MUON/AliMUONGain.cxx

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  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 #include "AliMUONGain.h"
  19 #include "AliMUONPedestal.h"
  20 #include "AliMUONErrorCounter.h"
  21 #include "AliMUON2DMap.h"
  22 #include "AliMUONVCalibParam.h"
  23 #include "AliMUONVStore.h"
  24 #include "AliMpIntPair.h"
  25
  26 #include <TString.h>
  27 #include <THashList.h>
  28 #include <TTimeStamp.h>
  29 #include <TTree.h>
  30 #include <TFile.h>
  31 #include <TF1.h>
  32 #include <TGraphErrors.h>
  33 #include <TMath.h>
  34 #include <Riostream.h>
  35
  36 #include <sstream>
  37 //
  38 //AMORE
  39 //
  40 #ifdef ALI_AMORE
  41 #include <AmoreDA.h>
  42 #include "TSystem.h"
  43 #endif
  44
  45 #define  NFITPARAMS 4
  46
  47 //-----------------------------------------------------------------------------
  48 /// \class AliMUONGain
  49 ///
  50 /// Implementation of calibration computing
  51 ///
  52 /// add
  53 ///
  54 ///
  55 /// \author Alberto Baldisseri, JL Charvet
  56 //-----------------------------------------------------------------------------
  57
  58
  59
  60
  61 // functions
  62
  63
  64 //______________________________________________________________________________
  65 Double_t funcLin (const Double_t *x, const Double_t *par)
  66 {
  67   /// Linear function
  68   return par[0] + par[1]*x[0];
  69 }
  70
  71 //______________________________________________________________________________
  72 Double_t funcParabolic (const Double_t *x, const Double_t *par)
  73 {
  74   /// Parabolic function
  75   return par[0]*x[0]*x[0];
  76 }
  77
  78 //______________________________________________________________________________
  79 Double_t funcCalib (const Double_t *x, const Double_t *par)
  80 {
  81   /// Calibration function
  82   Double_t xLim= par[3];
  83
  84   if(x[0] <= xLim) return par[0] + par[1]*x[0];
  85
  86   Double_t yLim = par[0]+ par[1]*xLim;
  87   return yLim + par[1]*(x[0] - xLim) + par[2]*(x[0] - xLim)*(x[0] - xLim);
  88 }
  89
  90
  91 /// \cond CLASSIMP
  92 ClassImp(AliMUONGain)
  93 /// \endcond
  94
  95 //______________________________________________________________________________
  96 AliMUONGain::AliMUONGain()
  97 : AliMUONPedestal(),
  98 fInjCharge(0),
  99 fnInit(1),
 100 fnEntries(11),
 101 fnbpf1(6),
 102 fPrintLevel(0),
 103 fPlotLevel(0)
 104 {
 105 /// Default constructor
 106
 107   sprintf(fRootDataFileName," "); //Gain
 108 }
 109 //  AliMUONPedestal& operator=(const AliMUONPedestal& other); Copy ctor
 110
 111 //______________________________________________________________________________
 112 AliMUONGain::~AliMUONGain()
 113 {
 114 /// Destructor
 115 }
 116
 117 //______________________________________________________________________________
 118 TString AliMUONGain::WriteDummyHeader(void)
 119 {
 120 ///
 121
 122   ostringstream stream;
 123   stream<<"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)"<< endl;
 124   stream<<"//================================================" << endl;
 125   stream<<"//       MUONTRKda: Calibration run  " << endl;
 126   stream<<"//================================================" << endl;
 127   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 128   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 129   stream<<"//   * DAC           : " << fInjCharge << endl;
 130   stream<<"//-------------------------------------------------" << endl;
 131
 132   return TString(stream.str().c_str());
 133 }
 134
