TOF/AliTOFClusterFinder.cxx

   1 /***************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log: AliTOFClusterFinder.cxx,v $
  18 Revision 1.31  2007/11/24 14:53:19  zampolli
  19 Status flag implemented as UChar_t
  20
  21 Revision 1.30  2007/10/04 13:08:52  arcelli
  22 updates to comply with AliTOFGeometryV5 becoming AliTOFGeometry
  23
  24 Revision 1.29  2007/10/03 10:42:33  arcelli
  25 updates to handle new AliTOFcluster, inheriting form AliCluster3D
  26
  27 Revision 1.28  2007/05/31 16:06:05  arcelli
  28 move instance of AliRawStream outside loop on DDL
  29
  30 Revision 1.27  2007/05/02 16:31:49  arcelli
  31 Add methods to handle single event reconstruction.  retrieval of Calib
  32 info moved to AliTOFReconstructor ctor, and passed via a pointer to
  33 AliTOFcalib
  34
  35 Revision 1.26  2007/04/30 19:02:24  arcelli
  36 hopefully the last refinements for correct type conversion in calibration
  37
  38 Revision 1.25  2007/04/30 15:22:17  arcelli
  39 Change TOF digit Time, Tot etc to int type
  40
  41 Revision 1.24  2007/04/27 11:19:31  arcelli
  42 updates for the new decoder
  43
  44 Revision 1.23  2007/04/23 16:51:39  decaro
  45 Digits-to-raw_data conversion: correction for a more real description
  46 (A.De Caro, R.Preghenella)
  47
  48 Revision 1.22  2007/04/19 17:26:32  arcelli
  49 Fix a bug (add some debug printout
  50
  51 Revision 1.21  2007/04/18 17:28:12  arcelli
  52 Set the ToT bin width to the one actually used...
  53
  54 Revision 1.20  2007/03/09 09:57:23  arcelli
  55  Remove a forgotten include of Riostrem
  56
  57 Revision 1.19  2007/03/08 15:41:20  arcelli
  58 set uncorrected times when filling RecPoints
  59
  60 Revision 1.18  2007/03/06 16:31:20  arcelli
  61 Add Uncorrected TOF Time signal
  62
  63 Revision 1.17  2007/02/28 18:09:11  arcelli
  64 Add protection against failed retrieval of the CDB cal object,
  65 now Reconstruction exits with AliFatal
  66
  67 Revision 1.16  2007/02/20 15:57:00  decaro
  68 Raw data update: to read the TOF raw data defined in UNPACKED mode
  69
  70
  71 Revision 0.03  2005/07/28 A. De Caro
  72          Implement public method
  73          Raw2Digits(Int_t, AliRawReader *)
  74          to convert digits from raw data in MC digits
  75          (temporary solution)
  76
  77 Revision 0.02  2005/07/27 A. De Caro
  78          Implement public method
  79          Digits2RecPoint(Int_t)
  80          to convert digits in clusters
  81
  82 Revision 0.02  2005/07/26 A. De Caro
  83          Implement private methods
  84          InsertCluster(AliTOFcluster *)
  85          FindClusterIndex(Double_t)
  86          originally implemented in AliTOFtracker
  87          by S. Arcelli and C. Zampolli
  88
  89 Revision 0.01  2005/07/25 A. De Caro
  90          Implement public methods
  91          Digits2RecPoint(AliRawReader *, TTree *)
  92          Digits2RecPoint(Int_t, AliRawReader *)
  93          to convert raw data in clusters
  94  */
  95
  96 ////////////////////////////////////////////////////////////////
  97 //                                                            //
  98 //         Class for TOF cluster finder                       //
  99 //                                                            //
 100 // Starting from Raw Data, create rec points,                 //
 101 //                         fill TreeR for TOF,                //
 102 //                         write TOF.RecPoints.root file      //
 103 //                                                            //
 104 ////////////////////////////////////////////////////////////////
 105
 106 #include "Riostream.h"
 107
 108 #include "TClonesArray.h"
 109 #include "TStopwatch.h"
 110 #include "TTree.h"
 111 //#include <TGeoManager.h>
 112 #include <TGeoMatrix.h>
 113 //#include <TGeoPhysicalNode.h>
 114
 115 #include "AliDAQ.h"
 116 #include "AliLoader.h"
 117 #include "AliLog.h"
 118 #include "AliRawReader.h"
 119 #include "AliRunLoader.h"
 120 //#include "AliAlignObj.h"
 121 #include <AliGeomManager.h>
 122
 123 #include "AliTOFcalib.h"
 124 #include "AliTOFChannelOnlineArray.h"
 125 #include "AliTOFChannelOnlineStatusArray.h"
 126 #include "AliTOFChannelOffline.h"
 127 #include "AliTOFClusterFinder.h"
 128 #include "AliTOFcluster.h"
 129 #include "AliTOFdigit.h"
 130 #include "AliTOFGeometry.h"
 131 #include "AliTOFrawData.h"
 132 //#include "AliTOFRawStream.h"
 133
 134 //extern TFile *gFile;
 135
 136 ClassImp(AliTOFClusterFinder)
 137
 138 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliTOFcalib *calib):
 139   fRunLoader(0),
 140   fTOFLoader(0),
 141   fTreeD(0),
 142   fTreeR(0),
 143   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 144   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 145   fNumberOfTofClusters(0),
 146   fVerbose(0),
 147   fDecoderVersion(0),
 148   fTOFcalib(calib),
 149   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 150 {
 151 //
 152 // Constructor
 153 //
 154
 155 }
 156
 157 //______________________________________________________________________________
 158
 159 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliRunLoader* runLoader, AliTOFcalib *calib):
 160   fRunLoader(runLoader),
 161   fTOFLoader(runLoader->GetLoader("TOFLoader")),
 162   fTreeD(0),
 163   fTreeR(0),
 164   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 165   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 166   fNumberOfTofClusters(0),
 167   fVerbose(0),
 168   fDecoderVersion(0),
 169   fTOFcalib(calib),
 170   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 171 {
 172 //
 173 // Constructor
 174 //
 175
 176 }
 177
 178 //------------------------------------------------------------------------
 179 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source)
 180   :TObject(source),
 181   fRunLoader(0),
 182   fTOFLoader(0),
 183   fTreeD(0),
 184   fTreeR(0),
 185   fDigits(source.fDigits),
 186   fRecPoints(source.fRecPoints),
 187   fNumberOfTofClusters(0),
 188   fVerbose(0),
 189   fDecoderVersion(source.fDecoderVersion),
 190   fTOFcalib(source.fTOFcalib),
 191   fTOFRawStream(source.fTOFRawStream)
 192 {
 193   // copy constructor
 194 }
 195
 196 //------------------------------------------------------------------------
 197 AliTOFClusterFinder& AliTOFClusterFinder::operator=(const AliTOFClusterFinder &source)
 198 {
 199   // ass. op.
 200
 201   if (this == &source)
 202     return *this;
 203
 204   TObject::operator=(source);
 205   fDigits=source.fDigits;
 206   fRecPoints=source.fRecPoints;
