ANALYSIS/AliAnalysisManager.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17 // Author: Andrei Gheata, 31/05/2006
  18
  19 //==============================================================================
  20 //   AliAnalysysManager - Manager analysis class. Allows creation of several
  21 // analysis tasks and data containers storing their input/output. Allows
  22 // connecting/chaining tasks via shared data containers. Serializes the current
  23 // event for all tasks depending only on initial input data.
  24 //==============================================================================
  25 //
  26 //==============================================================================
  27
  28 #include <Riostream.h>
  29
  30 #include <TClass.h>
  31 #include <TFile.h>
  32 #include <TMethodCall.h>
  33 #include <TChain.h>
  34 #include <TSystem.h>
  35 #include <TROOT.h>
  36 #include <TCanvas.h>
  37
  38 #include "AliAnalysisTask.h"
  39 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
  40 #include "AliAnalysisDataSlot.h"
  41 #include "AliVEventHandler.h"
  42 #include "AliSysInfo.h"
  43 #include "AliAnalysisManager.h"
  44
  45 ClassImp(AliAnalysisManager)
  46
  47 AliAnalysisManager *AliAnalysisManager::fgAnalysisManager = NULL;
  48
  49 //______________________________________________________________________________
  50 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const char *name, const char *title)
  51                    :TNamed(name,title),
  52                     fTree(NULL),
  53                     fInputEventHandler(NULL),
  54                     fOutputEventHandler(NULL),
  55                     fMCtruthEventHandler(NULL),
  56                     fCurrentEntry(-1),
  57                     fNSysInfo(0),
  58                     fMode(kLocalAnalysis),
  59                     fInitOK(kFALSE),
  60                     fDebug(0),
  61                     fTasks(NULL),
  62                     fTopTasks(NULL),
  63                     fZombies(NULL),
  64                     fContainers(NULL),
  65                     fInputs(NULL),
  66                     fOutputs(NULL)
  67 {
  68 // Default constructor.
  69    fgAnalysisManager = this;
  70    fTasks      = new TObjArray();
  71    fTopTasks   = new TObjArray();
  72    fZombies    = new TObjArray();
  73    fContainers = new TObjArray();
  74    fInputs     = new TObjArray();
  75    fOutputs    = new TObjArray();
  76    SetEventLoop(kTRUE);
  77 }
  78
  79 //______________________________________________________________________________
  80 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const AliAnalysisManager& other)
  81                    :TNamed(other),
  82                     fTree(NULL),
  83                     fInputEventHandler(NULL),
  84                     fOutputEventHandler(NULL),
  85                     fMCtruthEventHandler(NULL),
  86                     fCurrentEntry(-1),
  87                     fNSysInfo(0),
  88                     fMode(other.fMode),
  89                     fInitOK(other.fInitOK),
  90                     fDebug(other.fDebug),
  91                     fTasks(NULL),
  92                     fTopTasks(NULL),
  93                     fZombies(NULL),
  94                     fContainers(NULL),
  95                     fInputs(NULL),
  96                     fOutputs(NULL)
  97 {
  98 // Copy constructor.
  99    fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
 100    fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
 101    fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
 102    fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
 103    fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
 104    fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
 105    fgAnalysisManager = this;
 106 }
 107
 108 //______________________________________________________________________________
 109 AliAnalysisManager& AliAnalysisManager::operator=(const AliAnalysisManager& other)
 110 {
 111 // Assignment
 112    if (&other != this) {
 113       TNamed::operator=(other);
 114       fInputEventHandler   = other.fInputEventHandler;
 115       fOutputEventHandler  = other.fOutputEventHandler;
 116       fMCtruthEventHandler = other.fMCtruthEventHandler;
 117       fTree       = NULL;
 118       fCurrentEntry = -1;
 119       fNSysInfo   = other.fNSysInfo;
 120       fMode       = other.fMode;
 121       fInitOK     = other.fInitOK;
 122       fDebug      = other.fDebug;
 123       fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
 124       fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
 125       fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
 126       fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
 127       fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
 128       fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
 129       fgAnalysisManager = this;
 130    }
 131    return *this;
 132 }
 133
 134 //______________________________________________________________________________
 135 AliAnalysisManager::~AliAnalysisManager()
 136 {
 137 // Destructor.
