New support for QA histos

Hidden symbols removed (Marian)

Pedestal subtraction is implemented

Removing shadowed variables

First implemnetation of the inteface to the GOOFIE
values.

New better functionality to be added to remove outliers.

(Marian, Juan)

Splitting the AliTPCtrackerMI to the two files
One file with helper classes AliTPCtrackerSector - for cluster navigation
and AliTPCtrackerMI for tracking

Preparation for possibility to use different cluster navigation
+ easier to test functionality
clases derived from TObject possibility to test it from command line

(Marian)

EcoreRadius is relocated from AliPHOSEmcRecPoint to AliPHOSClusterizerv1
to avoid a circular dependency between libPHOSbase.so and libPHOSrec.so

Update documentation (SPD, SSD, multiplicity)

Histogram type for Etot is changed from TH1I to TH1F

Radius for core energy is set via AliPHOSRecoParam.

Compilation on Windows/Cygwin

Compilation on Windows/Cygwin

1. Correction for the previous commit - in order to visualise the esd data, the call to AliEVE should be placed before the reset of the esd object i.e. inside RunEvent(). 2. The calls to AliEVE are put in separate methods. 3. esd_tracks.C macro is added to alieve_online.C one.

Data member initialization is added for copy constructor

Creation of TClonesArray in constructor only, instead of per-event.
Cleanup of memory leaks.

Bug fix (T. Virgili, D. Elia)

Static TClonesarray cleared at each cycle (Panos)

Remove nested class from AliTPCtrackerMI (Marian)

Add virtual 'void FillClusterArray(TObjArray* array)' that will allow for extraction of clusters from all trackers.

tpc_clusters.C - added missing AliRunLoader::UnloadRecPoints(). New tpc_raw.C macro that shows both 2D and 3D sectors raw-data. acorde_raw.C - default geometry is taken (acorde is already in). These 3 macros are added into alieve_online.C.

Add status bits for cluster usage and sharing.

Overlap fixed (M. Sitta)

Removed overlaps between SDD and SSD cables (M. Sitta)

adding trigger configuration
making control histograms mergaable
syncing run.C with runCorrection.C

ITS raw-data and clusters macro fixed in order to be used by the online display. its_clusters.C - AliRunLoader::UnloadRecPoints() added so that it does not interfere with the underlying AliReconstruction. its_raw.C - the loading of the CDB entry fixed in a way so that it works also when the CDB caching is active.

printing trigger and detector used for the analysis on startup

Remove print (A.Rossi)

Included files: updated EVE repository

New Configuration Parameter to set Alien Path for CDB implemented.

Fixing memory handling of AliHLTMUONHitReconstructorComponent during error conditions. Also allocation and deletion code is a little cleaner.
Adding parameters to HeaderOk and IntegrityOk methods in AliHLTMUONUtils, so that the reason for the data structure problem is optionally returned.

First version of the online reco + AliEVE attached to it. (Matevz and Cvetan)

Write histograms instead of TObjArray

Fixing documentation typo.

updated SampleLib and tutorial, sample macros added

- added default CDB initialization to AliHLTComponent: CDB storage and
  run number set to $ALICEOOT and 0 if not yet initialized)
- AliHLTSystem: allow empty '-chains=' option to disable all chains
- added data origin for sample data  kAliHLTDataOriginSample ('SMPL')

Update of the old TRD tracker for the new raw PID representation in ESD

Optimization of TClonesArray (FCA)

implemented selection by detector string (argument '-detector')

Corrected comment line only

New histos for AMORE

This class is obsolete

Making the high performence raw data decoders default.
- The reconstruction options USEFAST*DECODER* were changed to NOFAST*DECODER*
- The option is NOT propagated to AliMUONQADataMakerRec, which uses always
  the default decoder

Updated documentation (Marian)

remove classes alredy moved to EMCALcalib library

adding EMCAL QA classes

Fixed up overlap check script
Added names to all shapes in the geometry - useful for EVE
Stuff

Compilation on Windows/Cygwin

Changes in order to correct fot edge effects changes (Marian)
Currently only cut on distance to the edge

AliTPCtracklet.h AliTPCtracklet.cxx
Adding cut on distance to the edge

macros/CalbrateTPC.C
Adding possibility to use the Memory chcecker

AliTPCcalibAlign.cxx      AliTPCcalibAlign.h

Adding functionality to monitor edge effects - currently only wirting to the debug stream

Move pio calibration staff to directiry Calib;
Library libEMCALsim.so should be load by hand
after loading ANALYSIS and ANALYSISalice

Changing fabs into TMath::Abs

Adding a command line utility to convert dHLT raw internal data blocks into ROOT objects, which sometimes makes analysis and testing easier. AliHLTSystem and the appropriate dHLT components are used under the hood.

