EMCAL/AliEMCALClusterizerv1.cxx

   1
   2 /**************************************************************************
   3  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   4  *                                                                        *
   5  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   6  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   7  *                                                                        *
   8  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   9  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  10  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  11  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  12  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  13  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  14  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  15  **************************************************************************/
  16
  17 /* $Id$ */
  18
  19 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  20 //  August 2002 Yves Schutz: clone PHOS as closely as possible and intoduction
  21 //                           of new  IO (à la PHOS)
  22 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  23 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  24 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  25 //  Results are stored in TreeR#, branches EMCALTowerRP (EMC recPoints),
  26 //  EMCALPreShoRP (CPV RecPoints) and AliEMCALClusterizer (Clusterizer with all
  27 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  28 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  29 //  standalone mode.
  30 // Use Case:
  31 //  root [0] AliEMCALClusterizerv1 * cl = new AliEMCALClusterizerv1("galice.root")
  32 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  33 //               //reads gAlice from header file "..."
  34 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  35 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  36 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  37 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  38 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  39 //               //sets another title four output branches
  40 //  root [4] cl->SetTowerLocalMaxCut(0.03)
  41 //               //set clusterization parameters
  42 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  43 //               //once more finds RecPoints options are
  44 //               // deb - print number of found rec points
  45 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  46 //               // time - print benchmarking results
  47
  48 // --- ROOT system ---
  49
  50 #include "TROOT.h"
  51 #include "TFile.h"
  52 #include "TFolder.h"
  53 #include "TMath.h"
  54 #include "TMinuit.h"
  55 #include "TTree.h"
  56 #include "TSystem.h"
  57 #include "TBenchmark.h"
  58
  59 // --- Standard library ---
  60
  61
  62 // --- AliRoot header files ---
  63 #include "AliEMCALGetter.h"
  64 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
  65 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  66 #include "AliEMCALDigit.h"
  67 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  68 #include "AliEMCAL.h"
  69 #include "AliEMCALGeometry.h"
  70
  71 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
  72
  73 Int_t addOn[20][60][60];
  74
  75 //____________________________________________________________________________
  76   AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1() : AliEMCALClusterizer()
  77 {
  78   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
  79
  80   InitParameters() ;
  81   fDefaultInit = kTRUE ;
  82   for(Int_t is=0;is<20;is++){
  83     for(Int_t i=0;i<60;i++){
  84       for(Int_t j=0;j<60;j++){
  85         addOn[is][i][j]=0;
  86       }
  87     }
  88   }
  89 //PH   cout<<"file to read 1"<<endl;
  90   ReadFile();
  91 //PH   cout<<"file read 1"<<endl;
  92 }
  93
  94 //____________________________________________________________________________
  95 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1(const TString alirunFileName, const TString eventFolderName)
  96 :AliEMCALClusterizer(alirunFileName, eventFolderName)
  97 {
  98   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
  99
 100   InitParameters() ;
 101   Init() ;
 102   fDefaultInit = kFALSE ;
 103   for(Int_t is=0;is<20;is++){
 104     for(Int_t i=0;i<60;i++){
 105       for(Int_t j=0;j<60;j++){
 106         addOn[is][i][j]=0;
 107       }
 108     }
 109   }
 110 //PH   cout<<"file to read 2"<<endl;
 111   ReadFile();
 112 //PH   cout<<"file read 2"<<endl;
 113
 114 }
 115
 116 //____________________________________________________________________________
 117   AliEMCALClusterizerv1::~AliEMCALClusterizerv1()
 118 {
 119   // dtor
 120
 121 }
 122
 123 //____________________________________________________________________________
 124 const TString AliEMCALClusterizerv1::BranchName() const
 125 {
 126    return GetName();
 127
 128 }
 129
 130 //____________________________________________________________________________
 131 Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp) const
 132 {
 133   //To be replased later by the method, reading individual parameters from the database
 134   return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 135 }
 136
 137 //____________________________________________________________________________
 138 void AliEMCALClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
 139 {
 140   // Steering method to perform clusterization for events
 141   // in the range from fFirstEvent to fLastEvent.
