PWG4/PartCorrDep/AliAnaElectron.cxx

   1  /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes hereby granted      *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id: $ */
  16
  17 //_________________________________________________________________________
  18 //
  19 // Class for the electron identification.
  20 // Clusters from EMCAL matched to tracks
  21 // and kept in the AOD. Few histograms produced.
  22 //
  23 // -- Author: J.L. Klay (Cal Poly), M. Heinz (Yale)
  24 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 // --- ROOT system ---
  27 #include <TH2F.h>
  28 #include <TParticle.h>
  29 #include <TNtuple.h>
  30 #include <TClonesArray.h>
  31 #include <TObjString.h>
  32 //#include <Riostream.h>
  33
  34 // --- Analysis system ---
  35 #include "AliAnaElectron.h"
  36 #include "AliCaloTrackReader.h"
  37 #include "AliMCAnalysisUtils.h"
  38 #include "AliAODCaloCluster.h"
  39 #include "AliFidutialCut.h"
  40 #include "AliAODTrack.h"
  41 #include "AliAODPid.h"
  42 #include "AliCaloPID.h"
  43 #include "AliAODMCParticle.h"
  44 #include "AliStack.h"
  45 #include "AliExternalTrackParam.h"
  46 #include "AliESDv0.h"
  47
  48 ClassImp(AliAnaElectron)
  49
  50 //____________________________________________________________________________
  51 AliAnaElectron::AliAnaElectron()
  52 : AliAnaPartCorrBaseClass(),fCalorimeter(""),
  53   fpOverEmin(0.),fpOverEmax(0.),fResidualCut(0.),
  54   fDrCut(0.),fPairDcaCut(0.),fDecayLenCut(0.),fImpactCut(0.),
  55   fAssocPtCut(0.),fMassCut(0.),fSdcaCut(0.),fITSCut(0),
  56   fWriteNtuple(kFALSE),
  57   //matching checks
  58   fEleNtuple(0),
  59   fh1pOverE(0),fh1dR(0),fh2EledEdx(0),fh2MatchdEdx(0),fh2dEtadPhi(0),
  60   fh2dEtadPhiMatched(0),fh2dEtadPhiUnmatched(0),
  61   fh2TrackPVsClusterE(0),fh2TrackPtVsClusterE(0),fh2TrackPhiVsClusterPhi(0),fh2TrackEtaVsClusterEta(0),
  62   //Photonic electron checks
  63   fh1OpeningAngle(0),fh1MinvPhoton(0),
  64   //reco
  65   fhPtElectron(0),fhPhiElectron(0),fhEtaElectron(0),
  66   fhPtNPE(0),fhPhiNPE(0),fhEtaNPE(0),
  67   fhPtPE(0),fhPhiPE(0),fhEtaPE(0),
  68   fhPtConversion(0),fhPhiConversion(0),fhEtaConversion(0),
  69   fhPtBottom(0),fhPhiBottom(0),fhEtaBottom(0),
  70   fhPtCharm(0),fhPhiCharm(0),fhEtaCharm(0),
  71   fhPtCFromB(0),fhPhiCFromB(0),fhEtaCFromB(0),
  72   fhPtDalitz(0),fhPhiDalitz(0),fhEtaDalitz(0),
  73   fhPtWDecay(0),fhPhiWDecay(0),fhEtaWDecay(0),
  74   fhPtZDecay(0),fhPhiZDecay(0),fhEtaZDecay(0),
  75   fhPtPrompt(0),fhPhiPrompt(0),fhEtaPrompt(0),
  76   fhPtUnknown(0),fhPhiUnknown(0),fhEtaUnknown(0),
  77   //B-tagging
  78   fhBtagCut1(0),fhBtagCut2(0),fhBtagCut3(0),
  79   //MC
  80   fMCEleNtuple(0)
  81 {
  82   //default ctor
  83
  84   //Initialize parameters
  85   InitParameters();
  86
  87 }
  88
  89 //____________________________________________________________________________
  90 AliAnaElectron::AliAnaElectron(const AliAnaElectron & g)
  91   : AliAnaPartCorrBaseClass(g),fCalorimeter(g.fCalorimeter),
  92    fpOverEmin(g.fpOverEmin),fpOverEmax(g.fpOverEmax),fResidualCut(g.fResidualCut),
  93    fDrCut(g.fDrCut),fPairDcaCut(g.fPairDcaCut),fDecayLenCut(g.fDecayLenCut),fImpactCut(g.fImpactCut),
  94   fAssocPtCut(g.fAssocPtCut),fMassCut(g.fMassCut),fSdcaCut(g.fSdcaCut),fITSCut(g.fITSCut),
  95    fWriteNtuple(g.fWriteNtuple),
  96    //matching checks
  97    fEleNtuple(g.fEleNtuple),
  98    fh1pOverE(g.fh1pOverE),fh1dR(g.fh1dR),
  99    fh2EledEdx(g.fh2EledEdx),fh2MatchdEdx(g.fh2MatchdEdx),fh2dEtadPhi(g.fh2dEtadPhi),
 100    fh2dEtadPhiMatched(g.fh2dEtadPhiMatched),fh2dEtadPhiUnmatched(g.fh2dEtadPhiUnmatched),
 101    fh2TrackPVsClusterE(g.fh2TrackPVsClusterE),fh2TrackPtVsClusterE(g.fh2TrackPtVsClusterE),
 102    fh2TrackPhiVsClusterPhi(g.fh2TrackPhiVsClusterPhi),fh2TrackEtaVsClusterEta(g.fh2TrackEtaVsClusterEta),
 103    //Photonic electron checks
 104    fh1OpeningAngle(g.fh1OpeningAngle),fh1MinvPhoton(g.fh1MinvPhoton),
 105    //reco
 106    fhPtElectron(g.fhPtElectron),fhPhiElectron(g.fhPhiElectron),fhEtaElectron(g.fhEtaElectron),
 107    fhPtNPE(g.fhPtNPE),fhPhiNPE(g.fhPhiNPE),fhEtaNPE(g.fhEtaNPE),
 108    fhPtPE(g.fhPtPE),fhPhiPE(g.fhPhiPE),fhEtaPE(g.fhEtaPE),
 109    fhPtConversion(g.fhPtConversion),fhPhiConversion(g.fhPhiConversion),fhEtaConversion(g.fhEtaConversion),
 110    fhPtBottom(g.fhPtBottom),fhPhiBottom(g.fhPhiBottom),fhEtaBottom(g.fhEtaBottom),
 111    fhPtCharm(g.fhPtCharm),fhPhiCharm(g.fhPhiCharm),fhEtaCharm(g.fhEtaCharm),
 112    fhPtCFromB(g.fhPtCFromB),fhPhiCFromB(g.fhPhiCFromB),fhEtaCFromB(g.fhEtaCFromB),
 113    fhPtDalitz(g.fhPtDalitz),fhPhiDalitz(g.fhPhiDalitz),fhEtaDalitz(g.fhEtaDalitz),
 114    fhPtWDecay(g.fhPtWDecay),fhPhiWDecay(g.fhPhiWDecay),fhEtaWDecay(g.fhEtaWDecay),
 115    fhPtZDecay(g.fhPtZDecay),fhPhiZDecay(g.fhPhiZDecay),fhEtaZDecay(g.fhEtaZDecay),
 116    fhPtPrompt(g.fhPtPrompt),fhPhiPrompt(g.fhPhiPrompt),fhEtaPrompt(g.fhEtaPrompt),
 117    fhPtUnknown(g.fhPtUnknown),fhPhiUnknown(g.fhPhiUnknown),fhEtaUnknown(g.fhEtaUnknown),
 118    //B-tagging
 119    fhBtagCut1(g.fhBtagCut1),fhBtagCut2(g.fhBtagCut2),fhBtagCut3(g.fhBtagCut3),
 120    //MC
 121    fMCEleNtuple(g.fMCEleNtuple)
 122 {
 123   // cpy ctor
 124
 125 }
 126
 127 //_________________________________________________________________________
 128 AliAnaElectron & AliAnaElectron::operator = (const AliAnaElectron & g)
 129 {
 130   // assignment operator
 131
 132   if(&g == this) return *this;
 133   fCalorimeter = g.fCalorimeter;
 134   fpOverEmin = g.fpOverEmin;
 135   fpOverEmax = g.fpOverEmax;
 136   fResidualCut = g.fResidualCut;
 137   fDrCut = g.fDrCut;
 138   fPairDcaCut = g.fPairDcaCut;
 139   fDecayLenCut = g.fDecayLenCut;
 140   fImpactCut = g.fImpactCut;
 141   fAssocPtCut = g.fAssocPtCut;
 142   fMassCut = g.fMassCut;
 143   fSdcaCut = g.fSdcaCut;