 135 //______________________________________________________________________________
 136 void AliMUONGain::MakePedStoreForGain(TString shuttleFile)
 137 {
 138 ///
 139
 140   ofstream fileout;
 141   TString tempstring;
 142   Char_t flatFile[256]="";
 143   TString outputFile;
 144
 145   // Store pedestal map in root file
 146   TTree* tree = 0x0;
 147
 148   // write dummy ascii file -> Shuttle
 149   if(fIndex<fnEntries)
 150     {
 151       //     fileout.open(shuttleFile.Data());
 152       //     tempstring = WriteDummyHeader();
 153       //     fileout << tempstring;
 154       FILE *pfilew=0;
 155       pfilew = fopen (shuttleFile,"w");
 156
 157       fprintf(pfilew,"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)\n");
 158       fprintf(pfilew,"//================================================\n");
 159       fprintf(pfilew,"//       MUONTRKda: Calibration run  \n");
 160       fprintf(pfilew,"//=================================================\n");
 161       fprintf(pfilew,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 162       fprintf(pfilew,"//   * Date          : %s \n",fDate->AsString("l"));
 163       fprintf(pfilew,"//   * DAC           : %d \n",fInjCharge);
 164       fprintf(pfilew,"//-------------------------------------------------\n");
 165       fclose(pfilew);
 166     }
 167
 168
 169
 170   if(fPrintLevel>0)
 171     {
 172       // compute and store mean DAC values (like pedestals)
 173       sprintf(flatFile,"%s.ped",fprefixDA);
 174       outputFile=flatFile;
 175       cout << "\n" << fprefixDA << " : Flat file  generated  : " << flatFile << "\n";
 176       MakePedStore(outputFile);
 177     }
 178   else
 179     MakePedStore("");
 180
 181   TString mode("UPDATE");
 182
 183   if (fIndex==1) {
 184     mode = "RECREATE";
 185   }
 186   TFile* histoFile = new TFile(fRootDataFileName, mode.Data(), "MUON Tracking Gains");
 187
 188   // second argument should be the injected charge, taken from config crocus file
 189   // put also info about run number could be usefull
 190   AliMpIntPair* pair   = new AliMpIntPair(fRunNumber,fInjCharge );
 191
 192   if (mode.CompareTo("UPDATE") == 0) {
 193     tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 194     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 195     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 196
 197   } else {
 198     tree = new TTree("t","Pedestal tree");
 199     tree->Branch("run", "AliMpIntPair",&pair);
 200     tree->Branch("ped", "AliMUON2DMap",&fPedestalStore);
 201     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 202     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 203
 204   }
 205
 206   tree->Fill();
 207   tree->Write("t", TObject::kOverwrite); // overwrite the tree
 208   histoFile->Close();
 209
 210   delete pair;
 211 }
 212
 213 //______________________________________________________________________________
 214 TString AliMUONGain::WriteGainHeader(Int_t nInit, Int_t nEntries, Int_t nbpf2, Int_t *numrun, Double_t *injCharge)
 215 {
 216 ///
 217
 218   ostringstream stream;
 219
 220
 221   stream<<"//================================================" << endl;
 222   stream<<"//  Calibration file calculated by MUONTRKda" << endl;
 223   stream<<"//=================================================" << endl;
 224   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 225   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 226   stream<<"//   * Statictics    : " << fNEvents << endl;
