TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //
  21 //           Implementation of the TPC seed class
  22 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  23 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  24 //-----------------------------------------------------------------
  25 #include "TClonesArray.h"
  26 #include "TGraphErrors.h"
  27 #include "AliTPCseed.h"
  28 #include "AliTPCReconstructor.h"
  29 #include "AliTPCClusterParam.h"
  30 #include "AliTPCCalPad.h"
  31 #include "AliTPCCalROC.h"
  32 #include "AliTPCcalibDB.h"
  33 #include "AliTPCParam.h"
  34 #include "AliMathBase.h"
  35 #include "AliTPCTransform.h"
  36 #include "AliSplineFit.h"
  37 #include "AliCDBManager.h"
  38 #include "AliTPCcalibDButil.h"
  39
  40
  41 ClassImp(AliTPCseed)
  42
  43
  44
  45 AliTPCseed::AliTPCseed():
  46   AliTPCtrack(),
  47   fEsd(0x0),
  48   fClusterOwner(kFALSE),
  49   fRow(0),
  50   fSector(-1),
  51   fRelativeSector(-1),
  52   fCurrentSigmaY2(1e10),
  53   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  54   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
  55   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
  56   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
  57   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
  58   //
  59   fErrorY2(1e10),
  60   fErrorZ2(1e10),
  61   fCurrentCluster(0x0),
  62   fCurrentClusterIndex1(-1),
  63   fInDead(kFALSE),
  64   fIsSeeding(kFALSE),
  65   fNoCluster(0),
  66   fSort(0),
  67   fBSigned(kFALSE),
  68   fSeedType(0),
  69   fSeed1(-1),
  70   fSeed2(-1),
  71   fMAngular(0),
  72   fCircular(0)
  73 {
  74   //
  75   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  76   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  77   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  78   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  79   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  80     fDEDX[i] = 0.;
  81     fSDEDX[i] = 1e10;
  82     fNCDEDX[i] = 0;
  83     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
  84   }
  85   fDEDX[4] = 0;
  86   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  87 }
  88
  89 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  90   AliTPCtrack(s),
  91   fEsd(0x0),
  92   fClusterOwner(clusterOwner),
  93   fRow(0),
  94   fSector(-1),
  95   fRelativeSector(-1),
  96   fCurrentSigmaY2(-1),
  97   fCurrentSigmaZ2(-1),
  98   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
  99   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 100   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 101   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 102   fErrorY2(1e10),
 103   fErrorZ2(1e10),
 104   fCurrentCluster(0x0),
 105   fCurrentClusterIndex1(-1),
 106   fInDead(kFALSE),
 107   fIsSeeding(kFALSE),
 108   fNoCluster(0),
 109   fSort(0),
 110   fBSigned(kFALSE),
 111   fSeedType(0),
 112   fSeed1(-1),
 113   fSeed2(-1),
 114   fMAngular(0),
 115   fCircular(0)
 116 {
 117   //---------------------
 118   // dummy copy constructor
 119   //-------------------------
 120   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 121     fClusterPointer[i]=0;
 122     if (fClusterOwner){
 123       if (s.fClusterPointer[i])
 124         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 125     }else{
 126       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 127     }
 128     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 129   }
 130   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 131   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 132   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 133     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 134     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 135     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 136     fNCDEDXInclThres[i] = s.fNCDEDXInclThres[i];
 137   }
 138   fDEDX[4] = s.fDEDX[4];
 139   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 140
 141 }
 142
 143
 144 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 145   AliTPCtrack(t),
 146   fEsd(0x0),
 147   fClusterOwner(kFALSE),
 148   fRow(0),
 149   fSector(-1),
 150   fRelativeSector(-1),
 151   fCurrentSigmaY2(-1),
 152   fCurrentSigmaZ2(-1),
 153   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 154   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 155   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 156   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 157   fErrorY2(1e10),
 158   fErrorZ2(1e10),
 159   fCurrentCluster(0x0),
 160   fCurrentClusterIndex1(-1),
 161   fInDead(kFALSE),
 162   fIsSeeding(kFALSE),
 163   fNoCluster(0),
 164   fSort(0),
 165   fBSigned(kFALSE),
 166   fSeedType(0),
 167   fSeed1(-1),
 168   fSeed2(-1),
 169   fMAngular(0),
 170   fCircular(0)
 171 {
 172   //
 173   // Constructor from AliTPCtrack
 174   //
 175   fFirstPoint =0;
 176   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 177   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 178     fClusterPointer[i] = 0;
 179     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 180     if (index>=-1){
 181       SetClusterIndex2(i,index);
 182     }
 183     else{
 184       SetClusterIndex2(i,-3);
 185     }
 186   }
 187   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 188     fDEDX[i] = 0.;
 189     fSDEDX[i] = 1e10;
 190     fNCDEDX[i] = 0;
 191     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
 192   }
 193     fDEDX[4] = 0;
 194   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 195 }
 196
 197 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 198                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 199   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 200   fEsd(0x0),
 201   fClusterOwner(kFALSE),
 202   fRow(0),
 203   fSector(-1),
 204   fRelativeSector(-1),
 205   fCurrentSigmaY2(-1),
 206   fCurrentSigmaZ2(-1),
 207   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 208   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 209   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 210   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 211   fErrorY2(1e10),
 212   fErrorZ2(1e10),
 213   fCurrentCluster(0x0),
 214   fCurrentClusterIndex1(-1),
 215   fInDead(kFALSE),
 216   fIsSeeding(kFALSE),
 217   fNoCluster(0),
 218   fSort(0),
 219   fBSigned(kFALSE),
 220   fSeedType(0),
 221   fSeed1(-1),
 222   fSeed2(-1),
 223   fMAngular(0),
 224   fCircular(0)
 225 {
 226   //
 227   // Constructor
 228   //
 229   fFirstPoint =0;
 230   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 231   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 232   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 233   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 234     fDEDX[i] = 0.;
 235     fSDEDX[i] = 1e10;
 236     fNCDEDX[i] = 0;
 237     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
 238   }
 239     fDEDX[4] = 0;
 240   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 241 }
 242
 243 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 244   //
 245   // destructor
 246   fNoCluster =0;
 247   if (fClusterOwner){
 248     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 249       delete fClusterPointer[icluster];
 250     }
 251   }
 252
 253 }
 254 //_________________________________________________
 255 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
 256 {
 257   //
 258   // assignment operator
 259   //
 260   if(this!=&param){
 261     AliTPCtrack::operator=(param);
 262     fEsd =param.fEsd;
 263     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
 264     if (!fClusterOwner) for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i];
 265     else                for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(param.fClusterPointer[i]));
 266     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
 267     // but deleted in the dtor... strange...
