ITS/AliITSsimulationSDD.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17 #include <iostream.h>
  18 #include <stdlib.h>
  19 #include <stdio.h>
  20 #include <string.h>
  21
  22 #include "AliRun.h"
  23 #include "AliITS.h"
  24 #include "AliITSMapA1.h"
  25 #include "AliITSMapA2.h"
  26 #include "AliITSsimulationSDD.h"
  27 #include "AliITSetfSDD.h"
  28 #include "AliITSRawData.h"
  29 #include "AliITSHuffman.h"
  30
  31 ClassImp(AliITSsimulationSDD)
  32 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  33 // Version: 0
  34 // Written by Piergiorgio Cerello
  35 // November 23 1999
  36 //
  37 // AliITSsimulationSDD is the simulation of SDDs.
  38   //
  39 //Begin_Html
  40 /*
  41 <img src="picts/ITS/AliITShit_Class_Diagram.gif">
  42 </pre>
  43 <br clear=left>
  44 <font size=+2 color=red>
  45 <p>This show the relasionships between the ITS hit class and the rest of Aliroot.
  46 </font>
  47 <pre>
  48 */
  49 //End_Html
  50 //_____________________________________________________________________________
  51
  52 Int_t power(Int_t b, Int_t e) {
  53   // compute b to the e power, where both b and e are Int_ts.
  54   Int_t power = 1,i;
  55   for(i=0; i<e; i++) power *= b;
  56   return power;
  57 }
  58
  59 //_____________________________________________
  60
  61 void FastFourierTransform(AliITSetfSDD *alisddetf,Double_t *real,
  62                           Double_t *imag,Int_t direction) {
  63   // Do a Fast Fourier Transform
  64
  65   Int_t samples = alisddetf->GetSamples();
  66   Int_t l = (Int_t) ((log((Float_t) samples)/log(2.))+0.5);
  67   Int_t m1 = samples;
  68   Int_t m  = samples/2;
  69   Int_t m2 = samples/m1;
  70   Int_t i,j,k;
  71   for(i=1; i<=l; i++) {
  72     for(j=0; j<samples; j += m1) {
  73       Int_t p = 0;
  74       for(k=j; k<= j+m-1; k++) {
  75         Double_t wsr = alisddetf->GetWeightReal(p);
  76         Double_t wsi = alisddetf->GetWeightImag(p);
  77         if(direction == -1) wsi = -wsi;
  78         Double_t xr = *(real+k+m);
  79         Double_t xi = *(imag+k+m);
  80         *(real+k+m) = wsr*(*(real+k)-xr) - wsi*(*(imag+k)-xi);
  81         *(imag+k+m) = wsr*(*(imag+k)-xi) + wsi*(*(real+k)-xr);
  82         *(real+k) += xr;
  83         *(imag+k) += xi;
  84         p += m2;
  85       }
  86     }
  87     m1 = m;
  88     m /= 2;
  89     m2 += m2;
  90   }
  91
  92   for(j=0; j<samples; j++) {
  93     Int_t j1 = j;
  94     Int_t p = 0;
  95     Int_t i1;
  96     for(i1=1; i1<=l; i1++) {
  97       Int_t j2 = j1;
  98       j1 /= 2;
  99       p = p + p + j2 - j1 - j1;
 100     }
 101     if(p >= j) {
 102       Double_t xr = *(real+j);
 103       Double_t xi = *(imag+j);
 104       *(real+j) = *(real+p);
 105       *(imag+j) = *(imag+p);
 106       *(real+p) = xr;
 107       *(imag+p) = xi;
 108     }
 109   }
 110   if(direction == -1) {
 111     for(i=0; i<samples; i++) {
 112       *(real+i) /= samples;
 113       *(imag+i) /= samples;
 114     }
 115   }
 116   return;
 117 }
 118 //_____________________________________________________________________________
 119
 120 AliITSsimulationSDD::AliITSsimulationSDD(){
 121   // Default constructor
 122
 123   fResponse = 0;
 124   fSegmentation = 0;
 125   fHis = 0;
 126   fD.Set(0);
 127   fT1.Set(0);
 128   fT2.Set(0);
 129   fTol.Set(0);
 130   SetScaleFourier();
 131   SetPerpendTracksFlag();
 132   fInZR = 0;
 133   fInZI = 0;
 134   fOutZR = 0;
 135   fOutZI = 0;
 136 }
 137 //_____________________________________________________________________________
 138 AliITSsimulationSDD::AliITSsimulationSDD(AliITSsimulationSDD &source)
 139 {
 140   // Copy constructor to satify Coding roules only.
 141   if(this==&source) return;
 142   printf("Not allowed to make a copy of AliITSsimulationSDD "
 143          "Using default creater instead\n");
 144   AliITSsimulationSDD();
 145 }
 146 //_____________________________________________________________________________
 147 AliITSsimulationSDD& AliITSsimulationSDD::operator=(AliITSsimulationSDD &source)
 148 {
 149   // Assignment operator to satify Coding roules only.
