const Bool_t AliAnalysisGoodies::MakeEsdCollectionFromTagCollection(AliRunTagCuts * runCuts, AliEventTagCuts * evtCuts, const char * in, const char * out) const
 204 {
 205   // Makes an esd collection from a xml tag collection
 206   Bool_t rv = kTRUE ;
 207    // Open the file collection
 208   printf("*** Create Collection       ***\n");
 209   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 210   printf("***  Coll   = |%s|             \n",in);
 211
 212 #ifdef WITHALIEN
 213
 214   TAlienCollection * collection = TAlienCollection::Open(in);
 215   TGridResult* result = collection->GetGridResult("");
 216   AliTagAnalysis * tagAna = new AliTagAnalysis();
 217   tagAna->ChainGridTags(result);
 218
 219   tagAna->CreateXMLCollection(out, runCuts, evtCuts) ;
 220
 221 #else
 222   rv =  kFALSE;
 223 #endif
 224   return rv ;
 225 }
 226
 227 //______________________________________________________________________
 228 const Bool_t AliAnalysisGoodies::MakeEsdCollectionFromTagCollection(const char * runCuts, const char * evtCuts, const char * in, const char * out) const
 229 {
 230   // Makes an esd collection from a xml tag collection
 231
 232   Bool_t rv = kTRUE ;
 233
 234   // Open the file collection
 235   printf("*** Create Collection       ***\n");
 236   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 237   printf("***  Coll   = |%s|             \n",in);
 238
 239 #ifdef WITHALIEN
 240
 241   TAlienCollection * collection = TAlienCollection::Open(in);
 242   TGridResult* result = collection->GetGridResult("");
 243   AliTagAnalysis * tagAna = new AliTagAnalysis();
 244   tagAna->ChainGridTags(result);
 245
 246   tagAna->CreateXMLCollection(out, runCuts, evtCuts) ;
 247
 248   return rv ;
 249 #else
 250   return kFALSE;
 251 #endif
 252 }
 253
 254 //______________________________________________________________________
 255 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Merge(const char * collectionFile, const char * subFile, const char * outFile)
 256 {
 257   // merges files listed in a xml collection
 258   // usage Merge(collection, outputFile))
 259   //              collection: is a xml collection
 260
 261   Bool_t rv = kFALSE ;
 262
 263   if ( strstr(collectionFile, ".xml") == 0 ) {
 264     AliError("Input collection file must be an \".xml\" file\n") ;
 265     return kFALSE ;
 266   }
 267
 268   fTimer.Start() ;
 269
 270   // Open the file collection
 271   printf("*** Create Collection       ***\n");
 272   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 273   printf("***  Coll   = |%s|             \n",collectionFile);
 274
 275 #ifdef WITHALIEN
 276
 277   TAlienCollection * collection = TAlienCollection::Open(collectionFile);
 278   TGridResult* result = collection->GetGridResult("");
 279
 280   Int_t index = 0  ;
 281   const char * turl ;
 282   TFileMerger merger ;
 283   if (!outFile) {
 284     TString tempo(collectionFile) ;
 285     if ( subFile)
 286       tempo.ReplaceAll(".xml", subFile) ;
 287     else
 288       tempo.ReplaceAll(".xml", "_Merged.root") ;
 289     outFile = tempo.Data() ;
 290   }
 291   merger.OutputFile(outFile) ;
 292
 293   while ( (turl = result->GetKey(index, "turl")) ) {
 294     char file[2048] ;
 295     if ( subFile )
 296       sprintf(file, "%s#%s", turl, subFile) ;
 297     else
 298       sprintf(file, "%s", turl) ;
 299
 300     printf("%s\n", file) ;
 301     merger.AddFile(file) ;
 302     index++ ;
 303   }
 304
 305   if (index)
 306     merger.Merge() ;
 307
 308   AliInfo(Form("Files merged into %s\n", outFile)) ;
 309
 310   fTimer.Stop();
 311   fTimer.Print();
 312
 313   return rv ;
 314 #else
 315   return kFALSE;
 316 #endif
 317 }
 318
 319 //______________________________________________________________________
