EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /*
  16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
  17
  18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
  19           S. Salur LBL April 2008
  20
  21 Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
  22 The idea:average counts for all the towers should be flat
  23 Change all existing histograms as experts
  24
  25 Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
  26 Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
  27 Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system
  28
  29 */
  30
  31 // --- ROOT system ---
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TFile.h>
  34 #include <TH1F.h>
  35 #include <TH1I.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TLine.h>
  38 #include <TText.h>
  39 #include <TProfile.h>
  40 #include <TProfile2D.h>
  41 #include <TStyle.h>
  42 // --- Standard library ---
  43
  44
  45 // --- AliRoot header files ---
  46 #include "AliDAQ.h"
  47 #include "AliESDCaloCluster.h"
  48 #include "AliESDCaloCells.h"
  49 #include "AliESDEvent.h"
  50 #include "AliLog.h"
  51 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
  52 #include "AliQAChecker.h"
  53 #include "AliEMCALDigit.h"
  54 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  55 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  56 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  57 #include "AliEMCALRecParam.h"
  58 #include "AliRawReader.h"
  59 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  60 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  61 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
  62 #include "AliQAManager.h"
  63 #include "AliCDBEntry.h"
  64
  65 #include "AliCaloBunchInfo.h"
  66 #include "AliCaloFitResults.h"
  67 #include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
  68 #include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
  69 #include "AliCaloRawAnalyzerKStandard.h"
  70 #include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
  71 #include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
  72 #include "AliEMCALGeometry.h"
  73 #include "AliEMCALTriggerSTURawStream.h"
  74
  75 #include "AliCaloRawAnalyzerFactory.h"
  76
  77 using namespace std;
  78
  79 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
  80
  81 //____________________________________________________________________________
  82 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(Int_t fitAlgo) :
  83   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
  84   fFittingAlgorithm(0),
  85   fRawAnalyzer(0),
  86   fRawAnalyzerTRU(0),
  87   fGeom(0),
  88   fSuperModules(20), // number of SuperModules; updated to 20 for EMCal + DCal
  89   fFirstPedestalSample(0),
  90   fLastPedestalSample(3),
  91   fFirstPedestalSampleTRU(0),
  92   fLastPedestalSampleTRU(3),
  93   fMinSignalLG(0),
  94   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  95   fMinSignalHG(0),
  96   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  97   fMinSignalTRU(0),
  98   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  99   fMinSignalLGLEDMon(0),
 100   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
 101   fMinSignalHGLEDMon(0),
 102   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
 103   fCalibRefHistoPro(NULL),
 104   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 105   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 106   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 107 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 108 //  fLineCol(NULL),
 109 //  fLineRow(NULL)
 110
 111 {
 112   // ctor
 113   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
 114
 115   fGeom = new AliEMCALGeometry("EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL_8SM", "EMCAL");
 116 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 117 //    fTextSM[sm] = NULL ;
 118 //  }
 119 }
 120
 121 //____________________________________________________________________________
 122 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
 123   AliQADataMakerRec(),
 124   fFittingAlgorithm(0),
 125   fRawAnalyzer(0),
 126   fRawAnalyzerTRU(0),
 127         fGeom(0),
 128   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()),
 129   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()),
 130   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),
 131   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()),
 132   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),
 133   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
 134   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
 135   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
 136   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
 137   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
 138   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
 139   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
 140   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
 141   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
 142   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
 143   fCalibRefHistoPro(NULL),
 144   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 145   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 146   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 147 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 148 //  fLineCol(NULL),
 149 //  fLineRow(NULL)
 150 {
 151   //copy ctor
 152   SetName((const char*)qadm.GetName()) ;
 153   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle());
 154   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
 155
 156 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 157 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 158 //  }
 159 }
 160
 161 //__________________________________________________________________
 162 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
 163 {
 164   // Equal operator.