 144   fITSCut = g.fITSCut;
 145   fWriteNtuple = g.fWriteNtuple;
 146   fEleNtuple = g.fEleNtuple;
 147   fh1pOverE = g.fh1pOverE;
 148   fh1dR = g.fh1dR;
 149   fh2EledEdx = g.fh2EledEdx;
 150   fh2MatchdEdx = g.fh2MatchdEdx;
 151   fh2dEtadPhi = g.fh2dEtadPhi;
 152   fh2dEtadPhiMatched = g.fh2dEtadPhiMatched;
 153   fh2dEtadPhiUnmatched = g.fh2dEtadPhiUnmatched;
 154   fh2TrackPVsClusterE = g.fh2TrackPVsClusterE;
 155   fh2TrackPtVsClusterE = g.fh2TrackPtVsClusterE;
 156   fh2TrackPhiVsClusterPhi = g.fh2TrackPhiVsClusterPhi;
 157   fh2TrackEtaVsClusterEta = g.fh2TrackEtaVsClusterEta;
 158   fh1OpeningAngle = g.fh1OpeningAngle;
 159   fh1MinvPhoton = g.fh1MinvPhoton;
 160   fhPtElectron = g.fhPtElectron;
 161   fhPhiElectron = g.fhPhiElectron;
 162   fhEtaElectron = g.fhEtaElectron;
 163   fhPtNPE = g.fhPtNPE;
 164   fhPhiNPE = g.fhPhiNPE;
 165   fhEtaNPE = g.fhEtaNPE;
 166   fhPtPE = g.fhPtPE;
 167   fhPhiPE = g.fhPhiPE;
 168   fhEtaPE = g.fhEtaPE;
 169   fhPtConversion = g.fhPtConversion;
 170   fhPhiConversion = g.fhPhiConversion;
 171   fhEtaConversion = g.fhEtaConversion;
 172   fhPtBottom = g.fhPtBottom;
 173   fhPhiBottom = g.fhPhiBottom;
 174   fhEtaBottom = g.fhEtaBottom;
 175   fhPtCharm = g.fhPtCharm;
 176   fhPhiCharm = g.fhPhiCharm;
 177   fhEtaCharm = g.fhEtaCharm;
 178   fhPtCFromB = g.fhPtCFromB;
 179   fhPhiCFromB = g.fhPhiCFromB;
 180   fhEtaCFromB = g.fhEtaCFromB;
 181   fhPtDalitz = g.fhPtDalitz;
 182   fhPhiDalitz = g.fhPhiDalitz;
 183   fhEtaDalitz = g.fhEtaDalitz;
 184   fhPtWDecay = g.fhPtWDecay;
 185   fhPhiWDecay = g.fhPhiWDecay;
 186   fhEtaWDecay = g.fhEtaWDecay;
 187   fhPtZDecay = g.fhPtZDecay;
 188   fhPhiZDecay = g.fhPhiZDecay;
 189   fhEtaZDecay = g.fhEtaZDecay;
 190   fhPtPrompt = g.fhPtPrompt;
 191   fhPhiPrompt = g.fhPhiPrompt;
 192   fhEtaPrompt = g.fhEtaPrompt;
 193   fhPtUnknown = g.fhPtUnknown;
 194   fhPhiUnknown = g.fhPhiUnknown;
 195   fhEtaUnknown = g.fhEtaUnknown;
 196   fMCEleNtuple = g.fMCEleNtuple;
 197
 198   //B-tagging
 199   fhBtagCut1 = g.fhBtagCut1;
 200   fhBtagCut2 = g.fhBtagCut2;
 201   fhBtagCut3 = g.fhBtagCut3;
 202
 203   return *this;
 204
 205 }
 206
 207 //____________________________________________________________________________
 208 AliAnaElectron::~AliAnaElectron()
 209 {
 210   //dtor
 211
 212 }
 213
 214
 215 //________________________________________________________________________
 216 TList *  AliAnaElectron::GetCreateOutputObjects()
 217 {
 218   // Create histograms to be saved in output file and
 219   // store them in outputContainer
 220   TList * outputContainer = new TList() ;
 221   outputContainer->SetName("ElectronHistos") ;
 222
 223   //created ele ntuple for further analysis
 224   if(fWriteNtuple) {
 225       fEleNtuple = new TNtuple("EleNtuple","Electron Ntuple","tmctag:cmctag:pt:phi:eta:p:E:deta:dphi:nCells:dEdx:pidProb:impXY:impZ");
 226     outputContainer->Add(fEleNtuple) ;
 227   }
 228
 229   Int_t nptbins  = GetHistoNPtBins();
 230   Int_t nphibins = GetHistoNPhiBins();
 231   Int_t netabins = GetHistoNEtaBins();
 232   Float_t ptmax  = GetHistoPtMax();
 233   Float_t phimax = GetHistoPhiMax();
 234   Float_t etamax = GetHistoEtaMax();
 235   Float_t ptmin  = GetHistoPtMin();
 236   Float_t phimin = GetHistoPhiMin();
 237   Float_t etamin = GetHistoEtaMin();
 238
 239   fh1pOverE = new TH1F("h1pOverE","EMCAL-TRACK matches p/E",100,0.,10.);
 240   fh1dR = new TH1F("h1dR","EMCAL-TRACK matches dR",300, 0.,TMath::Pi());
 241   fh2EledEdx = new TH2F("h2EledEdx","dE/dx vs. p for electrons",200,0.,50.,200,0.,400.);
 242   fh2MatchdEdx = new TH2F("h2MatchdEdx","dE/dx vs. p for all matches",200,0.,50.,200,0.,400.);
 243   fh2dEtadPhi = new TH2F("h2dEtadPhi","#Delta#eta vs. #Delta#phi for all track-cluster pairs",200,0.,1.4,300,0.,TMath::Pi());
 244   fh2dEtadPhiMatched = new TH2F("h2dEtadPhiMatched","#Delta#eta vs. #Delta#phi for matched track-cluster pairs",200,0.,1.4,300,0.,TMath::Pi());
 245   fh2dEtadPhiUnmatched = new TH2F("h2dEtadPhiUnmatched","#Delta#eta vs. #Delta#phi for unmatched track-cluster pairs",200,0.,1.4,300,0.,TMath::Pi());
 246
 247   fh2TrackPVsClusterE = new TH2F("h2TrackPVsClusterE","h2TrackPVsClusterE",nptbins,ptmin,ptmax,nptbins,ptmin,ptmax);
 248   fh2TrackPtVsClusterE = new TH2F("h2TrackPtVsClusterE","h2TrackPtVsClusterE",nptbins,ptmin,ptmax,nptbins,ptmin,ptmax);
 249   fh2TrackPhiVsClusterPhi = new TH2F("h2TrackPhiVsClusterPhi","h2TrackPhiVsClusterPhi",nphibins,phimin,phimax,nphibins,phimin,phimax);
 250   fh2TrackEtaVsClusterEta = new TH2F("h2TrackEtaVsClusterEta","h2TrackEtaVsClusterEta",netabins,etamin,etamax,netabins,etamin,etamax);
 251
 252   outputContainer->Add(fh1pOverE) ;
 253   outputContainer->Add(fh1dR) ;
 254   outputContainer->Add(fh2EledEdx) ;
 255   outputContainer->Add(fh2MatchdEdx) ;
 256   outputContainer->Add(fh2dEtadPhi) ;
 257   outputContainer->Add(fh2dEtadPhiMatched) ;
 258   outputContainer->Add(fh2dEtadPhiUnmatched) ;
 259   outputContainer->Add(fh2TrackPVsClusterE) ;
 260   outputContainer->Add(fh2TrackPtVsClusterE) ;
 261   outputContainer->Add(fh2TrackPhiVsClusterPhi) ;
 262   outputContainer->Add(fh2TrackEtaVsClusterEta) ;
 263
 264   //photonic electron checks
 265   fh1OpeningAngle = new TH1F("hOpeningAngle","Opening angle between electron pairs",100,0.,TMath::Pi());
 266   fh1MinvPhoton = new TH1F("hMinvPhoton","Invariant mass of electron pairs",100,0.,2.);
 267
 268   outputContainer->Add(fh1OpeningAngle);
 269   outputContainer->Add(fh1MinvPhoton);
 270