 268     fRow            = param.fRow;
 269     fSector         = param.fSector;
 270     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
 271     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
 272     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
 273     fErrorY2        = param.fErrorY2;
 274     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
 275     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
 276     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1;
 277     fInDead         = param.fInDead;
 278     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
 279     fNoCluster      = param.fNoCluster;
 280     fSort           = param.fSort;
 281     fBSigned        = param.fBSigned;
 282     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
 283       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
 284       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
 285       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
 286       fNCDEDXInclThres[i] = param.fNCDEDXInclThres[i];
 287     }
 288       fDEDX[4]   = param.fDEDX[4];
 289     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
 290
 291     fSeedType = param.fSeedType;
 292     fSeed1    = param.fSeed1;
 293     fSeed2    = param.fSeed2;
 294     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
 295     fMAngular = param.fMAngular;
 296     fCircular = param.fCircular;
 297     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
 298   }
 299   return (*this);
 300 }
 301 //____________________________________________________
 302 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 303 {
 304   //
 305   //
 306   return &fTrackPoints[i];
 307 }
 308
 309
 310
 311 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 312 {
 313   //
 314   //
 315   // return cluster for n rows bellow first point
 316   Int_t nfoundable = 1;
 317   Int_t nfound      = 1;
 318   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 319     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 320     if (index!=-1) nfoundable++;
 321     if (index>0) nfound++;
 322   }
 323   if (nfoundable<n) return 0;
 324   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 325
 326 }
 327
 328
 329 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 330 {
 331   // get cluster stat.  on given region
 332   //
 333   found       = 0;
 334   foundable   = 0;
 335   shared      =0;
 336   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 337     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 338     if (index!=-1) foundable++;
 339     if (index&0x8000) continue;
 340     if (fClusterPointer[i]) {
 341       found++;
 342     }
 343     else
 344       continue;
 345
 346     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 347       shared++;
 348       continue;
 349     }
 350     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 351     //
 352     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 353       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 354         shared++;
 355         continue;
 356       }
 357     }
 358     if ( fClusterPointer[i+1]){
 359       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 360         shared++;
 361         continue;
 362       }
 363     }
 364
 365   }
 366   //if (shared>found){
 367     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 368   //}
 369 }
 370
 371
 372
 373
 374
 375 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 376 {
 377   //
 378   //
 379   SetNumberOfClusters(0);
 380   fNFoundable = 0;
 381   SetChi2(0);
 382   ResetCovariance(10.);
 383   /*
 384   if (fTrackPoints){
 385     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 386       delete [] fTrackPoints[i];
 387     }
 388     delete fTrackPoints;
 389     fTrackPoints =0;
 390   }
 391   */
 392
 393   if (all){
 394     for (Int_t i=200;i--;) SetClusterIndex2(i,-3);
 395     if (!fClusterOwner) for (Int_t i=160;i--;) fClusterPointer[i]=0;
 396     else                for (Int_t i=160;i--;) {delete fClusterPointer[i]; fClusterPointer[i]=0;}
 397   }
 398
 399 }
 400
 401
 402 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 403 {
 404
 405   //------------------------------------------------------------------
 406   //This function makes a track forget its history :)
 407   //------------------------------------------------------------------
 408   if (factor<=0) {
 409     ResetCovariance(10.);
 410     return;
 411   }
 412   ResetCovariance(factor);
 413
 414   SetNumberOfClusters(0);
 415   fNFoundable =0;
 416   SetChi2(0);
 417   fRemoval = 0;
 418   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 419   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 420   fNoCluster     = 0;
 421   //fFirstPoint = 160;
 422   //fLastPoint  = 0;
 423 }
 424
 425
 426
 427
 428 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 429 {
 430   //-----------------------------------------------------------------
 431   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 432   // doesn't change internal state of the track
 433   //-----------------------------------------------------------------
 434
 435   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 436
 437   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 438     return 0;
 439   }
 440
 441   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 442   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
 443   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
 444
 445   y = GetY();
 446   z = GetZ();
 447   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 448   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 449
 450   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 451   Double_t dz = 0;
 452   //
 453   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 454   /*
 455   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 456     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 457   }else{
 458     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 459   }
 460   */
 461   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 462   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 463   //
 464   y+=dy;
 465   z+=dz;
 466
 467
 468   return 1;
 469 }
 470
 471
 472 //_____________________________________________________________________________
 473 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 474 {
 475   //-----------------------------------------------------------------
 476   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 477   //-----------------------------------------------------------------
 478   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 479   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 480
 481   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
 482   if (TMath::Abs(dx)>0){
 483     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
 484     Float_t dy = dx*ty;
 485     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
 486     p[0] = c->GetY()-dy;
 487     p[1] = c->GetZ()-dz;
 488   }
 489   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 490 }
 491
 492 //_________________________________________________________________________________________
 493
 494
 495 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 496   //-----------------------------------------------------------------
 497   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 498   //-----------------------------------------------------------------
 499   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 500
 501   if (fSort == 0){
 502     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 503     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 504     Double_t z2 = t->GetZ();
 505     Double_t z1 = GetZ();
 506     if (z2>z1) return 1;
 507     if (z2<z1) return -1;
 508     return 0;
 509   }
 510   else {
 511     Float_t f2 =1;
 512     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
 513     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 514
 515     Float_t f1 =1;
 516     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
 517
 518     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 519
 520     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 521     else return +1;
 522   }
 523 }
 524
 525
 526
 527
 528 //_____________________________________________________________________________
 529 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
 530 {
 531   //-----------------------------------------------------------------
 532   // This function associates a cluster with this track.
