update (Chiara B)

Updates
Ch. Oppedisano

Putting back the -ansi for CFLAGS, would not compile in lhapdf otherwise (thanks to Jochen Klein for reporting)

ITS pid

Reordering

Reordering, so that ALICE_INSTALL is set also in case the corresponding environment variable is not

default 2012/13 geo

remove the -ansi flag and prevent install dir to equal build dir but allowing them to have partly matching paths

code fix, missing std namespace (Savannah bug #102730)

undo accidental commit of header from rev 64461

Keep track of used tracks also when adding normal tracks, not only secondaries

Modified task
 - problem during merging due to high memory consumption solved

 fixing error messages, detecting input data type

Restored dictionary generation for private sub-classes.
The generation is conditional on the ROOT version used:
If it's less then 5.99 (ROOT6-alpha) then we do generate the
dictionaries.  If not, then the dictionaries are not generated.
Perhaps we need to make the sub-classes public for the up-coming
ROOT6 (May 2014 apparently) if needed for object persistency of
the parent classes.

Fixed up link of runTrain to take LDFLAGS into account.

Added missing 'using std::...' declarations

Added possibility to only accumulate statistics for MB events.
This is to prevent a possible bias in case the MB trigger is
downscaled relative to the other triggers active.

Added user-callable check if we have an MC input handler

Fix merge via JDL and make it compile again

Adding Systematic uncertainties for pPb measurements vs rapidity

code fixes, important for c++98, necessary for c++11 (Savannah bug #102665)

Add QA plots for time cuts + code cleanup (from Chris)

fill converted photons histograms not with merged photons from neutral mesons

Initial port of the analysis task to AODs

move MeanNtrk to an external macro to be reused

move momentum correction to track candidates and code clean up

fix latex labels

default to all tracks in standard cuts

Update by Pedro

flag for checked/unchecked centrality in MC

Change FilterBit procedure when !=7, include Kt3 binning

Change FilterBit procedure when !=7, include Kt3 binning

from Laurent Aphecetche:
fix compilation problems using clang (mac os x, xcode 5.0) by removing
the default unnamed constructors - just the named ones remain with default
arguments.

Array initialization corrected

Setter to change centrality estimator is added

coverity

updated from Leonardo

update to Vc 0.7.3-dev

* the previous Vc copy came from the development branch leading up to Vc 0.7
* this update contains a large number of fixes
* most importantly it fixes the issue with the latest XCode clang
  compiler supporting only a template recursion depth of 128

from Ante Bilandzic:
updates

o Add configuration for default QA task

From Salvatore
- Complete transition to dev base classes (except one task from Chiara, which will done soon)
- AliAnalysisTaskSAQA: new QA histograms
- AliAnalysisTaskEmbeddingFromAOD: cut on ITS refit failing tracks implemented also for skimmed ESD embedding

new version of the LRC code (Christoph Mayer <Christoph.Mayer@cern.ch>)

bug fix in MCEfftree plus two new variables

fix from Ruediger to actually return the jet mass

Updates From Oliver

nicer printout

Analysis macro for transport profile output

Step counting added.

bug fixed needed in order to be able to run on normal data again

increase streamer version

from Ante Bilandzic:
update for the new AliFlowAnalysisWithMultiChineseCorrelations classes

Fix Savannah [bug #102665] code fixes, important for c++98, necessary for c++11 (Laurent)

From Jochen:
- distinguish TRD-relevant trigger classes
- generalise to VEvent
- prepare for MC analysis

Update of the AOD muon filtering. 1) in the normal ESD -> AOD filtering, add the ZDC object to the muon AOD, as well as (optionally) the SPD tracklets, 2) added an AOD (full) to muon AOD filtering task, 3) added a couple of macros that are used on AF (SAF only currently) to make the AOD filtering on-the-fly during staging of the datasets (Laurent)

fixes for Savannah bug #102730, missing std namespace (Jayarathna, Sandun Y <sypahula@Central.UH.EDU>)

Make the object browsable (in TBrowser). Note that it only works with for root >= v5.34.10. (Laurent)

New task for 2particle correlations with PID for triggers at low pT (Debojit Sarkar <debojit.sarkar@cern.ch>)

fix Savanah bug #102665: code fixes, important for c++98, necessary for c++11 (Laurent)

STL make_pair fix (see https://savannah.cern.ch/bugs/?102665)

shortened the output names to avoid get error messages

From Chris

fix (final one)

fix

Cleanup, docu and adjusted default timing settings

Change of FilterBit operations when !=7

Fixes for ROOT trunk - #error is seen by Cling-based rootcint

Fixes for ROOT trunk - private sub-classes not accessible through Cling interpreter

comment

TRD trig. analysis

TRD trig. analysis

new method to unfold single clusters and other updates - Adam Matyja

new method to unfold single clusters and other updates - Adam Matyja

add setter

New task for 2particle correlations with PID for triggers at high pT (Subikash Choudhury <subikash.choudhury@cern.ch>)

Fix std namespace

Use neg. of ESD label in case TOF label does not correspond to any AOD MCParticle

Be able to set recombination scheme (Ruediger)

tofLabel copying

Added some classes to the build of PWGLF/forward2
Removed obsolete PWGLF/forward and corresponding directories
Removed obsolete corrections for PWGLF/forward2

Major refactoring of the code.

Introduced two base classes:

 * AliBaseESDTask:  Base class for tasks to read-in ESD data
 * AliBaseAODTask:  Base class for tasks to read-in AOD data

The various tasks has been moved to these base classes.  This is
to avoid too much code duplication and to make the output more
consistent, as well as to insure that some diagnostics is
produced.

Note, these base classes defines a new interface for the sub-classs
to implement rather than the AliAnalysisTaskSE interface.

The code has been tested throught the full chain and should be ready
to deploy.

Also some other minor fixes for other code.

Added scripts for Casper/Valentina style P(N_{ch}) analysis

fix from Tim

removed smear in ntot

Update
Tim Schuster

coverity fix (Tim Schuster <Tim.Schuster@cern.ch>)

add optional restriction on leading hadron on opposite side of trigger

Adding methods for pPb rapidity measurements

updated

fix coverity defects

added possibility to use MC centrality from generated tracks (Tim)

https://savannah.cern.ch/bugs/?102706

Fix for MC truth centrality estimators in p-Pb (Tim)

- gtuTMU: limit number of tracklets per layer as in hardware
- fix memory leaks

Fixing missing references to the std namespace (Laurent)

- additional output methods for verification of TRAPconfig and mcmSim

- bugfix to correctly use the TRAPconfig name and version from the OCDB

Bug fix: when mixing exact matched triggers and trigger patterns (i.e. containing *), the exact matches were counted twice. The problem was not there when mixing patterns and trigger combinations. (Diego)

Fix for getting beam energy correct in all cases. (by cholm)

fix

add proper values of FONLL scaling per rapidity bin (fixed)

new correction maps (Alis Rodriguez Manso <alisrm@nikhef.nl>)