HLT/TPCLib/tracking-ca/AliHLTTPCCATrackerComponent.cxx

   1 // @(#) $Id$
   2 // **************************************************************************
   3 // This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project          *
   4 // ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                           *
   5 //                                                                          *
   6 // Primary Authors: Sergey Gorbunov <sergey.gorbunov@kip.uni-heidelberg.de> *
   7 //                  Ivan Kisel <kisel@kip.uni-heidelberg.de>                *
   8 //                  for The ALICE HLT Project.                              *
   9 //                                                                          *
  10 // Permission to use, copy, modify and distribute this software and its     *
  11 // documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted     *
  12 // without fee, provided that the above copyright notice appears in all     *
  13 // copies and that both the copyright notice and this permission notice     *
  14 // appear in the supporting documentation. The authors make no claims       *
  15 // about the suitability of this software for any purpose. It is            *
  16 // provided "as is" without express or implied warranty.                    *
  17 //                                                                          *
  18 //***************************************************************************
  19
  20
  21 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  22 //                                                                           //
  23 // a TPC tracker processing component for the HLT based on CA by Ivan Kisel  //
  24 //                                                                           //
  25 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  26
  27 #if __GNUC__>= 3
  28 using namespace std;
  29 #endif
  30
  31 #include "AliHLTTPCCATrackerComponent.h"
  32 #include "AliHLTTPCTransform.h"
  33 #include "AliHLTTPCCATrackerFramework.h"
  34 #include "AliHLTTPCCAOutTrack.h"
  35 #include "AliHLTTPCCAParam.h"
  36 #include "AliHLTTPCCATrackConvertor.h"
  37 #include "AliHLTArray.h"
  38
  39 #include "AliHLTTPCSpacePointData.h"
  40 #include "AliHLTTPCClusterDataFormat.h"
  41 #include "AliHLTTPCCACompressedInputData.h"
  42 #include "AliHLTTPCTransform.h"
  43 #include "AliHLTTPCTrackSegmentData.h"
  44 #include "AliHLTTPCTrackArray.h"
  45 #include "AliHLTTPCTrackletDataFormat.h"
  46 #include "AliHLTTPCDefinitions.h"
  47 #include "AliExternalTrackParam.h"
  48 #include "TStopwatch.h"
  49 #include "TMath.h"
  50 #include "AliCDBEntry.h"
  51 #include "AliCDBManager.h"
  52 #include "TObjString.h"
  53 #include "TObjArray.h"
  54 #include "AliHLTTPCCASliceOutput.h"
  55 #include "AliHLTTPCCAClusterData.h"
  56
  57 const AliHLTComponentDataType AliHLTTPCCADefinitions::fgkTrackletsDataType = AliHLTComponentDataTypeInitializer( "CATRACKL", kAliHLTDataOriginTPC );
  58
  59 /** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
  60 ClassImp( AliHLTTPCCATrackerComponent )
  61
  62 AliHLTTPCCATrackerComponent::AliHLTTPCCATrackerComponent()
  63     :
  64     fTracker( NULL ),
  65     fSolenoidBz( 0 ),
  66     fMinNTrackClusters( 0 ),
  67     fClusterZCut( 500. ),
  68     fNeighboursSearchArea( 0 ),
  69     fClusterErrorCorrectionY(0),
  70     fClusterErrorCorrectionZ(0),
  71     fFullTime( 0 ),
  72     fRecoTime( 0 ),
  73     fNEvents( 0 ),
  74     fOutputTRAKSEGS( 0 )
  75 {
  76   // see header file for class documentation
  77   // or
  78   // refer to README to build package
  79   // or
  80   // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
  81 }
  82
  83 AliHLTTPCCATrackerComponent::AliHLTTPCCATrackerComponent( const AliHLTTPCCATrackerComponent& )
  84     :
  85     AliHLTProcessor(),
  86     fTracker( NULL ),
  87     fSolenoidBz( 0 ),
  88     fMinNTrackClusters( 30 ),
  89     fClusterZCut( 500. ),
  90     fNeighboursSearchArea(0),
  91     fClusterErrorCorrectionY(0),
  92     fClusterErrorCorrectionZ(0),
  93     fFullTime( 0 ),
  94     fRecoTime( 0 ),
  95     fNEvents( 0 ),
  96     fOutputTRAKSEGS( 0 )
  97 {
  98   // see header file for class documentation
  99   HLTFatal( "copy constructor untested" );
 100 }
 101
 102 AliHLTTPCCATrackerComponent& AliHLTTPCCATrackerComponent::operator=( const AliHLTTPCCATrackerComponent& )
 103 {
 104   // see header file for class documentation
 105   HLTFatal( "assignment operator untested" );
 106   return *this;
 107 }
 108
 109 AliHLTTPCCATrackerComponent::~AliHLTTPCCATrackerComponent()
 110 {
 111   // see header file for class documentation
 112   if (fTracker) delete fTracker;
 113 }
 114
 115 //
 116 // Public functions to implement AliHLTComponent's interface.