 207   fVerbose=source.fVerbose;
 208   fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
 209   fTOFcalib=source.fTOFcalib;
 210   fTOFRawStream=source.fTOFRawStream;
 211   return *this;
 212
 213 }
 214 //______________________________________________________________________________
 215
 216 AliTOFClusterFinder::~AliTOFClusterFinder()
 217 {
 218
 219   //
 220   // Destructor
 221   //
 222
 223   if (fDigits)
 224     {
 225       fDigits->Delete();
 226       delete fDigits;
 227       fDigits=0;
 228     }
 229   if (fRecPoints)
 230     {
 231       fRecPoints->Delete();
 232       delete fRecPoints;
 233       fRecPoints=0;
 234     }
 235
 236 }
 237 //______________________________________________________________________________
 238
 239 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
 240 {
 241   //
 242   // Converts digits to recpoints for TOF
 243   //
 244
 245   TStopwatch stopwatch;
 246   stopwatch.Start();
 247
 248   Int_t inholes = 0;
 249
 250   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 251
 252   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 253   if (fTreeD == 0x0)
 254     {
 255       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 256     }
 257
 258   TBranch *branch = fTreeD->GetBranch("TOF");
 259   if (!branch) {
 260     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 261     return;
 262   }
 263
 264   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 265   staticdigits.Clear();
 266   TClonesArray *digits =&staticdigits;
 267   branch->SetAddress(&digits);
 268
 269   ResetRecpoint();
 270
 271   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 272   if (fTreeR == 0x0)
 273     {
 274       fTOFLoader->MakeTree("R");
 275       fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 276     }
 277
 278   Int_t bufsize = 32000;
 279   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 280
 281   fTreeD->GetEvent(0);
 282   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 283   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 284
 285   Int_t ii;
 286   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 287   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 288   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 289   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 290     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 291     dig[0]=d->GetSector();
 292     dig[1]=d->GetPlate();
 293     dig[2]=d->GetStrip();
 294     dig[3]=d->GetPadz();
 295     dig[4]=d->GetPadx();
 296
 297     /* check valid index */
 298     if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
 299
 300     // Do not reconstruct anything in the holes
 301     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 302       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 303         inholes++;
 304         continue;
 305       }
 306     }
 307
 308     AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 309
 310     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 311     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 312     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 313     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 314     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 315     Double_t posClus[3];
 316     Double_t covClus[6];
 317     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 318     GetClusterPars(dig, posClus,covClus);
 319     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 320     InsertCluster(tofCluster);
 321
 322   }
 323
 324   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 325
 326   CalibrateRecPoint();
 327   FillRecPoint();
 328
 329   fTreeR->Fill();
 330   ResetRecpoint();
 331
 332   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 333   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 334
 335   AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 336                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 337   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 338
 339 }
 340
 341 //______________________________________________________________________________
 342
 343 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(TTree* digitsTree, TTree* clusterTree)
 344 {
 345   //
 346   // Converts digits to recpoints for TOF
 347   //
 348
 349   TStopwatch stopwatch;
 350   stopwatch.Start();
 351
 352   Int_t inholes = 0;
 353
 354   ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 355
 356   if (digitsTree == 0x0)
 357     {
 358       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 359     }
 360
 361   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("TOF");
 362   if (!branch) {
 363     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 364     return;
 365   }
 366
 367   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 368   staticdigits.Clear();
 369   TClonesArray *digits = & staticdigits;
 370   branch->SetAddress(&digits);
 371
 372   ResetRecpoint();
 373
 374   fTreeR=clusterTree;
 375   Int_t bufsize = 32000;
 376   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 377
 378   digitsTree->GetEvent(0);
 379   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 380   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 381
 382   Int_t ii;
 383   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 384   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 385   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 386   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 387     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 388     dig[0]=d->GetSector();
 389     dig[1]=d->GetPlate();
 390     dig[2]=d->GetStrip();
 391     dig[3]=d->GetPadz();
 392     dig[4]=d->GetPadx();
 393
 394     /* check valid index */
 395     if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
 396
 397     // Do not reconstruct anything in the holes
 398     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 399       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 400         inholes++;
 401         continue;
 402       }
 403     }
 404
 405     //    AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 406
 407     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 408     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 409     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 410     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 411     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 412
 413     Double_t posClus[3];
 414     Double_t covClus[6];