 142   // This range is optionally set by SetEventRange().
 143   // if fLastEvent=-1 (by default), then process events until the end.
 144
 145   if(strstr(option,"tim"))
 146     gBenchmark->Start("EMCALClusterizer");
 147
 148   if(strstr(option,"print"))
 149     Print("") ;
 150
 151   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 152
 153   if (fLastEvent == -1)
 154     fLastEvent = gime->MaxEvent() - 1;
 155   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
 156
 157   Int_t ievent ;
 158   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
 159     gime->Event(ievent,"D") ;
 160     GetCalibrationParameters() ;
 161
 162     fNumberOfECAClusters = 0;
 163
 164     MakeClusters() ;
 165
 166     if(fToUnfold)
 167       MakeUnfolding() ;
 168
 169     WriteRecPoints() ;
 170
 171     if(strstr(option,"deb"))
 172       PrintRecPoints(option) ;
 173
 174     //increment the total number of recpoints per run
 175     fRecPointsInRun += gime->ECARecPoints()->GetEntriesFast() ;
 176   }
 177
 178   Unload();
 179
 180   if(strstr(option,"tim")){
 181     gBenchmark->Stop("EMCALClusterizer");
 182     printf("Exec took %f seconds for Clusterizing %f seconds per event",
 183          gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer"), gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer")/nEvents ) ;
 184   }
 185
 186   SaveHists();
 187
 188 }
 189
 190 //____________________________________________________________________________
 191 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 192                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 193 {
 194   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 195   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 196   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 197
 198   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 199   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 200
 201   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 202   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 203   gMinuit->SetFCN(AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 204                                          // To set the address of the minimization function
 205   TList * toMinuit = new TList();
 206   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 207   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
 208
 209   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 210
 211   // filling initial values for fit parameters
 212   AliEMCALDigit * digit ;
 213
 214   Int_t ierflg  = 0;
 215   Int_t index   = 0 ;
 216   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 217
 218   Int_t iDigit ;
 219
 220   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 221
 222   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 223     digit = maxAt[iDigit];
 224
 225     Int_t relid[2] ;
 226     Float_t x = 0.;
 227     Float_t z = 0.;
 228     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 229     geom->PosInAlice(relid, x, z) ;
 230
 231     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 232
 233     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 234     index++ ;
 235     if(ierflg != 0){
 236       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : x = %f",  x ) ;
 237       return kFALSE;
 238     }
 239     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 240     index++ ;
 241     if(ierflg != 0){
 242        Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : z = %f", z) ;
 243       return kFALSE;
 244     }
 245     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 246     index++ ;
 247     if(ierflg != 0){
 248      Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : energy = %f", energy) ;
 249       return kFALSE;
 250     }
 251   }
 252
 253   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 254                       //  depends on it.
 255   Double_t p1 = 1.0 ;
 256   Double_t p2 = 0.0 ;
 257
 258   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 259   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 260   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 261   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 262
 263   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 264
 265   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 266     Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Fit not converged, cluster abandoned " ) ;
 267     return kFALSE ;
 268   }
 269   for(index = 0; index < nPar; index++){
 270     Double_t err ;
 271     Double_t val ;
 272     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 273     fitparameters[index] = val ;
 274    }
 275
 276   delete toMinuit ;
 277   return kTRUE;
 278
 279 }
 280