 227   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNManu << endl;
 228   stream<<"//   * # of channels : " << fNChannel << endl;
 229   stream<<"//-------------------------------------------------" << endl;
 230
 231   if(nInit==0)
 232     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order)" << endl;
 233   if(nInit==1)
 234     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order) DAC=0 excluded" << endl;
 235
 236   stream<<"//   RUN     DAC   " << endl;
 237   stream<<"//-----------------" << endl;
 238   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 239         stream<<Form("//   %d    %5.0f \n",numrun[i],injCharge[i]);
 240   }
 241   stream<<"//=======================================" << endl;
 242   stream<<"// BP MANU CH.   a1      a2     thres. q " << endl;
 243   stream<<"//=======================================" << endl;
 244
 245   return TString(stream.str().c_str());
 246 }
 247
 248 //______________________________________________________________________________
 249 TString AliMUONGain::WriteGainData(Int_t BP, Int_t Manu, Int_t ch, Double_t p1, Double_t p2, Int_t threshold, Int_t q)
 250 {
 251 ///
 252
 253   ostringstream stream("");
 254   stream << Form("%4i %5i %2i %7.4f %10.3e %4i %2x\n",BP,Manu,ch,p1,p2,threshold,q);
 255   return TString(stream.str().c_str());
 256
 257 }
 258
 259 //_______________________________________________________________________________
 260 void AliMUONGain::MakeGainStore(TString shuttleFile)
 261 {
 262   /// Store gains in ASCII files
 263   ofstream fileout;
 264   ofstream filcouc;
 265   TString tempstring;
 266   Char_t filename[256];
 267
 268   Double_t goodA1Min =  0.5;
 269   Double_t goodA1Max =  2.;
 270   //     Double_t goodA1Min =  0.7;
 271   //     Double_t goodA1Max =  1.7;
 272   Double_t goodA2Min = -0.5E-03;
 273   Double_t goodA2Max =  1.E-03;
 274   // Table for uncalibrated  buspatches and manus
 275   THashList* uncalBuspatchManuTable = new THashList(1000,2);
 276
 277   Int_t numrun[11];
 278
 279   // open file MUONTRKda_gain_data.root
 280   // read again the pedestal for the calibration runs (11 runs)
 281   // need the injection charge from config file (to be done)
 282   // For each channel make a TGraphErrors (mean, sigma) vs injected charge
 283   // Fit with a polynomial fct
 284   // store the result in a flat file.
 285
 286   TFile*  histoFile = new TFile(fRootDataFileName);
 287
 288   AliMUON2DMap* map[11];
 289   AliMUONVCalibParam* ped[11];
 290   AliMpIntPair* run[11];
 291
 292   //read back from root file
 293   TTree* tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 294   Int_t nEntries = tree->GetEntries();
 295
 296   Int_t nbpf2 = nEntries - (fnInit + fnbpf1) + 1; // nb pts used for 2nd order fit
 297
 298   // read back info
 299   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 300     map[i] = 0x0;
 301     run[i] = 0x0;
 302     tree->SetBranchAddress("ped",&map[i]);
 303     tree->SetBranchAddress("run",&run[i]);
 304     tree->GetEvent(i);
 305     //        std::cout << map[i] << " " << run[i] << std::endl;
 306   }
 307   // RunNumber extracted from Root data fil
 308   if(fIndex==0)fRunNumber=(UInt_t)run[nEntries-1]->GetFirst();
 309   //     sscanf(getenv("DATE_RUN_NUMBER"),"%d",&gAliRunNumber);
 310
 311   Double_t pedMean[11];
 312   Double_t pedSigma[11];
 313   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {pedMean[i]=0.;pedSigma[i]=1.;};
 314   Double_t injCharge[11];
 315   Double_t injChargeErr[11];
 316   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {injCharge[i]=0.;injChargeErr[i]=1.;};