 138    if (fTasks) {fTasks->Delete(); delete fTasks;}
 139    if (fTopTasks) delete fTopTasks;
 140    if (fZombies) delete fZombies;
 141    if (fContainers) {fContainers->Delete(); delete fContainers;}
 142    if (fInputs) delete fInputs;
 143    if (fOutputs) delete fOutputs;
 144    if (fgAnalysisManager==this) fgAnalysisManager = NULL;
 145 }
 146
 147 //______________________________________________________________________________
 148 Int_t AliAnalysisManager::GetEntry(Long64_t entry, Int_t getall)
 149 {
 150 // Read one entry of the tree or a whole branch.
 151    if (fDebug > 1) {
 152       cout << "== AliAnalysisManager::GetEntry()" << endl;
 153    }
 154    fCurrentEntry = entry;
 155    return fTree ? fTree->GetTree()->GetEntry(entry, getall) : 0;
 156 }
 157
 158 //______________________________________________________________________________
 159 void AliAnalysisManager::Init(TTree *tree)
 160 {
 161   // The Init() function is called when the selector needs to initialize
 162   // a new tree or chain. Typically here the branch addresses of the tree
 163   // will be set. It is normaly not necessary to make changes to the
 164   // generated code, but the routine can be extended by the user if needed.
 165   // Init() will be called many times when running with PROOF.
 166    if (!tree) return;
 167    if (fDebug > 1) {
 168       printf("->AliAnalysisManager::InitTree(%s)\n", tree->GetName());
 169    }
 170
 171    // Call InitTree of EventHandler
 172    if (fOutputEventHandler) {
 173       if (fMode == kProofAnalysis) {
 174          fOutputEventHandler->Init(0x0, "proof");
 175       } else {
 176          fOutputEventHandler->Init(0x0, "local");
 177       }
 178    }
 179
 180    if (fInputEventHandler) {
 181       if (fMode == kProofAnalysis) {
 182          fInputEventHandler->Init(tree, "proof");
 183       } else {
 184          fInputEventHandler->Init(tree, "local");
 185       }
 186    } else {
 187       // If no input event handler we need to get the tree once
 188       // for the chain
 189       if(!tree->GetTree()) tree->LoadTree(0);
 190    }
 191
 192
 193    if (fMCtruthEventHandler) {
 194       if (fMode == kProofAnalysis) {
 195          fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "proof");
 196       } else {
 197          fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "local");
 198       }
 199    }
 200
 201    if (!fInitOK) InitAnalysis();
 202    if (!fInitOK) return;
 203    fTree = tree;
 204    AliAnalysisDataContainer *top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
 205    if (!top) {
 206       cout<<"Error: No top input container !" <<endl;
 207       return;
 208    }
 209    top->SetData(tree);
 210    if (fDebug > 1) {
 211       printf("<-AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
 212    }
 213 }
 214
 215 //______________________________________________________________________________
 216 void AliAnalysisManager::SlaveBegin(TTree *tree)
 217 {
 218   // The SlaveBegin() function is called after the Begin() function.
 219   // When running with PROOF SlaveBegin() is called on each slave server.