 271   fhPtElectron = new TH1F("hPtElectron","Electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 272   fhPhiElectron = new TH2F("hPhiElectron","Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 273   fhEtaElectron = new TH2F("hEtaElectron","Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 274   fhPtNPE = new TH1F("hPtNPE","Non-photonic Electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 275   fhPhiNPE = new TH2F("hPhiNPE","Non-photonic Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 276   fhEtaNPE = new TH2F("hEtaNPE","Non-photonic Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 277   fhPtPE = new TH1F("hPtPE","Photonic Electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 278   fhPhiPE = new TH2F("hPhiPE","Photonic Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 279   fhEtaPE = new TH2F("hEtaPE","Photonic Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 280
 281   outputContainer->Add(fhPtElectron) ;
 282   outputContainer->Add(fhPhiElectron) ;
 283   outputContainer->Add(fhEtaElectron) ;
 284   outputContainer->Add(fhPtNPE) ;
 285   outputContainer->Add(fhPhiNPE) ;
 286   outputContainer->Add(fhEtaNPE) ;
 287   outputContainer->Add(fhPtPE) ;
 288   outputContainer->Add(fhPhiPE) ;
 289   outputContainer->Add(fhEtaPE) ;
 290
 291   //B-tagging
 292   fhBtagCut1 = new TH2F("hbtag_cut1","B-tag result cut1", 10,0,10 ,nptbins,ptmin,ptmax);
 293   fhBtagCut2 = new TH2F("hbtag_cut2","B-tag result cut2", 10,0,10 ,nptbins,ptmin,ptmax);
 294   fhBtagCut3 = new TH2F("hbtag_cut3","B-tag result cut3", 10,0,10 ,nptbins,ptmin,ptmax);
 295
 296   outputContainer->Add(fhBtagCut1) ;
 297   outputContainer->Add(fhBtagCut2) ;
 298   outputContainer->Add(fhBtagCut3) ;
 299
 300   if(IsDataMC()){
 301
 302     fhPtConversion = new TH1F("hPtConversion","Conversion electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 303     fhPhiConversion = new TH2F("hPhiConversion","Conversion Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 304     fhEtaConversion = new TH2F("hEtaConversion","Conversion Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 305     fhPtBottom = new TH1F("hPtBottom","Bottom electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 306     fhPhiBottom = new TH2F("hPhiBottom","Bottom Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 307     fhEtaBottom = new TH2F("hEtaBottom","Bottom Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 308     fhPtCharm = new TH1F("hPtCharm","Charm electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 309     fhPhiCharm = new TH2F("hPhiCharm","Charm Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 310     fhEtaCharm = new TH2F("hEtaCharm","Charm Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 311     fhPtCFromB = new TH1F("hPtCFromB","Charm from Bottom electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 312     fhPhiCFromB = new TH2F("hPhiCFromB","Charm from Bottom Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 313     fhEtaCFromB = new TH2F("hEtaCFromB","Charm from Bottom Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 314     fhPtDalitz = new TH1F("hPtDalitz","Dalitz electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 315     fhPhiDalitz = new TH2F("hPhiDalitz","Dalitz Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 316     fhEtaDalitz = new TH2F("hEtaDalitz","Dalitz Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 317     fhPtWDecay = new TH1F("hPtWDecay","W-boson Electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 318     fhPhiWDecay = new TH2F("hPhiWDecay","W-boson electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 319     fhEtaWDecay = new TH2F("hEtaWDecay","W-boson Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 320     fhPtZDecay = new TH1F("hPtZDecay","Z-boson electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 321     fhPhiZDecay = new TH2F("hPhiZDecay","Z-boson Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 322     fhEtaZDecay = new TH2F("hEtaZDecay","Z-boson Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 323     fhPtPrompt = new TH1F("hPtPrompt","Prompt electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 324     fhPhiPrompt = new TH2F("hPhiPrompt","Prompt Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 325     fhEtaPrompt = new TH2F("hEtaPrompt","Prompt Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 326     fhPtUnknown = new TH1F("hPtUnknown","Unknown electron pT",nptbins,ptmin,ptmax);
 327     fhPhiUnknown = new TH2F("hPhiUnknown","Unknown Electron phi vs pT",nptbins,ptmin,ptmax,nphibins,phimin,phimax);
 328     fhEtaUnknown = new TH2F("hEtaUnknown","Unknown Electron eta vs. eta",nptbins,ptmin,ptmax,netabins,etamin,etamax);
 329
 330     outputContainer->Add(fhPtConversion);
 331     outputContainer->Add(fhPhiConversion);
 332     outputContainer->Add(fhEtaConversion);
 333     outputContainer->Add(fhPtBottom);
 334     outputContainer->Add(fhPhiBottom);
 335     outputContainer->Add(fhEtaBottom);
 336     outputContainer->Add(fhPtCharm);
 337     outputContainer->Add(fhPhiCharm);
 338     outputContainer->Add(fhEtaCharm);
 339     outputContainer->Add(fhPtCFromB);
 340     outputContainer->Add(fhPhiCFromB);
 341     outputContainer->Add(fhEtaCFromB);
 342     outputContainer->Add(fhPtDalitz);
 343     outputContainer->Add(fhPhiDalitz);
 344     outputContainer->Add(fhEtaDalitz);
 345     outputContainer->Add(fhPtWDecay);
 346     outputContainer->Add(fhPhiWDecay);
 347     outputContainer->Add(fhEtaWDecay);
 348     outputContainer->Add(fhPtZDecay);
 349     outputContainer->Add(fhPhiZDecay);
 350     outputContainer->Add(fhEtaZDecay);
 351     outputContainer->Add(fhPtPrompt);
 352     outputContainer->Add(fhPhiPrompt);
 353     outputContainer->Add(fhEtaPrompt);
 354     outputContainer->Add(fhPtUnknown);
 355     outputContainer->Add(fhPhiUnknown);
 356     outputContainer->Add(fhEtaUnknown);
 357
 358     //created ele ntuple for further analysis
 359     if(fWriteNtuple) {
 360       fMCEleNtuple = new TNtuple("MCEleNtuple","MC Electron Ntuple","mctag:pt:phi:eta:x:y:z");
 361       outputContainer->Add(fMCEleNtuple) ;