 165   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
 166   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
 167 //  fLineCol = NULL;
 168 //  fLineRow = NULL;
 169 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 170 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 171 //  }
 172   return *this;
 173 }
 174
 175 //____________________________________________________________________________
 176 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
 177 {
 178   //Detector specific actions at end of cycle
 179
 180 //  if(fCycleCounter)
 181 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
 182
 183   // do the QA checking
 184   ResetEventTrigClasses(); // reset triggers list to select all histos
 185   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;
 186 }
 187
 188 //____________________________________________________________________________
 189 void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
 190 {
 191   //Get the reference histogram from OCDB
 192   TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
 193   TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
 194   sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 195   sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 196
 197   TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 198   if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
 199     AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ;
 200   } else {
 201     AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;
 202     AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
 203     if ( ! manQA->GetLock() ) {
 204       manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 205       manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 206       manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ;
 207       manQA->SetLock() ;
 208     }
 209     char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ;
 210     AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
 211     if (entry) {
 212       TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
 213       if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
 214         AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ;
 215         listDetQAD = NULL ;
 216       }
 217       TObjArray * dirOCDB= NULL ;
 218       if ( listDetQAD )
 219         dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;
 220       if (dirOCDB){
 221         fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ;
 222         fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ;
 223       }
 224     }
 225   }
 226
 227   if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
 228
 229     //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 230     Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 231     Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 232     Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 233
 234     if(!fCalibRefHistoH2F)
 235       fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
 236     ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ;
 237   } else {
 238     AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ;
 239   }
 240 }
 241 //____________________________________________________________________________
 242 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
 243 {
 244   //Create histograms to controll ESD
 245   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 246   const Bool_t image    = kTRUE ;
 247
 248   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ;
 249   h1->Sumw2() ;
 250   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;
 251
 252   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ;
 253   h2->Sumw2() ;
 254   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
 255
 256   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ;
 257   h3->Sumw2() ;
 258   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;
 259
 260   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ;
 261   h4->Sumw2() ;
 262   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
 263   //
 264   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kESDS); // this should be the last line
 265 }
 266
 267 //____________________________________________________________________________
 268 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 269 {
 270   // create Digits histograms in Digits subdir
 271   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 272   const Bool_t image    = kTRUE ;
 273
 274   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ;
 275   h0->Sumw2() ;
 276   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
 277   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ;
 278   h1->Sumw2() ;
 279   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
 280   //
 281   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kDIGITS); // this should be the last line
 282 }
 283
 284 //____________________________________________________________________________
 285 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 286 {
 287   // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
 288   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 289   const Bool_t image    = kTRUE ;
 290
 291   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
 292   h0->Sumw2();
 293   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
 294
 295   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
 296   h1->Sumw2();
 297   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
 298
 299   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
 300   h2->Sumw2();
 301   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
 302   //
 303   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRECPOINTS); // this should be the last line
 304 }
 305
 306 //____________________________________________________________________________
 307 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
 308 {
 309   // create Raws histograms in Raws subdir
 310   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 311   const Bool_t saveCorr = kTRUE ;
 312   const Bool_t image    = kTRUE ;
 313   const Option_t *profileOption = "s";
 314
 315   Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 316   Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
 317
 318   //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 319   Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 320   Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 321   Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 322
 323   Int_t nTRUCols = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUCols; //total TRU columns for 2D TRU histos
 324   Int_t nTRURows = nSMSectors*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRURows; //total TRU rows for 2D TRU histos
 325    // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 326   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 327                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 328   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 329   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 330                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 331   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 332
 333   // where did max sample occur? (bins are towers)
 334   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 335                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 336   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 337   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 338                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 339   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 340
 341   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
 342   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 343                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 344   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 345   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 346                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 347   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 348
 349   // total counter: channels per event
 350   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
 351   h6->Sumw2() ;
 352   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 353   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
 354   h7->Sumw2() ;
 355   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 356
 357   // pedestal (bins are towers)
 358   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 359                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 360   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 361   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 362                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 363   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 364
 365
 366   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
 367   Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 368
 369   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 370   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
 371                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 372   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 373
 374   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
 375   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]",
 376                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
 377   Add2RawsList(hT1, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 378
 379   // total counter: channels per event
 380   TH1I * hT2 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
 381   hT2->Sumw2() ;
 382   Add2RawsList(hT2, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 383
 384   // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
 385   TH2I * hT3 = new TH2I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated",  nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5);
 386   hT3->SetOption("COLZ");
 387   //hT3->Sumw2();
 388   Add2RawsList(hT3, kNL0TRU, expert, image, !saveCorr);
 389
 390   // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
 391   TProfile2D * hT4 = new TProfile2D("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5, profileOption);
 392   hT4->SetOption("COLZ");
 393   Add2RawsList(hT4, kTimeL0TRU, expert, image, !saveCorr);
 394
 395   // L0 trigger hits: first in the event (bins are TRU channels)
 396   TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hitsFirst", "L0 trigger hits: First hit in the event", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
 397   hT5->Sumw2();
 398   Add2RawsList(hT5, kNL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
 399
 400   // L0 trigger hits: average time of first hit in the event (bins are TRU channels)
 401   TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsFirstAvgTime", "L0 trigger hits: average time of first hit", nTot2x2, -0.5, nTot2x2, profileOption);
 402   Add2RawsList(hT6, kTimeL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
 403
 404   // and also LED Mon..