 220   // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
 221    if (fDebug > 1) {
 222       cout << "->AliAnalysisManager::SlaveBegin()" << endl;
 223    }
 224
 225    // Call Init of EventHandler
 226    if (fOutputEventHandler) {
 227       if (fMode == kProofAnalysis) {
 228          fOutputEventHandler->Init("proof");
 229       } else {
 230          fOutputEventHandler->Init("local");
 231       }
 232    }
 233
 234    if (fInputEventHandler) {
 235       fInputEventHandler->SetInputTree(tree);
 236       if (fMode == kProofAnalysis) {
 237          fInputEventHandler->Init("proof");
 238       } else {
 239          fInputEventHandler->Init("local");
 240       }
 241    }
 242
 243    if (fMCtruthEventHandler) {
 244       if (fMode == kProofAnalysis) {
 245          fMCtruthEventHandler->Init("proof");
 246       } else {
 247          fMCtruthEventHandler->Init("local");
 248       }
 249    }
 250
 251    TIter next(fTasks);
 252    AliAnalysisTask *task;
 253    // Call CreateOutputObjects for all tasks
 254    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 255       TDirectory *curdir = gDirectory;
 256       task->CreateOutputObjects();
 257       if (curdir) curdir->cd();
 258    }
 259
 260    if (fDebug > 1) {
 261       cout << "<-AliAnalysisManager::SlaveBegin()" << endl;
 262    }
 263 }
 264
 265 //______________________________________________________________________________
 266 Bool_t AliAnalysisManager::Notify()
 267 {
 268    // The Notify() function is called when a new file is opened. This
 269    // can be either for a new TTree in a TChain or when when a new TTree
 270    // is started when using PROOF. It is normaly not necessary to make changes
 271    // to the generated code, but the routine can be extended by the
 272    // user if needed. The return value is currently not used.
 273     if (fTree) {
 274         TFile *curfile = fTree->GetCurrentFile();
 275         if (curfile && fDebug>1) printf("AliAnalysisManager::Notify() file: %s\n", curfile->GetName());
 276         TIter next(fTasks);
 277         AliAnalysisTask *task;
 278         // Call Notify for all tasks
 279         while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
 280             task->Notify();
 281
 282         // Call Notify of the event handlers
 283         if (fInputEventHandler) {
 284             fInputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
 285         }
 286
 287         if (fOutputEventHandler) {
 288             fOutputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
 289         }
 290
 291         if (fMCtruthEventHandler) {
 292             fMCtruthEventHandler->Notify(curfile->GetName());
 293         }
 294
 295     }
 296     return kTRUE;
 297 }
 298
 299 //______________________________________________________________________________
 300 Bool_t AliAnalysisManager::Process(Long64_t entry)
 301 {
 302   // The Process() function is called for each entry in the tree (or possibly
 303   // keyed object in the case of PROOF) to be processed. The entry argument
 304   // specifies which entry in the currently loaded tree is to be processed.
 305   // It can be passed to either TTree::GetEntry() or TBranch::GetEntry()
 306   // to read either all or the required parts of the data. When processing
 307   // keyed objects with PROOF, the object is already loaded and is available
 308   // via the fObject pointer.
 309   //
 310   // This function should contain the "body" of the analysis. It can contain
 311   // simple or elaborate selection criteria, run algorithms on the data
 312   // of the event and typically fill histograms.
 313
 314   // WARNING when a selector is used with a TChain, you must use
 315   //  the pointer to the current TTree to call GetEntry(entry).
 316   //  The entry is always the local entry number in the current tree.
 317   //  Assuming that fChain is the pointer to the TChain being processed,
 318   //  use fChain->GetTree()->GetEntry(entry).
 319    if (fDebug > 1) {
 320       cout << "->AliAnalysisManager::Process(" << entry << ")" << endl;
 321    }
 322    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
 323    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
 324    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
 325
 326    GetEntry(entry);
 327    ExecAnalysis();
 328    if (fDebug > 1) {
 329       cout << "<-AliAnalysisManager::Process()" << endl;
 330    }
 331    return kTRUE;
 332 }
 333
 334 //______________________________________________________________________________
 335 void AliAnalysisManager::PackOutput(TList *target)
 336 {
 337   // Pack all output data containers in the output list. Called at SlaveTerminate
 338   // stage in PROOF case for each slave.