 150   if(this==&source) return *this;
 151   printf("Not allowed to make a = with AliITSsimulationSDD "
 152          "Using default creater instead\n");
 153   return *this ;
 154 }
 155 //_____________________________________________________________________________
 156
 157 AliITSsimulationSDD::AliITSsimulationSDD(AliITSsegmentation *seg,AliITSresponse *resp)
 158 {
 159   // Standard Constructor
 160       fResponse = resp;
 161       fSegmentation = seg;
 162       SetScaleFourier();
 163       SetPerpendTracksFlag();
 164
 165       fHitMap2 = new AliITSMapA2(fSegmentation,fScaleSize,1);
 166       fHitMap1 = new AliITSMapA1(fSegmentation);
 167
 168       //
 169       fNofMaps=fSegmentation->Npz();
 170       fMaxNofSamples=fSegmentation->Npx();
 171
 172       Float_t sddLength = fSegmentation->Dx();
 173       Float_t sddWidth = fSegmentation->Dz();
 174
 175       Int_t dummy=0;
 176       Float_t anodePitch = fSegmentation->Dpz(dummy);
 177       Double_t timeStep = (Double_t)fSegmentation->Dpx(dummy);
 178       Float_t driftSpeed=fResponse->DriftSpeed();
 179
 180       if(anodePitch*(fNofMaps/2) > sddWidth) {
 181          Warning("AliITSsimulationSDD",
 182             "Too many anodes %d or too big pitch %f \n",fNofMaps/2,anodePitch);
 183       }
 184
 185       if(timeStep*fMaxNofSamples < sddLength/driftSpeed) {
 186          Error("AliITSsimulationSDD",
 187                               "Time Interval > Allowed Time Interval: exit\n");
 188          return;
 189       }
 190
 191       fElectronics = new AliITSetfSDD(timeStep/fScaleSize);
 192
 193       char opt1[20], opt2[20];
 194       fResponse->ParamOptions(opt1,opt2);
 195       fParam=opt2;
 196       char *same = strstr(opt1,"same");
 197       if (same) {
 198          fNoise.Set(0);
 199          fBaseline.Set(0);
 200       } else {
 201          fNoise.Set(fNofMaps);
 202          fBaseline.Set(fNofMaps);
 203       }
 204
 205       //
 206       const char *kopt=fResponse->ZeroSuppOption();
 207         if (strstr(fParam,"file") ) {
 208           fD.Set(fNofMaps);
 209           fT1.Set(fNofMaps);
 210           if (strstr(kopt,"2D")) {
 211             fT2.Set(fNofMaps);
 212             fTol.Set(0);
 213             Init2D();       // desactivate if param change module by module
 214           } else if(strstr(kopt,"1D"))  {
 215             fT2.Set(2);
 216             fTol.Set(2);
 217             Init1D();      // desactivate if param change module by module
 218           }
 219         } else {
 220           fD.Set(2);
 221           fTol.Set(2);
 222           fT1.Set(2);
 223           fT2.Set(2);
 224           SetCompressParam();
 225         }
 226
 227
 228         Bool_t write=fResponse->OutputOption();
 229         if(write && strstr(kopt,"2D")) MakeTreeB();
 230
 231         // call here if baseline does not change by module
 232         // ReadBaseline();
 233
 234         fITS = (AliITS*)gAlice->GetModule("ITS");
 235         Int_t size=fNofMaps*fMaxNofSamples;
 236         fStream = new AliITSInStream(size);
 237
 238         fInZR = new Double_t [fScaleSize*fMaxNofSamples];
 239         fInZI = new Double_t [fScaleSize*fMaxNofSamples];
 240         fOutZR = new Double_t [fScaleSize*fMaxNofSamples];
 241         fOutZI = new Double_t [fScaleSize*fMaxNofSamples];
 242
 243 }
 244
 245
 246 //_____________________________________________________________________________
 247
 248 AliITSsimulationSDD::~AliITSsimulationSDD() {
 249   // destructor
 250
 251   delete fHitMap1;
 252   delete fHitMap2;
 253   delete fStream;
 254
 255   fD.Set(0);
 256   fT1.Set(0);
 257   fT2.Set(0);
 258   fTol.Set(0);
 259   fNoise.Set(0);
 260   fBaseline.Set(0);
 261
 262   if (fHis) {
 263      fHis->Delete();
 264      delete fHis;
 265   }
 266   if(fInZR) delete [] fInZR;
 267   if(fInZI) delete [] fInZI;
 268   if(fOutZR) delete [] fOutZR;
 269   if(fOutZI) delete [] fOutZI;
 270 }
 271 //_____________________________________________________________________________
 272
 273 void AliITSsimulationSDD::DigitiseModule(AliITSmodule *mod,Int_t md,Int_t ev){
 274   // create maps to build the lists of tracks
 275   // for each digit
 276
 277     fModule=md;
 278     fEvent=ev;
 279
 280     TObjArray *fHits = mod->GetHits();
 281     Int_t nhits = fHits->GetEntriesFast();
 282     if (!nhits) return;
 283
 284
 285     TObjArray *list=new TObjArray;
 286     static TClonesArray *padr=0;
 287     if(!padr) padr=new TClonesArray("TVector",1000);
 288     Int_t arg[6] = {0,0,0,0,0,0};
 289     fHitMap1->SetArray(list);
 290
 291
 292     Int_t nofAnodes=fNofMaps/2;
 293
 294     Float_t sddLength = fSegmentation->Dx();
 295     Float_t sddWidth = fSegmentation->Dz();
 296
 297     Int_t dummy=0;
 298     Float_t anodePitch = fSegmentation->Dpz(dummy);
 299     Float_t timeStep = fSegmentation->Dpx(dummy);
 300
 301     Float_t driftSpeed=fResponse->DriftSpeed();
 302
 303     // Piergiorgio's part (apart for few variables which I made float
 304     // when i thought that can be done
 305
 306     // Fill detector maps with GEANT hits
 307     // loop over hits in the module
 308
 309     const Float_t kconv=1.0e+6;  // GeV->KeV
 310     Int_t ii;
 311     for(ii=0; ii<nhits; ii++) {
 312         AliITShit *hit = (AliITShit*) fHits->At(ii);
 313         Float_t xL[3];
 314         hit = (AliITShit*) fHits->At(ii);
 315         hit->GetPositionL(xL[0],xL[1],xL[2]);
 316         Int_t hitDetector = hit->GetDetector();
 317
 318         // Deposited energy in keV
 319         Float_t avpath = 0.;
 320         Float_t avanod = 0.;
 321         Float_t depEnergy = kconv*hit->GetIonization();
 322         AliITShit *hit1 = 0;
 323         if(depEnergy != 0.) continue;
 324
 325         ii++;
 326         Float_t xL1[3];
 327         hit1 = (AliITShit*) fHits->At(ii);
 328         hit1->GetPositionL(xL1[0],xL1[1],xL1[2]);
 329         avpath = xL1[0];
 330         avanod = xL1[2];
 331         depEnergy = kconv*hit1->GetIonization();
 332
 333         // scale path to simulate a perpendicular track
 334         if (fFlag) {
 335           Float_t lC[3];
 336           hit->GetPositionL(lC[0],lC[1],lC[2]);
 337           Float_t lC1[3];
 338           hit1->GetPositionL(lC1[0],lC1[1],lC1[2]);
 339           Float_t pathInSDD = TMath::Sqrt((lC[0]-lC1[0])*(lC[0]-lC1[0])+(lC[1]-lC1[1])*(lC[1]-lC1[1])+(lC[2]-lC1[2])*(lC[2]-lC1[2]));
 340           depEnergy *= (0.03/pathInSDD);
 341         }
 342
 343         Float_t avDrft = xL[0]+avpath;
 344         Float_t avAnode = xL[2]+avanod;
 345
 346         if(avpath != 0.) avDrft /= 2.;
 347         if(avanod != 0.) avAnode /= 2.;
 348
 349         Float_t driftPath = 10000.*avDrft;
 350         Int_t iWing = 2;
 351         if(driftPath < 0) {
 352           iWing = 1;
 353           driftPath = -driftPath;
 354         }
 355         driftPath = sddLength-driftPath;
 356         Int_t detector = 2*(hitDetector-1) + iWing;
 357         if(driftPath < 0) {
 358           cout << "Warning: negative drift path " << driftPath << endl;
 359           continue;
 360         }
 361
 362         //   Drift Time
 363         Float_t driftTime = driftPath/driftSpeed;
 364         Int_t timeSample = (Int_t) (fScaleSize*driftTime/timeStep + 1);
 365         if(timeSample > fScaleSize*fMaxNofSamples) {
 366           cout << "Warning: Wrong Time Sample: " << timeSample << endl;
 367           continue;
 368         }
 369
 370         //   Anode
 371         Float_t xAnode = 10000.*(avAnode)/anodePitch + nofAnodes/2;  // +1?
 372         if((xAnode+1)*anodePitch > sddWidth || xAnode*anodePitch < 0.)