 405   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
 406   Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 407
 408   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 409   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 410                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 411   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 412   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 413                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 414   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 415
 416   // where did max sample occur? (bins are strips)
 417   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 418                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 419   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 420   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 421                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 422   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 423
 424   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
 425   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 426                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 427   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 428   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 429                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 430   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 431
 432     // total counter: channels per event
 433   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
 434   hL6->Sumw2() ;
 435   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 436   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
 437   hL7->Sumw2() ;
 438   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 439
 440   // pedestal (bins are strips)
 441   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 442                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 443   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 444   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 445                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 446   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 447
 448   //temp 2D amplitude histogram for the current run
 449   fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 450    fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
 451   //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data
 452   TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5,
 453                         nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 454   //settings for display in amore
 455   h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}");
 456   h15->SetMaximum(2.0);
 457   h15->SetMinimum(0.1);
 458   h15->SetOption("COLZ");
 459   gStyle->SetOptStat(0);
 460   Int_t color[] = {4,3,2} ;
 461   gStyle->SetPalette(3,color);
 462   h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
 463   h15->UseCurrentStyle();
 464   h15->SetDirectory(0);
 465   Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, expert, image, !saveCorr) ;
 466
 467   TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
 468   // h16->SetMinimum(0.1);
 469   // h16->SetMaximum(100.);
 470   gStyle->SetOptStat(0);
 471   h16->UseCurrentStyle();
 472   h16->SetDirectory(0);
 473   Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
 474
 475   //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
 476   //to be used for decision whether we need to change reference data
 477   TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 478   //settings for display in amore
 479   hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}");
 480   hL10->SetMaximum(2.0);
 481   hL10->SetMinimum(0.1);
 482   gStyle->SetOptStat(0);
 483   hL10->UseCurrentStyle();
 484   hL10->SetDirectory(0);
 485 //  hL10->SetOption("E");
 486   Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, expert, image, !saveCorr) ;
 487
 488   TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTotLEDMon, 0, 2);
 489   // hL11->SetMinimum(0.1) ;
 490   gStyle->SetOptStat(0);
 491   hL11->UseCurrentStyle();
 492   hL11->SetDirectory(0);
 493   Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, expert, image, !saveCorr) ;
 494
 495   GetCalibRefFromOCDB();
 496
 497
 498         //STU histgrams
 499
 500  //histos
 501  Int_t nSTUCols = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols;
 502  Int_t nSTURows = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows;
 503 //              kAmpL1, kGL1, kJL1,
 504 //              kGL1V0, kJL1V0, kSTUTRU
 505
 506  TProfile2D *hS0 = new TProfile2D("hL1Amp", "Mean STU signal per Row and Column", nSTUCols, -0.5, nSTUCols-0.5, nSTURows, -0.5, nSTURows-0.5);
 507  Add2RawsList(hS0, kAmpL1, expert, !image, !saveCorr) ;
 508
 509  TH2F *hS1 = new TH2F("hL1Gamma", "L1 Gamma patch position (FastOR top-left)", nSTUCols, -0.50, nSTUCols-0.5, nSTURows + 5, -0.5, nSTURows-0.5 + 5); //+5 for better visible error box
 510  Add2RawsList(hS1, kGL1, !expert, image, !saveCorr) ;
 511
 512  TH2F *hS2 = new TH2F("hL1Jet", "L1 Jet patch position (FastOR top-left)", 12, -0.5, nSTUCols-0.5, 16, 0, nSTURows-0.5);
 513  Add2RawsList(hS2, kJL1, !expert, image, !saveCorr) ;
 514
 515  TH2I *hS3 = new TH2I("hL1GV0", "L1 Gamma patch amplitude versus V0 signal", 500, 0, 50000, 1500, 0, 1500);
 516  Add2RawsList(hS3, kGL1V0, expert, image, !saveCorr) ;
 517
 518  TH2I *hS4 = new TH2I("hL1JV0", "L1 Jet patch amplitude versus V0 signal", 500, 0, 50000, 1000, 0, 1000);
 519  Add2RawsList(hS4, kJL1V0, expert, !image, !saveCorr) ;
 520
 521  TH1I *hS5 = new TH1I("hFrameR","Link between TRU and STU", 32, 0, 32);
 522  Add2RawsList(hS5, kSTUTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 523
 524  hS0->SetOption("COLZ");
 525  hS1->SetOption("COLZ");
 526  hS2->SetOption("COLZ");
 527  hS3->SetOption("COLZ");
 528  hS4->SetOption("COLZ");
 529
 530   //
 531   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRAWS); // this should be the last line
 532 }
 533
 534 //____________________________________________________________________________
 535 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 536 {
 537   // make QA data from ESDs
 538
 539   Int_t nTot = 0 ;