 533   //-----------------------------------------------------------------
 534   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 535   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
 536
 537   AliCluster cl(*c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
 538   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
 539   if (TMath::Abs(dx)>0){
 540     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
 541     Float_t dy = dx*ty;
 542     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
 543     cl.SetY(c->GetY()-dy);
 544     cl.SetZ(c->GetZ()-dz);
 545   }
 546
 547   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
 548
 549   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
 550     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 551     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 552     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
 553     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
 554   }
 555   //
 556   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();
 557   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();
 558   if (fCurrentSigmaY2>0){
 559     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;
 560     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;
 561   }
 562
 563
 564   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
 565   return kTRUE;
 566 }
 567
 568
 569
 570 //_____________________________________________________________________________
 571 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t /* onlyused */) {
 572   //-----------------------------------------------------------------
 573   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 574   //-----------------------------------------------------------------
 575   // CookdEdxAnalytical(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Int_t returnVal)
 576   AliTPCParam *param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
 577
 578   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
 579   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
 580   Int_t row2 = row1+param->GetNRowUp2();
 581   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
 582   Int_t useTot = 0;
 583   if (recoParam) useTot = (recoParam->GetUseTotCharge())? 0:1;
 584   //
 585   //
 586   //
 587   fDEDX[0]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,i1  ,i2,   0);
 588   fDEDX[1]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,0   ,row0, 0);
 589   fDEDX[2]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row1, 0);
 590   fDEDX[3]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row1,row2, 0);
 591   fDEDX[4]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row2, 0); // full OROC truncated mean
 592   //
 593   fSDEDX[0]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,i1  ,i2,   1);
 594   fSDEDX[1]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,0   ,row0, 1);
 595   fSDEDX[2]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row1, 1);
 596   fSDEDX[3]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row1,row2, 1);
 597   //
 598   fNCDEDX[0]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, i1  , i2));
 599   fNCDEDX[1]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, 0   , row0));
 600   fNCDEDX[2]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, row0, row1));
 601   fNCDEDX[3]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, row1, row2));
 602   //
 603   fNCDEDXInclThres[0]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, i1  , i2));
 604   fNCDEDXInclThres[1]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, 0   , row0));
 605   fNCDEDXInclThres[2]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, row0, row1));
 606   fNCDEDXInclThres[3]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, row1, row2));
 607   //
 608   SetdEdx(fDEDX[0]);
 609   return fDEDX[0];
 610
 611 //  return CookdEdxNorm(low,up,0,i1,i2,1,0,2);
 612
 613
 614 //   Float_t amp[200];
 615 //   Float_t angular[200];
 616 //   Float_t weight[200];
 617 //   Int_t index[200];
 618 //   //Int_t nc = 0;
 619 //   Float_t meanlog = 100.;
 620
 621 //   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 622 //   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 623 //   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 624 //   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 625 //   //
 626 //   //
 627 //   fNShared =0;
 628
 629 //   Float_t gainGG = 1;
 630 //   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
 631 //     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000.;  //relative gas gain
 632 //   }
 633
 634
 635 //   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 636 //     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 637 //       {
 638 //      Int_t clindex = fIndex[i];
 639 //      if (clindex<0||clindex&0x8000) continue;
 640
 641 //      //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 642 //      AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 643 //      //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 644 //      //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 645 //      //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 646
 647 //      if (point==0) continue;
 648 //      AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 649 //      if (cl==0) continue;
 650 //      if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 651 //      if (cl->IsUsed(11)) {
 652 //        fNShared++;
 653 //        continue;
 654 //      }
 655 //      Int_t   type   = cl->GetType();
 656 //      //if (point->fIsShared){
 657 //      //  fNShared++;
 658 //      //  continue;
 659 //      //}
 660 //      //if (pointm)
 661 //      //  if (pointm->fIsShared) continue;
 662 //      //if (pointp)
 663 //      //  if (pointp->fIsShared) continue;
 664
 665 //      if (type<0) continue;
 666 //      //if (type>10) continue;
 667 //      //if (point->GetErrY()==0) continue;
 668 //      //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 669
 670 //      //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 671 //      //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 672 //      //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 673
 674
 675 //      //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 676 //      if (cl->GetMax()<5) continue;
 677 //      Float_t angley = point->GetAngleY();
 678 //      Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 679
 680 //      Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 681 //      Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 682 //      /*
 683 //      Float_t ns = 1.;
 684 //      if (pointm){
 685 //        rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 686 //        rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 687 //        ns+=1.;
 688 //      }
 689 //      if (pointp){
 690 //        rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 691 //        rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 692 //        ns+=1.;
 693 //      }
 694 //      rsigmay/=ns;
 695 //      rsigmaz/=ns;
 696 //      */
 697
 698 //      Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 699
 700 //      Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 701 //      if (i>64){
 702 //        //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 703 //        ampc = 1.*cl->GetMax();
 704 //        //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 705 //        //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 706 //        //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 707 //        // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 708 //        //Float_t dz =