 281 //____________________________________________________________________________
 282 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 283 {
 284   // Gets the parameters for the calibration from the digitizer
 285   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 286
 287   if ( !gime->Digitizer() )
 288     gime->LoadDigitizer();
 289   AliEMCALDigitizer * dig = gime->Digitizer();
 290
 291   fADCchannelECA   = dig->GetECAchannel() ;
 292   fADCpedestalECA  = dig->GetECApedestal();
 293 //PH  cout<<"ChannelECA, peds "<<fADCchannelECA<<" "<<fADCpedestalECA<<endl;
 294 }
 295
 296 //____________________________________________________________________________
 297 void AliEMCALClusterizerv1::Init()
 298 {
 299   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 300   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
 301
 302   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance();
 303   if(!gime)
 304     gime = AliEMCALGetter::Instance(GetTitle(), fEventFolderName.Data());
 305
 306   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 307 //PH   cout<<"gime,geom "<<gime<<" "<<geom<<endl;
 308
 309 //Sub  fNTowers = geom->GetNZ() *  geom->GetNPhi() ;
 310   fNTowers =400;
 311   if(!gMinuit)
 312     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 313  //Sub if ( !gime->Clusterizer() )
 314  //Sub   gime->PostClusterizer(this);
 315  BookHists();
 316 //PH   cout<<"hists booked "<<endl;
 317 }
 318
 319 //____________________________________________________________________________
 320 void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
 321 {
 322   // Initializes the parameters for the Clusterizer
 323   fNumberOfECAClusters = 0;
 324
 325   fECAClusteringThreshold   = 0.5;  // value obtained from Alexei
 326   fECALocMaxCut = 0.03;
 327
 328   fECAW0     = 4.5 ;
 329   fTimeGate = 1.e-8 ;
 330   fToUnfold = kFALSE ;
 331   fRecPointsInRun  = 0 ;
 332   fMinECut = 0.3;
 333 }
 334
 335 //____________________________________________________________________________
 336 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2)const
 337 {
 338   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 339   //                                       = 1 are neighbour
 340   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 341   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 342   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 343   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 344
 345    AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGetter::Instance()->EMCALGeometry() ;
 346
 347   Int_t rv = 0 ;
 348
 349   Int_t relid1[2] ;
 350  //Sub geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 351     Int_t nSupMod=0;
 352     Int_t nTower=0;
 353     Int_t nIphi=0;
 354     Int_t nIeta=0;
 355     Int_t iphi=0;
 356     Int_t ieta=0;
 357    geom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 358    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 359    relid1[0]=ieta;
 360    relid1[1]=iphi;
 361
 362
 363     Int_t nSupMod1=0;
 364     Int_t nTower1=0;
 365     Int_t nIphi1=0;
 366     Int_t nIeta1=0;
 367     Int_t iphi1=0;
 368     Int_t ieta1=0;
 369    geom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
 370    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1, nTower1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
 371    Int_t relid2[2] ;
 372    relid2[0]=ieta1;
 373    relid2[1]=iphi1;
 374
 375   //Sub  geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 376
 377
 378   Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 379   Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 380
 381   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 382       rv = 1 ;
 383   }
 384   else {
 385     if((relid2[0] > relid1[0]) && (relid2[1] > relid1[1]+1))
 386       rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 387   }
 388
 389   if (gDebug == 2 )
 390 if(rv==1)printf("AreNeighbours: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n",
 391          rv, d1->GetId(), relid1[0], relid1[1],
 392          d2->GetId(), relid2[0], relid2[1]) ;
 393
 394   return rv ;
 395 }
 396
 397 //____________________________________________________________________________
 398 void AliEMCALClusterizerv1::Unload()
 399 {
 400   // Unloads the Digits and RecPoints
 401   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 402   gime->EmcalLoader()->UnloadDigits() ;
 403   gime->EmcalLoader()->UnloadRecPoints() ;
 404 }
 405
 406 //____________________________________________________________________________
 407 void AliEMCALClusterizerv1::WriteRecPoints()
 408 {
 409
 410   // Creates new branches with given title
 411   // fills and writes into TreeR.