 540   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
 541     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
 542     if( clu->IsEMCAL() ) {
 543       FillESDsData(kESDCaloClusE,clu->E()) ;
 544       nTot++ ;
 545     }
 546   }
 547   FillESDsData(kESDCaloClusM,nTot) ;
 548
 549   //fill calo cells
 550   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
 551   FillESDsData(kESDCaloCellM,cells->GetNumberOfCells()) ;
 552
 553   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
 554     FillESDsData(kESDCaloCellA,cells->GetAmplitude(index)) ;
 555   }
 556   //
 557   IncEvCountCycleESDs();
 558   IncEvCountTotalESDs();
 559 }
 560
 561 //____________________________________________________________________________
 562 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 563 {
 564   // Check that all the reference histograms exist before we try to use them - otherwise call InitRaws
 565   // RS: Attention: the counters are increments after custom modification of eventSpecie
 566   if (!fCalibRefHistoPro || !fCalibRefHistoH2F || !fLEDMonRefHistoPro || !fHighEmcHistoH2F) {
 567     InitRaws();
 568   }
 569
 570   // make sure EMCal was readout during the event
 571   Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
 572   const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern();
 573   UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
 574   if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
 575
 576   // setup
 577   rawReader->Reset() ;
 578   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL");
 579   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's
 580
 581   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
 582   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) {
 583     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
 584   }
 585
 586   const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 587   const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
 588   const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
 589   const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
 590   const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
 591   const Int_t nTot2x2      = fSuperModules * n2x2PerSM; // total TRU channel
 592
 593   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
 594   Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 595   Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 596   Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
 597   Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 598   Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 599
 600   const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
 601         int firstL0TimeBin = 999;
 602   int triggers[nTot2x2][24]; //auxiliary array for L0 trigger - TODO remove hardcoded 24
 603         memset(triggers, 0, sizeof(int) * 24 * nTot2x2);
 604
 605   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
 606   // start loop over input stream
 607   while (in.NextDDL()) {
 608     Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
 609     Int_t iDDL = in.GetDDLNumber();
 610     fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() );
 611
 612     while (in.NextChannel()) {
 613       Int_t iBranch = in.GetBranch();
 614
 615       iSM = in.GetModule(); // SuperModule
 616       //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber());
 617       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
 618
 619         Int_t nsamples = 0;
 620         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist;
 621         while (in.NextBunch()) {
 622           nsamples += in.GetBunchLength();
 623           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
 624         }
 625
 626         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
 627           Float_t time = 0.;
 628           Float_t amp  = 0.;
 629           // indices for pedestal calc.
 630           Int_t firstPedSample = 0;
 631           Int_t lastPedSample  = 0;
 632           bool isTRUL0IdData   = false;
 633
 634           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling
 635             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 636             amp  = fitResults.GetAmp();
 637             time = fitResults.GetTof();
 638             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
 639             lastPedSample  = fLastPedestalSample;
 640           }
 641           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
 642             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 643             amp  = fitResults.GetAmp();
 644             time = fitResults.GetTof();
 645             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
 646             lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
 647             if (in.GetColumn() >= n2x2PerTRU) {
 648               isTRUL0IdData = true;
 649             }
 650           }
 651
 652           // pedestal samples
 653           Int_t nPed = 0;
 654           vector<Int_t> pedSamples;
 655
 656           // select earliest bunch
 657           unsigned int bunchIndex = 0;
 658           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
 659           if (bunchlist.size() > 0) {
 660             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
 661               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
 662                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
 663                 bunchIndex = ui;
 664               }
 665             }
 666           }
 667
 668           // check bunch for entries in the pedestal sample range
 669           Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength();
 670           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
 671           Int_t timebin = 0;
 672
 673           if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
 674             for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
 675               timebin = startBin--;
 676               if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
 677                 pedSamples.push_back( sig[i] );
 678                 nPed++;
 679               }
 680             } // i
 681           }
 682           else { // TRU L0 Id Data
 683             // which TRU the channel belongs to?