 320 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Process(TChain * chain)
 321 {
 322   // process events starting from a chain of esd Trees
 323   Bool_t rv = kFALSE ;
 324
 325   fTimer.Start() ;
 326
 327   rv = ProcessChain(chain) ;
 328
 329   fTimer.Stop();
 330   fTimer.Print();
 331
 332   return rv ;
 333 }
 334
 335 //______________________________________________________________________
 336 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Process(const char * inFile)
 337 {
 338   // process the events with an Analysis Task
 339   // usage Process(esdFile)
 340   //              esdFile: is of the form opt?file_lfn
 341   Bool_t rv = kFALSE ;
 342   AliRunTagCuts   * runCuts = 0x0 ;
 343   AliEventTagCuts * evtCuts = 0x0 ;
 344
 345   rv = Process(inFile, runCuts, evtCuts) ;
 346
 347   return rv ;
 348 }
 349
 350 //______________________________________________________________________
 351 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Process(const char * inFile, AliRunTagCuts *runCuts, AliEventTagCuts * evtCuts )
 352 {
 353   // process the events with an Analysis Task
 354   // usage Process(esdFile, runtagCuts, evtTagCuts)
 355   //              esdFile: is of the form opt?file_lfn
 356
 357   Bool_t rv = kFALSE ;
 358
 359   fTimer.Start() ;
 360
 361   TString file(inFile) ;
 362   if ( file.Contains("esd?") && file.Contains(".root") ) {
 363     file.ReplaceAll("esd?", "") ;
 364     rv = ProcessEsdFile(file.Data()) ;
 365
 366   } else if ( file.Contains("esd?") && file.Contains(".xml") ) {
 367     file.ReplaceAll("esd?", "") ;
 368     rv = ProcessEsdXmlCollection(file.Data()) ;
 369
 370   } else if (file.Contains("tag?") && file.Contains(".root") ) {
 371     file.ReplaceAll("tag?", "") ;
 372     rv = ProcessTagFile(file.Data(), runCuts, evtCuts) ;
 373
 374   } else if (file.Contains("tag?") && file.Contains(".xml") ) {
 375     file.ReplaceAll("tag?", "") ;
 376     rv = ProcessTagXmlCollection(file.Data(), runCuts, evtCuts) ;
 377
 378   } else {
 379     AliError(Form("%s is not a valid file format", inFile)) ;
 380     rv = kFALSE ;
 381   }
 382
 383   fTimer.Stop();
 384   fTimer.Print();
 385
 386   return rv ;
 387 }
 388
 389 //______________________________________________________________________
 390 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Process(const char * inFile, const char * runCuts, const char * evtCuts)
 391 {
 392   // process the events with an Analysis Task
 393   // usage Process(esdFile, runtagCuts, evtTagCuts)
 394   //              esdFile: is of the form opt?file_lfn
 395
 396   Bool_t rv = kFALSE ;
 397
 398   fTimer.Start() ;
 399
 400   TString file(inFile) ;
 401   if ( file.Contains("esd?") && file.Contains(".root") ) {
 402     file.ReplaceAll("esd?", "") ;
 403     rv = ProcessEsdFile(file.Data()) ;
 404
 405   } else if ( file.Contains("esd?") && file.Contains(".xml") ) {
 406     file.ReplaceAll("esd?", "") ;
 407     rv = ProcessEsdXmlCollection(file.Data()) ;
 408
 409   } else if (file.Contains("tag?") && file.Contains(".root") ) {
 410     file.ReplaceAll("tag?", "") ;
 411     rv = ProcessTagFile(file.Data(), runCuts, evtCuts) ;
 412
 413   } else if (file.Contains("tag?") && file.Contains(".xml") ) {
 414     file.ReplaceAll("tag?", "") ;
 415     rv = ProcessTagXmlCollection(file.Data(), runCuts, evtCuts) ;
 416
 417   } else {
 418     AliError(Form("%s is not a valid file format", inFile)) ;
 419     rv = kFALSE ;
 420   }
 421
 422   fTimer.Stop();
 423   fTimer.Print();
 424
 425   return rv ;
 426 }
 427
 428 //______________________________________________________________________
 429 const Bool_t AliAnalysisGoodies::ProcessChain(TChain * chain) const
 430 {
 431   // Procees a TChain.