 362     }
 363
 364   }//Histos with MC
 365
 366   //Save parameters used for analysis
 367   TString parList ; //this will be list of parameters used for this analysis.
 368   char onePar[255] ;
 369
 370   sprintf(onePar,"--- AliAnaElectron ---\n") ;
 371   parList+=onePar ;
 372   sprintf(onePar,"fCalorimeter: %s\n",fCalorimeter.Data()) ;
 373   parList+=onePar ;
 374   sprintf(onePar,"fpOverEmin: %f\n",fpOverEmin) ;
 375   parList+=onePar ;
 376   sprintf(onePar,"fpOverEmax: %f\n",fpOverEmax) ;
 377   parList+=onePar ;
 378   sprintf(onePar,"fResidualCut: %f\n",fResidualCut) ;
 379   parList+=onePar ;
 380   sprintf(onePar,"---Btagging\n");
 381   parList+=onePar ;
 382   sprintf(onePar,"max IP-cut (e,h): %f\n",fImpactCut);
 383   parList+=onePar ;
 384   sprintf(onePar,"min ITS-hits: %d\n",fITSCut);
 385   parList+=onePar ;
 386   sprintf(onePar,"max dR (e,h): %f\n",fDrCut);
 387   parList+=onePar ;
 388   sprintf(onePar,"max pairDCA: %f\n",fPairDcaCut);
 389   parList+=onePar ;
 390   sprintf(onePar,"max decaylength: %f\n",fDecayLenCut);
 391   parList+=onePar ;
 392   sprintf(onePar,"min Associated Pt: %f\n",fAssocPtCut);
 393   parList+=onePar ;
 394
 395   //Get parameters set in base class.
 396   parList += GetBaseParametersList() ;
 397
 398   //Get parameters set in FidutialCut class (not available yet)
 399   //parlist += GetFidCut()->GetFidCutParametersList()
 400
 401   TObjString *oString= new TObjString(parList) ;
 402   outputContainer->Add(oString);
 403
 404   return outputContainer ;
 405
 406 }
 407
 408 //____________________________________________________________________________
 409 void AliAnaElectron::Init()
 410 {
 411
 412   //do some initialization
 413   if(fCalorimeter == "PHOS") {
 414     printf("AliAnaElectron::Init() - !!STOP: You want to use PHOS in analysis but this is not (yet) supported!!\n!!Check the configuration file!!\n");
 415     fCalorimeter = "EMCAL";
 416   }
 417   if(fCalorimeter == "EMCAL" && !GetReader()->IsEMCALSwitchedOn()){
 418     printf("AliAnaElectron::Init() - !!STOP: You want to use EMCAL in analysis but it is not read!!\n!!Check the configuration file!!\n");
 419     abort();
 420   }
 421
 422 }
 423
 424
 425 //____________________________________________________________________________
 426 void AliAnaElectron::InitParameters()
 427 {
 428
 429   //Initialize the parameters of the analysis.
 430   SetOutputAODClassName("AliAODPWG4Particle");
 431   SetOutputAODName("PWG4Particle");
 432
 433   AddToHistogramsName("AnaElectron_");
 434
 435   fCalorimeter = "EMCAL" ;
 436   fpOverEmin = 0.5;
 437   fpOverEmax = 1.5;
 438   fResidualCut = 0.02;
 439   //B-tagging
 440   fDrCut       = 1.0;
 441   fPairDcaCut  = 0.02;
 442   fDecayLenCut = 1.0;
 443   fImpactCut   = 0.5;
 444   fAssocPtCut  = 1.0;
 445   fMassCut     = 1.5;
 446   fSdcaCut     = 0.1;
 447   fITSCut      = 4;
 448
 449 }
 450
 451 //__________________________________________________________________
 452 void  AliAnaElectron::MakeAnalysisFillAOD()
 453 {
 454   //
 455   // Do analysis and fill aods with electron candidates
 456   // These AODs will be used to do subsequent histogram filling
 457   //
 458   // Also fill some QA histograms
 459   //
 460
 461   TObjArray *cl = new TObjArray();
 462
 463   Double_t bfield = 0.;
 464   if(GetReader()->GetDataType() != AliCaloTrackReader::kMC) bfield = GetReader()->GetBField();
 465
 466   //Select the calorimeter of the electron
 467   if(fCalorimeter != "EMCAL") {
 468     printf("This class not yet implemented for PHOS\n");
 469     abort();
 470   }
 471   cl = GetAODEMCAL();
 472
 473   ////////////////////////////////////////////////
 474   //Start from tracks and get associated clusters
 475   ////////////////////////////////////////////////
 476   if(!GetAODCTS() || GetAODCTS()->GetEntriesFast() == 0) return ;
 477   Int_t ntracks = GetAODCTS()->GetEntriesFast();
 478   if(GetDebug() > 0)
 479     printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillAOD() - In CTS aod entries %d\n", ntracks);
 480
 481   //Unfortunately, AliAODTracks don't have associated EMCAL clusters.