 373              { cout << "Warning: Z = " << xAnode*anodePitch << endl; }
 374         Int_t iAnode = (Int_t) (1.+xAnode); // xAnode?
 375         if(iAnode < 0 || iAnode > nofAnodes) {
 376           cout << "Warning: Wrong iAnode: " << iAnode << endl;
 377           continue;
 378         }
 379
 380
 381         // work with the idtrack=entry number in the TreeH for the moment
 382         Int_t idhit,idtrack;
 383         mod->GetHitTrackAndHitIndex(ii,idtrack,idhit);
 384         //Int_t idtrack=mod->GetHitTrackIndex(ii);
 385         // or store straight away the particle position in the array
 386         // of particles :
 387         Int_t itrack = hit->GetTrack();
 388
 389         //  Signal 2d Shape
 390         Float_t diffCoeff, s0;
 391         fResponse->DiffCoeff(diffCoeff,s0);
 392
 393         // Squared Sigma along the anodes
 394         Double_t sigma2A = 2.*diffCoeff*driftTime+s0*s0;
 395         Double_t sigmaA  = TMath::Sqrt(sigma2A);
 396         Double_t sigmaT  = sigmaA/driftSpeed;
 397
 398         // Peak amplitude in nanoAmpere
 399         Double_t eVpairs = 3.6;
 400         Double_t amplitude = fScaleSize*160.*depEnergy/(timeStep*eVpairs*2.*acos(-1.)*sigmaT*sigmaA);
 401
 402         Float_t nsigma=fResponse->NSigmaIntegration();
 403         // Spread the charge
 404         // Pixel index
 405         Int_t ja = iAnode;
 406         Int_t jt = timeSample;
 407         // Sub-pixel index
 408         Int_t nsplit = 4; // hard-wired
 409         nsplit = (nsplit+1)/2*2;
 410         // Sub-pixel size
 411         Double_t aStep = anodePitch/(nsplit*fScaleSize);
 412         Double_t tStep = timeStep/(nsplit*fScaleSize);
 413         // Define SDD window corresponding to the hit
 414         Int_t anodeWindow = (Int_t) (fScaleSize*nsigma*sigmaA/anodePitch + 1);
 415         Int_t timeWindow = (Int_t) (fScaleSize*nsigma*sigmaT/timeStep + 1);
 416         Int_t jamin = (ja - anodeWindow/2 - 1)*fScaleSize*nsplit + 1;
 417         Int_t jamax = (ja + anodeWindow/2)*fScaleSize*nsplit;
 418         if(jamin <= 0) jamin = 1;
 419         if(jamax > fScaleSize*nofAnodes*nsplit) jamax = fScaleSize*nofAnodes*nsplit;
 420         Int_t jtmin = (jt - timeWindow*3 - 1)*nsplit + 1; //hard-wired
 421         Int_t jtmax = (jt + timeWindow*3)*nsplit; //hard-wired
 422         if(jtmin <= 0) jtmin = 1;
 423         if(jtmax > fScaleSize*fMaxNofSamples*nsplit) jtmax = fScaleSize*fMaxNofSamples*nsplit;
 424
 425         Double_t rlAnode = log(aStep*amplitude);
 426
 427         // Spread the charge in the anode-time window
 428         Int_t ka;
 429         for(ka=jamin; ka <=jamax; ka++) {
 430           Int_t ia = (ka-1)/(fScaleSize*nsplit) + 1;
 431           if(ia <= 0) { cout << "Warning: ia < 1: " << endl; continue; }
 432           if(ia > nofAnodes) ia = nofAnodes;
 433           Double_t aExpo = (aStep*(ka-0.5)-xAnode*anodePitch)/sigmaA;
 434           Double_t anodeAmplitude = rlAnode - 0.5*aExpo*aExpo;
 435           // Protect against overflows
 436           if(anodeAmplitude > -87.3)
 437             anodeAmplitude = exp(anodeAmplitude);
 438           else
 439             anodeAmplitude = 0;
 440           Int_t index = ((detector+1)%2)*nofAnodes+ia-1;  // index starts from 0
 441           if(anodeAmplitude) {
 442             Double_t rlTime = log(tStep*anodeAmplitude);
 443             Int_t kt;
 444             for(kt=jtmin; kt<=jtmax; kt++) {
 445               Int_t it = (kt-1)/nsplit+1;  // it starts from 1
 446               if(it<=0) { cout << "Warning: it < 1: " << endl; continue; }
 447               if(it>fScaleSize*fMaxNofSamples) it = fScaleSize*fMaxNofSamples;
 448               Double_t tExpo = (tStep*(kt-0.5)-driftTime)/sigmaT;
 449               Double_t timeAmplitude = rlTime - 0.5*tExpo*tExpo;
 450               // Protect against overflows
 451               if(timeAmplitude > -87.3){
 452                 timeAmplitude = exp(timeAmplitude);
 453               } else
 454                 timeAmplitude = 0;
 455
 456               // build the list of digits for this module
 457               arg[0]=index;
 458               arg[1]=it;
 459               arg[2]=itrack;
 460               arg[3]=idhit;
 461               ListOfFiredCells(arg,timeAmplitude,list,padr);
 462         } // loop over time in window
 463       } // end if anodeAmplitude
 464     } // loop over anodes in window
 465   } // end loop over hits
 466
 467   // introduce the electronics effects and do zero-suppression if required
 468   Int_t nentries=list->GetEntriesFast();
 469   if (nentries) {
 470     ChargeToSignal();
 471
 472     const char *kopt=fResponse->ZeroSuppOption();
 473     ZeroSuppression(kopt);
 474   }
 475
 476   // clean memory
 477   list->Delete();
 478   delete list;
 479
 480   padr->Delete();
 481
 482   fHitMap1->ClearMap();
 483   fHitMap2->ClearMap();
 484
 485   //gObjectTable->Print();
 486 }
 487
 488
 489 //____________________________________________
 490
 491 void AliITSsimulationSDD::ListOfFiredCells(Int_t *arg,Double_t timeAmplitude,
 492                                            TObjArray *list,TClonesArray *padr){
 493   // Returns the list of "fired" cells.