 432
 433   Bool_t rv = kTRUE ;
 434
 435   if (! fTaskList ) {
 436     AliError("No tasks defined") ;
 437     return kFALSE ;
 438   }
 439
 440   // Make the analysis manager
 441   AliAnalysisManager * mgr = new AliAnalysisManager() ;
 442
 443   // Make tasks
 444   // The top input must be common to all top tasks
 445   TClass * classIn = fTaskInType[0] ;
 446   AliAnalysisDataContainer * taskInput  = mgr->CreateContainer("InputContainer", classIn, AliAnalysisManager::kInputContainer) ;
 447   Int_t index ;
 448   for (index = 0; index < fnumberOfTasks; index++) {
 449     AliAnalysisTask * task = fTaskList[index] ;
 450     mgr->AddTask(task) ;
 451
 452     // Create containers for input/output
 453     TClass * classOu = fTaskOuType[index] ;
 454     AliAnalysisDataContainer * taskOutput = mgr->CreateContainer(Form("OutputContainer%d",index), classOu, AliAnalysisManager::kOutputContainer,
 455                                             Form("%s.root",task->GetName())) ;
 456     mgr->ConnectInput (task, 0, taskInput);
 457     mgr->ConnectOutput(task, 0, taskOutput);
 458   }
 459
 460   // Open data
 461 //  taskInput->SetData(chain);
 462
 463   if (mgr->InitAnalysis()) {
 464     mgr->PrintStatus();
 465 //    chain->Process(mgr);
 466     mgr->StartAnalysis("local",chain);
 467   } else
 468     rv = kFALSE ;
 469
 470   return rv ;
 471 }
 472
 473 //______________________________________________________________________
 474 const Bool_t AliAnalysisGoodies::ProcessEsdFile(const char * esdFile) const
 475 {
 476   // process the events in a single ESD file with an Analysis Task
 477   // usage ProcessLocalEsdFile(esdFile)
 478   //              esdFile: is the root file (local or in alien) with the ESD Tree ( ex: AliESDs.root)
 479
 480   Bool_t rv = kTRUE ;
 481
 482   printf("*** Process       ***\n");
 483   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 484   printf("***  Coll   = |%s|             \n",esdFile);
 485
 486   // Makes the ESD chain
 487   printf("*** Getting the Chain       ***\n");
 488   TChain* analysisChain = new TChain(fESDTreeName) ;
 489   analysisChain->AddFile(esdFile);
 490
 491   // Process the events
 492   rv = ProcessChain(analysisChain) ;
 493
 494   return rv;
 495 }
 496
 497 //______________________________________________________________________
 498 const Bool_t AliAnalysisGoodies::ProcessTagFile(const char * tagFile, AliRunTagCuts *runCuts, AliEventTagCuts *evtCuts) const
 499 {
 500   // process the events in a single Tag file with an Analysis Task
 501   // usage ProcessLocalEsdFile(tagFile)
 502   //              tagFile: is the root file (local or in alien) with the Tag Tree (ex: Run102.Event0_100.ESD.tag.root)
 503
 504   Bool_t rv = kTRUE ;
 505
 506   if ( !evtCuts && !runCuts ) {
 507     AliError("No Tag cuts provided") ;
 508     return kFALSE ;
 509   }
 510
 511   printf("*** Process       ***\n");
 512   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 513   printf("***  Coll   = |%s|             \n",tagFile);
 514
 515   AliTagAnalysis * tagAna = new AliTagAnalysis();
 516   rv = tagAna->AddTagsFile(tagFile);
 517   if ( ! rv )
 518     return rv ;
 519
 520   // Query the tag file and make the analysis chain
 521   TChain * analysisChain = new TChain(fESDTreeName)  ;
 522   analysisChain = tagAna->QueryTags(runCuts, evtCuts);
 523
 524   // Process the events
 525   rv = ProcessChain(analysisChain) ;
 526
 527   return rv;
 528 }
 529
 530 //______________________________________________________________________
 531 const Bool_t AliAnalysisGoodies::ProcessTagFile(const char * tagFile, const char * runCuts, const char * evtCuts) const