 339    if (fDebug > 1) {
 340       cout << "->AliAnalysisManager::PackOutput()" << endl;
 341    }
 342    if (!target) {
 343       Error("PackOutput", "No target. Aborting.");
 344       return;
 345    }
 346    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->Terminate();
 347    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->Terminate();
 348    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->Terminate();
 349
 350    if (fMode == kProofAnalysis) {
 351       TIter next(fOutputs);
 352       AliAnalysisDataContainer *output;
 353       while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 354          if (output->GetData()) {
 355             if (output->GetProducer()->IsPostEventLoop()) continue;
 356             AliAnalysisDataWrapper *wrap = output->ExportData();
 357             // Output wrappers must delete data after merging (AG 13/11/07)
 358             wrap->SetDeleteData(kTRUE);
 359             if (fDebug > 1) printf("   Packing container %s...\n", output->GetName());
 360             target->Add(wrap);
 361          }
 362       }
 363    }
 364    if (fDebug > 1) {
 365       printf("<-AliAnalysisManager::PackOutput: output list contains %d containers\n", target->GetSize());
 366    }
 367 }
 368
 369 //______________________________________________________________________________
 370 void AliAnalysisManager::ImportWrappers(TList *source)
 371 {
 372 // Import data in output containers from wrappers coming in source.
 373    if (fDebug > 1) {
 374       cout << "->AliAnalysisManager::ImportWrappers()" << endl;
 375    }
 376    TIter next(fOutputs);
 377    AliAnalysisDataContainer *cont;
 378    AliAnalysisDataWrapper   *wrap;
 379    Int_t icont = 0;
 380    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 381       if (cont->GetProducer()->IsPostEventLoop()) continue;
 382       wrap = (AliAnalysisDataWrapper*)source->FindObject(cont->GetName());
 383       if (!wrap && fDebug>1) {
 384          printf("(WW) ImportWrappers: container %s not found in analysis output !\n", cont->GetName());
 385          continue;
 386       }
 387       icont++;
 388       if (fDebug > 1) printf("   Importing data for container %s\n", wrap->GetName());
 389       if (cont->GetFileName()) printf("    -> %s\n", cont->GetFileName());
 390       cont->ImportData(wrap);
 391    }
 392    if (fDebug > 1) {
 393       cout << "<-AliAnalysisManager::ImportWrappers(): "<< icont << " containers imported" << endl;
 394    }
 395 }
 396
 397 //______________________________________________________________________________
 398 void AliAnalysisManager::UnpackOutput(TList *source)
 399 {
 400   // Called by AliAnalysisSelector::Terminate. Output containers should
 401   // be in source in the same order as in fOutputs.
 402    if (fDebug > 1) {
 403       cout << "->AliAnalysisManager::UnpackOutput()" << endl;
 404    }
 405    if (!source) {
 406       Error("UnpackOutput", "No target. Aborting.");
 407       return;
 408    }
 409    if (fDebug > 1) {
 410       printf("   Source list contains %d containers\n", source->GetSize());
 411    }
 412
 413    if (fMode == kProofAnalysis) ImportWrappers(source);
 414
 415    TIter next(fOutputs);
 416    AliAnalysisDataContainer *output;
 417    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 418       if (!output->GetData()) continue;
 419       // Check if there are client tasks that run post event loop
 420       if (output->HasConsumers()) {
 421          // Disable event loop semaphore
 422          output->SetPostEventLoop(kTRUE);
 423          TObjArray *list = output->GetConsumers();
 424          Int_t ncons = list->GetEntriesFast();
 425          for (Int_t i=0; i<ncons; i++) {
 426             AliAnalysisTask *task = (AliAnalysisTask*)list->At(i);
 427             task->CheckNotify(kTRUE);
 428             // If task is active, execute it
 429             if (task->IsPostEventLoop() && task->IsActive()) {
 430                if (fDebug > 1) {
 431                   cout << "== Executing post event loop task " << task->GetName() << endl;
 432                }
 433                task->ExecuteTask();
 434             }
 435          }
 436       }
 437       // Check if the output need to be written to a file.