 415     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 416     GetClusterPars(dig,posClus,covClus);
 417     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 418     InsertCluster(tofCluster);
 419
 420   }
 421
 422   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 423
 424   CalibrateRecPoint();
 425   FillRecPoint();
 426
 427   clusterTree->Fill();
 428   ResetRecpoint();
 429
 430   AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 431                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 432   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 433
 434 }
 435 //______________________________________________________________________________
 436
 437 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
 438                                            TTree *clustersTree)
 439 {
 440   //
 441   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 442   //
 443
 444   TStopwatch stopwatch;
 445   stopwatch.Start();
 446
 447   Int_t inholes = 0;
 448
 449   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 450
 451   ResetRecpoint();
 452
 453   Int_t bufsize = 32000;
 454   clustersTree->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 455
 456   TClonesArray * clonesRawData;
 457
 458   Int_t dummy = -1;
 459
 460   Int_t detectorIndex[5];
 461   Int_t parTOF[5];
 462
 463   ofstream ftxt;
 464   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 465
 466   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 467   fTOFRawStream.Clear();
 468   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 469
 470   Int_t indexDDL = 0;
 471   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 472
 473     rawReader->Reset();
 474     if (fDecoderVersion) {
 475       AliInfo("Using New Decoder \n");
 476       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 477     }
 478     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 479
 480     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 481
 482     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 483
 484       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 485
 486       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 487       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 488
 489       if (fVerbose==2) {
 490         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 491         else         ftxt << " " << indexDDL;
 492         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 493         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 494         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 495         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 496         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 497         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 498       }
 499
 500       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 501                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 502       dummy = detectorIndex[3];
 503       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 504       detectorIndex[4] = dummy;
 505
 506       if (fVerbose==2) {
 507         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 508         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 509         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 510         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 511         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 512         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 513         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 514         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 515       }
 516
 517     /* check valid index */
 518     if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
 519
 520       // Do not reconstruct anything in the holes
 521       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 522         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 523           inholes++;
 524           continue;
 525         }
 526       }
 527
 528       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); //TDC
 529       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 530       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); //ADC==TOF
 531       parTOF[3] = -1;//raw data: no track of undecalib sim time
 532       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // RAW time
 533       Double_t posClus[3];
 534       Double_t covClus[6];
 535       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 536       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 537       Bool_t status=kTRUE;
 538       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 539       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 540       InsertCluster(tofCluster);
 541
 542       if (fVerbose==2) {
 543         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 544         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 545         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 546         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 547         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 548         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 549         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 550       }
 551
 552     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 553
 554     clonesRawData->Clear();
 555
 556   } // closed loop on DDL index
 557
 558   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 559
 560   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 561
 562   CalibrateRecPoint();
 563   FillRecPoint();
 564
 565   clustersTree->Fill();
 566
 567   ResetRecpoint();
 568
 569   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 570                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 571   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 572
 573 }
 574 //______________________________________________________________________________
 575
 576 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 577 {
 578   //
 579   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 580   //
 581
 582   TStopwatch stopwatch;
 583   stopwatch.Start();
 584
 585   Int_t inholes = 0;
 586
 587   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 588
 589   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 590
 591   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 592
 593   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 594
 595   if (fTreeR == 0x0){
 596     fTOFLoader->MakeTree("R");