 494
 495                     Int_t index=arg[0];
 496                     Int_t ik=arg[1];
 497                     Int_t idtrack=arg[2];
 498                     Int_t idhit=arg[3];
 499                     Int_t counter=arg[4];
 500                     Int_t countadr=arg[5];
 501
 502                     Double_t charge=timeAmplitude;
 503                     charge += fHitMap2->GetSignal(index,ik-1);
 504                     fHitMap2->SetHit(index, ik-1, charge);
 505
 506                     Int_t digits[3];
 507                     Int_t it=(Int_t)((ik-1)/fScaleSize);
 508
 509                     digits[0]=index;
 510                     digits[1]=it;
 511                     digits[2]=(Int_t)timeAmplitude;
 512                     Float_t phys;
 513                     if (idtrack >= 0) phys=(Float_t)timeAmplitude;
 514                     else phys=0;
 515
 516                     Double_t cellcharge=0.;
 517                     AliITSTransientDigit* pdigit;
 518                     // build the list of fired cells and update the info
 519                     if (!fHitMap1->TestHit(index, it)) {
 520
 521                         new((*padr)[countadr++]) TVector(3);
 522                         TVector &trinfo=*((TVector*) (*padr)[countadr-1]);
 523                         trinfo(0)=(Float_t)idtrack;
 524                         trinfo(1)=(Float_t)idhit;
 525                         trinfo(2)=(Float_t)timeAmplitude;
 526
 527                         list->AddAtAndExpand(
 528                             new AliITSTransientDigit(phys,digits),counter);
 529
 530                         fHitMap1->SetHit(index, it, counter);
 531                         counter++;
 532                         pdigit=(AliITSTransientDigit*)list->
 533                                                       At(list->GetLast());
 534                         // list of tracks
 535                         TObjArray *trlist=(TObjArray*)pdigit->TrackList();
 536                         trlist->Add(&trinfo);
 537
 538                     } else {
 539                         pdigit=
 540                          (AliITSTransientDigit*) fHitMap1->GetHit(index, it);
 541                         for(Int_t kk=0;kk<fScaleSize;kk++) {
 542                           cellcharge += fHitMap2->GetSignal(index,fScaleSize*it+kk);
 543                         }
 544                         // update charge
 545                         (*pdigit).fSignal=(Int_t)cellcharge;
 546                         (*pdigit).fPhysics+=phys;
 547                         // update list of tracks
 548                         TObjArray* trlist=(TObjArray*)pdigit->TrackList();
 549                         Int_t lastentry=trlist->GetLast();
 550                         TVector *ptrkp=(TVector*)trlist->At(lastentry);
 551                         TVector &trinfo=*ptrkp;
 552                         Int_t lasttrack=Int_t(trinfo(0));
 553                         Int_t lasthit=Int_t(trinfo(1));
 554                         Float_t lastcharge=(trinfo(2));
 555
 556                         if (lasttrack==idtrack ) {
 557                             lastcharge+=(Float_t)timeAmplitude;
 558                             trlist->RemoveAt(lastentry);
 559                             trinfo(0)=lasttrack;
 560                             trinfo(1)=lasthit; // or idhit
 561                             trinfo(2)=lastcharge;
 562                             trlist->AddAt(&trinfo,lastentry);
 563                         } else {
 564
 565                             new((*padr)[countadr++]) TVector(3);
 566                             TVector &trinfo=*((TVector*) (*padr)[countadr-1]);
 567                             trinfo(0)=(Float_t)idtrack;
 568                             trinfo(1)=(Float_t)idhit;
 569                             trinfo(2)=(Float_t)timeAmplitude;
 570
 571                             trlist->Add(&trinfo);
 572                         }
 573
 574 #ifdef print
 575                         // check the track list - debugging
 576                         Int_t trk[20], htrk[20];
 577                         Float_t chtrk[20];
 578                         Int_t nptracks=trlist->GetEntriesFast();
 579                         if (nptracks > 2) {
 580                             Int_t tr;
 581                             for (tr=0;tr<nptracks;tr++) {
 582                                 TVector *pptrkp=(TVector*)trlist->At(tr);
 583                                 TVector &pptrk=*pptrkp;
 584                                 trk[tr]=Int_t(pptrk(0));
 585                                 htrk[tr]=Int_t(pptrk(1));
 586                                 chtrk[tr]=(pptrk(2));
 587                                 printf("nptracks %d \n",nptracks);
 588                                 // set printings
 589                             }
 590                         } // end if nptracks
 591 #endif
 592                     } //  end if pdigit
 593
 594                     arg[4]=counter;
 595                     arg[5]=countadr;
 596
 597
 598 }
 599
 600
 601 //____________________________________________
 602
 603 void AliITSsimulationSDD::AddDigit(Int_t i, Int_t j, Int_t signal){
 604   // Adds a Digit.
 605     // tag with -1 signals coming from background tracks
 606     // tag with -2 signals coming from pure electronic noise
 607
 608     Int_t digits[3], tracks[3], hits[3];
 609     Float_t phys, charges[3];
 610
 611     Int_t trk[20], htrk[20];
 612     Float_t chtrk[20];
 613
 614     signal=Convert8to10(signal); // set a flag in case non-ZS are 10-bit
 615     AliITSTransientDigit *obj = (AliITSTransientDigit*)fHitMap1->GetHit(i,j);
 616     digits[0]=i;
 617     digits[1]=j;
 618     digits[2]=signal;
 619     if (!obj) {
 620         phys=0;
 621         Int_t k;
 622         for (k=0;k<3;k++) {
 623           tracks[k]=-2;
 624           charges[k]=0;
 625           hits[k]=0;
 626         }
 627         fITS->AddSimDigit(1,phys,digits,tracks,hits,charges);
 628     } else {
 629       phys=obj->fPhysics;
