TPC only cuts created only once

Changes for #81171 Port request- AliReconstruction: ESD friend filtering - Random cosmic and B field OFF data

In QA task, take TPC BB param from AliAODPidHF

revert unwanted change from previous commit, add some tabs

add protection against truncated events + coverity - Rachid

Fix for the include path

The corrected ZDC timing cuts as members of the class.

Unintentional delete corrected.

Updates + addition of EMCal

Updates, adding EMCal (committing on behalf of Silvia)

AOD based merging updates.
Gustavo Conesa

- update handling of arrayDictionary
- shift Q0, Q1 in tracklet to remove additional digits

Fixes for #81212: loadlibs.C macro doesn't work with v4-21-21-AN

started code cleanup of Huffman encoding package, using AliAltroRawStreamV3 for data access, commissioning ongoing

I/O constructor is added

Constructor of the task is corrected

Numerical protection (Savannah #81183)

more realistic time resolution as a function of energy (fit and parameters from Francesco Blanco)

- provide option to save all individual pads of all canvases, by default it is off

Added option for initialization of peak position (Francesco) + new parameterization of mean positions (Melinda) + new containers for fit parameters (Riccardo Russo)

Adding new DPs for TPC.

Typo fixed.

Updating EMCAL configuration at P2 - adding new DPs.

- set X titles in the task, so that the canvases can be filled in loops in the macro

Updating TPC configuration with new DPs.

Set flag to kFALSE after compression

Adding additional detectors  )all outer )

Jochen + Rongrong

add calculation of epsilon using (1-x)+x*ncoll as a weight

next version for gsi train

- DCA calculations according to what is done in the PWG1 task

Change requested by Benjamin

Changes and bugfixes by Uwe

Update

full chain for pass0: channels equalizing and season time shift correction

efficiency histograms added

- calculate the DCA for offline as for HLT, without the use of the TPC inner parameters
- use as default cuts in compare-HLT-offline-local.C, |eta|<0.9, pt>0.3 GeV/c, |DCAr|<7 cm and |DCAz|<7 cm (adjustable)

Renamed some vars plus print task settings in usercreateobjects

Remove forgotten debug statements

Get trigger primitive information and do trigger cluster matching
Reduce memory footprint
Train mode to save memory

correct selection of embedded signal clusters, get new list of clusters from input or output event

- overload the constructor with arguments for cuts on eta, pt, DCAr and DCAz
  (default values deliberately are loose)
- saved these values in the output of the task for use in the drawing macro

- DCAr and DCAz with cuts are removed, not necessary
- rearrange drawing macro

- save the canvas with the cut distribution

- include a series of HLT histograms with cuts for selecting primary tracks
- rearranged histo titles for reducing the number of calls in the drawing macro
- removed obsolete unused histograms

- fill more histograms to match the central barrel task output
- unify the canvases to bear the same names and have the same content for the two tasks

- added the V0 centrality information to be filled when the beam type is Pb-Pb

increase classdef version

- fixed the statistics box printing

corrected OCDB storage path for trigger info + added few AliInfo lines for now

Prevent skipping of 1st line in the list of derivatives files

- call function for global task to set the beam type

- included run number and date info in the output list
- added function to set the beam type (used for setting histogram ranges)
- removed a lot of unused histograms
- modifed macro to create a folder and save the png and ROOT file in there

- added the task name in front of the folder name with the run number and the date info

script to download the set of the alien files

# Arguments:
#   $1 fileList
#   $2 timeOut in seconds
#   $3 nprocess
#   $4 prefix
#
# Algorithm:
#   1. Check the input parameters
#   2. Group randomly the files into the group - generates nprocess download scripts
#   3. Start $nprocess to download the files - with forced timeout
# Example usage:
# 1. Create file list
# alien_find /alice/data/2010/LHC10h/000138795/pass0_2 root_ar | grep root > file.list
# 2. run script with timeout 60 and n processes 10 and the sarting diectory  -current directory
# $ALICE_ROOT/PWG1/CalibMacros/MergeCalibration/alienDownloadTimeOut.sh file.list 60 30 `pwd`

add a maximum cluster energy cut in the reader, apply this cut in the add task macro, avoid crazy channels when not removed yet from analysis; also correct EMCAL energy energy by non linearity from beam test

new non linearity correction from beam test

different vertex cut for pp and PbPb collisions, change vertex binning for mixing in pp and PbPb accordingly