 684             Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
 685
 686             for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
 687               for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
 688                 // check if the bit j is 1
 689                 if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
 690                   Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
 691                   if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
 692                     Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
 693                     // Fill the histograms
 694                     Int_t globTRUCol, globTRURow;
 695                     GetTruChannelPosition(globTRURow, globTRUCol, iSM, iDDL, iBranch, iTRUIdInSM );
 696
 697                     FillRawsData(kNL0TRU, globTRUCol, globTRURow);
 698                     FillRawsData(kTimeL0TRU, globTRUCol, globTRURow, startBin);
 699                     triggers[iTRUAbsId][startBin] = 1;
 700
 701                     if((int)startBin < firstL0TimeBin) firstL0TimeBin = startBin;
 702                   }
 703                 }
 704               }
 705               startBin--;
 706             } // i
 707           } // TRU L0 Id data
 708
 709           // fill histograms
 710           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
 711             Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
 712             if ( in.IsLowGain() ) {
 713               nTotalSMLG[iSM]++;
 714               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) {
 715                 FillRawsData(kSigLG,towerId, amp);
 716                 FillRawsData(kTimeLG,towerId, time);
 717               }
 718               if (nPed > 0) {
 719                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 720                   FillRawsData(kPedLG,towerId, pedSamples[i]);
 721                 }
 722               }
 723             } // gain==0
 724             else if ( in.IsHighGain() ) {
 725               nTotalSMHG[iSM]++;
 726               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) {
 727                 FillRawsData(kSigHG,towerId, amp);
 728                 FillRawsData(kTimeHG,towerId, time);
 729               }
 730               if (nPed > 0) {
 731                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 732                   FillRawsData(kPedHG,towerId, pedSamples[i]);
 733                 }
 734               }
 735             } // gain==1
 736           } // low or high gain
 737           // TRU
 738           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
 739             // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
 740             Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
 741             Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU
 742               + in.GetColumn();
 743             nTotalSMTRU[iSM]++;
 744             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) {
 745               FillRawsData(kSigTRU,iTRU2x2Id, amp);
 746               //FillRawsData(kTimeTRU,iTRU2x2Id, time);
 747             }
 748             //if (nPed > 0) {
 749               //for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 750                 //FillRawsData(kPedTRU,iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
 751               //}
 752             //}
 753           }
 754           // LED Mon
 755           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
 756             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
 757             // and the Strip number in the Column..
 758             Int_t gain = in.GetRow();
 759             Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
 760
 761             if ( gain == 0 ) {
 762               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++;
 763               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) {
 764                 FillRawsData(kSigLGLEDMon,stripId, amp);
 765                 FillRawsData(kTimeLGLEDMon,stripId, time);
 766               }
 767               if (nPed > 0) {
 768                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 769                   FillRawsData(kPedLGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 770                 }
 771               }
 772             } // gain==0
 773             else if ( gain == 1 ) {
 774               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++;
 775               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) {
 776                 FillRawsData(kSigHGLEDMon,stripId, amp);
 777                 FillRawsData(kTimeHGLEDMon,stripId, time);
 778               }
 779               if (nPed > 0) {
 780                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 781                   FillRawsData(kPedHGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 782                 }
 783               }
 784             } // low or high gain
 785           } // LEDMon
 786
 787         } // SM index OK
 788
 789       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
 790     }// end while over channel
 791
 792   }//end while over DDL's, of input stream
 793   //filling some L0 trigger histos
 794   if( firstL0TimeBin < 999 ){
 795     for(Int_t i = 0; i < nTot2x2; i++) {
 796       if( triggers[i][firstL0TimeBin] > 0 ) {
 797         //histo->Fill(i,j);
 798         FillRawsData(kNL0FirstTRU, i);
 799         FillRawsData(kTimeL0FirstTRU, i, firstL0TimeBin);
 800       }
 801     }
 802   }
 803
 804   //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
 805   // RS: operation on the group of histos kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatio,kSigLGLEDMon
 806   const int hGrp[] = {kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatioDist,kSigLGLEDMon};
 807   if ( rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent &&
 808        CheckCloningConsistency(fRawsQAList, hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int)) ) {  // RS converting original code to loop over all matching triggers
 809     int nTrig =IsClonedPerTrigClass(kSigHG,fRawsQAList) ? GetNEventTrigClasses() : 0; // loop over triggers only if histos were cloned
 810     //
 811     for (int itr=-1;itr<nTrig;itr++) { // start from -1 to acknowledge original histos if they were kept
 812       TObjArray* trArr = GetMatchingRawsHistosSet(hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int) ,itr);
 813       if (!trArr) continue;  // no histos for current trigger
 814       //
 815       Double_t binContent = 0.;
 816       TProfile* prSigHG      = (TProfile *)trArr->At(0); //kSigHG
 817       TH1* th2DRatioAmp      = (TH1*) trArr->At(1); //k2DRatioAmp