 117 // These functions are required for the registration process
 118 //
 119
 120 const char* AliHLTTPCCATrackerComponent::GetComponentID()
 121 {
 122   // see header file for class documentation
 123   return "TPCCATracker";
 124 }
 125
 126 void AliHLTTPCCATrackerComponent::GetInputDataTypes( vector<AliHLTComponentDataType>& list )
 127 {
 128   // see header file for class documentation
 129   list.clear();
 130   list.push_back( AliHLTTPCDefinitions::fgkClustersDataType );
 131   list.push_back( AliHLTTPCCADefinitions::fgkCompressedInputDataType );
 132 }
 133
 134 AliHLTComponentDataType AliHLTTPCCATrackerComponent::GetOutputDataType()
 135 {
 136   // see header file for class documentation
 137   if ( fOutputTRAKSEGS ) return AliHLTTPCDefinitions::fgkTrackSegmentsDataType;
 138   else return AliHLTTPCCADefinitions::fgkTrackletsDataType;
 139 }
 140
 141 void AliHLTTPCCATrackerComponent::GetOutputDataSize( unsigned long& constBase, double& inputMultiplier )
 142 {
 143   // define guess for the output data size
 144   constBase = 200;       // minimum size
 145   inputMultiplier = 3.; // size relative to input
 146 }
 147
 148 AliHLTComponent* AliHLTTPCCATrackerComponent::Spawn()
 149 {
 150   // see header file for class documentation
 151   return new AliHLTTPCCATrackerComponent;
 152 }
 153
 154 void AliHLTTPCCATrackerComponent::SetDefaultConfiguration()
 155 {
 156   // Set default configuration for the CA tracker component
 157   // Some parameters can be later overwritten from the OCDB
 158
 159   fSolenoidBz = -5.00668;
 160   fMinNTrackClusters = 0;
 161   fClusterZCut = 500.;
 162   fNeighboursSearchArea = 0;
 163   fClusterErrorCorrectionY = 0;
 164   fClusterErrorCorrectionZ = 0;
 165   fOutputTRAKSEGS = 0;
 166   fFullTime = 0;
 167   fRecoTime = 0;
 168   fNEvents = 0;
 169 }
 170
 171 int AliHLTTPCCATrackerComponent::ReadConfigurationString(  const char* arguments )
 172 {
 173   // Set configuration parameters for the CA tracker component from the string
 174
 175   int iResult = 0;
 176   if ( !arguments ) return iResult;
 177
 178   TString allArgs = arguments;
 179   TString argument;
 180   int bMissingParam = 0;
 181
 182   TObjArray* pTokens = allArgs.Tokenize( " " );
 183
 184   int nArgs =  pTokens ? pTokens->GetEntries() : 0;
 185
 186   for ( int i = 0; i < nArgs; i++ ) {
 187     argument = ( ( TObjString* )pTokens->At( i ) )->GetString();
 188     if ( argument.IsNull() ) continue;
 189
 190     if ( argument.CompareTo( "-solenoidBz" ) == 0 ) {
 191       if ( ( bMissingParam = ( ++i >= pTokens->GetEntries() ) ) ) break;
 192       fSolenoidBz = ( ( TObjString* )pTokens->At( i ) )->GetString().Atof();
 193       HLTInfo( "Magnetic Field set to: %f", fSolenoidBz );
 194       continue;
 195     }
 196
 197     if ( argument.CompareTo( "-minNClustersOnTrack" ) == 0 ) {
 198       if ( ( bMissingParam = ( ++i >= pTokens->GetEntries() ) ) ) break;
 199       fMinNTrackClusters = ( ( TObjString* )pTokens->At( i ) )->GetString().Atoi();
 200       HLTInfo( "minNClustersOnTrack set to: %d", fMinNTrackClusters );
 201       continue;
 202     }
 203
 204     if ( argument.CompareTo( "-clusterZCut" ) == 0 ) {
 205       if ( ( bMissingParam = ( ++i >= pTokens->GetEntries() ) ) ) break;
 206       fClusterZCut = TMath::Abs( ( ( TObjString* )pTokens->At( i ) )->GetString().Atof() );
 207       HLTInfo( "ClusterZCut set to: %f", fClusterZCut );
 208       continue;
 209     }
 210
 211    if ( argument.CompareTo( "-neighboursSearchArea" ) == 0 ) {
 212       if ( ( bMissingParam = ( ++i >= pTokens->GetEntries() ) ) ) break;
 213       fNeighboursSearchArea = TMath::Abs( ( ( TObjString* )pTokens->At( i ) )->GetString().Atof() );
 214       HLTInfo( "NeighboursSearchArea set to: %f", fNeighboursSearchArea );
 215       continue;
 216     }
 217
 218    if ( argument.CompareTo( "-errorCorrectionY" ) == 0 ) {
 219      if ( ( bMissingParam = ( ++i >= pTokens->GetEntries() ) ) ) break;
 220      fClusterErrorCorrectionY = ( ( TObjString* )pTokens->At( i ) )->GetString().Atof();
 221      HLTInfo( "Cluster Y error correction factor set to: %f", fClusterErrorCorrectionY );
 222      continue;
 223    }
 224