 709 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 710 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 711 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 712 //        //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 713 //        //ampc               *=zfactor;
 714 //      }
 715 //      else{
 716 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 717 //        ampc = 1.0*cl->GetMax();
 718 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 719 //        //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 720 //        // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 721 //        //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 722 //        //Float_t dz =
 723 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 724
 725 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 726 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 727 //        //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 728 //        //ampc               *=zfactor;
 729
 730 //      }
 731 //      ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 732 //      //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 733 //      Float_t w      =  1.;
 734 //      //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 735 //      //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 736 //      if (i<64) {
 737 //        ampc /= 0.6;
 738 //        //ampc /= (1+0.0008*z);
 739 //      } else
 740 //        if (i>128){
 741 //          ampc /=1.5;
 742 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
 743 //        }else{
 744 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
 745 //        }
 746
 747 //      if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 748 //        // w*= 2.;
 749
 750 //        continue;
 751 //      }
 752 //      if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 753 //      amp[nc[of]]        = ampc;
 754 //      amp[nc[of]]       /=gainGG;
 755 //      angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 756 //      weight[nc[of]]     = w;
 757 //      nc[of]++;
 758 //       }
 759
 760 //     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 761 //     Float_t sumamp=0;
 762 //     Float_t sumamp2=0;
 763 //     Float_t sumw=0;
 764 //     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 765 //     meanlog = 50;
 766 //     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 767 //       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 768 //       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 769 //       //
 770 //       sumw    += weight[index[i]];
 771 //       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 772 //       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 773 //       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 774 //     }
 775 //     if (sumw<1){
 776 //       SetdEdx(0);
 777 //     }
 778 //     else {
 779 //       norm[of] /= sumw;
 780 //       mean[of]  = sumamp/sumw;
 781 //       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 782 //       if (sigma[of]>0.1)
 783 //      sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 784 //       else
 785 //      sigma[of] = 1000;
 786
 787 //     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 788 //     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 789 //     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 790 //     }
 791 //   }
 792
 793 //   Float_t dedx =0;
 794 //   fSdEdx =0;
 795 //   fMAngular =0;
 796 //   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 797 //   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 798
 799
 800 //   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 801 //   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 802
 803 //   Int_t norm2 = 0;
 804 //   Int_t norm3 = 0;
 805 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 806 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 807 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
 808 //       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 809 //       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 810 //       norm2     += nc[i];
 811 //       norm3     += nc[i]-2;
 812 //     }
 813 //     fDEDX[i]  = mean[i];
 814 //     fSDEDX[i] = sigma[i];
 815 //     fNCDEDX[i]= nc[i];
 816 //   }
 817
 818 //   if (norm3>0){
 819 //     dedx   /=norm2;
 820 //     fSdEdx /=norm3;
 821 //     fMAngular/=norm2;
 822 //   }
 823 //   else{
 824 //     SetdEdx(0);
 825 //     return 0;
 826 //   }
 827 //   //  Float_t dedx1 =dedx;
 828 //   /*
 829 //   dedx =0;
 830 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 831 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 832 //       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 833 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
 834 //     }
 835 //     fDEDX[i]  = mean[i];
 836 //   }
 837 //   dedx /= norm2;
 838 //   */
 839
 840
 841 //   SetdEdx(dedx);
 842 //   return dedx;
 843 }
 844
 845 void AliTPCseed::CookPID()
 846 {
 847   //
 848   // cook PID information according dEdx
 849   //
 850   Double_t fRange = 10.;
 851   Double_t fRes   = 0.1;
 852   Double_t fMIP   = 47.;
 853   //
 854   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 855   Double_t sumr =0;
 856   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 857     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 858     Double_t mom=GetP();
 859     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 860     Double_t bethe=AliMathBase::BetheBlochAleph(mom/mass);
 861     Double_t sigma=fRes*bethe;
 862     if (sigma>0.001){
 863       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 864         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 865         sumr+=fTPCr[j];
 866         continue;
 867       }
 868       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 869       sumr+=fTPCr[j];
 870     }
 871     else{
 872       fTPCr[j]=1.;
 873       sumr+=fTPCr[j];
 874     }
 875   }
 876   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 877     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 878   }
 879 }
 880
 881 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
 882 //-----------------------------------------------------------------
 883 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
 884 //-----------------------------------------------------------------
 885   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
 886     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
 887     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
 888     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
 889     Double_t r2=TMath::Sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
 890     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
 891 }
 892
 893
 894
 895 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Bool_t shapeNorm,Int_t posNorm, Int_t padNorm, Int_t returnVal){
 896
 897   //
 898   // calculates dedx using the cluster
 899   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
 900   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster
 901   //           //2- max no corr 3- total+ correction
 902   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
 903   // shapeNorm - kTRUE  -taken from OCDB
 904   //
 905   // posNorm   - usage of pos normalization
 906   // padNorm   - pad type normalization
 907   // returnVal - 0 return mean