 412
 413   AliEMCALGetter *gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 414
 415   TObjArray * aECARecPoints = gime->ECARecPoints() ;
 416
 417   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 418   TTree * treeR = gime->TreeR(); ;
 419
 420   Int_t index ;
 421
 422   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties for EC section
 423   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
 424     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->EvalAll(fECAW0,digits) ;
 425
 426   aECARecPoints->Sort() ;
 427
 428   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
 429     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->SetIndexInList(index) ;
 430
 431   aECARecPoints->Expand(aECARecPoints->GetEntriesFast()) ;
 432
 433   Int_t bufferSize = 32000 ;
 434   Int_t splitlevel = 0 ;
 435
 436   //EC section branch
 437   TBranch * branchECA = treeR->Branch("EMCALECARP","TObjArray",&aECARecPoints,bufferSize,splitlevel);
 438   branchECA->SetTitle(BranchName());
 439
 440   branchECA->Fill() ;
 441
 442   gime->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 443   gime->WriteClusterizer("OVERWRITE");
 444 }
 445
 446 //____________________________________________________________________________
 447 void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
 448 {
 449   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 450   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 451
 452   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 453
 454   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 455
 456   TObjArray * aECARecPoints  = gime->ECARecPoints() ;
 457
 458   aECARecPoints->Delete() ;
 459
 460   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 461   TClonesArray * digitsC =  dynamic_cast<TClonesArray*>(digits->Clone()) ;
 462
 463   // Clusterization starts
 464   TIter nextdigit(digitsC) ;
 465   AliEMCALDigit * digit;
 466
 467 //just for hist
 468 /*
 469   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
 470           digitAmp->Fill(digit->GetAmp());
 471   }
 472   */
 473 ///////////
 474
 475   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
 476     AliEMCALRecPoint * clu = 0 ;
 477
 478     TArrayI clusterECAdigitslist(50000);
 479
 480 //Sub    if (gDebug == 2) {
 481    //  printf("MakeClusters: id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),Calibrate(digit->GetAmp()),
 482 //         fECAClusteringThreshold) ;
 483 //    }
 484 ////////////////////////temp solution, embedding///////////////////
 485    int nSupMod=0, nTower=0, nIphi=0, nIeta=0;
 486    int iphi=0, ieta=0;
 487           geom->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 488           geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 489
 490          ///////////////////////////////////
 491
 492 //cout<<ieta<<" "<<iphi<<endl;
 493
 494 //    if ( geom->IsInECA(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()) > fECAClusteringThreshold  ) ){
 495     if (geom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) > fECAClusteringThreshold  ) ){
 496       //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"11 digit, add "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 497 //          cout<<"crossed the threshold "<<endl;
 498       Int_t iDigitInECACluster = 0;
 499       // start a new Tower RecPoint
 500       if(fNumberOfECAClusters >= aECARecPoints->GetSize())
 501           aECARecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
 502       AliEMCALRecPoint * rp = new  AliEMCALRecPoint("") ;
 503       aECARecPoints->AddAt(rp, fNumberOfECAClusters) ;
 504       clu = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ;
 505       fNumberOfECAClusters++ ;
 506       clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1])) ;
 507       clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digit->GetIndexInList() ;
 508       iDigitInECACluster++ ;
 509 //    cout<<" 1st setp:cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 510       digitsC->Remove(digit) ;
 511       if (gDebug == 2 )
 512         printf("MakeClusters: OK id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),Calibrate(digit->GetAmp()), fECAClusteringThreshold) ;
 513       nextdigit.Reset() ;
 514
 515       AliEMCALDigit * digitN ;
 516       Int_t index = 0 ;
 517
 518       // Find the neighbours
 519       while (index < iDigitInECACluster){ // scan over digits already in cluster
 520         digit =  (AliEMCALDigit*)digits->At(clusterECAdigitslist[index])  ;
 521         index++ ;
 522         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigit())) { // scan over the reduced list of digits
 523 //      cout<<"we have new digit "<<endl;
 524           // check that the digit is above the min E Cut
 525          ////////////////////