 482   //we have to redo track-matching, I guess
 483   Int_t iCluster = -999;
 484   Int_t bt = 0; //counter for event b-tags
 485
 486   for (Int_t itrk =  0; itrk <  ntracks; itrk++) {////////////// track loop
 487     iCluster = -999; //start with no match
 488     AliAODTrack * track = (AliAODTrack*) (GetAODCTS()->At(itrk)) ;
 489     AliAODPid* pid = (AliAODPid*) track->GetDetPid();
 490
 491     Double_t emcpos[3];
 492     pid->GetEMCALPosition(emcpos);
 493     Double_t emcmom[3];
 494     pid->GetEMCALMomentum(emcmom);
 495
 496     TVector3 pos(emcpos[0],emcpos[1],emcpos[2]);
 497     TVector3 mom(emcmom[0],emcmom[1],emcmom[2]);
 498     Double_t tphi = pos.Phi();
 499     Double_t teta = pos.Eta();
 500     Double_t tmom = mom.Mag();
 501
 502     TLorentzVector mom2(mom,0.);
 503     Bool_t in =  GetFidutialCut()->IsInFidutialCut(mom2,fCalorimeter) ;
 504     if(GetDebug() > 1) printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillAOD() - Track pt %2.2f, phi %2.2f, eta %2.2f in fidutial cut %d\n",track->Pt(), track->Phi(), track->Eta(), in);
 505     if(mom.Pt() > GetMinPt() && in) {
 506
 507       Double_t dEdx = pid->GetTPCsignal();
 508
 509       //NOTE:  As of 02-Sep-2009, the XYZAtDCA methods of AOD do not
 510       //work, but it is possible to get the position of a track at
 511       //closest approach to the vertex from the GetPosition method
 512       Double_t xyz[3];
 513       //track->XYZAtDCA(xyz);
 514       Bool_t isNotDCA = track->GetPosition(xyz);
 515       if(isNotDCA) printf("##Problem getting impact parameter!\n");
 516       //printf("\tTRACK POSITION AT DCA: %2.2f,%2.2f,%2.2f\n",xyz[0],xyz[1],xyz[2]);
 517       Double_t xy = TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0]+xyz[1]*xyz[1]);
 518       Double_t z = xyz[2];
 519
 520       Int_t ntot = cl->GetEntriesFast();
 521       Double_t res = 999.;
 522       Double_t pOverE = -999.;
 523
 524       Bool_t isElectron = kFALSE;
 525       //For tracks in EMCAL acceptance, pair them with all clusters
 526       //and fill the dEta vs dPhi for these pairs:
 527       for(Int_t iclus = 0; iclus < ntot; iclus++) {
 528         AliAODCaloCluster * clus = (AliAODCaloCluster*) (cl->At(iclus));
 529         if(!clus) continue;
 530
 531         Double_t x[3];
 532         clus->GetPosition(x);
 533         TVector3 cluspos(x[0],x[1],x[2]);
 534         Double_t deta = teta - cluspos.Eta();
 535         Double_t dphi = tphi - cluspos.Phi();
 536         if(dphi > TMath::Pi()) dphi -= 2*TMath::Pi();
 537         if(dphi < -TMath::Pi()) dphi += 2*TMath::Pi();
 538         fh2dEtadPhi->Fill(deta,dphi);
 539         fh2TrackPVsClusterE->Fill(clus->E(),track->P());
 540         fh2TrackPtVsClusterE->Fill(clus->E(),track->Pt());
 541         fh2TrackPhiVsClusterPhi->Fill(cluspos.Phi(),mom.Phi());
 542         fh2TrackEtaVsClusterEta->Fill(cluspos.Eta(),mom.Eta());
 543
 544         res = sqrt(dphi*dphi + deta*deta);
 545         fh1dR->Fill(res);
 546         fh2dEtadPhiMatched->Fill(deta,dphi);
 547
 548         /////////////////////////////////
 549         //Perform electron cut analysis//
 550         /////////////////////////////////
 551         //Good match
 552         if(res < fResidualCut) {
 553           iCluster = iclus;
 554
 555           Int_t tmctag = -1;
 556           Int_t cmctag = -1;
 557
 558           if(IsDataMC()) {
 559             //Input from second AOD?
 560             Int_t input = 0;
 561             if(GetReader()->GetAODCTSNormalInputEntries() <= itrk) input = 1;
 562             tmctag = GetMCAnalysisUtils()->CheckOrigin(track->GetLabel(),GetReader(),input);
 563
 564             //Do you want the cluster or the track label?
 565             input = 0;
 566             if(GetReader()->GetAODEMCALNormalInputEntries() <= iclus) input = 1;
 567             cmctag = GetMCAnalysisUtils()->CheckOrigin(clus->GetLabel(0),GetReader(),input);
 568           }
 569
 570           if(fWriteNtuple) {
 571             fEleNtuple->Fill(tmctag,cmctag,track->Pt(),track->Phi(),track->Eta(),track->P(),clus->E(),deta,dphi,clus->GetNCells(),dEdx,track->GetMostProbablePID(),xy,z);
 572           }
 573
 574           fh2MatchdEdx->Fill(track->P(),dEdx);
 575
 576           Double_t energy = clus->E();
 577           if(energy > 0) pOverE = tmom/energy;
 578           fh1pOverE->Fill(pOverE);
 579
 580           Int_t mult = clus->GetNCells();
 581           if(mult < 2 &&  GetDebug() > 0) printf("Single digit cluster.\n");
 582
 583           //////////////////////////////
 584           //Electron cuts happen here!//
 585           //////////////////////////////
 586           if(pOverE > fpOverEmin && pOverE < fpOverEmax) isElectron = kTRUE;
 587         } else {
 588           fh2dEtadPhiUnmatched->Fill(deta,dphi);
 589         }
 590
 591       } //calocluster loop
 592
 593       ///////////////////////////
 594       //Fill AOD with electrons//
 595       ///////////////////////////
 596       if(isElectron) {
 597
 598         //B-tagging
 599         if(GetDebug() > 1) printf("Found Electron - do b-tagging\n");
 600         Int_t btag = GetBtag(track); bt += btag;
 601
 602         fh2EledEdx->Fill(track->P(),dEdx);
 603
 604         Double_t eMass = 0.511/1000; //mass in GeV
 605         Double_t eleE = sqrt(track->P()*track->P() + eMass*eMass);
 606         AliAODPWG4Particle tr = AliAODPWG4Particle(track->Px(),track->Py(),track->Pz(),eleE);
 607         tr.SetLabel(track->GetLabel());
 608         tr.SetCaloLabel(iCluster,-1); //sets the indices of the original caloclusters
 609         tr.SetTrackLabel(track->GetID(),-1); //sets the indices of the original tracks
 610         tr.SetDetector(fCalorimeter);
 611         if(GetReader()->GetAODCTSNormalInputEntries() <= itrk) tr.SetInputFileIndex(1);
 612         //Make this preserve sign of particle
 613         if(track->Charge() < 0) tr.SetPdg(11); //electron is 11
 614         else  tr.SetPdg(-11); //positron is -11
 615         tr.SetBtag(btag);
 616
 617         //Play with the MC stack if available
 618         //Check origin of the candidates
 619         if(IsDataMC()){
 620
 621           //FIXME:  Need to re-think this for track-oriented analysis
 622           //JLK DO WE WANT TRACK TAG OR CLUSTER TAG?
 623           tr.SetTag(GetMCAnalysisUtils()->CheckOrigin(tr.GetLabel(),GetReader(),tr.GetInputFileIndex()));
 624
 625           if(GetDebug() > 0) printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillAOD() - Origin of candidate %d\n",tr.GetTag());
 626         }//Work with stack also
 627
 628         AddAODParticle(tr);
 629
 630         if(GetDebug() > 1) printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillAOD() - Electron selection cuts passed: pT %3.2f, pdg %d\n",tr.Pt(),tr.GetPdg());
 631       }//electron
 632     }//pt, fiducial selection
 633   }//track loop
 634
 635   //FIXME:  Should we also check from the calocluster side, just in
 636   //case?