 317
 318   // some print
 319   cout<<"\n ********  MUONTRKda for Gain computing (Last Run = " << fRunNumber << ") ********\n" << endl;
 320   cout<<" * Date          : " << fDate->AsString("l") << "\n" << endl;
 321   cout << " Entries = " << nEntries << " DAC values \n" << endl;
 322   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 323     cout<< " Run = " << run[i]->GetFirst() << "    DAC = " << run[i]->GetSecond() << endl;
 324     numrun[i] = run[i]->GetFirst();
 325     injCharge[i] = run[i]->GetSecond();
 326     injChargeErr[i] = 0.01*injCharge[i];
 327     if(injChargeErr[i] <= 1.) injChargeErr[i]=1.;
 328   }
 329   cout << "" << endl;
 330
 331   //  print out in .log file
 332
 333   (*fFilcout)<<"\n\n//=================================================" << endl;
 334   (*fFilcout)<<"//    MUONTRKda: Gain Computing  Run = " << fRunNumber << endl;
 335   (*fFilcout)<<"//    RootDataFile  = "<< fRootDataFileName << endl;
 336   (*fFilcout)<<"//=================================================" << endl;
 337   (*fFilcout)<<"//* Date          : " << fDate->AsString("l") << "\n" << endl;
 338
 339
 340
 341   // why 2 files ? (Ch. F.)  => second file contains detailed results
 342     FILE *pfilen = 0;
 343     if(fPrintLevel>1)
 344       {
 345         sprintf(filename,"%s.param",fprefixDA);
 346         cout << " Second fit parameter file        = " << filename << "\n";
 347         pfilen = fopen (filename,"w");
 348
 349         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 350         fprintf(pfilen,"//  BP MANU CH. par[0]     [1]     [2]     [3]      xlim          P(chi2) p1        P(chi2)2  p2\n");
 351         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 352         fprintf(pfilen,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 353         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 354       }
 355
 356
 357
 358
 359   //  Write Ascii file -> Shuttle
 360
 361   ofstream pfilew;
 362   pfilew.open(shuttleFile.Data());
 363   pfilew << WriteGainHeader(fnInit,nEntries,nbpf2,numrun,injCharge);
 364 #ifdef ALI_AMORE
 365   ostringstream stringout; // String to be sent to AMORE_DB
 366   stringout << WriteGainHeader(fnInit,nEntries,nbpf2,numrun,injCharge);
 367 #endif
 368
 369   // print mean and sigma values in file
 370   FILE *pfilep = 0;
 371   if(fPrintLevel>1)
 372     {
 373       sprintf(filename,"%s.peak",fprefixDA);
 374       cout << " File containing Peak mean values = " << filename << "\n";
 375       pfilep = fopen (filename,"w");
 376
 377       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 378       fprintf(pfilep,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 379       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 380       fprintf(pfilep,"// BP  MANU  CH.    Ped.     <0>      <1>      <2>      <3>      <4>      <5>      <6>      <7>      <8>      <9>     <10> \n");
 381       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 382       fprintf(pfilep,"//                 DAC= %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f  fC\n",injCharge[0],injCharge[1],injCharge[2],injCharge[3],injCharge[4],injCharge[5],injCharge[6],injCharge[7],injCharge[8],injCharge[9],injCharge[10]);
 383       fprintf(pfilep,"//                      %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f\n",injChargeErr[0],injChargeErr[1],injChargeErr[2],injChargeErr[3],injChargeErr[4],injChargeErr[5],injChargeErr[6],injChargeErr[7],injChargeErr[8],injChargeErr[9],injChargeErr[10]);