 908   //           - 1 return RMS
 909   //           - 2 return number of clusters
 910   //
 911   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
 912   //
 913   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
 914   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
 915   if (!parcl)  return 0;
 916   if (!param) return 0;
 917   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
 918   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
 919
 920   Float_t amp[160];
 921   Int_t   indexes[160];
 922   Int_t   ncl=0;
 923   //
 924   //
 925   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
 926   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
 927   Float_t corrShape   = 1;  // correction due angular effect, diffusion and electron attachment
 928   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
 929   Float_t corrPadType = 1;  // pad type correction - if padNorm enabled
 930   Float_t corrNorm    = 1;  // normalization factor - set Q to channel 50
 931   //
 932   //
 933   //
 934   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
 935     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
 936   }
 937
 938   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
 939   const Float_t kedgey =3.;
 940   //
 941   //
 942   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
 943     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
 944     if (!cluster) continue;
 945     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
 946     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
 947     Int_t  ipad= 0;
 948     if (irow>=row0) ipad=1;
 949     if (irow>=row1) ipad=2;
 950     //
 951     //
 952     //
 953     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
 954     if (gainMap) {
 955       //
 956       // Get gainPad - pad by pad calibration
 957       //
 958       Float_t factor = 1;
 959       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
 960       if (irow < row0) { // IROC
 961         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
 962       } else {         // OROC
 963         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
 964       }
 965       if (factor>0.5) gainPad=factor;
 966     }
 967     //
 968     //do position and angular normalization
 969     //
 970     if (shapeNorm){
 971       if (type<=1){
 972         //
 973         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
 974         Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
 975         Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
 976
 977         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
 978         corrShape  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
 979       }
 980     }
 981
 982     if (posNorm>0){
 983       //
 984       // Do position normalization - relative distance to
 985       // center of pad- time bin
 986       // Work in progress
 987       //      corrPos = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),
 988       //                                cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
 989       //                                cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),
 990       //                                cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
 991       // scaled response function
 992       Float_t yres0 = parcl->GetRMS0(0,ipad,0,0)/param->GetPadPitchWidth(cluster->GetDetector());
 993       Float_t zres0 = parcl->GetRMS0(1,ipad,0,0)/param->GetZWidth();
 994       //
 995
 996       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
 997       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
 998       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
 999
1000       if (type==1) corrPos =
1001         parcl->QmaxCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1002                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,0.4);
1003       if (type==0) corrPos =
1004         parcl->QtotCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1005                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,cluster->GetQ(),2.5,0.4);
1006       if (posNorm==3){
1007         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1008         Double_t signtgl = (cluster->GetZ()*point->GetAngleZ()>0)? 1:-1;
1009         Double_t p2 = TMath::Abs(TMath::Sin(TMath::ATan(ty)));
1010         Float_t corrHis = parcl->QnormHis(ipad,type,dr,p2,TMath::Abs(point->GetAngleZ())*signtgl);
1011         if (corrHis>0) corrPos*=corrHis;
1012       }
1013
1014     }
1015
1016     if (padNorm==1){
1017       //taken from OCDB
1018       if (type==0 && parcl->QpadTnorm()) corrPadType = (*parcl->QpadTnorm())[ipad];
1019       if (type==1 && parcl->QpadMnorm()) corrPadType = (*parcl->QpadMnorm())[ipad];
1020
1021     }
1022     if (padNorm==2){
1023       corrPadType  =param->GetPadPitchLength(cluster->GetDetector(),cluster->GetRow());
1024       //use hardwired - temp fix
1025       if (type==0) corrNorm=3.;
1026       if (type==1) corrNorm=1.;
1027     }
1028     //
1029     amp[ncl]=charge;
1030     amp[ncl]/=gainGG;
1031     amp[ncl]/=gainPad;
1032     amp[ncl]/=corrShape;
1033     amp[ncl]/=corrPadType;
1034     amp[ncl]/=corrPos;
1035     amp[ncl]/=corrNorm;
1036     //
1037     ncl++;
1038   }
1039
1040   if (type>3) return ncl;
1041   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1042
1043   if (ncl<10) return 0;
1044
1045   Float_t suma=0;
1046   Float_t suma2=0;
1047   Float_t sumn=0;
1048   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1049   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1050   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1051     suma+=amp[indexes[icl]];
1052     suma2+=amp[indexes[icl]]*amp[indexes[icl]];
1053     sumn++;
1054   }
1055   Float_t mean =suma/sumn;
1056   Float_t rms  =TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1057   //
1058   // do time-dependent correction for pressure and temperature variations
1059   UInt_t runNumber = 1;
1060   Float_t corrTimeGain = 1;
1061   AliTPCTransform * trans = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform();
1062   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
1063   if (trans && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) {
1064     runNumber = trans->GetCurrentRunNumber();
1065     //AliTPCcalibDB::Instance()->SetRun(runNumber);
1066     TObjArray * timeGainSplines = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTimeGainSplinesRun(runNumber);
1067     if (timeGainSplines) {
1068       UInt_t time = trans->GetCurrentTimeStamp();
1069       AliSplineFit * fitMIP = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(0);
1070       AliSplineFit * fitFPcosmic = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(1);
1071       if (fitMIP) {
1072         corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitMIP, time);/*fitMIP->Eval(time);*/
1073       } else {
1074         if (fitFPcosmic) corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitFPcosmic, time);/*fitFPcosmic->Eval(time);*/
1075       }
1076     }
1077   }
1078   mean /= corrTimeGain;
1079   rms /= corrTimeGain;
1080   //
1081   if (returnVal==1) return rms;
1082   if (returnVal==2) return ncl;
1083   return mean;
1084 }
1085
1086 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxAnalytical(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Int_t returnVal, Int_t rowThres, Int_t mode){
1087
1088   //
1089   // calculates dedx using the cluster
1090   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