 637
 638   if(GetDebug() > 1 && bt > 0) printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillAOD() *** Event Btagged *** \n");
 639   if(GetDebug() > 1) printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillAOD()  End fill AODs \n");
 640
 641 }
 642
 643 //__________________________________________________________________
 644 void  AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms()
 645 {
 646   //Do analysis and fill histograms
 647
 648   AliStack * stack = 0x0;
 649   TParticle * primary = 0x0;
 650   TClonesArray * mcparticles0 = 0x0;
 651   TClonesArray * mcparticles1 = 0x0;
 652   AliAODMCParticle * aodprimary = 0x0;
 653
 654   if(IsDataMC()) {
 655     if(GetReader()->ReadStack()){
 656       stack =  GetMCStack() ;
 657
 658       if(!stack)
 659         printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms() *** no stack ***: \n");
 660
 661     }
 662     else if(GetReader()->ReadAODMCParticles()){
 663       //Get the list of MC particles
 664       mcparticles0 = GetReader()->GetAODMCParticles(0);
 665       if(!mcparticles0 && GetDebug() > 0)     {
 666         printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms() -  Standard MCParticles not available!\n");
 667       }
 668       if(GetReader()->GetSecondInputAODTree()){
 669         mcparticles1 = GetReader()->GetAODMCParticles(1);
 670         if(!mcparticles1 && GetDebug() > 0)     {
 671           printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms() -  Second input MCParticles not available!\n");
 672         }
 673       }
 674
 675     }
 676   }// is data and MC
 677
 678   //Loop on stored AOD electrons
 679   Int_t naod = GetOutputAODBranch()->GetEntriesFast();
 680   if(GetDebug() > 0) printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms() - aod branch entries %d\n", naod);
 681
 682   for(Int_t iaod = 0; iaod < naod ; iaod++){
 683     AliAODPWG4Particle* ele =  (AliAODPWG4Particle*) (GetOutputAODBranch()->At(iaod));
 684     Int_t pdg = ele->GetPdg();
 685
 686     if(GetDebug() > 3)
 687       printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms() - PDG %d, MC TAG %d, Calorimeter %s\n", ele->GetPdg(),ele->GetTag(), (ele->GetDetector()).Data()) ;
 688
 689     if(TMath::Abs(pdg) != AliCaloPID::kElectron) continue;
 690     if(ele->GetDetector() != fCalorimeter) continue;
 691
 692     if(GetDebug() > 1)
 693       printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms() - ID Electron: pt %f, phi %f, eta %f\n", ele->Pt(),ele->Phi(),ele->Eta()) ;
 694
 695
 696     //Filter for photonic electrons based on opening angle and Minv
 697     //cuts, also fill histograms
 698     Bool_t photonic = kFALSE;
 699     photonic = IsItPhotonic(ele);
 700
 701     //Fill electron histograms
 702     Float_t ptele = ele->Pt();
 703     Float_t phiele = ele->Phi();
 704     Float_t etaele = ele->Eta();
 705
 706     fhPtElectron  ->Fill(ptele);
 707     fhPhiElectron ->Fill(ptele,phiele);
 708     fhEtaElectron ->Fill(ptele,etaele);
 709
 710     if(photonic) {
 711       fhPtPE->Fill(ptele);
 712       fhPhiPE->Fill(ptele,phiele);
 713       fhEtaPE->Fill(ptele,etaele);
 714     } else {
 715       fhPtNPE->Fill(ptele);
 716       fhPhiNPE->Fill(ptele,phiele);
 717       fhEtaNPE->Fill(ptele,etaele);
 718     }
 719
 720     if(IsDataMC()){
 721       Int_t tag = ele->GetTag();
 722       if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCConversion)){
 723         fhPtConversion  ->Fill(ptele);
 724         fhPhiConversion ->Fill(ptele,phiele);
 725         fhEtaConversion ->Fill(ptele,etaele);
 726       }
 727       else if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCEFromB))
 728         {
 729           printf("\t\tTAG VALUE = %d\n",tag);
 730           fhPtBottom  ->Fill(ptele);
 731           fhPhiBottom ->Fill(ptele,phiele);
 732           fhEtaBottom ->Fill(ptele,etaele);
 733         }
 734       else if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCEFromC))
 735         {
 736           fhPtCharm  ->Fill(ptele);
 737           fhPhiCharm ->Fill(ptele,phiele);
 738           fhEtaCharm ->Fill(ptele,etaele);
 739         }
 740       else if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCEFromCFromB))
 741         {
 742           fhPtCFromB  ->Fill(ptele);
 743           fhPhiCFromB ->Fill(ptele,phiele);
 744           fhEtaCFromB ->Fill(ptele,etaele);
 745         }
 746       else if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCPi0Decay) || GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCEtaDecay) || GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCOtherDecay))
 747         {
 748           fhPtDalitz  ->Fill(ptele);
 749           fhPhiDalitz ->Fill(ptele,phiele);
 750           fhEtaDalitz ->Fill(ptele,etaele);
 751         }
 752       else if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCWDecay))
 753         {
 754           fhPtWDecay  ->Fill(ptele);
 755           fhPhiWDecay ->Fill(ptele,phiele);
 756           fhEtaWDecay ->Fill(ptele,etaele);
 757         }
 758       else if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCZDecay))
 759         {
 760           fhPtZDecay  ->Fill(ptele);
 761           fhPhiZDecay ->Fill(ptele,phiele);
 762           fhEtaZDecay ->Fill(ptele,etaele);
 763         }
 764       else if(GetMCAnalysisUtils()->CheckTagBit(tag,AliMCAnalysisUtils::kMCElectron))
 765         {
 766           fhPtPrompt  ->Fill(ptele);
 767           fhPhiPrompt ->Fill(ptele,phiele);
 768           fhEtaPrompt ->Fill(ptele,etaele);
 769         }
 770       else{
 771         fhPtUnknown  ->Fill(ptele);
 772         fhPhiUnknown ->Fill(ptele,phiele);
 773         fhEtaUnknown ->Fill(ptele,etaele);
 774       }
 775     }//Histograms with MC
 776
 777   }// aod loop
 778
 779   ////////////////////////////////////////////////////////
 780   //Fill histograms of pure MC kinematics from the stack//
 781   ////////////////////////////////////////////////////////
 782   if(IsDataMC()) {
 783     if(GetReader()->ReadStack()) {
 784       for(Int_t ipart = 0; ipart < stack->GetNtrack(); ipart++) {
 785         primary = stack->Particle(ipart);
 786         Int_t pdgcode = primary->GetPdgCode();
 787         //we only care about electrons
 788         if(TMath::Abs(pdgcode) != 11) continue;
 789         //we only want TRACKABLE electrons (TPC 85-250cm)
 790         if(primary->R() > 200.) continue;
 791         //Ignore low pt electrons
 792         if(primary->Pt() < 0.2) continue;
 793
 794         //find out what the ancestry of this electron is
 795         Int_t mctag = -1;
 796         Int_t input = 0;
 797         mctag = GetMCAnalysisUtils()->CheckOrigin(ipart,GetReader(),input);
 798
 799         //fill ntuple
 800         if(fWriteNtuple) {
 801           fMCEleNtuple->Fill(mctag,primary->Pt(),primary->Phi(),primary->Eta(),primary->Vx(),primary->Vy(),primary->Vz());
 802         }
 803
 804       }
 805
 806     } else if(GetReader()->ReadAODMCParticles()) {
 807       Int_t npart0 = mcparticles0->GetEntriesFast();
 808           Int_t npart1 = 0;
 809           if(mcparticles1) npart1 = mcparticles1->GetEntriesFast();
 810       Int_t npart = npart0+npart1;
 811       for(Int_t ipart = 0; ipart < npart; ipart++) {
 812         if(ipart < npart0) aodprimary = (AliAODMCParticle*)mcparticles0->At(ipart);
 813         else aodprimary = (AliAODMCParticle*)mcparticles1->At(ipart-npart0);
 814         if(!aodprimary) {
 815           printf("AliAnaElectron::MakeAnalysisFillHistograms() *** no primary ***:  label %d \n", ipart);
 816           continue;
 817         }
 818         Int_t pdgcode = aodprimary->GetPdgCode();
 819         //we only care about electrons
 820         if(TMath::Abs(pdgcode) != 11) continue;
 821         //we only want TRACKABLE electrons (TPC 85-250cm)
 822         Double_t radius = TMath::Sqrt(aodprimary->Xv()*aodprimary->Xv() + aodprimary->Yv()*aodprimary->Yv());
 823         if(radius > 200.) continue;
 824
 825         if(aodprimary->Pt() < 0.2) continue;
 826
 827         //find out what the ancestry of this electron is
 828         Int_t mctag = -1;
 829         Int_t input = 0;
 830         Int_t ival = ipart;
 831         if(ipart > npart0) { ival -= npart0; input = 1;}
 832         mctag = GetMCAnalysisUtils()->CheckOrigin(ival,GetReader(),input);
 833
 834         //fill ntuple
 835         if(fWriteNtuple) {
 836           fMCEleNtuple->Fill(mctag,aodprimary->Pt(),aodprimary->Phi(),aodprimary->Eta(),aodprimary->Xv(),aodprimary->Yv(),aodprimary->Zv());
 837         }
 838
 839       }
 840     }
 841   } //pure MC kine histos
 842
 843 }
 844
 845 //__________________________________________________________________
 846 Int_t AliAnaElectron::GetBtag(AliAODTrack * tr )
 847 {
 848   //This method uses the Displaced Vertex between electron-hadron
 849   //pairs and the primary vertex to determine whether an electron is
 850   //likely from a B hadron.