 225    if ( argument.CompareTo( "-errorCorrectionZ" ) == 0 ) {
 226      if ( ( bMissingParam = ( ++i >= pTokens->GetEntries() ) ) ) break;
 227      fClusterErrorCorrectionZ = ( ( TObjString* )pTokens->At( i ) )->GetString().Atof();
 228      HLTInfo( "Cluster Z error correction factor set to: %f", fClusterErrorCorrectionZ );
 229      continue;
 230    }
 231
 232    if ( argument.CompareTo( "-outputTRAKSEGS" ) == 0 ) {
 233       fOutputTRAKSEGS = 1;
 234       HLTInfo( "The special output type \"TRAKSEGS\" is set" );
 235       continue;
 236     }
 237
 238     HLTError( "Unknown option \"%s\"", argument.Data() );
 239     iResult = -EINVAL;
 240   }
 241   delete pTokens;
 242
 243   if ( bMissingParam ) {
 244     HLTError( "Specifier missed for parameter \"%s\"", argument.Data() );
 245     iResult = -EINVAL;
 246   }
 247
 248   return iResult;
 249 }
 250
 251
 252 int AliHLTTPCCATrackerComponent::ReadCDBEntry( const char* cdbEntry, const char* chainId )
 253 {
 254   // see header file for class documentation
 255
 256   const char* defaultNotify = "";
 257
 258   if ( !cdbEntry ) {
 259     cdbEntry = "HLT/ConfigTPC/TPCCATracker";
 260     defaultNotify = " (default)";
 261     chainId = 0;
 262   }
 263
 264   HLTInfo( "configure from entry \"%s\"%s, chain id %s", cdbEntry, defaultNotify, ( chainId != NULL && chainId[0] != 0 ) ? chainId : "<none>" );
 265   AliCDBEntry *pEntry = AliCDBManager::Instance()->Get( cdbEntry );//,GetRunNo());
 266
 267   if ( !pEntry ) {
 268     HLTError( "cannot fetch object \"%s\" from CDB", cdbEntry );
 269     return -EINVAL;
 270   }
 271
 272   TObjString* pString = dynamic_cast<TObjString*>( pEntry->GetObject() );
 273
 274   if ( !pString ) {
 275     HLTError( "configuration object \"%s\" has wrong type, required TObjString", cdbEntry );
 276     return -EINVAL;
 277   }
 278
 279   HLTInfo( "received configuration object string: \"%s\"", pString->GetString().Data() );
 280
 281   return  ReadConfigurationString( pString->GetString().Data() );
 282 }
 283
 284
 285 int AliHLTTPCCATrackerComponent::Configure( const char* cdbEntry, const char* chainId, const char *commandLine )
 286 {
 287   // Configure the component
 288   // There are few levels of configuration,
 289   // parameters which are set on one step can be overwritten on the next step
 290
 291   //* read hard-coded values
 292
 293   SetDefaultConfiguration();
 294
 295   //* read the default CDB entry
 296
 297   int iResult1 = ReadCDBEntry( NULL, chainId );
 298
 299   //* read magnetic field
 300
 301   int iResult2 = ReadCDBEntry( kAliHLTCDBSolenoidBz, chainId );
 302
 303   //* read the actual CDB entry if required
 304
 305   int iResult3 = ( cdbEntry ) ? ReadCDBEntry( cdbEntry, chainId ) : 0;
 306
 307   //* read extra parameters from input (if they are)
 308
 309   int iResult4 = 0;
 310
 311   if ( commandLine && commandLine[0] != '\0' ) {
 312     HLTInfo( "received configuration string from HLT framework: \"%s\"", commandLine );
 313     iResult4 = ReadConfigurationString( commandLine );
 314   }
 315
 316   // Initialise the tracker here
 317
 318   return iResult1 ? iResult1 : ( iResult2 ? iResult2 : ( iResult3 ? iResult3 : iResult4 ) );
 319 }
 320
 321
 322
 323 int AliHLTTPCCATrackerComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
 324 {
 325   // Configure the CA tracker component
 326
 327   if ( fTracker ) return EINPROGRESS;
 328
 329
 330   //fTracker = new AliHLTTPCCATrackerFramework();
 331   //Do not initialize the TrackerFramework here since the CUDA framework is thread local and DoInit is called from different thread than DoEvent
 332
 333   TString arguments = "";
 334   for ( int i = 0; i < argc; i++ ) {
 335     if ( !arguments.IsNull() ) arguments += " ";
 336     arguments += argv[i];
 337   }
 338
 339   return Configure( NULL, NULL, arguments.Data() );
 340 }
 341
 342
 343 int AliHLTTPCCATrackerComponent::DoDeinit()
 344 {
 345   // see header file for class documentation
 346   if (fTracker) delete fTracker;
 347   fTracker = NULL;
 348   return 0;
 349 }
 350
 351
 352
 353 int AliHLTTPCCATrackerComponent::Reconfigure( const char* cdbEntry, const char* chainId )
 354 {
 355   // Reconfigure the component from OCDB .