 818       TH1* thRatioDist       = (TH1*) trArr->At(2); //kRatioDist
 819       TH1* thLEDMonRatio     = (TH1*) trArr->At(3); //kLEDMonRatio
 820       TH1* thLEDMonRatioDist = (TH1*) trArr->At(4); //kLEDMonRatio
 821       TH1* hSigLGLEDMon      = (TH1*) trArr->At(5); //kSigLGLEDMon
 822       th2DRatioAmp->Reset("ICE");
 823       thRatioDist->Reset("ICE");
 824       thLEDMonRatio->Reset("ICE");
 825       thLEDMonRatioDist->Reset("ICE");
 826       th2DRatioAmp->ResetStats();
 827       thRatioDist->ResetStats();
 828       thLEDMonRatio->ResetStats();
 829       thLEDMonRatioDist->ResetStats();
 830       ConvertProfile2H(prSigHG, fHighEmcHistoH2F);
 831       //
 832       for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
 833         for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) {
 834           if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy))
 835             binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy);
 836           th2DRatioAmp->SetBinContent(ix, iy, binContent);
 837           thRatioDist->Fill(binContent);
 838         }
 839       }
 840       //
 841       //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
 842       Double_t binError = 0. ;
 843       // for the binError, we add the relative errors, squared
 844       Double_t relativeErrorSqr = 0. ;
 845       //
 846       for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
 847         //
 848         if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) {
 849           binContent = hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
 850
 851           relativeErrorSqr = TMath::Power( (fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib)), 2);
 852           if( hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) != 0) {
 853             relativeErrorSqr += TMath::Power( (hSigLGLEDMon->GetBinError(ib)/hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib)), 2);
 854           }
 855         }
 856         else { // ref. run info is zero
 857           binContent = -1;
 858           relativeErrorSqr = 1;
 859         }
 860         thLEDMonRatio->SetBinContent(ib, binContent);
 861
 862         binError = sqrt(relativeErrorSqr) * binContent;
 863         thLEDMonRatio->SetBinError(ib, binError);
 864         thLEDMonRatioDist->Fill(thLEDMonRatio->GetBinContent(ib));
 865       }
 866     } // loop over eventual trigger clones
 867   }
 868   // let's also fill the SM and event counter histograms
 869   Int_t nTotalHG = 0;
 870   Int_t nTotalLG = 0;
 871   Int_t nTotalTRU = 0;
 872   Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
 873   Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
 874   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {
 875     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM];
 876     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM];
 877     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM];
 878     nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM];
 879     nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM];
 880     FillRawsData(kNsmodLG,iSM, nTotalSMLG[iSM]);
 881     FillRawsData(kNsmodHG,iSM, nTotalSMHG[iSM]);
 882     FillRawsData(kNsmodTRU,iSM, nTotalSMTRU[iSM]);
 883     FillRawsData(kNsmodLGLEDMon,iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]);
 884     FillRawsData(kNsmodHGLEDMon,iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]);
 885   }
 886
 887   FillRawsData(kNtotLG,nTotalLG);
 888   FillRawsData(kNtotHG,nTotalHG);
 889   FillRawsData(kNtotTRU,nTotalTRU);
 890   FillRawsData(kNtotLGLEDMon,nTotalLGLEDMon);
 891   FillRawsData(kNtotHGLEDMon,nTotalHGLEDMon);
 892
 893   IncEvCountCycleESDs();
 894   IncEvCountTotalESDs();
 895   SetEventSpecie(saveSpecie) ;
 896
 897         MakeRawsSTU(rawReader);
 898
 899   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
 900   rawReader->Reset() ;
 901   return;
 902 }
 903
 904 //____________________________________________________________________________
 905 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
 906 {
 907   // makes data from Digits
 908   FillDigitsData(1,fDigitsArray->GetEntriesFast()) ;
 909   TIter next(fDigitsArray) ;
 910   AliEMCALDigit * digit ;
 911   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
 912     FillDigitsData(0, digit->GetAmplitude()) ;
 913   }
 914   //
 915 }
 916
 917 //____________________________________________________________________________
 918 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
 919 {
 920   // makes data from Digit Tree
 921   // RS: Attention: the counters are increments in the MakeDigits()
 922   if (fDigitsArray)
 923     fDigitsArray->Clear("C") ;
 924   else
 925     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ;
 926
 927   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
 928   if ( ! branch ) { AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found"); return; }
 929   //
 930   branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
 931   branch->GetEntry(0) ;
 932   MakeDigits() ;
 933   //
 934   IncEvCountCycleDigits();
 935   IncEvCountTotalDigits();
 936   //
 937 }
 938
 939 //____________________________________________________________________________
 940 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
 941 {
 942   // makes data from RecPoints
 943   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 944   if (!emcbranch) {
 945     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
 946     return;
 947   }
 948
 949   TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
 950   emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
 951   emcbranch->GetEntry(0);
 952
 953   FillRecPointsData(kRecPM,emcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 954   TIter next(emcRecPoints) ;
 955   AliEMCALRecPoint * rp ;
 956   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
 957     FillRecPointsData(kRecPE,rp->GetEnergy()) ;
 958     FillRecPointsData(kRecPDigM,rp->GetMultiplicity());
 959   }
 960   emcRecPoints->Delete();
 961   delete emcRecPoints;
 962   IncEvCountCycleRecPoints();
 963   IncEvCountTotalRecPoints();
 964 }
 965
 966 //____________________________________________________________________________
 967 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
 968 {
 969   //Detector specific actions at start of cycle
 970
 971 }
 972
 973 //____________________________________________________________________________
 974 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)
 975 {
 976   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
 977
 978   fRawAnalyzer =  AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(fitAlgo);
 979   fFittingAlgorithm = fitAlgo;
 980
 981   // Init also here the TRU algo, even if it is fixed type.