 438       const char *filename = output->GetFileName();
 439       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
 440           if (fOutputEventHandler) filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
 441       }
 442
 443       if (!filename || !strlen(filename)) continue;
 444       TFile *file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
 445       TDirectory *opwd = gDirectory;
 446       if (file) file->cd();
 447       else      file = new TFile(filename, "RECREATE");
 448       if (file->IsZombie()) continue;
 449       // Reparent data to this file
 450       TMethodCall callEnv;
 451       if (output->GetData()->IsA())
 452          callEnv.InitWithPrototype(output->GetData()->IsA(), "SetDirectory", "TDirectory*");
 453       if (callEnv.IsValid()) {
 454          callEnv.SetParam((Long_t) file);
 455          callEnv.Execute(output->GetData());
 456       }
 457       output->GetData()->Write();
 458       if (opwd) opwd->cd();
 459    }
 460    if (fDebug > 1) {
 461       cout << "<-AliAnalysisManager::UnpackOutput()" << endl;
 462    }
 463 }
 464
 465 //______________________________________________________________________________
 466 void AliAnalysisManager::Terminate()
 467 {
 468   // The Terminate() function is the last function to be called during
 469   // a query. It always runs on the client, it can be used to present
 470   // the results graphically.
 471    if (fDebug > 1) {
 472       cout << "->AliAnalysisManager::Terminate()" << endl;
 473    }
 474    AliAnalysisTask *task;
 475    TIter next(fTasks);
 476    // Call Terminate() for tasks
 477    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->Terminate();
 478    if (fDebug > 1) {
 479       cout << "<-AliAnalysisManager::Terminate()" << endl;
 480    }
 481    //
 482    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->TerminateIO();
 483    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->TerminateIO();
 484    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->TerminateIO();
 485    TIter next1(fOutputs);
 486    AliAnalysisDataContainer *output;
 487    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
 488       // Close all files at output
 489       const char *filename = output->GetFileName();
 490       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
 491          if (fOutputEventHandler) filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
 492       }
 493
 494       if (!filename || !strlen(filename)) continue;
 495       TFile *file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
 496       if (!file || file->IsZombie()) continue;
 497       file->Close();
 498    }
 499
 500    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
 501    if (getsysInfo) {
 502       TDirectory *cdir = gDirectory;
 503       TFile f("syswatch.root", "RECREATE");
 504       if (!f.IsZombie()) {
 505          TTree *tree = AliSysInfo::MakeTree("syswatch.log");
 506          tree->SetMarkerStyle(kCircle);
 507          tree->SetMarkerColor(kBlue);
 508          tree->SetMarkerSize(0.5);
 509          if (!gROOT->IsBatch()) {
 510             tree->SetAlias("event", "id0");
 511             tree->SetAlias("memUSED", "mi.fMemUsed");
 512             tree->SetAlias("userCPU", "pI.fCpuUser");
 513             TCanvas *c = new TCanvas("SysInfo","SysInfo",10,10,800,600);
 514             c->Divide(2,1,0.01,0.01);
 515             c->cd(1);
 516             tree->Draw("memUSED:event","","", 1234567890, 0);
 517             c->cd(2);
 518             tree->Draw("userCPU:event","","", 1234567890, 0);
 519          }
 520          tree->Write();
 521          f.Close();
 522          delete tree;
 523       }
 524       if (cdir) cdir->cd();
 525    }
 526 }
 527
 528 //______________________________________________________________________________
 529 void AliAnalysisManager::AddTask(AliAnalysisTask *task)
 530 {
 531 // Adds a user task to the global list of tasks.
 532    task->SetActive(kFALSE);
 533    fTasks->Add(task);
 534 }
 535
 536 //______________________________________________________________________________
 537 AliAnalysisTask *AliAnalysisManager::GetTask(const char *name) const
 538 {
 539 // Retreive task by name.