 356
 357   return Configure( cdbEntry, chainId, NULL );
 358 }
 359
 360
 361 bool AliHLTTPCCATrackerComponent::CompareClusters( AliHLTTPCSpacePointData *a, AliHLTTPCSpacePointData *b )
 362 {
 363   //* Comparison function for sort clusters
 364
 365   if ( a->fPadRow < b->fPadRow ) return 1;
 366   if ( a->fPadRow > b->fPadRow ) return 0;
 367   return ( a->fZ < b->fZ );
 368 }
 369
 370
 371
 372 int AliHLTTPCCATrackerComponent::DoEvent
 373 (
 374   const AliHLTComponentEventData& evtData,
 375   const AliHLTComponentBlockData* blocks,
 376   AliHLTComponentTriggerData& /*trigData*/,
 377   AliHLTUInt8_t* outputPtr,
 378   AliHLTUInt32_t& size,
 379   vector<AliHLTComponentBlockData>& outputBlocks )
 380 {
 381   //* process event
 382
 383   AliHLTUInt32_t maxBufferSize = size;
 384   size = 0; // output size
 385
 386   if ( GetFirstInputBlock( kAliHLTDataTypeSOR ) || GetFirstInputBlock( kAliHLTDataTypeEOR ) ) {
 387     return 0;
 388   }
 389
 390   TStopwatch timer;
 391
 392   // Event reconstruction in one TPC slice with CA Tracker
 393
 394   //Logging( kHLTLogWarning, "HLT::TPCCATracker::DoEvent", "DoEvent", "CA::DoEvent()" );
 395   if ( evtData.fBlockCnt <= 0 ) {
 396     HLTWarning( "no blocks in event" );
 397     return 0;
 398   }
 399
 400   const AliHLTComponentBlockData* iter = NULL;
 401   unsigned long ndx;
 402
 403   // Determine the slice number
 404
 405   //Find min and max slice number with now slice missing in between (for default output)
 406   int minslice = -1, maxslice = -1;
 407   int slice = -1;
 408   {
 409     std::vector<int> slices;
 410     std::vector<int>::iterator slIter;
 411     std::vector<unsigned> sliceCnts;
 412     std::vector<unsigned>::iterator slCntIter;
 413
 414     for ( ndx = 0; ndx < evtData.fBlockCnt; ndx++ ) {
 415       iter = blocks + ndx;
 416       if ( iter->fDataType != AliHLTTPCDefinitions::fgkClustersDataType
 417            && iter->fDataType != AliHLTTPCCADefinitions::fgkCompressedInputDataType
 418            ) continue;
 419
 420       slice = AliHLTTPCDefinitions::GetMinSliceNr( *iter );
 421           if (slice < minslice || minslice == -1) minslice = slice;
 422           if (slice > maxslice) maxslice = slice;
 423
 424       bool found = 0;
 425       slCntIter = sliceCnts.begin();
 426       for ( slIter = slices.begin(); slIter != slices.end(); slIter++, slCntIter++ ) {
 427         if ( *slIter == slice ) {
 428           found = kTRUE;
 429           break;
 430         }
 431       }
 432       if ( !found ) {
 433         slices.push_back( slice );
 434         sliceCnts.push_back( 1 );
 435       } else *slCntIter++;
 436     }
 437
 438           if ( slices.size() == 0 ) {
 439                 HLTWarning( "no slices found in event" );
 440                 return 0;
 441           }
 442
 443
 444     // Determine slice number to really use. (for obsolete output)
 445     if ( slices.size() > 1 ) {
 446                 Logging( fOutputTRAKSEGS ? kHLTLogError : kHLTLogDebug, "HLT::TPCSliceTracker::DoEvent", "Multiple slices found in event",
 447                "Multiple slice numbers found in event 0x%08lX (%lu). Determining maximum occuring slice number...",
 448                evtData.fEventID, evtData.fEventID );
 449       unsigned maxCntSlice = 0;
 450       slCntIter = sliceCnts.begin();
 451       for ( slIter = slices.begin(); slIter != slices.end(); slIter++, slCntIter++ ) {
 452         Logging( fOutputTRAKSEGS ? kHLTLogError : kHLTLogDebug, "HLT::TPCSliceTracker::DoEvent", "Multiple slices found in event",
 453                  "Slice %lu found %lu times.", *slIter, *slCntIter );
 454         if ( fOutputTRAKSEGS && maxCntSlice < *slCntIter ) {
 455           maxCntSlice = *slCntIter;
 456           slice = *slIter;
 457         }
 458       }
 459       if (fOutputTRAKSEGS)
 460       {
 461             Logging( kHLTLogError, "HLT::TPCSliceTracker::DoEvent", "Multiple slices found in event",
 462                "Using slice %lu.", slice );
 463         }
 464     } else if ( slices.size() > 0 ) {
 465       slice = *( slices.begin() );
 466     }
 467
 468
 469           if (fOutputTRAKSEGS)
 470           {
 471                   minslice = maxslice = slice;
 472           }
 473           else
 474           {
 475                   for (int islice = minslice;islice <= maxslice;islice++)
 476                   {
 477                           bool found = false;
 478                           for(slIter = slices.begin(); slIter != slices.end();slIter++)
 479                           {
 480                                   if (*slIter == islice)
 481                                   {
 482                                           found = true;
 483                                           break;
 484                                   }
 485                           }
 486                           if (!found)
 487                           {