 630       TObjArray* trlist=(TObjArray*)obj->TrackList();
 631       Int_t nptracks=trlist->GetEntriesFast();
 632
 633       if (nptracks > 20) {
 634          cout<<"Attention - nptracks > 20 "<<nptracks<<endl;
 635          nptracks=20;
 636       }
 637       Int_t tr;
 638       for (tr=0;tr<nptracks;tr++) {
 639           TVector &pp  =*((TVector*)trlist->At(tr));
 640           trk[tr]=Int_t(pp(0));
 641           htrk[tr]=Int_t(pp(1));
 642           chtrk[tr]=(pp(2));
 643       }
 644       if (nptracks > 1) {
 645           SortTracks(trk,chtrk,htrk,nptracks);
 646       }
 647       Int_t i;
 648       if (nptracks < 3 ) {
 649          for (i=0; i<nptracks; i++) {
 650              tracks[i]=trk[i];
 651              charges[i]=chtrk[i];
 652              hits[i]=htrk[i];
 653          }
 654          for (i=nptracks; i<3; i++) {
 655              tracks[i]=0;
 656              hits[i]=0;
 657              charges[i]=0;
 658          }
 659       } else {
 660          for (i=0; i<3; i++) {
 661              tracks[i]=trk[i];
 662              charges[i]=chtrk[i];
 663              hits[i]=htrk[i];
 664          }
 665       }
 666
 667       fITS->AddSimDigit(1,phys,digits,tracks,hits,charges);
 668
 669     }
 670
 671 }
 672
 673 //____________________________________________
 674
 675 void AliITSsimulationSDD::SortTracks(Int_t *tracks,Float_t *charges,Int_t *hits,Int_t ntr){
 676   //
 677   // Sort the list of tracks contributing to a given digit
 678   // Only the 3 most significant tracks are acctually sorted
 679   //
 680
 681   //
 682   //  Loop over signals, only 3 times
 683   //
 684
 685
 686   Float_t qmax;
 687   Int_t jmax;
 688   Int_t idx[3] = {-3,-3,-3};
 689   Float_t jch[3] = {-3,-3,-3};
 690   Int_t jtr[3] = {-3,-3,-3};
 691   Int_t jhit[3] = {-3,-3,-3};
 692   Int_t i,j,imax;
 693
 694   if (ntr<3) imax=ntr;
 695   else imax=3;
 696   for(i=0;i<imax;i++){
 697     qmax=0;
 698     jmax=0;
 699
 700     for(j=0;j<ntr;j++){
 701
 702       if((i == 1 && j == idx[i-1] )
 703          ||(i == 2 && (j == idx[i-1] || j == idx[i-2]))) continue;
 704
 705       if(charges[j] > qmax) {
 706         qmax = charges[j];
 707         jmax=j;
 708       }
 709     }
 710
 711     if(qmax > 0) {
 712       idx[i]=jmax;
 713       jch[i]=charges[jmax];
 714       jtr[i]=tracks[jmax];
 715       jhit[i]=hits[jmax];
 716     }
 717
 718   }
 719
 720   for(i=0;i<3;i++){
 721     if (jtr[i] == -3) {
 722          charges[i]=0;
 723          tracks[i]=-3;
 724          hits[i]=-1;
 725     } else {
 726          charges[i]=jch[i];
 727          tracks[i]=jtr[i];
 728          hits[i]=jtr[i];
 729     }
 730   }
 731
 732 }
 733 //____________________________________________
 734 void AliITSsimulationSDD::ChargeToSignal() {
 735   // add baseline, noise, electronics and ADC saturation effects
 736
 737
 738   Float_t maxadc = fResponse->MaxAdc();
 739   Float_t topValue = fResponse->MagicValue();
 740   Float_t norm = maxadc/topValue;
 741
 742
 743   char opt1[20], opt2[20];
 744   fResponse->ParamOptions(opt1,opt2);
 745   char *read = strstr(opt1,"file");
 746
 747   Float_t baseline, noise;
 748
 749   if (read) {
 750       static Bool_t readfile=kTRUE;
 751       //read baseline and noise from file
 752       if (readfile) ReadBaseline();
 753       readfile=kFALSE;
 754   } else fResponse->GetNoiseParam(noise,baseline);
 755
 756   Float_t contrib=0;
 757   Bool_t first=kTRUE;
 758
 759   TRandom *random = new TRandom();
 760   Int_t i,k,kk;
 761   for (i=0;i<=fNofMaps;i++) {
 762     if  (read && i<fNofMaps) GetAnodeBaseline(i,baseline,noise);
 763     if (!first) FastFourierTransform(fElectronics,&fInZR[0],&fInZI[0],1);
 764     for (k=0;k<fScaleSize*fMaxNofSamples;k++) {
 765         if (!first) {
 766             Float_t newcont = 0.;
 767             Float_t maxcont = 0.;
 768             Int_t it=(Int_t)(k/fScaleSize);
 769             if (k%fScaleSize == 0) {
 770               for(kk=0;kk<fScaleSize;kk++) {
 771                 newcont = fOutZR[fScaleSize*it+kk];
 772                 if(newcont > maxcont) maxcont = newcont;
 773               }
 774               newcont = maxcont;
 775               // analog to digital ?
 776               Double_t signal = newcont*norm;
 777               if (signal >= maxadc) signal = maxadc -1;
 778               // back to analog: ?
 779               signal /=norm;
 780               fHitMap2->SetHit(i-1,it,signal);
 781             }
 782             Double_t rw = fElectronics->GetTraFunReal(k);
 783             Double_t iw = fElectronics->GetTraFunImag(k);
 784             fOutZR[k] = fInZR[k]*rw - fInZI[k]*iw;
 785             fOutZI[k] = fInZR[k]*iw + fInZI[k]*rw;
 786             if(i+1 < fNofMaps) fInZR[k] = fHitMap2->GetSignal(i+1,k);
 787         }
 788
 789         if (first) {
 790           fInZR[k] = fHitMap2->GetSignal(i,k);
 791         }
 792         fInZI[k] = 0.;
 793         // add baseline and noise
 794         contrib = baseline + noise*random->Gaus();
 795         fInZR[k] += contrib;
 796
 797     } // loop over time
 798
 799     if (first) {
 800       FastFourierTransform(fElectronics,&fInZR[0],&fInZI[0],1);
 801       for (k=0; k<fScaleSize*fMaxNofSamples; k++) {
 802         Double_t rw = fElectronics->GetTraFunReal(k);
 803         Double_t iw = fElectronics->GetTraFunImag(k);
 804         fOutZR[k] = fInZR[k]*rw - fInZI[k]*iw;
 805         fOutZI[k] = fInZR[k]*iw + fInZI[k]*rw;
 806         fInZR[k] = fHitMap2->GetSignal(i+1,k);
 807         fInZI[k] = 0.;
 808         // add baseline and noise
 809         contrib = baseline + noise*random->Gaus();
 810         fInZR[k] += contrib;
 811       }
 812     }
 813     if(i<fNofMaps) FastFourierTransform(fElectronics,&fOutZR[0],&fOutZI[0],-1);
 814     first = kFALSE;
 815   } // loop over anodes
 816
 817 }
 818
 819 //____________________________________________
 820 void AliITSsimulationSDD::GetAnodeBaseline(Int_t i,Float_t &baseline,
 821                                            Float_t &noise){
 822   // Returns the Baseline for a particular anode.