1091   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster
1092   //           //2- max no corr 3- total+ correction
1093   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
1094   //
1095   // posNorm   - usage of pos normalization
1096   // returnVal - 0  return mean
1097   //           - 1  return RMS
1098   //           - 2  return number of clusters
1099   //           - 3  ratio
1100   //           - 4  mean upper half
1101   //           - 5  mean  - lower half
1102   //           - 6  third moment
1103   // mode      - 0 - linear
1104   //           - 1 - logatithmic
1105   // rowThres  - number of rows before and after given pad row to check for clusters below threshold
1106   //
1107   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
1108   //
1109   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1110   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1111   if (!parcl)  return 0;
1112   if (!param) return 0;
1113   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
1114   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
1115
1116   Float_t amp[160];
1117   Int_t   indexes[160];
1118   Int_t   ncl=0;
1119   Int_t   nclBelowThr = 0; // counts number of clusters below threshold
1120   //
1121   //
1122   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
1123   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
1124   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
1125   //
1126   //
1127   //
1128   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
1129     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
1130   }
1131   //
1132   // extract time-dependent correction for pressure and temperature variations
1133   //
1134   UInt_t runNumber = 1;
1135   Float_t corrTimeGain = 1;
1136   TObjArray * timeGainSplines = 0x0;
1137   TGraphErrors * grPadEqual = 0x0;
1138   //
1139   AliTPCTransform * trans = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform();
1140   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
1141   //
1142   if (recoParam->GetNeighborRowsDedx() == 0) rowThres = 0;
1143   //
1144   if (trans) {
1145       runNumber = trans->GetCurrentRunNumber();
1146       //AliTPCcalibDB::Instance()->SetRun(runNumber);
1147       timeGainSplines = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTimeGainSplinesRun(runNumber);
1148       if (timeGainSplines && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) {
1149         UInt_t time = trans->GetCurrentTimeStamp();
1150         AliSplineFit * fitMIP = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(0);
1151         AliSplineFit * fitFPcosmic = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(1);
1152         if (fitMIP) {
1153           corrTimeGain =  AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitMIP, time); /*fitMIP->Eval(time);*/
1154         } else {
1155           if (fitFPcosmic) corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitFPcosmic, time); /*fitFPcosmic->Eval(time); */
1156         }
1157         //
1158         if (type==1) grPadEqual = (TGraphErrors * ) timeGainSplines->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQMAX_PADREGIONGAIN_BEAM_ALL");
1159         if (type==0) grPadEqual = (TGraphErrors * ) timeGainSplines->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQTOT_PADREGIONGAIN_BEAM_ALL");
1160       }
1161   }
1162
1163   const Float_t kClusterShapeCut = 1.5; // IMPPRTANT TO DO: move value to AliTPCRecoParam
1164   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1165   const Float_t kedgey =3.;
1166   //
1167   //
1168   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
1169     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1170     if (!cluster && irow > 1 && irow < 157) {
1171       Bool_t isClBefore = kFALSE;
1172       Bool_t isClAfter  = kFALSE;
1173       for(Int_t ithres = 1; ithres <= rowThres; ithres++) {
1174         AliTPCclusterMI * clusterBefore = GetClusterPointer(irow - ithres);
1175         if (clusterBefore) isClBefore = kTRUE;
1176         AliTPCclusterMI * clusterAfter  = GetClusterPointer(irow + ithres);
1177         if (clusterAfter) isClAfter = kTRUE;
1178       }
1179       if (isClBefore && isClAfter) nclBelowThr++;
1180     }
1181     if (!cluster) continue;
1182     //
1183     //
1184     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1185     //
1186     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1187     if (point==0) continue;
1188     Float_t rsigmay = TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1189     if (rsigmay > kClusterShapeCut) continue;
1190     //
1191     if (cluster->IsUsed(11)) continue; // remove shared clusters for PbPb
1192     //
1193     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
1194     Int_t  ipad= 0;
1195     if (irow>=row0) ipad=1;
1196     if (irow>=row1) ipad=2;
1197     //
1198     //
1199     //
1200     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
1201     if (gainMap) {
1202       //
1203       // Get gainPad - pad by pad calibration
1204       //
1205       Float_t factor = 1;
1206       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
1207       if (irow < row0) { // IROC
1208         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1209       } else {         // OROC
1210         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1211       }
1212       if (factor>0.3) gainPad=factor;
1213     }
1214     //
1215     // Do position normalization - relative distance to
1216     // center of pad- time bin
1217
1218     Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1219     Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
1220     Float_t yres0 = parcl->GetRMS0(0,ipad,0,0)/param->GetPadPitchWidth(cluster->GetDetector());
1221     Float_t zres0 = parcl->GetRMS0(1,ipad,0,0)/param->GetZWidth();
1222
1223     yres0 *=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,0);
1224     zres0 *=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,1);
1225     Float_t effLength=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,4)*0.5;
1226     Float_t effDiff  =(parcl->GetQnormCorr(ipad, type,2)+parcl->GetQnormCorr(ipad, type,3))*0.5;
1227     //
1228     if (type==1) {
1229       corrPos = parcl->GetQnormCorr(ipad, type,5)*
1230         parcl->QmaxCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1231                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,effLength,effDiff);
1232       Float_t drm   = 0.5-TMath::Abs(cluster->GetZ()/250.);
1233       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,0)*drm);
1234       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,1)*ty*ty);
1235       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,2)*tz*tz);
1236       //
1237     }
1238     if (type==0) {
1239       corrPos = parcl->GetQnormCorr(ipad, type,5)*
1240         parcl->QtotCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1241                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,cluster->GetQ(),2.5,effLength,effDiff);
1242
1243       Float_t drm   = 0.5-TMath::Abs(cluster->GetZ()/250.);
1244       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,0)*drm);
1245       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,1)*ty*ty);
1246       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,2)*tz*tz);
1247       //
1248     }
1249     //
1250     // pad region equalization outside of cluster param
1251     //
1252     Float_t gainEqualPadRegion = 1;
1253     if (grPadEqual) gainEqualPadRegion = grPadEqual->Eval(ipad);
1254     //
1255     amp[ncl]=charge;
1256     amp[ncl]/=gainGG;