 851
 852   Int_t ncls1 = 0;
 853   for(Int_t l = 0; l < 6; l++) if(TESTBIT(tr->GetITSClusterMap(),l)) ncls1++;
 854   if (ncls1 < fITSCut) return 0;
 855
 856   Double_t x[3];
 857   //Note: 02-Sep-2009, Must use GetPosition, not XYZAtDCA
 858   //Bool_t gotit = tr->XYZAtDCA(x);
 859   Bool_t isNotDCA = tr->GetPosition(x);
 860   if(isNotDCA) { printf("##Problem getting impact parameter!\n"); return 0; }
 861
 862   Double_t d1 = TMath::Sqrt(x[0]*x[0] + x[1]*x[1]);
 863   if (TMath::Abs(d1)   > fImpactCut ) return 0;
 864   if (TMath::Abs(x[2]) > fImpactCut ) return 0;
 865   //printf("----- impact parameter: x=%f, y=%f, z=%f -------\n",x[0],x[1], x[2]);
 866
 867   Int_t nvtx1 = 0;
 868   Int_t nvtx2 = 0;
 869   Int_t nvtx3 = 0;
 870
 871   for (Int_t k2 =0; k2 < GetAODCTS()->GetEntriesFast() ; k2++) {
 872     //loop over assoc
 873     AliAODTrack* track2 = (AliAODTrack*) (GetAODCTS()->At(k2));
 874     Int_t id1 = tr->GetID();
 875     Int_t id2 = track2->GetID();
 876     if(id1 == id2) continue;
 877
 878     Int_t ncls2 = 0;
 879     for(Int_t l = 0; l < 6; l++) if(TESTBIT(track2->GetITSClusterMap(),l)) ncls2++;
 880     if (ncls2 < fITSCut) return 0;
 881
 882     if(track2->Pt() < fAssocPtCut) continue;
 883
 884     Double_t dphi = tr->Phi() - track2->Phi();
 885     if(dphi > TMath::Pi()) dphi -= 2*TMath::Pi();
 886     if(dphi < -TMath::Pi()) dphi += 2*TMath::Pi();
 887     Double_t deta = tr->Eta() - track2->Eta();
 888     Double_t dr = sqrt(deta*deta + dphi*dphi);
 889
 890     if(dr > fDrCut) continue;
 891
 892     Double_t sDca1 = ComputeSignDca(tr, track2, 1.0);
 893     if (sDca1 > fSdcaCut) nvtx1++;
 894     Double_t sDca2 = ComputeSignDca(tr, track2, 1.5);
 895     if (sDca2 > fSdcaCut) nvtx2++;
 896     Double_t sDca3 = ComputeSignDca(tr, track2, 1.8);
 897     if (sDca3 > fSdcaCut) nvtx3++;
 898
 899   } //loop over hadrons
 900
 901   if(GetDebug() > 0) {
 902     if (nvtx1>0) printf("result1 of btagging: %d \n",nvtx1);
 903     if (nvtx2>0) printf("result2 of btagging: %d \n",nvtx2);
 904     if (nvtx3>0) printf("result3 of btagging: %d \n",nvtx3);
 905   }
 906
 907   //fill QA histograms
 908   fhBtagCut1->Fill(nvtx1,tr->Pt());
 909   fhBtagCut2->Fill(nvtx2,tr->Pt());
 910   fhBtagCut3->Fill(nvtx3,tr->Pt());
 911
 912   return nvtx2;
 913 }
 914
 915 //__________________________________________________________________
 916 Double_t AliAnaElectron::ComputeSignDca(AliAODTrack *tr, AliAODTrack *tr2 , float masscut)
 917 {
 918   //Compute the signed dca between two tracks
 919   //and return the result
 920
 921   Double_t signDca=-999.;
 922   if(GetDebug() > 2 ) printf(">>ComputeSdca:: track1 %d, track2 %d, masscut %f \n", tr->GetLabel(), tr2->GetLabel(), masscut);
 923
 924   //=====Now calculate DCA between both tracks=======
 925   Double_t massE = 0.000511;
 926   Double_t massK = 0.493677;
 927
 928   Double_t bfield = 5.; //kG
 929   if(GetReader()->GetDataType() != AliCaloTrackReader::kMC) bfield = GetReader()->GetBField();
 930
 931   Double_t vertex[3] = {-999.,-999.,-999}; //vertex
 932   if(GetReader()->GetDataType() != AliCaloTrackReader::kMC) {
 933     GetReader()->GetVertex(vertex); //If only one file, get the vertex from there
 934     //FIXME:  Add a check for whether file 2 is PYTHIA or HIJING
 935     //If PYTHIA, then set the vertex from file 2, if not, use the
 936     //vertex from file 1
 937     if(GetReader()->GetSecondInputAODTree()) GetReader()->GetSecondInputAODVertex(vertex);
 938   }
 939
 940   TVector3 primV(vertex[0],vertex[1],vertex[2]) ;
 941
 942   if(GetDebug() > 5) printf(">>ComputeSdca:: primary vertex = %2.2f,%2.2f,%2.2f \n",vertex[0],vertex[1],vertex[2]) ;
 943
 944   AliExternalTrackParam *param1 = new AliExternalTrackParam(tr);
 945   AliExternalTrackParam *param2 = new AliExternalTrackParam(tr2);
 946
 947   Double_t xplane1 = 0.; Double_t xplane2 = 0.;
 948   Double_t pairdca = param1->GetDCA(param2,bfield,xplane1,xplane2);
 949
 950   Int_t id1 = 0, id2 = 0;
 951   AliESDv0 bvertex(*param1,id1,*param2,id2);
 952   Double_t vx,vy,vz;
 953   bvertex.GetXYZ(vx,vy,vz);
 954
 955   Double_t emom[3];
 956   Double_t hmom[3];
 957   param1->PxPyPz(emom);
 958   param2->PxPyPz(hmom);
 959   TVector3 emomAtB(emom[0],emom[1],emom[2]);
 960   TVector3 hmomAtB(hmom[0],hmom[1],hmom[2]);
 961   TVector3 secvtxpt(vx,vy,vz);
 962   TVector3 decayvector(0,0,0);
 963   decayvector = secvtxpt - primV; //decay vector from PrimVtx
 964   Double_t decaylength = decayvector.Mag();
 965
 966   if(GetDebug() > 0) {
 967     printf(">>ComputeSdca:: mom1=%f, mom2=%f \n", emomAtB.Perp(), hmomAtB.Perp() );
 968     printf(">>ComputeSdca:: pairDCA=%f, length=%f \n", pairdca,decaylength );
 969   }
 970
 971   if (emomAtB.Mag()>0 && pairdca < fPairDcaCut && decaylength < fDecayLenCut ) {
 972     TVector3 sumMom = emomAtB+hmomAtB;
 973     Double_t ener1 = sqrt(pow(emomAtB.Mag(),2) + massE*massE);
 974     Double_t ener2 = sqrt(pow(hmomAtB.Mag(),2) + massK*massK);
 975     Double_t ener3 = sqrt(pow(hmomAtB.Mag(),2) + massE*massE);
 976     Double_t mass = sqrt(pow((ener1+ener2),2) - pow(sumMom.Mag(),2));
 977     Double_t massPhot = sqrt(pow((ener1+ener3),2) - pow(sumMom.Mag(),2));