 384       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 385     }
 386
 387   Double_t chi2    = 0.;
 388   Double_t chi2P2  = 0.;
 389   Double_t prChi2  = 0;
 390   Double_t prChi2P2 =0;
 391   Double_t a0=0.,a1=1.,a2=0.;
 392   Int_t busPatchId ;
 393   Int_t manuId     ;
 394   Int_t channelId ;
 395   Int_t threshold = 0;
 396   Int_t q = 0;
 397   Int_t p1 =0;
 398   Int_t p2 =0;
 399   Double_t gain=0;
 400   Double_t capa=0.2; // internal capacitor (pF)
 401
 402   //  plot out
 403
 404   TFile* gainFile = 0x0;
 405   TTree* tg = 0x0;
 406   if(fPlotLevel>0)
 407     {
 408       sprintf(fHistoFileName,"%s.root",fprefixDA);
 409      gainFile = new TFile(fHistoFileName,"RECREATE","MUON Tracking gains");
 410       tg = new TTree("tg","TTree avec class Manu_DiMu");
 411
 412       tg->Branch("bp",&busPatchId, "busPatchId/I");
 413       tg->Branch("manu",&manuId, "manuId/I");
 414       tg->Branch("channel",&channelId, "channelId/I");
 415
 416       tg->Branch("a0",&a0, "a0/D");
 417       tg->Branch("a1",&a1, "a1/D");
 418       tg->Branch("a2",&a2, "a2/D");
 419       tg->Branch("Pchi2",&prChi2, "prChi2/D");
 420       tg->Branch("Pchi2_2",&prChi2P2, "prChi2P2/D");
 421       tg->Branch("Threshold",&threshold, "threshold/I");
 422       tg->Branch("q",&q, "q/I");
 423       tg->Branch("p1",&p1, "p1/I");
 424       tg->Branch("p2",&p2, "p2/I");
 425       tg->Branch("gain",&gain, "gain/D");
 426     }
 427
 428   char graphName[256];
 429
 430   // iterates over the first pedestal run
 431   TIter next(map[0]->CreateIterator());
 432   AliMUONVCalibParam* p;
 433
 434   Int_t    nmanu         = 0;
 435   Int_t    nGoodChannel   = 0;
 436   Int_t    nBadChannel   = 0;
 437   Int_t    noFitChannel   = 0;
 438   Int_t    nplot=0;
 439   Double_t sumProbChi2   = 0.;
 440   Double_t sumA1         = 0.;
 441   Double_t sumProbChi2P2 = 0.;
 442   Double_t sumA2         = 0.;
 443
 444   Double_t x[11], xErr[11], y[11], yErr[11];
 445   Double_t xp[11], xpErr[11], yp[11], ypErr[11];
 446
 447   Int_t uncalcountertotal=0 ;
 448
 449   while ( ( p = dynamic_cast<AliMUONVCalibParam*>(next() ) ) )
 450     {
 451       ped[0]  = p;
 452
 453       busPatchId = p->ID0();
 454       manuId     = p->ID1();
 455
 456       // read back pedestal from the other runs for the given (bupatch, manu)
 457       for (Int_t i = 1; i < nEntries; ++i) {
 458         ped[i] = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(map[i]->FindObject(busPatchId, manuId));
 459       }
 460
 461       // compute for each channel the gain parameters
 462       for ( channelId = 0; channelId < ped[0]->Size() ; ++channelId )
 463         {
 464
 465           Int_t n = 0;
 466           for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 467
 468             if (!ped[i]) continue; //shouldn't happen.
 469             pedMean[i]      = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 0);
 470             pedSigma[i]     = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 1);
 471
 472             if (pedMean[i] < 0) continue; // not connected
 473
 474             if (pedSigma[i] <= 0) pedSigma[i] = 1.; // should not happen.
 475             n++;
 476           }
 477
 478
 479           // print_peak_mean_values
 480           if(fPrintLevel>1)
 481             {
 482
 483               fprintf(pfilep,"%4i%5i%5i%10.3f",busPatchId,manuId,channelId,0.);
 484               fprintf(pfilep,"%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f \n",pedMean[0],pedMean[1],pedMean[2],pedMean[3],pedMean[4],pedMean[5],pedMean[6],pedMean[7],pedMean[8],pedMean[9],pedMean[10]);