 532 {
 533   // process the events in a single Tag file with an Analysis Task
 534   // usage ProcessLocalEsdFile(tagFile)
 535   //              tagFile: is the root file (local or in alien) with the Tag Tree (ex: Run102.Event0_100.ESD.tag.root)
 536
 537   Bool_t rv = kTRUE ;
 538
 539
 540   if ( !evtCuts && !runCuts ) {
 541     AliError("No Tag cuts provided") ;
 542     return kFALSE ;
 543   }
 544
 545   printf("*** Process       ***\n");
 546   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 547   printf("***  Coll   = |%s|             \n",tagFile);
 548
 549   AliTagAnalysis * tagAna = new AliTagAnalysis();
 550   rv = tagAna->AddTagsFile(tagFile);
 551   if ( ! rv )
 552     return rv ;
 553
 554   // Query the tag file and make the analysis chain
 555   TChain * analysisChain = new TChain(fESDTreeName)  ;
 556   analysisChain = tagAna->QueryTags(runCuts, evtCuts);
 557
 558   // Process the events
 559  rv = ProcessChain(analysisChain) ;
 560
 561   return rv;
 562 }
 563
 564 //______________________________________________________________________
 565 const Bool_t AliAnalysisGoodies::ProcessEsdXmlCollection(const char * xmlFile) const
 566 {
 567   // process the events in a xml ESD collection  with an Analysis Task
 568   // usage ProcessLocalEsdFile(xmlFile)
 569   //              xmlFile: is the local xml file with the ESD collection ( ex: esdCollection.xml)
 570
 571   Bool_t rv = kTRUE ;
 572
 573   printf("*** Process       ***\n");
 574   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 575   printf("***  Coll   = |%s|             \n",xmlFile);
 576
 577 #ifdef WITHALIEN
 578
 579   TAlienCollection * collection = TAlienCollection::Open(xmlFile) ;
 580   if (! collection) {
 581     AliError(Form("%s not found", xmlFile)) ;
 582     return kFALSE ;
 583   }
 584
 585   TGridResult* result = collection->GetGridResult("");
 586   TList* analysisfilelist = result->GetFileInfoList();
 587
 588   // Makes the ESD chain
 589   printf("*** Getting the Chain       ***\n");
 590   TChain* analysisChain = new TChain(fESDTreeName);
 591   analysisChain->AddFileInfoList(analysisfilelist);
 592
 593   // Process the events
 594   rv = ProcessChain(analysisChain) ;
 595
 596   return rv ;
 597 #else
 598   return kFALSE;
 599 #endif
 600 }
 601
 602 //______________________________________________________________________
 603 const Bool_t AliAnalysisGoodies::ProcessTagXmlCollection(const char * xmlFile, AliRunTagCuts *runCuts, AliEventTagCuts * evtCuts) const
 604 {
 605   // process the events in a xml ESD collection  with an Analysis Task
 606   // usage ProcessLocalEsdFile(xmlFile)
 607   //              xmlFile: is the local xml file with the tag collection ( ex: tagCollection.xml)
 608
 609   Bool_t rv = kTRUE ;
 610
 611   if ( !evtCuts && !runCuts ) {
 612     AliError("No Tag cuts provided") ;
 613     return kFALSE ;
 614   }
 615
 616   printf("*** Process       ***\n");
 617   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 618   printf("***  Coll   = |%s|             \n",xmlFile);
 619
 620   // check if file is local or alien
 621   if ( gSystem->AccessPathName(xmlFile) )
 622     TGrid::Connect("alien://");
 623
 624 #ifdef WITHALIEN
 625
 626   TAlienCollection * collection = TAlienCollection::Open(xmlFile) ;
 627   if (! collection) {
 628     AliError(Form("%s not found", xmlFile)) ;
 629     return kFALSE ;
 630   }
 631
 632   TGridResult* result = collection->GetGridResult("");
 633   AliTagAnalysis * tagAna = new AliTagAnalysis();
 634   tagAna->ChainGridTags(result);
 635
 636   // Query the tag file and make the analysis chain