Reader: Add option to remove or not event with primary vertex not reconstructed
Change centrality option from 5 to 20 when centrality is given up to 20
Photon and Pi0: Reduce number of filled histograms by default. Removed histograms can still be recovered via setters (conversion, pi0 invariant mass for different module combinations, event multiplitcity histograms for pp ...)
Macro: Correct some settings (phi range, z vertex event binning), reflect the above changes.

- fixed documentation

- added functions to replace big parts of the macro that were being repeated
- removed the DCA plot read from the HLTesdTree
- saved a ROOT file in addition to the png output of the macro
- can be run in compiled mode too

removing osolete macros

mergeCustom.C mergeStage0.sh        - adding macros for separate merging

CalibTimeGain.C  CalibTimeVdrift.C  - removing obsolete macros

- updates for synchronizing with the framework
  (call PostData twice, set output TList ownership)

Adding the TOF and T0 to the Pass0

Exporting Analysis headers

Obsoleting g95

Update (Chiara)

Added PostData in UserCreateOutputObjects (Chiara)

Changed cut at high pt (Renu)

Avoid to load the TPC response function twice.
J. Wiechula

Enable (handle by a flag) trigger conversion from raw2sdigits for embedding (Javier thanks to Bogdan, Roberta and Enrico)

Preprocessor related update (mainly from Jiri) to pick up TRU config info from DCS and store in OCDB

Updating TOF Pass0 class and macro (changing mane of output file and list).

- synchronize changes from the CB task and the drawing macro

- made the centrality selection work for the track properties
- few changes in the canvases where the overlaid histogams are printed to match the removal of the polar angle

Declare as connected an AODEvent read from tree

ITS cluster multiplicity and TPC standalone multiplicity in AODHeader

- removed the polar angle from the filling of the track THnSparse, eta is sufficient
- removed the TPC track multiplicity from the filling of the track THnSparse, since the multiplicity selection
  will be done based on the V0 centrality
- removed the cuts based on the TPC track multiplicity
- changed the drawing macro to follow the above changes

- added message for the case a canvas is not created when the entries of the THnSparse that fills it are 0.

- added function call for setting the pass number (according to the changes in the centrality selection task)

fca's changes -- take shelter -- optimising AOD tree handling

Caching the variables in order to make calculation faster
(fca)

Move the calibration macros to PWG1 (Marian)

Keep also the events with cosmic tracks (Marian)

removed possibility to choose channels for stability

Added possibility to show the trend of calibrations of single SDD modules

Fix in SDD correction maps for cases of negative drift length

- added the new function call that sets the pass for the centrality task

- synchronized the overlay macro to the changes of the drawing one
  (although draTHnSparse.C provides the same functionality)
- changed the max Pt range according to the value defined in the CB task
- added functionality to define the X axis range for overlaying histograms

- removed method plotAid, its functionality has been moved to other functions
- reduced the number of arguments in several methods
- the canvases are now created and filled inside the functions and under conditions
  that the respective THnSparse objects have non-zero entries
- the canvas with the overlaid histograms is created and filled only when there is more than one
  set of cuts to be studied
- added a canvas with overlaid track distributions for the offline tracks too
- took care of the way the statistics boxes are printed, now entries, mean and RMS appear

Minor change in SetLaddersOnLayer2 to speed-up the code

QA updates

Clean at the end of loop

Misplaced initialisation of ntimes corrected.

fixing backward incompatible operator=, check for existence of fEventPlaneP

-- changes for mean pT vs multiplicity studies (M. Knichel)
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysis.h
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysis.cxx

New track selection and new track matching

New macro to print SDD configuration from JTAG hex files

Minor fixes in SDD macros

Optionally the log term of Rossi parameterization for mult.scattering can be
accounted by SetUseLogTermMS static method. The default behaviour did not
change (no log term).