 540    if (!fTasks) return NULL;
 541    return (AliAnalysisTask*)fTasks->FindObject(name);
 542 }
 543
 544 //______________________________________________________________________________
 545 AliAnalysisDataContainer *AliAnalysisManager::CreateContainer(const char *name,
 546                                 TClass *datatype, EAliAnalysisContType type, const char *filename)
 547 {
 548 // Create a data container of a certain type. Types can be:
 549 //   kExchangeContainer  = 0, used to exchange date between tasks
 550 //   kInputContainer   = 1, used to store input data
 551 //   kOutputContainer  = 2, used for posting results
 552    if (fContainers->FindObject(name)) {
 553       Error("CreateContainer","A container named %s already defined !\n",name);
 554       return NULL;
 555    }
 556    AliAnalysisDataContainer *cont = new AliAnalysisDataContainer(name, datatype);
 557    fContainers->Add(cont);
 558    switch (type) {
 559       case kInputContainer:
 560          fInputs->Add(cont);
 561          break;
 562       case kOutputContainer:
 563          fOutputs->Add(cont);
 564          if (filename && strlen(filename)) {
 565             cont->SetFileName(filename);
 566             cont->SetDataOwned(kFALSE);  // data owned by the file
 567          }
 568          break;
 569       case kExchangeContainer:
 570          break;
 571    }
 572    return cont;
 573 }
 574
 575 //______________________________________________________________________________
 576 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectInput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
 577                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 578 {
 579 // Connect input of an existing task to a data container.
 580    if (!fTasks->FindObject(task)) {
 581       AddTask(task);
 582       Warning("ConnectInput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
 583    }
 584    Bool_t connected = task->ConnectInput(islot, cont);
 585    return connected;
 586 }
 587
 588 //______________________________________________________________________________
 589 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectOutput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
 590                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 591 {
 592 // Connect output of an existing task to a data container.
 593    if (!fTasks->FindObject(task)) {
 594       AddTask(task);
 595       Warning("ConnectOutput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
 596    }
 597    Bool_t connected = task->ConnectOutput(islot, cont);
 598    return connected;
 599 }
 600
 601 //______________________________________________________________________________
 602 void AliAnalysisManager::CleanContainers()
 603 {
 604 // Clean data from all containers that have already finished all client tasks.
 605    TIter next(fContainers);
 606    AliAnalysisDataContainer *cont;
 607    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer *)next())) {
 608       if (cont->IsOwnedData() &&
 609           cont->IsDataReady() &&
 610           cont->ClientsExecuted()) cont->DeleteData();
 611    }
 612 }
 613
 614 //______________________________________________________________________________
 615 Bool_t AliAnalysisManager::InitAnalysis()
 616 {
 617 // Initialization of analysis chain of tasks. Should be called after all tasks
 618 // and data containers are properly connected
 619    // Check for input/output containers
 620    fInitOK = kFALSE;
 621    // Check for top tasks (depending only on input data containers)
 622    if (!fTasks->First()) {
 623       Error("InitAnalysis", "Analysis has no tasks !");
 624       return kFALSE;
 625    }
 626    TIter next(fTasks);
 627    AliAnalysisTask *task;
 628    AliAnalysisDataContainer *cont;
 629    Int_t ntop = 0;
 630    Int_t nzombies = 0;
 631    Bool_t iszombie = kFALSE;
 632    Bool_t istop = kTRUE;
 633    Int_t i;
 634    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 635       istop = kTRUE;
 636       iszombie = kFALSE;
 637       Int_t ninputs = task->GetNinputs();
 638       for (i=0; i<ninputs; i++) {
 639          cont = task->GetInputSlot(i)->GetContainer();
 640          if (!cont) {
 641             if (!iszombie) {
 642                task->SetZombie();
 643                fZombies->Add(task);
 644                nzombies++;
 645                iszombie = kTRUE;
 646             }
 647             Error("InitAnalysis", "Input slot %d of task %s has no container connected ! Declared zombie...",
 648                   i, task->GetName());
 649          }
 650          if (iszombie) continue;
 651          // Check if cont is an input container
 652          if (istop && !fInputs->FindObject(cont)) istop=kFALSE;
 653          // Connect to parent task
 654       }
 655       if (istop) {
 656          ntop++;
 657          fTopTasks->Add(task);