 597     fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 598   }
 599
 600   Int_t bufsize = 32000;
 601   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 602
 603   TClonesArray * clonesRawData;
 604
 605   Int_t dummy = -1;
 606
 607   Int_t detectorIndex[5] = {-1, -1, -1, -1, -1};
 608   Int_t parTOF[5];
 609   ofstream ftxt;
 610   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 611
 612   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 613   fTOFRawStream.Clear();
 614   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 615
 616   Int_t indexDDL = 0;
 617   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 618
 619     rawReader->Reset();
 620     if (fDecoderVersion) {
 621       AliInfo("Using New Decoder \n");
 622       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 623     }
 624     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 625
 626     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 627
 628     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 629
 630       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 631
 632       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 633       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 634
 635       if (fVerbose==2) {
 636         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 637         else         ftxt << " " << indexDDL;
 638         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 639         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 640         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 641         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 642         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 643         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 644       }
 645
 646       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 647                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 648       dummy = detectorIndex[3];
 649       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 650       detectorIndex[4] = dummy;
 651
 652       if (fVerbose==2) {
 653         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 654         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 655         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 656         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 657         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 658         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 659         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 660         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 661       }
 662
 663     /* check valid index */
 664     if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
 665
 666       // Do not reconstruct anything in the holes
 667       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 668         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 669           inholes++;
 670           continue;
 671         }
 672       }
 673
 674       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); // TDC
 675       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 676       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); // raw data have ADC=TOT
 677       parTOF[3] = -1; //raw data: no track of the undecalib sim time
 678       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // Raw time == TDC
 679       Double_t posClus[3];
 680       Double_t covClus[6];
 681       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 682       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 683       Bool_t status=kTRUE;
 684       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 685       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 686       InsertCluster(tofCluster);
 687
 688       if (fVerbose==2) {
 689         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 690         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 691         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 692         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 693         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 694         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 695         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 696       }
 697
 698     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 699
 700     clonesRawData->Clear();
 701
 702   } // closed loop on DDL index
 703
 704   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 705
 706   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 707
 708   CalibrateRecPoint();
 709   FillRecPoint();
 710
 711   fTreeR->Fill();
 712   ResetRecpoint();
 713
 714   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 715   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 716
 717   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 718                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 719   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 720
 721 }
 722 //______________________________________________________________________________
 723
 724 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 725 {
 726   //
 727   // Converts RAW data to MC digits for TOF
 728   //
 729   //             (temporary solution)
 730   //
 731
 732   TStopwatch stopwatch;
 733   stopwatch.Start();
 734
 735   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 736
 737   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 738
 739   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 740   if (fTreeD)
 741     {
 742     AliInfo("TreeD re-creation");
 743     fTreeD = 0x0;
 744     fTOFLoader->MakeTree("D");
 745     fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 746     }
 747
 748   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 749   Int_t bufsize = 32000;
 750   fTreeD->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 751
 752   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 753
 754   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 755
 756   TClonesArray * clonesRawData;
 757
 758   Int_t dummy = -1;
 759
 760   Int_t detectorIndex[5];
 761   Int_t digit[4];
 762
 763   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 764   fTOFRawStream.Clear();
 765   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 766
 767   Int_t indexDDL = 0;
 768   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 769
 770     rawReader->Reset();
 771     if (fDecoderVersion) {
 772       AliInfo("Using New Decoder \n");
 773       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 774     }