 526           geom->GetCellIndex(digitN->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 527           geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 528           ////////////////
 529           if(Calibrate(digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  )  digitsC->Remove(digitN);
 530 //      cout<<" new digit above ECut "<<endl;
 531           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 532 //      cout<<" new digit neighbour?? "<<ineb<<endl;
 533          switch (ineb ) {
 534           case 0 :   // not a neighbour
 535             break ;
 536           case 1 :   // are neighbours
 537             //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"22 digit, add "<<nSupMod<<" "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 538             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) ) ;
 539             clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 540             iDigitInECACluster++ ;
 541 //    cout<<"when neighbour: cluno, digNo "<<digit->GetId()<<" "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 542             digitsC->Remove(digitN) ;
 543 //          break ;
 544 //          case 2 :   // too far from each other
 545 //Subh      goto endofloop1;
 546 //          cout<<"earlier go to end of loop"<<endl;
 547           } // switch
 548     //cout<<"in nextDigit loop "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 549         } // while digitN
 550
 551 //Sub      endofloop1: ;
 552         nextdigit.Reset() ;
 553       } // loop over ECA cluster
 554     } // energy threshold
 555     else if(Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  ){
 556       //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"33 digit, add  "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 557       digitsC->Remove(digit);
 558     }
 559     //cout<<"after endofloop: cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<endl;
 560   } // while digit
 561   delete digitsC ;
 562 cout<<"total no of clusters "<<fNumberOfECAClusters<<" from "<<digits->GetEntriesFast()<<" digits"<<endl;
 563 }
 564
 565 //____________________________________________________________________________
 566 void AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding() const
 567 {
 568   Fatal("AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding", "--> Unfolding not implemented") ;
 569
 570 }
 571
 572 //____________________________________________________________________________
 573 Double_t  AliEMCALClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 574 {
 575   // Shape of the shower (see EMCAL TDR)
 576   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 577
 578   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 579   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 580   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 581   return shape ;
 582 }
 583
 584 //____________________________________________________________________________
 585 void  AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster(AliEMCALRecPoint * /*iniTower*/,
 586                                            Int_t /*nMax*/,
 587                                            AliEMCALDigit ** /*maxAt*/,
 588                                            Float_t * /*maxAtEnergy*/) const
 589 {
 590   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 591
 592   Fatal("UnfoldCluster", "--> Unfolding not implemented") ;
 593
 594 }
 595
 596 //_____________________________________________________________________________
 597 void AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & /*nPar*/, Double_t * /*Grad*/,
 598                                                Double_t & /*fret*/,
 599                                                Double_t * /*x*/, Int_t /*iflag*/)
 600 {
 601   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 602   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 603
 604   ::Fatal("UnfoldingChiSquare","Unfolding not implemented") ;
 605 }
 606 //____________________________________________________________________________
 607 void AliEMCALClusterizerv1::Print(Option_t * /*option*/)const
 608 {
 609   // Print clusterizer parameters
 610
 611   TString message("\n") ;
 612
 613   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
 614
 615     // Print parameters
 616
 617     TString taskName(GetName()) ;
 618     taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
 619
 620     printf("--------------- ");
 621     printf(taskName.Data()) ;
 622     printf(" ");
 623     printf(GetTitle()) ;
 624     printf("-----------\n");
 625     printf("Clusterizing digits from the file: ");
 626     printf(taskName.Data());
 627     printf("\n                           Branch: ");
 628     printf(GetName());
 629     printf("\n                       ECA Local Maximum cut    = %f", fECALocMaxCut);
 630     printf("\n                       ECA Logarithmic weight   = %f", fECAW0);
