o add first version of lookup table corrections
o small updates

First Steps for tracking from seed of associated clusters:
- GetFittedTrackFromSeedAllClusters gets seed and performs simple tracking
- go row by row and look for clusters in this row
- TODO: cluster association and selection

Implement AliTPCtracker::Clusters2Tracks() for all clusters in given time frame:
- add setters of inner and outer sectors AliTPCtrackerSector in AliTPCtracker.h
- tracking for all clusters in one time frame (given by nevts or input file)
- TODO:
    - check tracking configuration
- add clusters and original tracks to debug output (how?)

expanding the toy MC

First attempt to implement tracking from all clusters
- Filling arrays for inner and outer sectors
- Function for track fitting from given seeds (not completed)
- Use AliTPCtracker to associate clusters to tracks (not completed, how to do?)

added method RunSimulation2(const Bool_t equalspacing, const Int_t type, const Int_t nevents, const Int_t ntracks) which makes it possible to run both the simple toy sim and use ESD input either with equal bunch spacing or train structure where the number of events per crossing is drawn from a poisson dist.

equalSpacing true (false) = fixed freq (bunch train)
type == 0: toy
type==1: esd input

fixed bug that set visualization time to wrong value

o update readme with simple example

adding name strings for canvases and histograms, adding z0 resolution

robust drawing also for 2D, adding axis titles

robust drawing in TStatToolkit::DrawHistogram (1D only so far) and first drawing macro for track parameters (to be improved)

o add function to connect output trees

Bug fix. Adding the header files

o fixes

o update reco

added track ID also for the tracks from ESD input

added method RunSimulationBunchTrain(constInt_t nevents,const Int_t ntracks) to simulate bunch train structure. So far, all parameters are hardcoded. A bunch spacing of 50e-9, abort gap of 3 microseconds and even train spacing is used. Number of collisions in one crossing drawn from poisson dist.

This is only implemented for the simple toy event generation so far (no ESDs yet).

Visualization class. To use

 AliToyMCDrawer* draw = new AliToyMCDrawer()
 draw->SetFileName("path/to/toyMC.root")

 draw->FillEventArray(Int_t centerEventNumber)
or
 draw->FillEventArray(Double_t time)
   to display with a certain event in the center or at a certain time

 draw->DrawEvents(Bool_t both, Bool_t before)
   where "both" will display events before and after the middle event and
   before will show also events before (after) the middle event if true (false)
   when "both" is false

Drawer class header file

o make reconstruction macro compilable
o add first version of reconstruction class

ref X as na argument

Added possibility to use ESD input

to use:
   root -l macros/{loadlibs.C,ConfigOCDB.C}
   AliToyMCEventGeneratorSimple s
   s.SetInputESD("path/to/root_archive.zip")
   s.RunSimulationESD(nevents, ntracks)

   nevents sets the number of events with ntracks!=0 to be used
   ntracks sets the maximum number of tracks in each event to be used

AliToyMCEventGenerator would crash if a sector only gets one space point (TSpline3 crashes). Modified it to skip those sectors.

adding code to visualize the current drawing

Adding draw function
Marian.

Adding print function and constant getter to the array of sensors

Adding functions to calulate and store the space carge maps

Adding macros to visualize trending of distortions

o comment out printf

o update resolution test part

o add Propagate function with return value for debugging

o add function for track propagation and resolution comparison after refit

1) add debug streamer for failed seeding  2) default is no correction for A or C side (sign correction does not work)

small modifications in recTest.C: 1) A/C side correction for time bin 2) bugfix: GetTimeAtVertex was done twice for distorted clusters

o add step distortion

o add setters for space charge files

o add epsilon 20 precalculated map

adding space charge map with epsilon 20

o small updates

o add precalculated space charge for eps 10

adding space charge map with epsilon 10

adding z0 information to event

o Update treatment of AliTrackPoint creation from AliTPCclusterMI
o Store AliTPCSpaceCharge3D directly in a file to not initialise
  the maps over and over again which is time consuming
o Update treatment of cluster and distorted cluster treatment
  by creating many space spoint and interpolating to the center
  of the pad row for l x-y and l x-z
o Proper settings for the pad coordinates of the clusters
o Update macro for doing the reconstruction

o add possibility to switch off Material budget correction

1) committing obsolete lines for OCDB in AliToyMCEventGenerator.cxx (to be checked)    2) remove toyMC.C (first version of reconstruction macro)    3) adding seedToInteraction macro (first version, to be improved)

added macro makeTree.C

o first test macro to try track extrapolation

o add comments in Generator
o change space point sim to one per row
o add cluster information to undistorted clusters
o add geom init for AliTPCParam

o Minor code cleanup
o Add simple tree filling

o add space charge maps needed for toy event generator

o rename ToyMC->AliToyMC

o add missing files for upgrade lib

o rename Toy -> AliToy
o add TPCupgrade library

o small fixes

o test

Default OCDB setup (Jens)

Adding default entries for the GRP

Export histograms to tree for easie fluctutation studies

Adding static function for the PID visulaization and coparisons

cluster -> TrackPoint
bug fix (not full commit before)

Updating the spacepoint constructor - using also covariance matrix

Adding constructor for the AliTrackPoint
(Michael)

Add new macros (Jens, marian)

for  Jens and  Martin

Continuous readout toy simulation:
loadlibs.C    //modified version of the one used for GEMtest code. I haven't looked into this so it probably contains a lot of stuff that is not needed
ToyMCTrack, ToyMCEvent //classes for storing event and track parameters
ToyMCEventGenerator   //base class for event generators, contains DistortTrack method to distort track using method borrowed from AliTPCCorrection
ToyMCEventGeneratorSimple  //simple first MC event generator, borrowing from Marians macro. Inherits from ToyMCEventGenerator to get DistortTrack method. Generate(Double_t time) generates and returns an event at time time
makeTree.C  //short macro to generate events from a poisson distr and storing in a ROOT tree.

to run : root -l loadlibs.C
         .L makeTree.C+
         makeTree(Double_t collFreq/*kHz*/, Double_t bunchFreq/*MHz*/, Int_t nEvents)

TPC development branch

adjusted macro to perfrom analysis also for K0s

Returning the flow event TaskSE instead of the cuts object to allow external modification (@ the wagon level)

coverity fixes and changing Printf to AliError or AliInfo (MW)

Better handling of hijing event header.

Updates for TRD HFE analysis

coverity

coverity fix

only excluding the same resonances as we try to do for data (MW) = rho0,rho+-,K0,Lambda,pi0Dalitz

update dihadron PID (Misha Veldhoen <Misha.Veldhoen@cern.ch>)

excluding pi0 for MC/MCAOD as well with all other resonance

updated for invariant mass study of TPC+TOF

changes for correction in different centrality bins (MW)

smaller pt bin for correlations in the range from 1.75 to 3 Gev/c

updates for studying the uncertainties

Coverity fixes

bug fix for tree fill and new histo to count events after event selection

Updated macros for K* analysis

Protection for MC of the HV dip cut

Set list owner

bug in period names corrected
 Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>

minor bugfix

add pt dependent histograms where already exist energy dependent

from ruediger

updated

Config files for DEtaDPhi train

Adding histograms for crosschecking hadronic correction and adding entry for tree for final calculation of ET

Restoring the analysis vs multiplicity

Macro for calculating hadronic deposits from data

Oysteins plotting macro

more updates from Markus

Adding parameters for LHC13f muon_pass2 (Diego)

Small update of the Plot method

Adding 2013 periods

Added Alice luminosity and bckg records.
Added possibility to export arbitrary data to the TGraph

updates for Markus