 775     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 776
 777     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 778
 779     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 780
 781       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 782
 783       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 784       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 785
 786       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 787                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 788       dummy = detectorIndex[3];
 789       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 790       detectorIndex[4] = dummy;
 791
 792       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 793       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 794       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 795       digit[3] = -1;
 796
 797       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 798
 799       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 800       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 801       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 802
 803     } // while loop
 804
 805     clonesRawData->Clear();
 806
 807   } // DDL Loop
 808
 809   fTreeD->Fill();
 810
 811   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 812   fTOFLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 813
 814   delete tofDigits;
 815
 816   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.2fs C:%.2fs",
 817                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 818
 819 }
 820
 821 //______________________________________________________________________________
 822
 823 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(AliRawReader *rawReader, TTree* digitsTree)
 824 {
 825   //
 826   // Converts RAW data to MC digits for TOF for the current event
 827   //
 828   //
 829
 830   TStopwatch stopwatch;
 831   stopwatch.Start();
 832
 833   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 834
 835   if (!digitsTree)
 836     {
 837     AliError("No input digits Tree");
 838     return;
 839     }
 840
 841   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 842   Int_t bufsize = 32000;
 843   digitsTree->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 844
 845   TClonesArray * clonesRawData;
 846
 847   Int_t dummy = -1;
 848
 849   Int_t detectorIndex[5];
 850   Int_t digit[4];
 851
 852   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 853   fTOFRawStream.Clear();
 854   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 855
 856   Int_t indexDDL = 0;
 857   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 858
 859     rawReader->Reset();
 860     if (fDecoderVersion) {
 861       AliInfo("Using New Decoder \n");
 862       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 863     }
 864     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 865
 866     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 867
 868     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 869
 870       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 871
 872       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 873       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 874
 875       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 876                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 877       dummy = detectorIndex[3];
 878       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 879       detectorIndex[4] = dummy;
 880
 881       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 882       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 883       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 884       digit[3] = -1;
 885
 886       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 887
 888       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 889       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 890       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 891
 892     } // while loop
 893
 894     clonesRawData->Clear();
 895
 896   } // DDL Loop
 897
 898   digitsTree->Fill();
 899
 900   delete tofDigits;
 901
 902   AliDebug(1, Form("Got %d digits: ", fDigits->GetEntries()));
 903   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and fill TOF digit tree : R:%.2fs C:%.2fs",
 904                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 905
 906 }
 907 //______________________________________________________________________________
 908
 909 Int_t AliTOFClusterFinder::InsertCluster(AliTOFcluster *tofCluster) {
 910   //---------------------------------------------------------------------------//
 911   // This function adds a TOF cluster to the array of TOF clusters sorted in Z //
 912   //---------------------------------------------------------------------------//
 913   if (fNumberOfTofClusters==kTofMaxCluster) {
 914     AliError("Too many clusters !");
 915     return 1;
 916   }
 917
 918   if (fNumberOfTofClusters==0) {
 919     fTofClusters[fNumberOfTofClusters++] = tofCluster;
 920     return 0;
 921   }
 922
 923   Int_t ii = FindClusterIndex(tofCluster->GetZ());
 924   memmove(fTofClusters+ii+1 ,fTofClusters+ii,(fNumberOfTofClusters-ii)*sizeof(AliTOFcluster*));
 925   fTofClusters[ii] = tofCluster;
 926   fNumberOfTofClusters++;
 927
 928   return 0;
 929
 930 }
 931 //_________________________________________________________________________
 932
 933 Int_t AliTOFClusterFinder::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 934   //--------------------------------------------------------------------
 935   // This function returns the index of the nearest cluster in z
 936   //--------------------------------------------------------------------
 937   if (fNumberOfTofClusters==0) return 0;
 938   if (z <= fTofClusters[0]->GetZ()) return 0;
 939   if (z > fTofClusters[fNumberOfTofClusters-1]->GetZ()) return fNumberOfTofClusters;
 940   Int_t b = 0, e = fNumberOfTofClusters-1, m = (b+e)/2;
 941   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 942     if (z > fTofClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 943     else e=m;
 944   }
 945
 946   return m;
 947
 948 }
 949 //_________________________________________________________________________
 950
 951 void AliTOFClusterFinder::FillRecPoint()
 952 {
 953   //
 954   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
 955   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
 956   // i.e. fRecPoints.