 982   fRawAnalyzerTRU = (AliCaloRawAnalyzerKStandard*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(Algo::kFakeAltro);
 983   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
 984   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
 985 }
 986
 987 //_____________________________________________________________________________________
 988 void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo)
 989 {
 990   // reset histogram
 991   histo->Reset("ICE") ;
 992   histo->ResetStats();
 993
 994   Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
 995
 996   // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo
 997   Int_t row = 0;
 998   Int_t col = 0;
 999   Double_t binContent = 0;
1000   Int_t towerNum = 0; // global tower Id
1001   //  i = 0; // tower Id within SuperModule
1002   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
1003   Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
1004   Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
1005
1006   // indices for 2D plots
1007   Int_t col2d = 0;
1008   Int_t row2d = 0;
1009
1010   for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
1011     towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
1012     binContent = p->GetBinContent(ibin);
1013
1014     // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
1015     iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1016     col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1017     row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
1018
1019     //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
1020     // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM
1021     // we are in
1022     iSMSector = iSM / 2;
1023     iSMSide = iSM % 2;
1024
1025     if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
1026       col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
1027     }
1028     else { // A side, shown to the left
1029       col2d = col;
1030     }
1031
1032     row2d = row + iSMSector * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
1033
1034     histo->SetBinContent(col2d+1, row2d+1, binContent);
1035   }
1036 }
1037 //____________________________________________________________________________
1038 void AliEMCALQADataMakerRec::GetTruChannelPosition( Int_t &globRow, Int_t &globColumn, Int_t module, Int_t ddl, Int_t branch, Int_t column ) const
1039 { // from local to global indices
1040   Int_t mrow;
1041   Int_t mcol;
1042   Int_t trow;
1043   Int_t tcol;
1044   Int_t drow;
1045   Int_t rcu;
1046   // RCU 0 or 1
1047   rcu = ddl % 2;
1048
1049   // 12 rows of 2x2s in a module (3 TRUs by 4 rows)
1050   mrow = (module/2) * 12;
1051   // 24 columns per module, odd module numbers increased by 24
1052   mcol = (module%2) * 24;
1053
1054   // position within TRU coordinates
1055   tcol = column / 4;
1056   trow = column % 4;
1057
1058   //.combine
1059   if( module%2 == 0 ){   // A side
1060     // mirror rows
1061     trow = 3 - trow;
1062
1063     // TRU in module row addition
1064     drow = (rcu*branch+rcu) * 4;
1065
1066   }
1067   else{   // C side
1068     // mirror columns
1069     tcol = 23 - tcol;
1070
1071     // TRU in module row addition
1072     drow = (2 - (rcu*branch+rcu)) * 4;
1073   }
1074
1075   // output global row/collumn position (0,0 = SMA0, phi = 0, |eta| = max)
1076   globRow = mrow + drow + trow;
1077   globColumn = mcol + tcol;
1078   return;
1079
1080 }
1081 //____________________________________________________________________________
1082 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRawsSTU(AliRawReader* rawReader)
1083 { // STU specifics
1084   AliEMCALTriggerSTURawStream* inSTU = new AliEMCALTriggerSTURawStream(rawReader);
1085
1086   rawReader->Reset();
1087   rawReader->Select("EMCAL", 44);
1088
1089   //L1 segmentation
1090   Int_t sizeL1gsubr = 1;
1091   Int_t sizeL1gpatch = 2;
1092   Int_t sizeL1jsubr = 4;
1093
1094   Int_t iEMCALtrig[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols][AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows];
1095   memset(iEMCALtrig, 0, sizeof(int) * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows);