 485               fprintf(pfilep,"                   sig= %9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f \n",pedSigma[0],pedSigma[1],pedSigma[2],pedSigma[3],pedSigma[4],pedSigma[5],pedSigma[6],pedSigma[7],pedSigma[8],pedSigma[9],pedSigma[10]);
 486             }
 487
 488           // makegain
 489
 490
 491           // Fit Method:  Linear fit over gAlinbpf1 points + parabolic fit  over nbpf2  points)
 492           // nInit=1 : 1st pt DAC=0 excluded
 493
 494           // 1. - linear fit over gAlinbpf1 points
 495
 496           Double_t par[4] = {0.,0.5,0.,kADCMax};
 497           Int_t nbs   = nEntries - fnInit;
 498           if(nbs < fnbpf1)fnbpf1=nbs;
 499
 500           Int_t fitproceed=1;
 501           for (Int_t j = 0; j < nbs; ++j)
 502             {
 503               Int_t k = j + fnInit;
 504               x[j]    = pedMean[k];
 505               if(x[j]==0. || x[j]== kADCMax)fitproceed=0;
 506               xErr[j] = pedSigma[k];
 507               y[j]    = injCharge[k];
 508               yErr[j] = injChargeErr[k];
 509
 510             }
 511
 512           TGraphErrors *graphErr;
 513           if(!fitproceed) { p1=0; p2=0; noFitChannel++;}
 514
 515           if(fitproceed)
 516             {
 517
 518               TF1 *f1 = new TF1("f1",funcLin,0.,kADCMax,2);
 519               graphErr = new TGraphErrors(fnbpf1, x, y, xErr, yErr);
 520
 521               f1->SetParameters(0,0);
 522
 523               graphErr->Fit("f1","RQ");
 524
 525               chi2 = f1->GetChisquare();
 526               f1->GetParameters(par);
 527
 528               delete graphErr;
 529               graphErr=0;
 530               delete f1;
 531
 532               prChi2 = TMath::Prob(chi2, fnbpf1 - 2);
 533
 534               Double_t xLim = pedMean[fnInit + fnbpf1 - 1];
 535               Double_t yLim = par[0]+par[1] * xLim;
 536
 537               a0 = par[0];
 538               a1 = par[1];
 539
 540               // 2. - Translation : new origin (xLim, yLim) + parabolic fit over nbf2 points
 541
 542               if(nbpf2 > 1)
 543                 {
 544                   for (Int_t j = 0; j < nbpf2; j++)
 545                     {
 546                       Int_t k  = j + (fnInit + fnbpf1) - 1;
 547                       xp[j]    = pedMean[k] - xLim;
 548                       xpErr[j] = pedSigma[k];
 549
 550                       yp[j]    = injCharge[k] - yLim - par[1]*xp[j];
 551                       ypErr[j] = injChargeErr[k];
 552                     }
 553
 554                   TF1 *f2 = new TF1("f2",funcParabolic,0.,kADCMax,1);
 555                   graphErr = new TGraphErrors(nbpf2, xp, yp, xpErr, ypErr);
 556
 557                   graphErr->Fit(f2,"RQ");
 558                   chi2P2 = f2->GetChisquare();
 559                   f2->GetParameters(par);
 560
 561                   delete graphErr;
 562                   graphErr=0;
 563                   delete f2;
 564
 565                   prChi2P2 = TMath::Prob(chi2P2, nbpf2-1);
 566                   a2 = par[0];
 567                 }
 568
 569               par[0] = a0;
 570               par[1] = a1;
 571               par[2] = a2;
 572               par[3] = xLim;
 573
 574               if(prChi2>0.999999)prChi2=0.999999 ; if(prChi2P2>0.999999)prChi2P2=0.9999999; // avoiding Pr(Chi2)=1 value
 575               p1 = TMath::Nint(floor(prChi2*15))+1;    // round down value : floor(2.8)=2.