1257     amp[ncl]/=gainPad;
1258     amp[ncl]/=corrPos;
1259     amp[ncl]/=gainEqualPadRegion;
1260     //
1261     ncl++;
1262   }
1263
1264   if (type==2) return ncl;
1265   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1266   //
1267   if (ncl<10) return 0;
1268   //
1269   Double_t * ampWithBelow = new Double_t[ncl + nclBelowThr];
1270   for(Int_t iCl = 0; iCl < ncl + nclBelowThr; iCl++) {
1271     if (iCl < nclBelowThr) {
1272       ampWithBelow[iCl] = amp[indexes[0]];
1273     } else {
1274       ampWithBelow[iCl] = amp[indexes[iCl - nclBelowThr]];
1275     }
1276   }
1277   //printf("DEBUG: %i shit %f", nclBelowThr, amp[indexes[0]]);
1278   //
1279   Float_t suma=0;
1280   Float_t suma2=0;
1281   Float_t suma3=0;
1282   Float_t sumaS=0;
1283   Float_t sumn=0;
1284   // upper,and lower part statistic
1285   Float_t sumL=0, sumL2=0, sumLN=0;
1286   Float_t sumD=0, sumD2=0, sumDN=0;
1287
1288   Int_t icl0=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*low);
1289   Int_t icl1=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*up);
1290   Int_t iclm=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*(low +(up+low)*0.5));
1291   //
1292   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1293     if (ampWithBelow[icl]<0.1) continue;
1294     Double_t camp=ampWithBelow[icl]/corrTimeGain;
1295     if (mode==1) camp= TMath::Log(camp);
1296     if (icl<icl1){
1297       suma+=camp;
1298       suma2+=camp*camp;
1299       suma3+=camp*camp*camp;
1300       sumaS+=TMath::Power(TMath::Abs(camp),1./3.);
1301       sumn++;
1302     }
1303     if (icl>iclm){
1304       sumL+=camp;
1305       sumL2+=camp*camp;
1306       sumLN++;
1307       }
1308     if (icl<=iclm){
1309       sumD+=camp;
1310       sumD2+=camp*camp;
1311       sumDN++;
1312     }
1313   }
1314   //
1315   Float_t mean = 0;
1316   Float_t meanL = 0;
1317   Float_t meanD = 0;           // lower half mean
1318   if (sumn > 1e-30)   mean =suma/sumn;
1319   if (sumLN > 1e-30)  meanL =sumL/sumLN;
1320   if (sumDN > 1e-30)  meanD =(sumD/sumDN);
1321   /*
1322   Float_t mean =suma/sumn;
1323   Float_t meanL = sumL/sumLN;
1324   Float_t meanD =(sumD/sumDN);           // lower half mean
1325   */
1326
1327   Float_t rms = 0;
1328   Float_t mean2=0;
1329   Float_t mean3=0;
1330   Float_t meanS=0;
1331
1332   if(sumn>0){
1333     rms = TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1334     mean2=suma2/sumn;
1335     mean3=suma3/sumn;
1336     meanS=sumaS/sumn;
1337   }
1338
1339   if (mean2>0) mean2=TMath::Power(TMath::Abs(mean2),1./2.);
1340   if (mean3>0) mean3=TMath::Power(TMath::Abs(mean3),1./3.);
1341   if (meanS>0) meanS=TMath::Power(TMath::Abs(meanS),3.);
1342   //
1343   if (mode==1) mean=TMath::Exp(mean);
1344   if (mode==1) meanL=TMath::Exp(meanL);  // upper truncation
1345   if (mode==1) meanD=TMath::Exp(meanD);  // lower truncation
1346   //
1347   delete [] ampWithBelow;
1348
1349
1350   //
1351   if (returnVal==1) return rms;
1352   if (returnVal==2) return ncl;
1353   if (returnVal==3) return Double_t(nclBelowThr)/Double_t(nclBelowThr+ncl);
1354   if (returnVal==4) return meanL;
1355   if (returnVal==5) return meanD;
1356   if (returnVal==6) return mean2;
1357   if (returnVal==7) return mean3;
1358   if (returnVal==8) return meanS;
1359   return mean;
1360 }
1361
1362
1363
1364
1365 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1366   //
1367   //
1368   //
1369  //-----------------------------------------------------------------
1370   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1371   //-----------------------------------------------------------------
1372   Float_t means=0;
1373   Float_t meanc=0;
1374   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1375     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1376     if (point==0) continue;
1377
1378     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1379     if (cl==0) continue;
1380
1381     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1382     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1383     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1384     if (type==0) means+=rsigma;
1385     if (type==1) means+=rsigmay;
1386     if (type==2) means+=rsigmaz;
1387     meanc++;
1388   }
1389   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1390   return mean;
1391 }
1392
1393
1394
1395 Int_t  AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed *seed, AliExternalTrackParam * parin, AliExternalTrackParam * parout){
1396   //
1397   // Refit the track
1398   // return value - number of used clusters
1399   //
1400   //
1401   const Int_t kMinNcl =10;
1402   AliTPCseed *track=new AliTPCseed(*seed);
1403   Int_t sector=-1;
1404   // reset covariance
1405   //
1406   Double_t covar[15];
1407   for (Int_t i=0;i<15;i++) covar[i]=0;
1408   covar[0]=10.*10.;
1409   covar[2]=10.*10.;
1410   covar[5]=10.*10./(64.*64.);
1411   covar[9]=10.*10./(64.*64.);
1412   covar[14]=1*1;
1413   //
1414
1415   Float_t xmin=1000, xmax=-10000;
1416   Int_t imin=158, imax=0;
1417   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
1418     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1419     if (!c) continue;
1420     if (sector<0) sector = c->GetDetector();
1421     if (c->GetX()<xmin) xmin=c->GetX();
1422     if (c->GetX()>xmax) xmax=c->GetX();
1423     if (i<imin) imin=i;
1424     if (i>imax) imax=i;
1425   }
1426   if(imax-imin<kMinNcl) {
1427     delete track;
1428     return 0 ;
1429   }
1430   // Not succes to rotate
1431   if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1432     delete track;
1433     return 0;
1434   }
1435   //
1436   //
1437   // fit from inner to outer row
1438   //
1439   AliExternalTrackParam paramIn;
1440   AliExternalTrackParam paramOut;
1441   Bool_t isOK=kTRUE;
1442   Int_t ncl=0;
1443   //
1444   //
1445   //
1446   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1447     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1448     if (!c) continue;
1449     //    if (RejectCluster(c,track)) continue;
1450     sector = (c->GetDetector()%18);
1451     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1452       //continue;
1453     }
1454     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1455     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1456     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1457       isOK=kFALSE;
1458     }
1459     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1460   }
1461   if (!isOK) { delete track; return 0;}
1462   track->AddCovariance(covar);
1463   //
1464   //
1465   //
1466   for (Int_t i=imax; i>=imin; i--){
1467     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1468     if (!c) continue;
1469     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1470     sector = (c->GetDetector()%18);
1471     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1472       //continue;
1473     }
1474     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1475     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1476     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1477       isOK=kFALSE;
1478     }
1479     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1480   }
1481   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1482   paramIn = *track;
1483   track->AddCovariance(covar);
1484   //
1485   //
1486   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1487     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1488     if (!c) continue;
1489     sector = (c->GetDetector()%18);
1490     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1491       //continue;