1096
1097   if (inSTU->ReadPayLoad())
1098     {
1099       //Fw version (use in case of change in L1 jet
1100       Int_t fw = inSTU->GetFwVersion();
1101       Int_t sizeL1jpatch = 2+(fw >> 16);
1102
1103       //To check link
1104       Int_t mask = inSTU->GetFrameReceived() ^ inSTU->GetRegionEnable();
1105
1106       for (int i = 0; i < 32; i++)
1107         {
1108                 if (!((mask >> i) &  0x1)) FillRawsData(kSTUTRU, i);
1109         }
1110
1111       //V0 signal in STU
1112       Int_t iV0Sig = inSTU->GetV0A()+inSTU->GetV0C();
1113
1114       //FastOR amplitude receive from TRU
1115       for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
1116         {
1117           UInt_t adc[96];
1118           for (Int_t j = 0; j < 96; j++) adc[j] = 0;
1119
1120           inSTU->GetADC(i, adc);
1121
1122           Int_t iTRU = fGeom->GetTRUIndexFromSTUIndex(i);
1123
1124           for (Int_t j = 0; j < 96; j++)
1125             {
1126               Int_t idx;
1127               fGeom->GetAbsFastORIndexFromTRU(iTRU, j, idx);
1128
1129               Int_t px, py;
1130               fGeom->GetPositionInEMCALFromAbsFastORIndex(idx, px, py);
1131
1132               iEMCALtrig[px][py] = adc[j];
1133             }
1134         }
1135
1136       //L1 Gamma patches
1137       Int_t iTRUSTU, x, y;
1138       for (Int_t i = 0; i < inSTU->GetNL1GammaPatch(0); i++)
1139         {
1140           if (inSTU->GetL1GammaPatch(i, 0, iTRUSTU, x, y)) // col (0..23), row (0..3)
1141             {
1142               Int_t iTRU;
1143               iTRU = fGeom->GetTRUIndexFromSTUIndex(iTRUSTU);
1144
1145               Int_t etaG = 23-x, phiG = y + 4 * int(iTRU/2); //position in EMCal
1146               if (iTRU%2) etaG += 24; //C-side
1147
1148               etaG = etaG - sizeL1gsubr * sizeL1gpatch + 1;
1149
1150               //Position of patch L1G (bottom-left FastOR of the patch)
1151               FillRawsData(kGL1, etaG, phiG);
1152
1153               //loop to sum amplitude of FOR in the gamma patch
1154               Int_t iL1GPatchAmp = 0;
1155               for (Int_t L1Gx = 0; L1Gx < sizeL1gpatch; L1Gx ++)
1156                 {
1157                   for (Int_t L1Gy = 0; L1Gy < sizeL1gpatch; L1Gy ++)
1158                     {
1159                       if (etaG+L1Gx < 48 && phiG+L1Gy < 64) iL1GPatchAmp += iEMCALtrig[etaG+L1Gx][phiG+L1Gy];
1160                       //cout << iEMCALtrig[etaG+L1Gx][phiG+L1Gy] << endl;
1161                     }
1162                 }
1163
1164               //if (iL1GPatchAmp > 500) cout << "L1G amp =" << iL1GPatchAmp << endl;
1165               FillRawsData(kGL1V0, iV0Sig, iL1GPatchAmp);
1166
1167             }
1168         }
1169
1170       //L1 Jet patches
1171       for (Int_t i = 0; i < inSTU->GetNL1JetPatch(0); i++)
1172         {
1173           if (inSTU->GetL1JetPatch(i, 0, x, y)) // col (0,15), row (0,11)
1174             {
1175
1176               Int_t etaJ = sizeL1jsubr * (11-y-sizeL1jpatch + 1);
1177               Int_t phiJ = sizeL1jsubr * (15-x-sizeL1jpatch + 1);
1178
1179               //position of patch L1J (FOR bottom-left)
1180               FillRawsData(kJL1, etaJ, phiJ);
1181
1182               //loop the sum aplitude of FOR in the jet patch
1183               Int_t iL1JPatchAmp = 0;
1184               for (Int_t L1Jx = 0; L1Jx < sizeL1jpatch*4; L1Jx ++)
1185                 {
1186                   for (Int_t L1Jy = 0; L1Jy < sizeL1jpatch*4; L1Jy ++)
1187                     {
1188                       if (etaJ+L1Jx < 48 && phiJ+L1Jy < 64) iL1JPatchAmp += iEMCALtrig[etaJ+L1Jx][phiJ+L1Jy];
1189                     }
1190                 }
1191
1192               //cout << "L1J amp =" << iL1JPatchAmp << endl;
1193               FillRawsData(kJL1V0, iV0Sig, iL1JPatchAmp);
1194             }
1195         }
1196     }
1197
1198   //Fill FOR amplitude histo
1199   for (Int_t i = 0; i < 48; i++)
1200     {
1201       for (Int_t j = 0; j < 60; j++)
1202         {
1203           if (iEMCALtrig[i][j] != 0) FillRawsData(kAmpL1, i, j, iEMCALtrig[i][j]);
1204         }
1205     }
1206
1207   delete inSTU;
1208   return;
1209 }
1210
1211