Improved error and usage messages in dHLTdumpraw and moved common code to AliHLTMUONUtils.

Updating documentation.

Removing obsolete files and updating some documentation.

making macro compilable and doing some clean-up

Update on limit. (C. Oppedisano)

Redundant file closing removed.

New line at the end of the file

macro and bash script to check for cdb-paths and entries in an OCDB folder

No optimization with gcc 4.3.0

Default compilation of PWGs code

Fixes to compile with gcc 4.3.0

Including TH2F.h

bugfix: ReadNextInt etc now handled correctly

bugfix: corrected variable to compile in debug mode

bugfix: track length cut increased in tracker pp setting (Gaute)

Implementation of IsSelected(TList*)

Macro for checking the serial & bin number of the mounted manus
(Christian)

Handle missing rec-point tree in a uniform way: return null pointer to TEvePointSet.

Minor changes

Update of HP decoders:

1) Added GetDDLTracker and GetDDLTrigger methods to AliMUONRawStreamTrackerHP
and AliMUONRawStreamTriggerHP respectively to create the DDL payload objects
on the fly. This was done to improve the compatibility of these classes to their
existing counterparts. These methods should however only be used in some rare cases
where one needs the payload object to modify the data and write it back to another
DDL file. Otherwise the existing interface methods of AliMUONRawStreamTrackerHP and
AliMUONRawStreamTriggerHP are much faster.

2) Modified AliMUONDigitMaker and AliMUONReconstruction to handle the new trigger
DDL decoder also. The fast decoders are now enabled by specifying the USEFASTDECODERS
option in the reconstruction options. To make the digit maker use just the fast tracker
DDL decoder use the USEFASTTRKDECODER option. Similarly for just the trigger decoder
you use the USEFASTTRGDECODER option.

Minor fix:
Fixed some documentation in AliMUONVRawStreamTrigger.h

(Artur)

Cut class for the filtering of ESD V0s (Boris Hippolyte <hippolyt@in2p3.fr>)

Fill correctly the PID for CaloClusters (Gustavo Conesa Balbastre <Gustavo.Conesa.Balbastre@cern.ch>)

Final TOF version: 18 modules with holes for PHOS (Annalisa)

AliAODCluster.h: PID particle types like in ESD but with two more for FMD/PMD kCharged and kNeutral. fPID array size
increased to 13. Setter of PID added to set PID array from ESDs which is 2 units smaller.
AliAODCluster.cxx, AliAODCaloCluster.cxx, .h: Size of PID arrays increased to 13
(Gustavo Conesa)

AliAnalysisCuts::IsSelected(TList*) added to cuts interface. Needed by V0 selection.

Improving TClonesArray handling - using static dummy TClonesArray.

Moved from TDPMjet.

AliGenDPMjetEventHeader.h removed.

Moved to STEERBase

DCS points reading switch to TRUE to test this part

Initial HLT-EMCAL components.

New version with the right DA Type field (LDC)

Delete arrays in FillESD

Add track time to stack photons

Proto version of GUI for event-manager.

Compilation with gcc 4.3.0

Fixed error with trigger name at method SetInput

Made changes to use common online/offline fast decoder.

Bug fix. There was a comma in a variable parameter list function that should not be there. Would have caused run time crashes in some rare cases.

Updated ideal geometry, including ACORDE

Delete temporal arrays with AbsId

Replication of arrays in setters. (G. Conesa Balbastre)

Correct number of tracks in the header. (M. Gheata)

From Alex: updated and new macros for TRD.

Compilation with gcc 3.2.3 (Artur)

Improving handling of TClonesArray objects - using Clear() instead of Delete()
for data members, and making static the TClonesArray objects.

Added option to reuse list in AliESDEvent, avoid delete/new whenever possible in FMD assignment

Implemented checker subdetector splitting with subdetector offsets. Checker enabled

Additional functionality added
in order to use OFFLINE tracking in HLT
components (Jacek)

Cleanup of documentation and code.
Splitting AliHLTMUONEvent from AliHLTMUONRootifierComponent.cxx file. The AliHLTMUONEvent class was a temporary solution, but it works so well we are making it permanent.
Adding the dHLT trigger decision component that actually calculates the dHLT trigger scalars from the reconstructed tracks.
Also added the corresponding ROOT AliHLTMUONDecision object for testing.
AliHLTMUONRootifierComponent now generates the AliHLTMUONDecision from raw dHLT internal data.