 957   //
 958
 959   Int_t ii, jj;
 960
 961   Int_t detectorIndex[5];
 962   Int_t parTOF[5];
 963   Int_t trackLabels[3];
 964   Int_t digitIndex = -1;
 965   Bool_t status=kTRUE;
 966
 967   TClonesArray &lRecPoints = *fRecPoints;
 968
 969   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
 970
 971     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
 972     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
 973     for(jj=0; jj<3; jj++) trackLabels[jj] = fTofClusters[ii]->GetLabel(jj);
 974     parTOF[0] = fTofClusters[ii]->GetTDC(); // TDC
 975     parTOF[1] = fTofClusters[ii]->GetToT(); // TOT
 976     parTOF[2] = fTofClusters[ii]->GetADC(); // ADC=TOT
 977     parTOF[3] = fTofClusters[ii]->GetTDCND(); // TDCND
 978     parTOF[4] = fTofClusters[ii]->GetTDCRAW();//RAW
 979     status=fTofClusters[ii]->GetStatus();
 980     Double_t posClus[3];
 981     Double_t covClus[6];
 982     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 983     GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 984     new(lRecPoints[ii]) AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],trackLabels,detectorIndex, parTOF,status,digitIndex);
 985
 986     AliDebug(2, Form(" %4d  %4d  %f %f %f  %f %f %f %f %f %f  %3d %3d %3d  %2d %1d %2d %1d %2d  %4d %3d %3d %4d %4d  %1d  %4d",
 987                      ii, volIdClus, posClus[0], posClus[1], posClus[2],
 988                      fTofClusters[ii]->GetSigmaX2(),
 989                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXY(),
 990                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXZ(),
 991                      fTofClusters[ii]->GetSigmaY2(),
 992                      fTofClusters[ii]->GetSigmaYZ(),
 993                      fTofClusters[ii]->GetSigmaZ2(),
 994                      trackLabels[0], trackLabels[1], trackLabels[2],
 995                      detectorIndex[0], detectorIndex[1], detectorIndex[2], detectorIndex[3], detectorIndex[4],
 996                      parTOF[0], parTOF[1], parTOF[2], parTOF[3], parTOF[4],
 997                      status, digitIndex));
 998
 999   } // loop on clusters
1000
1001 }
1002
1003 //_________________________________________________________________________
1004 void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
1005 {
1006   //
1007   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
1008   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
1009   // i.e. fRecPoints.
1010   //
1011
1012   Int_t ii, jj;
1013
1014   Int_t detectorIndex[5];
1015   Int_t digitIndex = -1;
1016   Double_t tToT;
1017   Double_t timeCorr;
1018   Int_t   tdcCorr;
1019   AliInfo(" Calibrating TOF Clusters: ")
1020
1021   AliTOFChannelOnlineArray *calDelay = fTOFcalib->GetTOFOnlineDelay();
1022   AliTOFChannelOnlineStatusArray *calStatus = fTOFcalib->GetTOFOnlineStatus();
1023   TObjArray *calTOFArrayOffline = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOffline();
1024   TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
1025   AliInfo(Form(" validity = %s",validity.Data()));
1026   Int_t calibration = -1;
1027   if (validity.CompareTo("valid")==0) {
1028     AliInfo(" Using offline calibration parameters");
1029     calibration = 1;
1030   }
1031   else {
1032     AliInfo(" Using online calibration parameters");
1033     calibration = 0 ;
1034   }
1035   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
1036     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
1037     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
1038
1039     Int_t index = AliTOFGeometry::GetIndex(detectorIndex);
1040
1041     UChar_t statusPulser=calStatus->GetPulserStatus(index);
1042     UChar_t statusNoise=calStatus->GetNoiseStatus(index);
1043     UChar_t statusHW=calStatus->GetHWStatus(index);
1044     UChar_t status=calStatus->GetStatus(index);
1045
1046     //check the status, also unknown is fine!!!!!!!