 658       }
 659    }
 660    if (!ntop) {
 661       Error("InitAnalysis", "No top task defined. At least one task should be connected only to input containers");
 662       return kFALSE;
 663    }
 664    // Check now if there are orphan tasks
 665    for (i=0; i<ntop; i++) {
 666       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
 667       task->SetUsed();
 668    }
 669    Int_t norphans = 0;
 670    next.Reset();
 671    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 672       if (!task->IsUsed()) {
 673          norphans++;
 674          Warning("InitAnalysis", "Task %s is orphan", task->GetName());
 675       }
 676    }
 677    // Check the task hierarchy (no parent task should depend on data provided
 678    // by a daughter task)
 679    for (i=0; i<ntop; i++) {
 680       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
 681       if (task->CheckCircularDeps()) {
 682          Error("InitAnalysis", "Found illegal circular dependencies between following tasks:");
 683          PrintStatus("dep");
 684          return kFALSE;
 685       }
 686    }
 687    // Check that all containers feeding post-event loop tasks are in the outputs list
 688    TIter nextcont(fContainers); // loop over all containers
 689    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextcont())) {
 690       if (!cont->IsPostEventLoop() && !fOutputs->FindObject(cont)) {
 691          if (cont->HasConsumers()) {
 692          // Check if one of the consumers is post event loop
 693             TIter nextconsumer(cont->GetConsumers());
 694             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextconsumer())) {
 695                if (task->IsPostEventLoop()) {
 696                   fOutputs->Add(cont);
 697                   break;
 698                }
 699             }
 700          }
 701       }
 702    }
 703    fInitOK = kTRUE;
 704    return kTRUE;
 705 }
 706
 707 //______________________________________________________________________________
 708 void AliAnalysisManager::PrintStatus(Option_t *option) const
 709 {
 710 // Print task hierarchy.
 711    if (!fInitOK) {
 712       Info("PrintStatus", "Analysis manager %s not initialized : call InitAnalysis() first", GetName());
 713       return;
 714    }
 715    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
 716    if (getsysInfo)
 717       Info("PrintStatus", "System information will be collected each %lld events", fNSysInfo);
 718    TIter next(fTopTasks);
 719    AliAnalysisTask *task;
 720    while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
 721       task->PrintTask(option);
 722 }
 723
 724 //______________________________________________________________________________
 725 void AliAnalysisManager::ResetAnalysis()
 726 {
 727 // Reset all execution flags and clean containers.
 728    CleanContainers();
 729 }
 730
 731 //______________________________________________________________________________
 732 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
 733 {
 734 // Start analysis for this manager. Analysis task can be: LOCAL, PROOF or GRID.
 735 // Process nentries starting from firstentry
 736    if (!fInitOK) {
 737       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
 738       return;
 739    }
 740    if (fDebug>1) {
 741       cout << "StartAnalysis: " << GetName() << endl;
 742    }
 743    TString anaType = type;
 744    anaType.ToLower();
 745    fMode = kLocalAnalysis;
 746    if (tree) {
 747       if (anaType.Contains("proof"))     fMode = kProofAnalysis;
 748       else if (anaType.Contains("grid")) fMode = kGridAnalysis;
 749    }
 750    if (fMode == kGridAnalysis) {
 751       Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
 752       fMode = kLocalAnalysis;
 753    }
 754    char line[128];
 755    SetEventLoop(kFALSE);
 756    // Disable all branches if requested and set event loop mode
 757    if (tree) {
 758       if (TestBit(kDisableBranches)) {
 759          printf("Disabling all branches...\n");
 760 //         tree->SetBranchStatus("*",0); // not yet working
 761       }
 762       SetEventLoop(kTRUE);
 763    }
 764
 765    TChain *chain = 0;
 766    TString ttype = "TTree";
 767    if (tree->IsA() == TChain::Class()) {
 768       chain = (TChain*)tree;
 769       ttype = "TChain";
 770    }
 771
 772    // Initialize locally all tasks
 773    TIter next(fTasks);
 774    AliAnalysisTask *task;
 775    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 776       task->LocalInit();
 777    }
 778
 779    switch (fMode) {
 780       case kLocalAnalysis:
 781          if (!tree) {
 782             TIter next(fTasks);
 783             AliAnalysisTask *task;
 784             // Call CreateOutputObjects for all tasks
 785             while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 786                TDirectory *curdir = gDirectory;