 823     baseline=fBaseline[i];
 824     noise=fNoise[i];
 825
 826 }
 827
 828 //____________________________________________
 829 void AliITSsimulationSDD::CompressionParam(Int_t i,Int_t &db,Int_t &tl,
 830                                            Int_t &th){
 831   // Returns the compression alogirthm parameters
 832    Int_t size = fD.GetSize();
 833    if (size > 2 ) {
 834       db=fD[i]; tl=fT1[i]; th=fT2[i];
 835    } else {
 836       if (size <= 2 && i>=fNofMaps/2) {
 837         db=fD[1]; tl=fT1[1]; th=fT2[1];
 838       } else {
 839         db=fD[0]; tl=fT1[0]; th=fT2[0];
 840       }
 841    }
 842 }
 843 //____________________________________________
 844 void AliITSsimulationSDD::CompressionParam(Int_t i,Int_t &db,Int_t &tl){
 845   // returns the compression alogirthm parameters
 846    Int_t size = fD.GetSize();
 847    if (size > 2 ) {
 848       db=fD[i]; tl=fT1[i];
 849    } else {
 850       if (size <= 2 && i>=fNofMaps/2) {
 851         db=fD[1]; tl=fT1[1];
 852       } else {
 853         db=fD[0]; tl=fT1[0];
 854       }
 855    }
 856
 857 }
 858 //____________________________________________
 859 void AliITSsimulationSDD::SetCompressParam(){
 860   // Sets the compression alogirthm parameters
 861    Int_t cp[8],i;
 862
 863    fResponse->GiveCompressParam(cp);
 864    for (i=0; i<2; i++) {
 865        fD[i]  =cp[i];
 866        fT1[i] =cp[i+2];
 867        fT2[i] =cp[i+4];
 868        fTol[i]=cp[i+6];
 869        printf("\n i, fD, fT1, fT2, fTol %d %d %d %d %d\n",
 870                                       i,fD[i],fT1[i],fT2[i],fTol[i]);
 871    }
 872 }
 873
 874 //____________________________________________
 875 void AliITSsimulationSDD::ReadBaseline(){
 876       // read baseline and noise from file - either a .root file and in this
 877       // case data should be organised in a tree with one entry for each
 878       // module => reading should be done accordingly
 879       // or a classic file and do smth. like this:
 880   //
 881   // Read baselines and noise for SDD
 882   //
 883
 884
 885     Int_t na,pos;
 886     Float_t bl,n;
 887     char input[100], base[100], param[100];
 888     char *filtmp;
 889
 890     fResponse->Filenames(input,base,param);
 891     fFileName=base;
 892 //
 893     filtmp = gSystem->ExpandPathName(fFileName.Data());
 894     FILE *bline = fopen(filtmp,"r");
 895     printf("filtmp %s\n",filtmp);
 896     na = 0;
 897
 898     if(bline) {
 899        while(fscanf(bline,"%d %f %f",&pos, &bl, &n) != EOF) {
 900           if (pos != na+1) {
 901              Error("ReadBaseline","Anode number not in increasing order!",
 902                    filtmp);
 903              exit(1);
 904           }
 905           fBaseline[na]=bl;
 906           fNoise[na]=n;
 907           na++;
 908        }
 909     } else {
 910       Error("ReadBaseline"," THE BASELINE FILE %s DOES NOT EXIST !",
 911           filtmp);
 912       exit(1);
 913     } // end if(bline)
 914
 915     fclose(bline);
 916     delete [] filtmp;
 917 }
 918
 919 //____________________________________________
 920 Int_t AliITSsimulationSDD::Convert10to8(Int_t signal) {
 921   // To the 10 to 8 bit lossive compression.
 922   // code from Davide C. and Albert W.
 923
 924    if (signal < 128)  return signal;
 925    if (signal < 256)  return (128+((signal-128)>>1));
 926    if (signal < 512)  return (192+((signal-256)>>3));
 927    if (signal < 1024) return (224+((signal-512)>>4));
 928    return 0;
 929
 930 }
 931
 932 //____________________________________________
 933 Int_t AliITSsimulationSDD::Convert8to10(Int_t signal) {
 934   // Undo the lossive 10 to 8 bit compression.
 935   // code from Davide C. and Albert W.
 936    if (signal < 0 || signal > 255) {
 937        printf("<Convert8to10> out of range %d \n",signal);
 938        return 0;
 939    }
 940
 941    if (signal < 128) return signal;
 942    if (signal < 192) {
 943      if (TMath::Odd(signal)) return (128+((signal-128)<<1));
 944      else  return (128+((signal-128)<<1)+1);
 945    }
 946    if (signal < 224) {
 947      if (TMath::Odd(signal)) return (256+((signal-192)<<3)+3);
 948      else  return (256+((signal-192)<<3)+4);
 949    }
 950    if (TMath::Odd(signal)) return (512+((signal-224)<<4)+7);
 951    else  return (512+((signal-224)<<4)+7);
 952    return 0;
 953
 954 }
 955
 956 //____________________________________________
 957 AliITSMap*   AliITSsimulationSDD::HitMap(Int_t i){
 958   //Return the correct map.
 959     return ((i==0)? fHitMap1 : fHitMap2);
 960 }
 961
 962
 963 //____________________________________________
 964 void AliITSsimulationSDD::ZeroSuppression(const char *option) {
 965   // perform the zero suppresion
 966   if (strstr(option,"2D")) {
 967     //Init2D();              // activate if param change module by module
 968     Compress2D();
 969   } else if (strstr(option,"1D")) {
 970     //Init1D();              // activate if param change module by module
 971     Compress1D();
 972   } else StoreAllDigits();
 973
 974 }
 975
 976 //____________________________________________
 977 void AliITSsimulationSDD::Init2D(){
 978      // read in and prepare arrays: fD, fT1, fT2
 979      //                         savemu[nanodes], savesigma[nanodes]
 980       // read baseline and noise from file - either a .root file and in this
 981       // case data should be organised in a tree with one entry for each
 982       // module => reading should be done accordingly
 983       // or a classic file and do smth. like this ( code from Davide C. and
 984       // Albert W.) :
 985   //
 986   // Read 2D zero-suppression parameters for SDD
 987   //
 988
 989     if (!strstr(fParam,"file")) return;
 990
 991     Int_t na,pos,tempTh;
 992     Float_t mu,sigma;
 993     Float_t *savemu = new Float_t [fNofMaps];
 994     Float_t *savesigma = new Float_t [fNofMaps];
 995     char input[100],basel[100],par[100];
 996     char *filtmp;
 997
 998
 999     Int_t minval = fResponse->MinVal();
1000
1001     fResponse->Filenames(input,basel,par);
1002     fFileName=par;
1003
1004 //
1005     filtmp = gSystem->ExpandPathName(fFileName.Data());
1006     FILE *param = fopen(filtmp,"r");
1007     na = 0;
1008
1009     if(param) {
1010        while(fscanf(param,"%d %f %f",&pos, &mu, &sigma) != EOF) {