 637   TChain * analysisChain = new TChain(fESDTreeName)  ;
 638   analysisChain = tagAna->QueryTags(runCuts, evtCuts);
 639
 640   // Process the events
 641   rv = ProcessChain(analysisChain) ;
 642
 643   return rv ;
 644 #else
 645   return kFALSE;
 646 #endif
 647 }
 648
 649 //______________________________________________________________________
 650 const Bool_t AliAnalysisGoodies::ProcessTagXmlCollection(const char * xmlFile, const char * runCuts, const char * evtCuts) const
 651 {
 652   // process the events in a xml ESD collection  with an Analysis Task
 653   // usage ProcessLocalEsdFile(xmlFile)
 654   //              xmlFile: is the local xml file with the tag collection ( ex: tagCollection.xml)
 655
 656   Bool_t rv = kTRUE ;
 657
 658  if ( !evtCuts && !runCuts ) {
 659     AliError("No Tag cuts provided") ;
 660     return kFALSE ;
 661   }
 662
 663   printf("*** Process       ***\n");
 664   printf("***  Wk-Dir = |%s|             \n",gSystem->WorkingDirectory());
 665   printf("***  Coll   = |%s|             \n",xmlFile);
 666
 667 #ifdef WITHALIEN
 668
 669   // check if file is local or alien
 670   if ( gSystem->AccessPathName(xmlFile) )
 671     TGrid::Connect("alien://");
 672
 673   TAlienCollection * collection = TAlienCollection::Open(xmlFile) ;
 674   if (! collection) {
 675     AliError(Form("%s not found", xmlFile)) ;
 676     return kFALSE ;
 677   }
 678
 679   TGridResult* result = collection->GetGridResult("");
 680   AliTagAnalysis * tagAna = new AliTagAnalysis();
 681   tagAna->ChainGridTags(result);
 682
 683   // Query the tag file and make the analysis chain
 684   TChain * analysisChain = new TChain(fESDTreeName)  ;
 685   analysisChain = tagAna->QueryTags(runCuts, evtCuts);
 686
 687   // Process the events
 688   rv = ProcessChain(analysisChain) ;
 689
 690   return rv ;
 691 #else
 692   return kFALSE;
 693 #endif
 694 }
 695
 696 //______________________________________________________________________
 697 const Bool_t AliAnalysisGoodies::Register( const char * lfndir, const char * pfndir, const char * file)
 698 {
 699   // register files already stored in a MSS into the AliEn catalog
 700   // usage: Register(lfndir, pfndir, pfnFileName)
 701   //         lfndir : AliEn directory ( ex:  /alice/data/2006/LHC06c/PHOS_TestBeam/ )
 702   //         pfndir : MSS directory   ( ex: /castor/cern.ch/alice/testbeam/phos/2006 )
 703   //         file   : text file with a list of the file names to be registered
 704
 705   Bool_t rv = kTRUE ;
 706   fTimer.Start() ;
 707
 708   ifstream in;
 709   in.open(file);
 710   if ( in.bad() ) {
 711     AliError(Form("Cannot open file %s\n", file)) ;
 712     return kFALSE ;
 713   }
 714
 715   TGrid::Connect("alien://");
 716
 717   char fileName[1024] ;
 718
 719   while (1) {
 720     in >> fileName ;
 721     if (!in.good())
 722       break;
 723     char lfn[1024] ;
 724
 725     sprintf(lfn, "%s/%s", lfndir, fileName) ;
 726
 727     char pfn[1024] ;
 728
 729     sprintf(pfn, "castor://Alice::CERN::Castor2/%s/%s", pfndir, fileName) ;
 730
 731     printf("Register %s as %s\n", pfn, lfn) ;
 732
 733     gGrid->Register(lfn, pfn) ;
 734   }
 735
 736   fTimer.Stop();
 737   fTimer.Print();
 738
 739   return rv;
 740 }
 741
 742 //______________________________________________________________________
 743 void AliAnalysisGoodies::SetTasks(Int_t nb, AliAnalysisTask ** taskList, TClass ** inputType, TClass ** outputType)
 744 {
 745   // define a task with its output and input type
 746
 747
 748   fnumberOfTasks= nb;
 749   fTaskList   = taskList ;
 750   fTaskInType = inputType ;
 751   fTaskOuType = outputType ;
 752 }