TPC & TRD calibration viewer GUI, base classes (Ionut)

Turning off debug flag to avoid cout statements.

Move error messages to debug level 1 (Jochen)

Fixing bug related to arithmetic overflow on 32 bit machines. The bug typically appears with corrupted data. (Artur)

Fix in a macro that was crashing due to missing segmentationSPD object

Adding missing checks to macro.

Adding a macro to extract muon spectrometer DDLs into flat files using AliRawReader. Useful for debugging DATE raw data streams.

remove return statement in case of missing MC

trigger code update from Rachid

clear debug cluster array after each tracklet fill

Set acceptance condition on kTRDpid (Alex W)

remove deprecated event type selection

- adding test macros for HLT/CALO
- is basically a python script running different aliroot macros
- python run_tests.py -h for usage
- currently only for PHOS.

Removing redundant class PHOS/AliHLTPHOSUtilities,
same fucntionality provided in AliHLTCaloUtilities

int

Cosmetics

Removing redundant class AliHLTPHOSUtilitities.
Use AliHLTCaloUtilities  instead which  provides exactly the
same functionality.

M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRcuHistogramProducerComponent.cxx
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRawAnalyzer.cxx
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRcuHistogramProducer.h
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRcuHistogramProducerComponent.h
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRawAnalyzerPeakFinder.cxx
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRcuHistogramProducer.cxx
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRawAnalyzerPeakFinder.h
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRcuDAComponent.cxx
M    HLT/PHOS/AliHLTPHOSRawAnalyzer.h
M    HLT/libAliHLTPHOS.pkg
M    HLT/CALO/AliHLTCaloUtilities.cxx
M    HLT/CALO/AliHLTCaloRawAnalyzerComponentv3.cxx
M    HLT/CALO/AliHLTCaloUtilities.h

several bugfixes to correctly propagate the MC information to the ESDtracks. The
MC id must be set in the reference object before updating the track parameters

adding copy constructor to create AliHLTGlobalBarrelTrack from AliHLTExternalTrackParam

Removing unused class
Removing unused class

Removing AliHLTPHOSRawAnalyzerChiSquareFit/h/cxx
which is not used and that in the future will be replaced by the
AliCaloLMS.... fit from the offline library.

Removing unused class

Removed global TStopwatch variable and moved it to the
function AliHLTCaloRawAnalyzerComponentv3::PrintDebugInfo()

Removed #include directives that is not needed

Refactoring: GetOutputDataSize moved to the AliCalo.. base class
since its the same  for PHOS and EMCAL

Removing #include directives that is not needed, plus remval of some dead code.

1) Removed some #include directives that was not needed
2) Removed Doxygen comments for functions that was allready documented in the base class.

Refactoring: All code related to the processing of
an event is now factored out to the AliHLTCaloRawAnalyzerComponentv3
base class.

Removed memory leaks in AliTOFClusterFinder classes (savannah bug #66665)

Method to get the number of TPC clusters added.

added new heöper method to print output size, changed merging method, new binning for spectrum

adjustments for esd friend reading

make a run list for alien OCDB scan
(Marian)

Coding conventions (Ionut)

Protection in case of wrong time stemp improved

Updates.

AODtags treared like ESDtags again.

Allow to have clusters in 2 SuperModules with common eta =0.
Many other corrections, improvements.

bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/?66219
update the track parameters at kTPCin after kTPCout
the exact sequence needs to be investigated

create a diroctory only if input is exitsting
(Marian)

remove print

Skip Calibration events by default. If not skip do not clusterize, just fill the ESDCaloCells
Change print in RawUtils to debug mode

- added OCDB folder and entry for the cluster finders' comparison component

- added schematic component for the comparison of the FCF and SCF properties

Add DCS datapoint OCDB entries

Add macro for DCS datapoint OCDB entries

removing the required component libraries, all inputs are handled dynamically

removing the required component libraries, all inputs are handled dynamically

adding example macro and description for running the HLT on simulated data

remove temporary data structure for PID exchange container
use class AliTRDpidInfo for communication between PID ref maker classes

align to the new AliTRDseedV1::Fit() function syntax

New pseudo tilt correction mechanism
The evaluation of the z coordinate of the tracklet is done based on
chamber geometry. Additional for pad row cross the z information is
known with the z alignment resolution.
The first results on ideal simulations have presented at
http://indico.cern.ch/conferenceDisplay.py?confId=93879

- removed unused array

Bug spotted by Raphael.

Warning fixed

commenting unused function argument

move AliCaloRawAnalyzerPeakFinder from Utils to base due to OCDB access

Make Lookup and fits of the ExB effect
Marian

From Stefano: use clearer variable names for global scenes and viewers.

New method ResetRecPoints() - needed for online monitoring with AMORE

fix to prevent sqrt of a negative number

Updates in SDD cluster finder: 1) updates in unfolding switch-off 2) improved cluster size calculation 3) new cut for noise removal based on cluster charge peak in drift time intervals (F.Prino)

1.) Minor correction in the QC and GFC classes: Treatment of errors when flow is zero has changed;

2.) Rewritten from scratch compareFlowResults.C. For each plot there is now a dedicated boolean and a method. For instance, if you want to see differential flow of POIs versus pt, please set

Bool_t plotDiffFlowPtPOI = kTRUE; // differential flow v(pt) for POIs

bugfix: correct initialization of the AliTPCcalibDB to avoid out of bounds messages from TObjArray

update JCORRAN code, wagon macro added (Filip Krizek)

Update by Theo

- add new calibration in the reconstruction macro (Theo)
- some bugfixes in the new calibration component

Two bug fixes: mismatch between subdetector names and fix for a return statement removed with revision 40886  (Melinda)

implementing OCDB object description (Theo)

New checker for SDD (Piergiorgio - Melinda)

adding functions for streamer info initialization to common tool class,
code copied from AliHLTReconstructor

coding conventions

From Stefano.

New macros to show track energy in calo-like representation in 3D
view, projected views and in stand-alone lego view.

Show this by default from visscan_init.C

Savannah bug #67195 - change to a V0 finder parameter

fix proposed by Alex W

- added additional debug info
- fixed the type of a variable in the printouts

chi2, mean and rms checks for input samples for fitting

Coding conventions

add SetReference method

In vmctest/*/commonConfig.C:
Modified TRD, PHOS and EMCAL setting to be consistent with the official
production macros; the old setting kept as the option (kConfigV0).
(Eva, Ivana)

Fixed Warning (Jens)

add suggestions by Markus Heide

Warning removal
+
AliTPCkalmanAlign.cxx Usage of TPC out instaed of OuterParam
Marian

removed 3D histograms in order to reduce size of output, added cut on vertex

Better weight function from the improved time slewing correction.

Improved time slewing correction after a refit of both 7 TeV and 900 GeV data with two different thresholds. To be added to the bug report #66844.

second iteration on implementing V0 list usage along TRD train

Warning corrected.

Protections against missing MC files as requested in https://savannah.cern.ch/bugs/?67224

Changed data member from pointer to object (Mikolaj)

Trying to extend the outer radius of the fiducial volume to 200 cm (A. Marin)

Set a limit on the number of events per file to workaround a problem in the aliloaders...

Decrease verbosity, make sure number of events is up to date, and added protection

Corrected off-by-one index test errors

patch for QA

Slight change in pt binning for B=0 data

Update of ITS-TPC alignment code (Mikolaj)

correct bug 67209

correct warnings

correct compilation break, third try

correct compilation break, second try