1011           if (pos != na+1) {
1012              Error("Init2D ","Anode number not in increasing order!",
1013                    filtmp);
1014              exit(1);
1015           }
1016           savemu[na]=mu;
1017           savesigma[na]=sigma;
1018           if ((2.*sigma) < mu) {
1019               fD[na] = (Int_t)floor(mu - 2.0*sigma + 0.5);
1020               mu = 2.0 * sigma;
1021           } else fD[na] = 0;
1022           tempTh = (Int_t)floor(mu+2.25*sigma+0.5) - minval;
1023           if (tempTh < 0) tempTh=0;
1024           fT1[na] = tempTh;
1025           tempTh = (Int_t)floor(mu+3.0*sigma+0.5) - minval;
1026           if (tempTh < 0) tempTh=0;
1027           fT2[na] = tempTh;
1028           na++;
1029        } // end while
1030
1031     } else {
1032       Error("Init2D "," THE FILE %s DOES NOT EXIST !",
1033           filtmp);
1034       exit(1);
1035     } // end if(param)
1036
1037     fclose(param);
1038     delete [] filtmp;
1039     delete [] savemu;
1040     delete [] savesigma;
1041 }
1042
1043 //____________________________________________
1044 void AliITSsimulationSDD::Compress2D(){
1045   //
1046   // simple ITS cluster finder -- online zero-suppression conditions
1047   //
1048   //
1049
1050     Int_t db,tl,th;
1051     Int_t minval = fResponse->MinVal();
1052     Bool_t write=fResponse->OutputOption();
1053
1054     Int_t nz, nl, nh, low, i, j;
1055
1056     for (i=0; i<fNofMaps; i++) {
1057         CompressionParam(i,db,tl,th);
1058         nz=0;
1059         nl=0;
1060         nh=0;
1061         low=0;
1062         for (j=0; j<fMaxNofSamples; j++) {
1063             Int_t signal=(Int_t)(fHitMap2->GetSignal(i,j));
1064             signal -= db; // if baseline eq. is done here
1065             if (signal <= 0) {nz++; continue;}
1066             if ((signal - tl) < minval) low++;
1067             if ((signal - th) >= minval) {
1068                 nh++;
1069                 Bool_t cond=kTRUE;
1070                 FindCluster(i,j,signal,minval,cond);
1071             } else if ((signal - tl) >= minval) nl++;
1072        } // loop time samples
1073        if (write) TreeB()->Fill(nz,nl,nh,low,i+1);
1074     } // loop anodes
1075
1076       char hname[30];
1077       if (write) {
1078         sprintf(hname,"TNtuple%d_%d",fModule,fEvent);
1079         TreeB()->Write(hname);
1080         // reset tree
1081         TreeB()->Reset();
1082       }
1083
1084 }
1085
1086 //_____________________________________________________________________________
1087 void  AliITSsimulationSDD::FindCluster(Int_t i,Int_t j,Int_t signal,
1088                                        Int_t minval,Bool_t cond){
1089 //
1090 //  Find clusters according to the online 2D zero-suppression algorithm
1091 //
1092
1093     Bool_t high=kFALSE;
1094
1095     fHitMap2->FlagHit(i,j);
1096 //
1097 //  check the online zero-suppression conditions
1098 //
1099     const Int_t maxNeighbours = 4;
1100
1101     Int_t nn;
1102     Int_t dbx,tlx,thx;
1103     Int_t xList[maxNeighbours], yList[maxNeighbours];
1104     fSegmentation->Neighbours(i,j,&nn,xList,yList);
1105     Int_t in,ix,iy;
1106     for (in=0; in<nn; in++) {
1107         ix=xList[in];
1108         iy=yList[in];
1109         if (fHitMap2->TestHit(ix,iy)==kUnused) {
1110            CompressionParam(ix,dbx,tlx,thx);
1111            Int_t qn = (Int_t)(fHitMap2->GetSignal(ix,iy));
1112            qn -= dbx; // if baseline eq. is done here
1113            if ((qn-tlx) < minval) {
1114               fHitMap2->FlagHit(ix,iy);
1115               continue;
1116            } else {
1117               if ((qn - thx) >= minval) high=kTRUE;
1118               if (cond) {
1119                  signal = Convert10to8(signal);
1120                  AddDigit(i,j,signal);
1121               }
1122               Int_t qns = Convert10to8(qn);
1123               if (!high) AddDigit(ix,iy,qns);
1124               cond=kFALSE;
1125               if(!high) fHitMap2->FlagHit(ix,iy);
1126            }
1127         } // TestHit
1128     } // loop over neighbours
1129
1130 }
1131
1132 //____________________________________________
1133 void AliITSsimulationSDD::Init1D(){
1134   // this is just a copy-paste of input taken from 2D algo
1135   // Torino people should give input
1136   //
1137   // Read 1D zero-suppression parameters for SDD
1138   //
1139
1140     if (!strstr(fParam,"file")) return;
1141
1142     Int_t na,pos,tempTh;
1143     Float_t mu,sigma;
1144     Float_t *savemu = new Float_t [fNofMaps];
1145     Float_t *savesigma = new Float_t [fNofMaps];
1146     char input[100],basel[100],par[100];
1147     char *filtmp;
1148
1149
1150     Int_t minval = fResponse->MinVal();
1151     fResponse->Filenames(input,basel,par);
1152     fFileName=par;
1153
1154 //  set first the disable and tol param
1155     SetCompressParam();
1156 //
1157     filtmp = gSystem->ExpandPathName(fFileName.Data());
1158     FILE *param = fopen(filtmp,"r");
1159     na = 0;
1160
1161     if (param) {
1162           fscanf(param,"%d %d %d %d ", &fT2[0], &fT2[1], &fTol[0], &fTol[1]);
1163           while(fscanf(param,"%d %f %f",&pos, &mu, &sigma) != EOF) {
1164                if (pos != na+1) {
1165                   Error("Init1D ","Anode number not in increasing order!",
1166                    filtmp);
1167                   exit(1);
1168                }
1169                savemu[na]=mu;
1170                savesigma[na]=sigma;
1171                if ((2.*sigma) < mu) {
1172                  fD[na] = (Int_t)floor(mu - 2.0*sigma + 0.5);
1173                  mu = 2.0 * sigma;
1174                } else fD[na] = 0;
1175                tempTh = (Int_t)floor(mu+2.25*sigma+0.5) - minval;
1176                if (tempTh < 0) tempTh=0;
1177                fT1[na] = tempTh;
1178                na++;
1179           } // end while
1180     } else {
1181       Error("Init1D "," THE FILE %s DOES NOT EXIST !",
1182           filtmp);
1183       exit(1);
1184     } // end if(param)
1185
1186     fclose(param);
1187     delete [] filtmp;
1188     delete [] savemu;
1189     delete [] savesigma;
1190
1191
1192
1193 }
1194
1195 //____________________________________________
1196 void AliITSsimulationSDD::Compress1D(){
1197     // 1D zero-suppression algorithm (from Gianluca A.)