 576               p2 = TMath::Nint(floor(prChi2P2*15))+1;
 577               q  = p1*16 + p2;  // fit quality
 578
 579               Double_t x0 = -par[0]/par[1]; // value of x corresponding to à 0 fC
 580               threshold = TMath::Nint(ceil(par[3]-x0)); // linear if x < threshold
 581
 582               if(fPrintLevel>1)
 583                 {
 584                   fprintf(pfilen,"%4i %4i %2i",busPatchId,manuId,channelId);
 585                   fprintf(pfilen," %6.2f %6.4f %10.3e %4.2f %4i          %8.6f %8.6f   %x          %8.6f  %8.6f   %x\n",
 586                           par[0], par[1], par[2], par[3], threshold, prChi2, floor(prChi2*15), p1,  prChi2P2, floor(prChi2P2*15),p2);
 587                 }
 588
 589
 590               // tests
 591               if(par[1]< goodA1Min ||  par[1]> goodA1Max) p1=0;
 592               if(par[2]< goodA2Min ||  par[2]> goodA2Max) p2=0;
 593
 594             } // fitproceed
 595
 596           if(fitproceed && p1>0 && p2>0)
 597             {
 598               nGoodChannel++;
 599               sumProbChi2   += prChi2;
 600               sumA1         += par[1];
 601               sumProbChi2P2   += prChi2P2;
 602               sumA2         += par[2];
 603             }
 604           else // bad calibration
 605             {
 606               nBadChannel++;
 607               q=0;
 608               par[1]=0.5; a1=0.5; p1=0;
 609               par[2]=0.;  a2=0.;  p2=0;
 610               threshold=kADCMax;
 611
 612               // bad calibration counter
 613               char bpmanuname[256];
 614               AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 615
 616               sprintf(bpmanuname,"bp%dmanu%d",busPatchId,manuId);
 617               if (!(uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*)uncalBuspatchManuTable->FindObject(bpmanuname)))
 618                 {
 619                   // New buspatch_manu name
 620                   uncalcounter= new AliMUONErrorCounter (busPatchId,manuId);
 621                   uncalcounter->SetName(bpmanuname);
 622                   uncalBuspatchManuTable->Add(uncalcounter);
 623                 }
 624               else
 625                 {
 626                   // Existing buspatch_manu name
 627                   uncalcounter->Increment();
 628                 }
 629               //                            uncalcounter->Print_uncal()
 630               uncalcountertotal ++;
 631             }
 632           gain=1./(par[1]*capa); // mv/fC
 633
 634           if(fPlotLevel>0)
 635             {if(fPlotLevel>1)
 636                 {
 637                   //                  if(q==0  and  nplot < 100)
 638                   //      if(p1>1 && p2==0  and  nplot < 100)
 639                             if(p1>10 && p2>10  and  nplot < 100)
 640                   //    if(p1>=1 and p1<=2  and  nplot < 100)
 641 //                if((p1==1 || p2==1) and  nplot < 100)
 642                     {
 643                       nplot++;
 644                       //              cout << " nplot = " << nplot << endl;
 645                       TF1 *f2Calib = new TF1("f2Calib",funcCalib,0.,kADCMax,NFITPARAMS);
 646
 647                       graphErr = new TGraphErrors(nEntries,pedMean,injCharge,pedSigma,injChargeErr);
 648
 649                       sprintf(graphName,"BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 650
 651                       graphErr->SetTitle(graphName);
 652                       graphErr->SetMarkerColor(3);
 653                       graphErr->SetMarkerStyle(12);
 654                       graphErr->Write(graphName);
 655
 656                       sprintf(graphName,"f2_BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 657                       f2Calib->SetTitle(graphName);
 658                       f2Calib->SetLineColor(4);
 659                       f2Calib->SetParameters(par);
 660                       f2Calib->Write(graphName);
 661
 662                       delete graphErr;
 663                       graphErr=0;
 664                       delete f2Calib;
 665                     }
 666                 }
 667
 668
 669               tg->Fill();