 787                task->CreateOutputObjects();
 788                if (curdir) curdir->cd();
 789             }
 790             ExecAnalysis();
 791             Terminate();
 792             return;
 793          }
 794          // Run tree-based analysis via AliAnalysisSelector
 795          cout << "===== RUNNING LOCAL ANALYSIS " << GetName() << " ON TREE " << tree->GetName() << endl;
 796          sprintf(line, "AliAnalysisSelector *selector = new AliAnalysisSelector((AliAnalysisManager*)0x%lx);",(ULong_t)this);
 797          gROOT->ProcessLine(line);
 798          sprintf(line, "((%s*)0x%lx)->Process(selector, \"\",%lld, %lld);",ttype.Data(),(ULong_t)tree, nentries, firstentry);
 799          gROOT->ProcessLine(line);
 800          break;
 801       case kProofAnalysis:
 802          if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
 803             printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
 804             return;
 805          }
 806          sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
 807          gROOT->ProcessLine(line);
 808          if (chain) {
 809             chain->SetProof();
 810             cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON CHAIN " << chain->GetName() << endl;
 811             chain->Process("AliAnalysisSelector", "", nentries, firstentry);
 812          } else {
 813             printf("StartAnalysis: no chain\n");
 814             return;
 815          }
 816          break;
 817       case kGridAnalysis:
 818          Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
 819    }
 820 }
 821
 822 //______________________________________________________________________________
 823 void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
 824 {
 825 // Execute analysis.
 826    static Long64_t ncalls = 0;
 827    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
 828    if (getsysInfo && ncalls==0) AliSysInfo::AddStamp("Start", (Int_t)ncalls);
 829    ncalls++;
 830    if (!fInitOK) {
 831      Error("ExecAnalysis", "Analysis manager was not initialized !");
 832       return;
 833    }
 834    AliAnalysisTask *task;
 835    // Check if the top tree is active.
 836    if (fTree) {
 837       TIter next(fTasks);
 838    // De-activate all tasks
 839       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->SetActive(kFALSE);
 840       AliAnalysisDataContainer *cont = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
 841       if (!cont) {
 842               Error("ExecAnalysis","Cannot execute analysis in TSelector mode without at least one top container");
 843          return;
 844       }
 845       cont->SetData(fTree); // This will notify all consumers
 846       Long64_t entry = fTree->GetTree()->GetReadEntry();
 847
 848 //
 849 //    Call BeginEvent() for optional input/output and MC services
 850       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
 851       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
 852       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
 853 //
 854 //    Execute the tasks
 855       TIter next1(cont->GetConsumers());
 856       while ((task=(AliAnalysisTask*)next1())) {
 857          if (fDebug >1) {
 858             cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
 859          }
 860
 861          task->ExecuteTask(option);
 862       }
 863 //
 864 //    Call FinishEvent() for optional output and MC services
 865       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
 866       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
 867       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
 868       // Gather system information if requested
 869       if (getsysInfo && ((ncalls%fNSysInfo)==0))
 870          AliSysInfo::AddStamp(Form("Event#%lld",ncalls),(Int_t)ncalls);
 871       return;
 872    }
 873    // The event loop is not controlled by TSelector
 874 //
 875 //  Call BeginEvent() for optional input/output and MC services
 876    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(-1);
 877    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(-1);
 878    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(-1);
 879    TIter next2(fTopTasks);
 880    while ((task=(AliAnalysisTask*)next2())) {
 881       task->SetActive(kTRUE);
 882       if (fDebug > 1) {
 883          cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
 884       }
 885       task->ExecuteTask(option);
 886    }
 887 //
 888 // Call FinishEvent() for optional output and MC services
 889    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
 890    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
 891    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
 892 }
 893
 894 //______________________________________________________________________________
 895 void AliAnalysisManager::FinishAnalysis()
 896 {
 897 // Finish analysis.
 898 }