 978     if (mass > masscut && massPhot > 0.1) signDca = decayvector.Dot(emomAtB)/emomAtB.Mag();
 979     if(GetDebug() > 0) printf("\t>>ComputeSdca:: mass=%f \n", mass);
 980     if(GetDebug() > 0) printf("\t>>ComputeSdca:: sec vtx-signdca :%f\n",signDca);
 981   }
 982
 983   //clean up
 984   delete param1;
 985   delete param2;
 986
 987   return signDca;
 988 }
 989
 990 //__________________________________________________________________
 991 Bool_t AliAnaElectron::IsItPhotonic(const AliAODPWG4Particle* part)
 992 {
 993   //This method checks the opening angle and invariant mass of
 994   //electron pairs to see if they are likely to be photonic electrons
 995
 996   Bool_t itIS = kFALSE;
 997
 998   Double_t massE = 0.000511;
 999   Double_t bfield = 5.; //kG
1000   if(GetReader()->GetDataType() != AliCaloTrackReader::kMC) bfield = GetReader()->GetBField();
1001
1002   Int_t trackId = part->GetTrackLabel(0);
1003   AliAODTrack* track = (AliAODTrack*)GetAODCTS()->At(trackId);
1004   Int_t pdg1 = part->GetPdg();
1005
1006   AliExternalTrackParam *param1 = new AliExternalTrackParam(track);
1007
1008   //Loop on stored AOD electrons and compute the angle differences and Minv
1009   for (Int_t k2 =0; k2 < GetOutputAODBranch()->GetEntriesFast() ; k2++) {
1010     AliAODPWG4Particle* part2 = (AliAODPWG4Particle*) GetOutputAODBranch()->At(k2);
1011     Int_t pdg2 = part2->GetPdg();
1012     if(TMath::Abs(pdg2) != AliCaloPID::kElectron) continue;
1013     if(part2->GetDetector() != fCalorimeter) continue;
1014
1015     //JLK: Check opp. sign pairs only ?
1016     if(pdg1*pdg2 < 0) continue;
1017
1018     //propagate to common vertex and check opening angle
1019     Int_t track2Id = part2->GetTrackLabel(0);
1020     AliExternalTrackParam *param2 = new AliExternalTrackParam((AliAODTrack*)GetAODCTS()->At(track2Id));
1021     Int_t id1 = 0, id2 = 0;
1022     AliESDv0 photonVtx(*param1,id1,*param2,id2);
1023     Double_t vx,vy,vz;
1024     photonVtx.GetXYZ(vx,vy,vz);
1025
1026     Double_t p1mom[3];
1027     Double_t p2mom[3];
1028     param1->PxPyPz(p1mom);
1029     param2->PxPyPz(p2mom);
1030
1031     TVector3 p1momAtB(p1mom[0],p1mom[1],p1mom[2]);
1032     TVector3 p2momAtB(p2mom[0],p2mom[1],p2mom[2]);
1033     TVector3 sumMom = p1momAtB+p2momAtB;
1034
1035     Double_t ener1 = sqrt(pow(p1momAtB.Mag(),2) + massE*massE);
1036     Double_t ener2 = sqrt(pow(p2momAtB.Mag(),2) + massE*massE);
1037     Double_t mass = sqrt(pow((ener1+ener2),2) - pow(sumMom.Mag(),2));
1038
1039     Double_t dphi = p1momAtB.DeltaPhi(p2momAtB);
1040     fh1OpeningAngle->Fill(dphi);
1041     fh1MinvPhoton->Fill(mass);
1042
1043     if(mass < 0.1) {
1044       if(GetDebug() > 0) printf("######PROBABLY A PHOTON\n");
1045       itIS = kTRUE;
1046     }
1047
1048     //clean up
1049     delete param2;
1050
1051   }
1052
1053   delete param1;
1054   return itIS;
1055
1056 }
1057
1058 //__________________________________________________________________
1059 void AliAnaElectron::Print(const Option_t * opt) const
1060 {
1061   //Print some relevant parameters set for the analysis
1062
1063   if(! opt)
1064     return;
1065
1066   printf("**** Print %s %s ****\n", GetName(), GetTitle() ) ;
1067   AliAnaPartCorrBaseClass::Print(" ");
1068
1069   printf("Calorimeter            =     %s\n", fCalorimeter.Data()) ;
1070   printf("pOverE range           =     %f - %f\n",fpOverEmin,fpOverEmax);
1071   printf("residual cut           =     %f\n",fResidualCut);
1072   printf("---Btagging\n");
1073   printf("max IP-cut (e,h)       =     %f\n",fImpactCut);
1074   printf("min ITS-hits           =     %d\n",fITSCut);
1075   printf("max dR (e,h)           =     %f\n",fDrCut);
1076   printf("max pairDCA            =     %f\n",fPairDcaCut);
1077   printf("max decaylength        =     %f\n",fDecayLenCut);
1078   printf("min Associated Pt      =     %f\n",fAssocPtCut);
1079   printf("    \n") ;
1080
1081 }
1082
1083 //________________________________________________________________________
1084 void AliAnaElectron::ReadHistograms(TList* outputList)
1085 {
1086   // Needed when Terminate is executed in distributed environment
1087   // Refill analysis histograms of this class with corresponding
1088   // histograms in output list.
1089
1090   // Histograms of this analsys are kept in the same list as other
1091   // analysis, recover the position of
1092   // the first one and then add the next
1093   Int_t index = outputList->IndexOf(outputList->FindObject(GetAddedHistogramsStringToName()+"fh1pOverE"));
1094
1095   //Read histograms, must be in the same order as in
1096   //GetCreateOutputObject.
1097   fh1pOverE     = (TH1F *) outputList->At(index);
1098   fh1dR         = (TH1F *) outputList->At(index++);
1099   fh2EledEdx    = (TH2F *) outputList->At(index++);
1100   fh2MatchdEdx  = (TH2F *) outputList->At(index++);
1101
1102 }
1103
1104 //__________________________________________________________________
1105 void  AliAnaElectron::Terminate(TList* outputList)
1106 {
1107
1108   //Do some plots to end
1109   //Recover histograms from output histograms list, needed for
1110   //distributed analysis.
1111   //ReadHistograms(outputList);
1112
1113   printf(" AliAnaElectron::Terminate()  *** %s Report: %d outputs\n", GetName(), outputList->GetEntries()) ;
1114
1115 }
1116