 631     if(fToUnfold)
 632       printf("\nUnfolding on\n");
 633     else
 634       printf("\nUnfolding off\n");
 635
 636     printf("------------------------------------------------------------------");
 637   }
 638   else
 639     printf("AliEMCALClusterizerv1 not initialized ") ;
 640 }
 641
 642 //____________________________________________________________________________
 643 void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
 644 {
 645   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
 646
 647   TObjArray * aECARecPoints = AliEMCALGetter::Instance()->ECARecPoints() ;
 648   printf("PrintRecPoints: Clusterization result:") ;
 649
 650   printf("event # %d\n", gAlice->GetEvNumber() ) ;
 651   printf("           Found %d ECA Rec Points\n ",
 652          aECARecPoints->GetEntriesFast()) ;
 653
 654   fRecPointsInRun +=  aECARecPoints->GetEntriesFast() ;
 655
 656   if(strstr(option,"all")) {
 657     Int_t index =0;
 658     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n") ;
 659     printf("Clusters in ECAL section\n") ;
 660     printf("Index    Ene(GeV) Multi Module     phi     r   theta    X    Y      Z   Dispersion Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list\n") ;
 661    Float_t maxE=0;
 662    Float_t maxL1=0;
 663    Float_t maxL2=0;
 664    Float_t maxDis=0;
 665
 666     for (index = 0 ; index < aECARecPoints->GetEntries() ; index++) {
 667       AliEMCALRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint * >(aECARecPoints->At(index)) ;
 668       TVector3  globalpos;
 669       //rp->GetGlobalPosition(globalpos);
 670       TVector3  localpos;
 671       rp->GetLocalPosition(localpos);
 672       Float_t lambda[2];
 673       rp->GetElipsAxis(lambda);
 674       Int_t * primaries;
 675       Int_t nprimaries;
 676       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
 677       printf("\n%6d  %8.4f  %3d     %4.1f    %4.1f %4.1f  %4.1f %4.1f %4.1f    %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
 678              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(),
 679              globalpos.X(), globalpos.Y(), globalpos.Z(), localpos.X(), localpos.Y(), localpos.Z(),
 680              rp->GetDispersion(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
 681   /////////////
 682       if(rp->GetEnergy()>maxE){
 683               maxE=rp->GetEnergy();
 684               maxL1=lambda[0];
 685               maxL2=lambda[1];
 686               maxDis=rp->GetDispersion();
 687       }
 688       pointE->Fill(rp->GetEnergy());
 689       pointL1->Fill(lambda[0]);
 690       pointL2->Fill(lambda[1]);
 691       pointDis->Fill(rp->GetDispersion());
 692       pointMult->Fill(rp->GetMultiplicity());
 693       /////////////
 694       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
 695         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
 696       }
 697     }
 698
 699       MaxE->Fill(maxE);
 700       MaxL1->Fill(maxL1);
 701       MaxL2->Fill(maxL2);
 702       MaxDis->Fill(maxDis);
 703
 704
 705     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
 706   }
 707 }
 708   void AliEMCALClusterizerv1::BookHists()
 709 {
 710         pointE = new TH1F("pointE","point energy", 2000, 0.0, 150.);
 711         pointL1 = new TH1F("pointL1","point L1", 1000, 0.0, 3.);
 712         pointL2 = new TH1F("pointL2","point L2", 1000, 0.0, 3.);
 713         pointDis = new TH1F("pointDis","point Dis", 1000, 0.0, 3.);
 714         pointMult = new TH1F("pointMult","point Mult", 100, 0.0, 100.);
 715         digitAmp = new TH1F("digitAmp","Digit Amplitude", 2000, 0.0, 5000.);
 716         MaxE = new TH1F("maxE","Max point energy", 2000, 0.0, 150.);
 717         MaxL1 = new TH1F("maxL1","Max point L1", 1000, 0.0, 3.);
 718         MaxL2 = new TH1F("maxL2","Max point L2", 1000, 0.0, 3.);
 719         MaxDis = new TH1F("maxDis","Max point Dis", 1000, 0.0, 3.);
 720 }
 721 void AliEMCALClusterizerv1::SaveHists()
 722 {
 723  recofile=new TFile("reco.root","RECREATE");
 724         pointE->Write();
 725         pointL1->Write();
 726         pointL2->Write();
 727         pointDis->Write();
 728         pointMult->Write();
 729         digitAmp->Write();
 730       MaxE->Write();
 731       MaxL1->Write();
 732       MaxL2->Write();
 733       MaxDis->Write();
 734 recofile->Close();
 735 }
 736
 737 void AliEMCALClusterizerv1::ReadFile()
 738 {
 739   return; // 3-jan-05
 740         FILE *fp = fopen("hijing1.dat","r");
 741         for(Int_t line=0;line<9113;line++){
 742          Int_t eg,l1,l2,sm;
 743          Int_t ncols0;
 744          ncols0 = fscanf(fp,"%d %d %d %d",&sm,&l1,&l2,&eg);
 745         // cout<<eg<<" "<<l1<<" "<<l2<<endl;
 746          addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=eg;
 747          //addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=0;
 748         }
 749 }
 750