1047
1048     AliDebug(2, Form(" Status for channel %d = %d",index, (Int_t)status));
1049     if((statusPulser & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)||(statusNoise & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)||(statusHW & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)){
1050       AliDebug(2, Form(" Bad Status for channel %d",index));
1051       fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE); //odd convention, to avoid conflict with calibration objects currently in the db (temporary solution).
1052     }
1053     else {
1054       AliDebug(2, Form(" Good Status for channel %d",index));
1055     }
1056     // Get Rough channel online equalization
1057     Double_t roughDelay=(Double_t)calDelay->GetDelay(index);  // in ns
1058     AliDebug(2,Form(" channel delay (ns) = %f", roughDelay));
1059     // Get Refined channel offline calibration parameters
1060     if (calibration ==1){
1061       AliTOFChannelOffline * calChannelOffline = (AliTOFChannelOffline*)calTOFArrayOffline->At(index);
1062       Double_t par[6];
1063       for (Int_t j = 0; j<6; j++){
1064         par[j]=(Double_t)calChannelOffline->GetSlewPar(j);
1065      }
1066       AliDebug(2,Form(" Calib Pars = %f, %f, %f, %f, %f, %f ",par[0],par[1],par[2],par[3],par[4],par[5]));
1067       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (counts) = %d , %d", fTofClusters[ii]->GetToT(),fTofClusters[ii]->GetTDC()));
1068       tToT = (Double_t)(fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth());
1069       tToT*=1.E-3; //ToT in ns
1070       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,tToT));
1071       timeCorr=par[0]+par[1]*tToT+par[2]*tToT*tToT+par[3]*tToT*tToT*tToT+par[4]*tToT*tToT*tToT*tToT+par[5]*tToT*tToT*tToT*tToT*tToT; // the time correction (ns)
1072     }
1073     else {
1074       timeCorr = roughDelay; // correction in ns
1075     }
1076     AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth()));
1077     AliDebug(2,Form(" The time correction (ns) = %f", timeCorr));
1078     timeCorr=(Double_t)(fTofClusters[ii]->GetTDC())*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3-timeCorr;//redefine the time
1079     timeCorr*=1.E3;
1080     AliDebug(2,Form(" The channel time, corr (ps)= %e",timeCorr ));
1081     tdcCorr=(Int_t)(timeCorr/AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
1082     fTofClusters[ii]->SetTDC(tdcCorr);
1083   } // loop on clusters
1084
1085 }
1086 //______________________________________________________________________________
1087
1088 void AliTOFClusterFinder::ResetRecpoint()
1089 {
1090   //
1091   // Clear the list of reconstructed points
1092   //
1093
1094   fNumberOfTofClusters = 0;
1095   if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
1096
1097 }
1098 //______________________________________________________________________________
1099
1100 void AliTOFClusterFinder::Load()
1101 {
1102   //
1103   // Load TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1104   //
1105
1106   fTOFLoader->LoadDigits("READ");
1107   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1108
1109 }
1110 //______________________________________________________________________________
1111
1112 void AliTOFClusterFinder::LoadClusters()
1113 {
1114   //
1115   // Load TOF.RecPoints.root file
1116   //
1117
1118   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1119
1120 }
1121 //______________________________________________________________________________
1122
1123 void AliTOFClusterFinder::UnLoad()
1124 {
1125   //
1126   // Unload TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1127   //
1128
1129   fTOFLoader->UnloadDigits();
1130   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1131
1132 }
1133 //______________________________________________________________________________
1134
1135 void AliTOFClusterFinder::UnLoadClusters()
1136 {
1137   //
1138   // Unload TOF.RecPoints.root file
1139   //
1140
1141   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1142
1143 }