 488                                   maxslice = islice - 1;
 489                                   break;
 490                           }
 491                   }
 492          }
 493   }
 494
 495   if ( !fTracker ) fTracker = new AliHLTTPCCATrackerFramework;
 496
 497   int slicecount = maxslice + 1 - minslice;
 498   if (slicecount > fTracker->MaxSliceCount())
 499   {
 500         maxslice = minslice + (slicecount = fTracker->MaxSliceCount());
 501   }
 502   int nClustersTotalSum = 0;
 503   AliHLTTPCCAClusterData* clusterData = new AliHLTTPCCAClusterData[slicecount];
 504
 505
 506   // min and max patch numbers and row numbers
 507   int* slicerow = new int[slicecount * 2];
 508   int* sliceminPatch = new int[slicecount];
 509   int* slicemaxPatch = new int[slicecount];
 510   memset(slicerow, 0, slicecount * 2 * sizeof(int));
 511   for (int i = 0;i < slicecount;i++)
 512   {
 513           sliceminPatch[i] = 100;
 514           slicemaxPatch[i] = -1;
 515   }
 516
 517   //Prepare everything for all slices
 518
 519   for (int islice = 0;islice < slicecount;islice++)
 520   {
 521           slice = minslice + islice;
 522
 523           // Initialize the tracker slice
 524           {
 525                 int iSec = slice;
 526                 float inRmin = 83.65;
 527                 //    float inRmax = 133.3;
 528                 //    float outRmin = 133.5;
 529                 float outRmax = 247.7;
 530                 float plusZmin = 0.0529937;
 531                 float plusZmax = 249.778;
 532                 float minusZmin = -249.645;
 533                 float minusZmax = -0.0799937;
 534                 float dalpha = 0.349066;
 535                 float alpha = 0.174533 + dalpha * iSec;
 536
 537                 bool zPlus = ( iSec < 18 );
 538                 float zMin =  zPlus ? plusZmin : minusZmin;
 539                 float zMax =  zPlus ? plusZmax : minusZmax;
 540                 //TPCZmin = -249.645, ZMax = 249.778
 541                 //    float rMin =  inRmin;
 542                 //    float rMax =  outRmax;
 543                 int nRows = AliHLTTPCTransform::GetNRows();
 544
 545                 float padPitch = 0.4;
 546                 float sigmaZ = 0.228808;
 547
 548                 float *rowX = new float [nRows];
 549                 for ( int irow = 0; irow < nRows; irow++ ) {
 550                   rowX[irow] = AliHLTTPCTransform::Row2X( irow );
 551                 }
 552
 553                 AliHLTTPCCAParam param;
 554
 555                 param.Initialize( iSec, nRows, rowX, alpha, dalpha,
 556                                                   inRmin, outRmax, zMin, zMax, padPitch, sigmaZ, fSolenoidBz );
 557                 param.SetHitPickUpFactor( 2 );
 558                 if( fNeighboursSearchArea>0 ) param.SetNeighboursSearchArea( fNeighboursSearchArea );
 559                 if( fClusterErrorCorrectionY>1.e-4 ) param.SetClusterError2CorrectionY( fClusterErrorCorrectionY*fClusterErrorCorrectionY );
 560                 if( fClusterErrorCorrectionZ>1.e-4 ) param.SetClusterError2CorrectionZ( fClusterErrorCorrectionZ*fClusterErrorCorrectionZ );
 561                 param.Update();
 562                 fTracker->InitializeSliceParam( slice, param );
 563                 delete[] rowX;
 564           }
 565
 566           // total n Hits
 567           int nClustersTotal = 0;
 568
 569           // sort patches
 570           std::vector<unsigned long> patchIndices;
 571
 572           for ( ndx = 0; ndx < evtData.fBlockCnt; ndx++ ) {
 573                 iter = blocks + ndx;
 574                 if ( slice != AliHLTTPCDefinitions::GetMinSliceNr( *iter ) ) continue;
 575                 if ( iter->fDataType == AliHLTTPCDefinitions::fgkClustersDataType ){
 576                   AliHLTTPCClusterData* inPtrSP = ( AliHLTTPCClusterData* )( iter->fPtr );
 577                   nClustersTotal += inPtrSP->fSpacePointCnt;
 578                 }
 579                 else if ( iter->fDataType == AliHLTTPCCADefinitions::fgkCompressedInputDataType){
 580                   const AliHLTUInt8_t * inPtr =  (const AliHLTUInt8_t *)iter->fPtr;
 581                   while( inPtr< ((const AliHLTUInt8_t *) iter->fPtr) + iter->fSize ){
 582                     AliHLTTPCCACompressedClusterRow *row = (AliHLTTPCCACompressedClusterRow*)inPtr;
 583                     nClustersTotal+= row->fNClusters;
 584                     inPtr = (const AliHLTUInt8_t *)(row->fClusters+row->fNClusters);
 585                   }
 586                 }
 587                 else continue;
 588
 589                 int patch = AliHLTTPCDefinitions::GetMinPatchNr( *iter );
 590                 if ( sliceminPatch[islice] > patch ) {
 591                   sliceminPatch[islice] = patch;
 592                   slicerow[2 * islice + 0] = AliHLTTPCTransform::GetFirstRow( patch );
 593                 }