1492     }
1493     ncl++;
1494     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1495     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1496     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1497     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1498       isOK=kFALSE;
1499     }
1500     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1501   }
1502   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1503   paramOut=*track;
1504   //
1505   //
1506   //
1507   if (parin) (*parin)=paramIn;
1508   if (parout) (*parout)=paramOut;
1509   delete track;
1510   return ncl;
1511 }
1512
1513
1514
1515 Bool_t AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed* /*seed*/, Bool_t /*out*/){
1516   //
1517   //
1518   //
1519   return kFALSE;
1520 }
1521
1522
1523
1524
1525
1526
1527 void  AliTPCseed::GetError(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param,
1528                                   Double_t& erry, Double_t &errz)
1529 {
1530   //
1531   // Get cluster error at given position
1532   //
1533   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1534   Double_t tany,tanz;
1535   Double_t snp1=param->GetSnp();
1536   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1537   //
1538   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1539   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1540   //
1541   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1542   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1543     padSize = 1;                              // medium pads
1544     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1545   }
1546
1547   erry  = clusterParam->GetError0Par( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany) );
1548   errz  = clusterParam->GetError0Par( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) );
1549 }
1550
1551
1552 void  AliTPCseed::GetShape(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param,
1553                                   Double_t& rmsy, Double_t &rmsz)
1554 {
1555   //
1556   // Get cluster error at given position
1557   //
1558   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1559   Double_t tany,tanz;
1560   Double_t snp1=param->GetSnp();
1561   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1562   //
1563   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1564   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1565   //
1566   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1567   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1568     padSize = 1;                              // medium pads
1569     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1570   }
1571
1572   rmsy  = clusterParam->GetRMSQ( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany), TMath::Abs(cluster->GetMax()) );
1573   rmsz  = clusterParam->GetRMSQ( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) ,TMath::Abs(cluster->GetMax()));
1574 }
1575
1576
1577
1578 Double_t AliTPCseed::GetQCorrGeom(Float_t ty, Float_t tz){
1579   //Geoetrical
1580   //ty    - tangent in local y direction
1581   //tz    - tangent
1582   //
1583   Float_t norm=TMath::Sqrt(1+ty*ty+tz*tz);
1584   return norm;
1585 }
1586
1587 Double_t AliTPCseed::GetQCorrShape(Int_t ipad, Int_t type,Float_t z, Float_t ty, Float_t tz, Float_t /*q*/, Float_t /*thr*/){
1588   //
1589   // Q normalization
1590   //
1591   // return value =  Q Normalization factor
1592   // Normalization - 1 - shape factor part for full drift
1593   //                 1 - electron attachment for 0 drift
1594
1595   // Input parameters:
1596   //
1597   // ipad - 0 short pad
1598   //        1 medium pad
1599   //        2 long pad
1600   //
1601   // type - 0 qmax
1602   //      - 1 qtot
1603   //
1604   //z     - z position (-250,250 cm)
1605   //ty    - tangent in local y direction
1606   //tz    - tangent
1607   //
1608
1609   AliTPCClusterParam * paramCl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1610   AliTPCParam   * paramTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1611
1612   if (!paramCl) return 1;
1613   //
1614   Double_t dr =  250.-TMath::Abs(z);
1615   Double_t sy =  paramCl->GetRMS0( 0,ipad, dr, TMath::Abs(ty));
1616   Double_t sy0=  paramCl->GetRMS0(0,ipad, 250, 0);
1617   Double_t sz =  paramCl->GetRMS0( 1,ipad, dr, TMath::Abs(tz));
1618   Double_t sz0=  paramCl->GetRMS0(1,ipad, 250, 0);
1619
1620   Double_t sfactorMax = TMath::Sqrt(sy0*sz0/(sy*sz));
1621
1622
1623   Double_t dt = 1000000*(dr/paramTPC->GetDriftV());  //time in microsecond
1624   Double_t attProb = TMath::Exp(-paramTPC->GetAttCoef()*paramTPC->GetOxyCont()*dt);
1625   //
1626   //
1627   if (type==0) return sfactorMax*attProb;
1628
1629   return attProb;
1630
1631
1632 }
1633
1634
1635 //_______________________________________________________________________
1636 Float_t AliTPCseed::GetTPCClustInfo(Int_t nNeighbours, Int_t type, Int_t row0, Int_t row1)
1637 {
1638   //
1639   // TPC cluster information
1640   // type 0: get fraction of found/findable clusters with neighbourhood definition
1641   //      1: found clusters
1642   //      2: findable (number of clusters above and below threshold)
1643   //
1644   // definition of findable clusters:
1645   //            a cluster is defined as findable if there is another cluster
1646   //           within +- nNeighbours pad rows. The idea is to overcome threshold
1647   //           effects with a very simple algorithm.
1648   //
1649
1650   const Float_t kClusterShapeCut = 1.5; // IMPPRTANT TO DO: move value to AliTPCRecoParam
1651   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1652   const Float_t kedgey =3.;
1653
1654   Float_t ncl = 0;
1655   Float_t nclBelowThr = 0; // counts number of clusters below threshold
1656
1657   for (Int_t irow=row0; irow<row1; irow++){
1658     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1659
1660     if (!cluster && irow > 1 && irow < 157) {
1661       Bool_t isClBefore = kFALSE;
1662       Bool_t isClAfter  = kFALSE;
1663       for(Int_t ithres = 1; ithres <= nNeighbours; ithres++) {
1664         AliTPCclusterMI * clusterBefore = GetClusterPointer(irow - ithres);
1665         if (clusterBefore) isClBefore = kTRUE;
1666         AliTPCclusterMI * clusterAfter  = GetClusterPointer(irow + ithres);
1667         if (clusterAfter) isClAfter = kTRUE;
1668       }
1669       if (isClBefore && isClAfter) nclBelowThr++;
1670     }
1671     if (!cluster) continue;
1672     //
1673     //
1674     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1675     //
1676     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1677     if (point==0) continue;
1678     Float_t rsigmay = TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1679     if (rsigmay > kClusterShapeCut) continue;
1680     //
1681     if (cluster->IsUsed(11)) continue; // remove shared clusters for PbPb
1682     ncl++;
1683   }
1684
1685   if(ncl<10)
1686     return 0;
1687   if(type==0)
1688     if(nclBelowThr+ncl>0)
1689       return ncl/(nclBelowThr+ncl);
1690   if(type==1)
1691     return ncl;
1692   if(type==2)
1693     return ncl+nclBelowThr;
1694   return 0;
1695 }
1696
1697 //_______________________________________________________________________
1698 void AliTPCseed::Clear(Option_t*)
1699 {
1700   // formally seed may allocate memory for clusters (althought this should not happen for
1701   // the seeds in the pool). Hence we need this method for fwd. compatibility
1702   if (fClusterOwner) for (int i=160;i--;) {delete fClusterPointer[i]; fClusterPointer[i] = 0;}
1703   AliTPCtrack::Clear();
1704 }