1144 //-------------------------------------------------------------------------
1145 UShort_t AliTOFClusterFinder::GetClusterVolIndex(Int_t *ind) const {
1146
1147   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1148   //
1149   // Detector numbering scheme
1150   Int_t nSector = 18;
1151   Int_t nPlate  = 5;
1152   Int_t nStripA = 15;
1153   Int_t nStripB = 19;
1154   Int_t nStripC = 19;
1155
1156   Int_t isector =ind[0];
1157   if (isector >= nSector)
1158     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
1159   Int_t iplate = ind[1];
1160   if (iplate >= nPlate)
1161     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1162   Int_t istrip = ind[2];
1163
1164   Int_t stripOffset = 0;
1165   switch (iplate) {
1166   case 0:
1167     stripOffset = 0;
1168     break;
1169   case 1:
1170     stripOffset = nStripC;
1171     break;
1172   case 2:
1173     stripOffset = nStripC+nStripB;
1174     break;
1175   case 3:
1176     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
1177     break;
1178   case 4:
1179     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
1180     break;
1181   default:
1182     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1183     break;
1184   };
1185
1186   Int_t index= (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
1187                stripOffset +
1188                istrip;
1189
1190   UShort_t volIndex = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,index);
1191   return volIndex;
1192 }
1193 //
1194 //-------------------------------------------------------------------------
1195 void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov) const {
1196
1197   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1198   //
1199   UShort_t volIndex = GetClusterVolIndex(ind);
1200   //
1201   //
1202   //we now go in the system of the strip: determine the local coordinates
1203   //
1204   //
1205   // 47---------------------------------------------------0  ^ z
1206   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 1 |
1207   // -----------------------------------------------------   | y going outwards
1208   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 0 |  par[0]=0;
1209
1210   // -----------------------------------------------------   |
1211   // x <-----------------------------------------------------
1212
1213   /*
1214   Float_t localX = (ind[4]-23.5)*AliTOFGeometry::XPad();
1215   Float_t localY = 0;
1216   Float_t localZ = (ind[3]- 0.5)*AliTOFGeometry::ZPad();
1217   */
1218   Float_t localX = (ind[4]-AliTOFGeometry::NpadX()/2)*AliTOFGeometry::XPad()+AliTOFGeometry::XPad()/2.;
1219   Float_t localY = 0;
1220   Float_t localZ = (ind[3]-AliTOFGeometry::NpadZ()/2)*AliTOFGeometry::ZPad()+AliTOFGeometry::ZPad()/2.;
1221   //move to the tracking ref system
1222
1223   Double_t lpos[3];
1224   lpos[0] = localX;
1225   lpos[1] = localY;
1226   lpos[2] = localZ;
1227
1228   const TGeoHMatrix *l2t= AliGeomManager::GetTracking2LocalMatrix(volIndex);
1229   // Get The position in the track ref system
1230   Double_t tpos[3];
1231   l2t->MasterToLocal(lpos,tpos);
1232   pos[0] = tpos[0];
1233   pos[1] = tpos[1];
1234   pos[2] = tpos[2];
1235
1236   //Get The cluster covariance in the track ref system
1237   Double_t lcov[9];
1238
1239   //cluster covariance in the local system:
1240   // sx2   0   0
1241   // 0     0   0
1242   // 0     0   sz2
1243
1244   lcov[0] = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
1245   lcov[1] = 0;
1246   lcov[2] = 0;
1247   lcov[3] = 0;
1248   lcov[4] = 0;
1249   lcov[5] = 0;
1250   lcov[6] = 0;
1251   lcov[7] = 0;
1252   lcov[8] = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
1253
1254   //cluster covariance in the tracking system:
1255   TGeoHMatrix m;
1256   m.SetRotation(lcov);
1257   m.Multiply(l2t);
1258   m.MultiplyLeft(&l2t->Inverse());
1259   Double_t *tcov = m.GetRotationMatrix();
1260   cov[0] = tcov[0]; cov[1] = tcov[1]; cov[2] = tcov[2];
1261   cov[3] = tcov[4]; cov[4] = tcov[5];
1262   cov[5] = tcov[8];
1263
1264   return;
1265
1266 }