 594                 if ( slicemaxPatch[islice] < patch ) {
 595                   slicemaxPatch[islice] = patch;
 596                   slicerow[2 * islice + 1] = AliHLTTPCTransform::GetLastRow( patch );
 597                 }
 598                 std::vector<unsigned long>::iterator pIter = patchIndices.begin();
 599                 while ( pIter != patchIndices.end() && AliHLTTPCDefinitions::GetMinPatchNr( blocks[*pIter] ) < patch ) {
 600                   pIter++;
 601                 }
 602                 patchIndices.insert( pIter, ndx );
 603           }
 604
 605
 606           // pass event to CA Tracker
 607
 608
 609           Logging( kHLTLogDebug, "HLT::TPCCATracker::DoEvent", "Reading hits",
 610                            "Total %d hits to read for slice %d", nClustersTotal, slice );
 611
 612
 613           clusterData[islice].StartReading( slice, nClustersTotal );
 614
 615           for ( std::vector<unsigned long>::iterator pIter = patchIndices.begin(); pIter != patchIndices.end(); pIter++ ) {
 616                 ndx = *pIter;
 617                 iter = blocks + ndx;
 618                 int patch = AliHLTTPCDefinitions::GetMinPatchNr( *iter );
 619                 int nPatchClust = 0;
 620                 if ( iter->fDataType == AliHLTTPCDefinitions::fgkClustersDataType ){
 621                   AliHLTTPCClusterData* inPtrSP = ( AliHLTTPCClusterData* )( iter->fPtr );
 622                   nPatchClust = inPtrSP->fSpacePointCnt;
 623                   for ( unsigned int i = 0; i < inPtrSP->fSpacePointCnt; i++ ) {
 624                     AliHLTTPCSpacePointData *c = &( inPtrSP->fSpacePoints[i] );
 625                     if ( CAMath::Abs( c->fZ ) > fClusterZCut ) continue;
 626                     if ( c->fPadRow > 159 ) {
 627                       HLTError( "Wrong TPC cluster with row number %d received", c->fPadRow );
 628                       continue;
 629                     }
 630                     clusterData[islice].ReadCluster( c->fID, c->fPadRow, c->fX, c->fY, c->fZ, c->fCharge );
 631                   }
 632                 }
 633                 else if ( iter->fDataType == AliHLTTPCCADefinitions::fgkCompressedInputDataType){
 634                   const AliHLTUInt8_t * inPtr = (const AliHLTUInt8_t *)iter->fPtr;
 635                   nPatchClust=0;
 636                   while( inPtr< ((const AliHLTUInt8_t *)iter->fPtr) + iter->fSize ){
 637                     AliHLTTPCCACompressedClusterRow *row = (AliHLTTPCCACompressedClusterRow*)inPtr;
 638                     UInt_t id = row->fSlicePatchRowID;
 639                     UInt_t jslice = id>>10;
 640                     UInt_t jpatch = (id>>6) & 0x7;
 641                     UInt_t jrow   =  id     & 0x3F;
 642                     jrow+= AliHLTTPCTransform::GetFirstRow( jpatch );
 643                     Double_t rowX = AliHLTTPCTransform::Row2X( jrow );
 644                     //cout<<"Read row: s "<<jslice<<" p "<<jpatch<<" r "<<jrow<<" x "<<row->fX<<" nclu "<<row->fNClusters<<" :"<<endl;
 645                     if( jrow > 159 ) {
 646                       HLTError( "Wrong TPC cluster with row number %d received", jrow );
 647                       continue;
 648                     }
 649                     for ( unsigned int i = 0; i < row->fNClusters; i++ ) {
 650                       AliHLTTPCCACompressedCluster *c = &( row->fClusters[i] );
 651
 652                       UInt_t ix0 = c->fP0 >>24;
 653                       UInt_t ix1 = c->fP1 >>24;
 654                       Double_t x = (ix1<<8) + ix0;
 655                       Double_t y = c->fP0 & 0x00FFFFFF;
 656                       Double_t z = c->fP1 & 0x00FFFFFF;
 657                       x = (x - 32768.)*1.e-4 + rowX;
 658                       y = (y - 8388608.)*1.e-4;
 659                       z = (z - 8388608.)*1.e-4;
 660
 661                       UInt_t cluId = nPatchClust + ((jslice&0x7f)<<25)+((jpatch&0x7)<<22);
 662                       //cout<<"clu "<<i<<": "<<x<<" "<<y<<" "<<z<<" "<<cluId<<endl;
 663                       if ( CAMath::Abs( z ) <= fClusterZCut ){
 664                         clusterData[islice].ReadCluster( cluId, jrow, x, y, z, 0 );
 665                       }
 666                       nPatchClust++;
 667                     }
 668                     inPtr = (const AliHLTUInt8_t *)(row->fClusters+row->fNClusters);
 669                   }
 670                 }
 671                 Logging( kHLTLogInfo, "HLT::TPCCATracker::DoEvent", "Reading hits",
 672                          "Read %d hits for slice %d - patch %d", nPatchClust, slice, patch );
 673           }
 674
 675           clusterData[islice].FinishReading();
 676           nClustersTotalSum += nClustersTotal;
 677   }
 678
 679   //Prepare Output
 680   AliHLTTPCCASliceOutput::outputControlStruct outputControl;
 681   //Set tracker output so tracker does not have to output both formats!