1198
1199     Int_t dis,tol,thres,decr,diff;
1200
1201     UChar_t *str=fStream->Stream();
1202     Int_t counter=0;
1203
1204     Int_t last=0;
1205     Int_t k,i,j;
1206     for (k=1; k<=2; k++) {
1207          tol = Tolerance(k-1);
1208          dis = Disable(k-1);
1209          for (i=0; i<fNofMaps/2; i++) {
1210              Bool_t firstSignal=kTRUE;
1211              CompressionParam(k*i,decr,thres);
1212              for (j=0; j<fMaxNofSamples; j++) {
1213                  Int_t signal=(Int_t)(fHitMap2->GetSignal(k*i,j));
1214                  signal -= decr;  // if baseline eq.
1215                  signal = Convert10to8(signal);
1216                  if (signal < thres) {
1217                      signal=0;
1218                      diff=128;
1219                      last=0;
1220                      // write diff in the buffer for HuffT
1221                      str[counter]=(UChar_t)diff;
1222                      counter++;
1223                      continue;
1224                  }
1225                  diff=signal-last;
1226                  if (diff > 127) diff=127;
1227                  if (diff < -128) diff=-128;
1228
1229                  if (signal < dis) {
1230                     if (tol==1 && (diff >= -2 && diff <= 1)) diff=0;
1231                     if (tol==2 && (diff >= -4 && diff <= 3)) diff=0;
1232                     if (tol==3 && (diff >= -16 && diff <= 15)) diff=0;
1233                     AddDigit(k*i,j,last+diff);
1234                  } else {
1235                    AddDigit(k*i,j,signal);
1236                  }
1237
1238                  diff += 128;
1239                  // write diff in the buffer used to compute Huffman tables
1240                  if (firstSignal) str[counter]=(UChar_t)signal;
1241                  else str[counter]=(UChar_t)diff;
1242                  counter++;
1243
1244                  last=signal;
1245                  firstSignal=kFALSE;
1246              } // loop time samples
1247          } // loop anodes  one half of detector
1248     }
1249
1250     // check
1251     fStream->CheckCount(counter);
1252
1253     // open file and write out the stream of diff's
1254
1255     static Bool_t open=kTRUE;
1256     static TFile *outFile;
1257     Bool_t write = fResponse->OutputOption();
1258
1259     if (write ) {
1260         if(open) {
1261             SetFileName("stream.root");
1262             cout<<"filename "<<fFileName<<endl;
1263             outFile=new TFile(fFileName,"recreate");
1264             cout<<"I have opened "<<fFileName<<" file "<<endl;
1265         }
1266         open=kFALSE;
1267         outFile->cd();
1268         fStream->Write();
1269     }  // endif write
1270
1271      fStream->ClearStream();
1272
1273      // back to galice.root file
1274
1275      TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1276      TFile *file = 0;
1277
1278      if (fAli) file =fAli->GetCurrentFile();
1279      file->cd();
1280
1281
1282 }
1283 //____________________________________________
1284 void AliITSsimulationSDD::StoreAllDigits(){
1285   // if non-zero-suppressed data
1286
1287     Int_t i, j, digits[3];
1288
1289     for (i=0; i<fNofMaps; i++) {
1290         for (j=0; j<fMaxNofSamples; j++) {
1291              Int_t signal=(Int_t)(fHitMap2->GetSignal(i,j));
1292              signal = Convert10to8(signal);
1293              signal = Convert8to10(signal); // ?
1294              digits[0]=i;
1295              digits[1]=j;
1296              digits[2]=signal;
1297              fITS->AddRealDigit(1,digits);
1298         }
1299     }
1300 }
1301 //____________________________________________
1302
1303 void AliITSsimulationSDD::CreateHistograms(){
1304   // Creates histograms of maps for debugging
1305
1306       Int_t i;
1307       for (i=0;i<fNofMaps;i++) {
1308            TString *sddName = new TString("sdd_");
1309            Char_t candNum[4];
1310            sprintf(candNum,"%d",i+1);
1311            sddName->Append(candNum);
1312            (*fHis)[i] = new TH1F(sddName->Data(),"SDD maps",
1313                               fMaxNofSamples,0.,(Float_t) fMaxNofSamples);
1314            delete sddName;
1315       }
1316
1317 }
1318 //____________________________________________
1319
1320 void AliITSsimulationSDD::ResetHistograms(){
1321     //
1322     // Reset histograms for this detector
1323     //
1324     Int_t i;
1325     for (i=0;i<fNofMaps;i++ ) {
1326         if ((*fHis)[i])    ((TH1F*)(*fHis)[i])->Reset();
1327     }
1328
1329 }
1330
1331
1332 //____________________________________________
1333
1334 TH1F *AliITSsimulationSDD::GetAnode(Int_t wing, Int_t anode) {
1335   // Fills a histogram from a give anode.
1336   if (!fHis) return 0;
1337
1338   if(wing <=0 || wing > 2) {
1339     cout << "Wrong wing number: " << wing << endl;
1340     return NULL;
1341   }
1342   if(anode <=0 || anode > fNofMaps/2) {
1343     cout << "Wrong anode number: " << anode << endl;
1344     return NULL;
1345   }
1346
1347   Int_t index = (wing-1)*fNofMaps/2 + anode-1;
1348   return (TH1F*)((*fHis)[index]);
1349 }
1350
1351 //____________________________________________
1352
1353 void AliITSsimulationSDD::WriteToFile(TFile *hfile) {
1354   // Writes the histograms to a file
1355   if (!fHis) return;
1356
1357   hfile->cd();
1358   Int_t i;
1359   for(i=0; i<fNofMaps; i++)  (*fHis)[i]->Write(); //fAdcs[i]->Write();
1360   return;
1361 }
1362 //____________________________________________
1363 Float_t AliITSsimulationSDD::GetNoise(Float_t threshold) {
1364   // Returns the noise value
1365   if (!fHis) return 0.;
1366
1367   TH1F *noisehist = new TH1F("noisehist","noise",100,0.,threshold);
1368   Int_t i,k;
1369   for (i=0;i<fNofMaps;i++) {
1370     Int_t nOfBinsA = ((TH1F*)(*fHis)[i])->GetNbinsX();
1371     for (k=0;k<nOfBinsA;k++) {
1372       Float_t content = ((TH1F*)(*fHis)[i])->GetBinContent(k+1);
1373       if (content < threshold) noisehist->Fill(content);
1374     }
1375   }
1376   TF1 *gnoise = new TF1("gnoise","gaus",0.,threshold);
1377   noisehist->Fit("gnoise","RQ");
1378   noisehist->Draw();
1379   Float_t mnoise = gnoise->GetParameter(1);
1380   cout << "mnoise : " << mnoise << endl;
1381   Float_t rnoise = gnoise->GetParameter(2);
1382   cout << "rnoise : " << rnoise << endl;
1383   delete noisehist;
1384   return rnoise;
1385 }