 670             }
 671
 672
 673           tempstring = WriteGainData(busPatchId,manuId,channelId,par[1],par[2],threshold,q);
 674           pfilew << tempstring;
 675 #ifdef ALI_AMORE
 676           stringout << tempstring;
 677 #endif
 678
 679         }
 680       nmanu++;
 681       if(nmanu % 500 == 0)std::cout << " Nb manu = " << nmanu << std::endl;
 682     }
 683
 684   //      print in logfile
 685   if (uncalBuspatchManuTable->GetSize())
 686     {
 687       uncalBuspatchManuTable->Sort();  // use compare
 688       TIterator* iter = uncalBuspatchManuTable->MakeIterator();
 689       AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 690       (*fFilcout) << "\n List of problematic BusPatch and Manu " << endl;
 691       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 692       (*fFilcout) << "        BP       Manu        Nb Channel  " << endl ;
 693       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 694       while((uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*) iter->Next()))
 695         {
 696           (*fFilcout) << "\t" << uncalcounter->BusPatch() << "\t " << uncalcounter->ManuId() << "\t\t"   << uncalcounter->Events() << endl;
 697         }
 698       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 699
 700       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated Manu    = " << uncalBuspatchManuTable->GetSize() << endl ;
 701       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated channel = " << uncalcountertotal << endl;
 702
 703     }
 704
 705
 706   (*fFilcout) << "\n Nb of channels in raw data = " << nmanu*64 << " (" << nmanu << " Manu)" <<  endl;
 707   (*fFilcout) << " Nb of calibrated channel   = " << nGoodChannel << " (" << goodA1Min << "<a1<" << goodA1Max
 708               << " and " << goodA2Min << "<a2<" << goodA2Max << ") " << endl;
 709   (*fFilcout) << " Nb of uncalibrated channel = " << nBadChannel << " (" << noFitChannel << " unfitted)" << endl;
 710
 711   cout << "\n Nb of channels in raw data = " << nmanu*64 << " (" << nmanu << " Manu)" <<  endl;
 712   cout << " Nb of calibrated channel   = " << nGoodChannel << " (" << goodA1Min << "<a1<" << goodA1Max
 713        << " and " << goodA2Min << "<a2<" << goodA2Max << ") " << endl;
 714   cout << " Nb of uncalibrated channel = " << nBadChannel << " (" << noFitChannel << " unfitted)" << endl;
 715
 716   Double_t meanA1         = sumA1/(nGoodChannel);
 717   Double_t meanProbChi2   = sumProbChi2/(nGoodChannel);
 718   Double_t meanA2         = sumA2/(nGoodChannel);
 719   Double_t meanProbChi2P2 = sumProbChi2P2/(nGoodChannel);
 720
 721   Double_t capaManu = 0.2; // pF
 722   (*fFilcout) << "\n linear fit   : <a1> = " << meanA1 << "\t  <gain>  = " <<  1./(meanA1*capaManu)
 723               << " mV/fC (capa= " << capaManu << " pF)" << endl;
 724   (*fFilcout) <<   "        Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2 << endl;
 725   (*fFilcout) << "\n parabolic fit: <a2> = " << meanA2  << endl;
 726   (*fFilcout) <<   "        Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2P2 << "\n" << endl;
 727
 728   cout << "\n  <gain>  = " <<  1./(meanA1*capaManu)
 729        << " mV/fC (capa= " << capaManu << " pF)"
 730        <<  "  Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2 << endl;
 731
 732   // file outputs for gain
 733
 734   pfilew.close();
 735 #ifdef ALI_AMORE
 736   //
 737   //Send objects to the AMORE DB
 738   //
 739   const char *role=gSystem->Getenv("AMORE_DA_NAME");
 740   if ( role ){
 741     amore::da::AmoreDA amoreDA(amore::da::AmoreDA::kSender);
 742 //  TObjString peddata(stringout.str().c_str());
 743     TObjString gaindata(stringout.str().c_str());
 744     Int_t status =0;
 745     status = amoreDA.Send("Pedestals",&gaindata);
 746     if ( status )
 747       cout << "Warning: Failed to write Pedestals in the AMORE database : " << status << endl;
 748   }
 749   else {
 750     cout << "Warning: environment variable 'AMORE_DA_NAME' not set. Cannot write to the AMORE database" << endl;
 751   }
 752 #endif
 753
 754   if(fPlotLevel>0){tg->Write();histoFile->Close();}
 755   if(fPrintLevel>1){fclose(pfilep); fclose(pfilen);}
 756 }