 682   outputControl.fObsoleteOutput = fOutputTRAKSEGS;
 683   outputControl.fDefaultOutput = !fOutputTRAKSEGS;
 684
 685   //For new output we can write directly to output buffer
 686   outputControl.fOutputPtr = fOutputTRAKSEGS ? NULL : (char*) outputPtr;
 687   outputControl.fOutputMaxSize = maxBufferSize;
 688
 689   AliHLTTPCCASliceOutput** sliceOutput = new AliHLTTPCCASliceOutput*[slicecount];
 690   memset(sliceOutput, 0, slicecount * sizeof(AliHLTTPCCASliceOutput*));
 691
 692   // reconstruct the event
 693   TStopwatch timerReco;
 694   fTracker->SetOutputControl(&outputControl);
 695   fTracker->ProcessSlices(minslice, slicecount, clusterData, sliceOutput);
 696   timerReco.Stop();
 697
 698   int ret = 0;
 699   unsigned int mySize = 0;
 700   int ntracks = 0;
 701   int error = 0;
 702
 703   for (int islice = 0;islice < slicecount;islice++)
 704   {
 705           slice = minslice + islice;
 706
 707           if (sliceOutput[islice])
 708           {
 709                   // write reconstructed tracks
 710
 711                   if ( fOutputTRAKSEGS ) {
 712
 713                   Logging( kHLTLogDebug, "HLT::TPCCATracker::DoEvent", "Reconstruct",
 714                                    "%d tracks found for slice %d", sliceOutput[islice]->NOutTracks(), slice );
 715
 716                         ntracks = sliceOutput[islice]->NOutTracks();
 717
 718                         AliHLTTPCTrackletData* outPtr = ( AliHLTTPCTrackletData* )( outputPtr );
 719
 720                         AliHLTTPCTrackSegmentData* currOutTracklet = outPtr->fTracklets;
 721
 722                         mySize =   ( ( AliHLTUInt8_t * )currOutTracklet ) -  ( ( AliHLTUInt8_t * )outputPtr );
 723
 724                         outPtr->fTrackletCnt = 0;
 725
 726                         for ( int itr = 0; itr < ntracks; itr++ ) {
 727
 728                           AliHLTTPCCAOutTrack &t = sliceOutput[islice]->OutTracks()[itr];
 729
 730                           //Logging( kHLTLogDebug, "HLT::TPCCATracker::DoEvent", "Wrtite output","track %d with %d hits", itr, t.NHits());
 731
 732                           if ( t.NHits() < fMinNTrackClusters ) continue;
 733
 734                           // calculate output track size
 735
 736                           unsigned int dSize = sizeof( AliHLTTPCTrackSegmentData ) + t.NHits() * sizeof( unsigned int );
 737
 738                           if ( mySize + dSize > maxBufferSize ) {
 739                                 HLTWarning( "Output buffer size exceed (buffer size %d, current size %d), %d tracks are not stored", maxBufferSize, mySize, ntracks - itr + 1 );
 740                                 ret = -ENOSPC;
 741                                 error = 1;
 742                                 break;
 743                           }
 744
 745                           // convert CA track parameters to HLT Track Segment
 746
 747                           int iFirstRow = 1000;
 748                           int iLastRow = -1;
 749                           int iFirstHit = sliceOutput[islice]->OutTrackHit(t.FirstHitRef());
 750                           int iLastHit = iFirstHit;
 751                           for ( int ih = 0; ih < t.NHits(); ih++ ) {
 752                                 int hitID = sliceOutput[islice]->OutTrackHit(t.FirstHitRef() + ih);
 753                                 int iRow = clusterData[islice].RowNumber( hitID );
 754                                 if ( iRow < iFirstRow ) {  iFirstRow = iRow; iFirstHit = hitID; }
 755                                 if ( iRow > iLastRow ) { iLastRow = iRow; iLastHit = hitID; }
 756                           }
 757
 758                           AliHLTTPCCATrackParam par = t.StartPoint();
 759
 760                           par.TransportToX( clusterData[islice].X( iFirstHit ), .99 );
 761
 762                           AliExternalTrackParam tp;
 763                           AliHLTTPCCATrackConvertor::GetExtParam( par, tp, 0 );
 764
 765                           currOutTracklet->fX = tp.GetX();
 766                           currOutTracklet->fY = tp.GetY();
 767                           currOutTracklet->fZ = tp.GetZ();
 768                           currOutTracklet->fCharge = ( int ) tp.GetSign();
 769                           currOutTracklet->fPt = TMath::Abs( tp.GetSignedPt() );
 770                           float snp =  tp.GetSnp() ;
 771                           if ( snp > .999 ) snp = .999;
 772                           if ( snp < -.999 ) snp = -.999;
 773                           currOutTracklet->fPsi = TMath::ASin( snp );
 774                           currOutTracklet->fTgl = tp.GetTgl();
 775
 776                           currOutTracklet->fY0err = tp.GetSigmaY2();
 777                           currOutTracklet->fZ0err = tp.GetSigmaZ2();
 778                           float h = -currOutTracklet->fPt * currOutTracklet->fPt;
 779                           currOutTracklet->fPterr = h * h * tp.GetSigma1Pt2();
 780                           h = 1. / TMath::Sqrt( 1 - snp * snp );
 781                           currOutTracklet->fPsierr = h * h * tp.GetSigmaSnp2();
 782                           currOutTracklet->fTglerr = tp.GetSigmaTgl2();
 783
 784                           if ( par.TransportToX( clusterData[islice].X( iLastHit ), .99 ) ) {
 785                                 currOutTracklet->fLastX = par.GetX();
 786                                 currOutTracklet->fLastY = par.GetY();
 787                                 currOutTracklet->fLastZ = par.GetZ();
 788                           } else {
 789                                 currOutTracklet->fLastX = clusterData[islice].X( iLastHit );
 790                                 currOutTracklet->fLastY = clusterData[islice].Y( iLastHit );
 791                                 currOutTracklet->fLastZ = clusterData[islice].Z( iLastHit );
 792                           }
 793                           //if( currOutTracklet->fLastX<10. ) {
 794                           //HLTError("CA last point: hitxyz=%f,%f,%f, track=%f,%f,%f, tracklet=%f,%f,%f, nhits=%d",clusterData[islice].X( iLastHit ),clusterData[islice].Y( iLastHit],clusterData[islice].Z( iLastHit],
 795                           //par.GetX(), par.GetY(),par.GetZ(),currOutTracklet->fLastX,currOutTracklet->fLastY ,currOutTracklet->fLastZ, t.NHits());
 796                           //}
 797                 #ifdef INCLUDE_TPC_HOUGH
 798                 #ifdef ROWHOUGHPARAMS
 799                           currOutTracklet->fTrackID = 0;
 800                           currOutTracklet->fRowRange1 = clusterData[islice].RowNumber( iFirstHit );
 801                           currOutTracklet->fRowRange2 = clusterData[islice].RowNumber( iLastHit );
 802                           currOutTracklet->fSector = slice;
 803                           currOutTracklet->fPID = 211;
 804                 #endif
 805                 #endif // INCLUDE_TPC_HOUGH
 806
 807
 808                           currOutTracklet->fNPoints = t.NHits();
 809
 810                           for ( int i = 0; i < t.NHits(); i++ ) {
 811                                 currOutTracklet->fPointIDs[i] = clusterData[islice].Id( sliceOutput[islice]->OutTrackHit(t.FirstHitRef()+i) );
 812                           }
 813
 814                           currOutTracklet = ( AliHLTTPCTrackSegmentData* )( ( Byte_t * )currOutTracklet + dSize );
 815                           mySize += dSize;
 816                           outPtr->fTrackletCnt++;
 817                         }
 818
 819                   } else { // default output type
 820
 821                   Logging( kHLTLogDebug, "HLT::TPCCATracker::DoEvent", "Reconstruct",
 822                                    "%d tracks found for slice %d", sliceOutput[islice]->NTracks(), slice );
 823
 824                           mySize += sliceOutput[islice]->OutputMemorySize();
 825                           ntracks += sliceOutput[islice]->NTracks();
 826                   }
 827           }
 828           else
 829           {
 830                   HLTWarning( "Output buffer size exceed (buffer size %d, current size %d), tracks are not stored", maxBufferSize, mySize );
 831                   mySize = 0;
 832                   ret = -ENOSPC;
 833                   ntracks = 0;
 834                   error = 1;
 835                   break;
 836           }
 837   }
 838
 839   size = 0;
 840   if (error == 0)
 841   {
 842           for (int islice = 0;islice < slicecount;islice++)
 843           {
 844                   slice = minslice + islice;
 845                   if (!fOutputTRAKSEGS) mySize = sliceOutput[islice]->OutputMemorySize();
 846                   if (mySize > 0)
 847                   {
 848                         AliHLTComponentBlockData bd;
 849                         FillBlockData( bd );
 850                         bd.fOffset = fOutputTRAKSEGS ? 0 : ((char*) sliceOutput[islice] - (char*) outputPtr);
 851                         bd.fSize = mySize;
 852                         bd.fSpecification = AliHLTTPCDefinitions::EncodeDataSpecification( slice, slice, sliceminPatch[islice], slicemaxPatch[islice] );
 853                         bd.fDataType = GetOutputDataType();
 854                         outputBlocks.push_back( bd );
 855                         size += mySize;
 856                   }
 857           }
 858   }
 859
 860   //No longer needed
 861   delete[] clusterData;
 862   //These are only temporary pointers to the output and no longer needed
 863   delete[] sliceOutput;
 864
 865   timer.Stop();
 866
 867   fFullTime += timer.RealTime();
 868   fRecoTime += timerReco.RealTime();
 869   fNEvents++;
 870
 871   // Set log level to "Warning" for on-line system monitoring
 872   int hz = ( int ) ( fFullTime > 1.e-10 ? fNEvents / fFullTime : 100000 );
 873   int hz1 = ( int ) ( fRecoTime > 1.e-10 ? fNEvents / fRecoTime : 100000 );
 874   //Min and Max Patch are taken for first slice processed...
 875   HLTInfo( "CATracker slices %d-%d: output %d tracks;  input %d clusters, patches %d..%d, rows %d..%d; time: full %d / reco %d Hz",
 876            minslice, maxslice, ntracks, nClustersTotalSum, sliceminPatch[0], slicemaxPatch[0], slicerow[0], slicerow[1], hz, hz1 );
 877
 878   return ret;
 879 }
 880
 881