Removing warnings pointed out by FC. Thanks

Make ACORDE modules transparent.

redefinition of the exception to the rule of incremental versioning for the specific case of GRP entries with version explicitly set

Use of PID info (ESD combined PID and/or MC PID) for Inv Mass histos (A.Maire)
Priors for Xi (0,0,2,0,1) and for Omega(0,0,1,1,1).

Revert changes made in revision 32751

Fixing output block type return values and documentation.

sdigits reading macro cleaned up

restructure error calculation :
  - move all cluster error parameterization to AliTRDcluster
  - re-implement leading cluster method for radial calculation of pad
    row cross tracklets
  - implement pull plots for cluster calibration
fix minor errors in performance tasks
update documentation

Removing warnings.

remove obsolete protection

Revert previous commit on AliMUONTrigger

More unnecessary log output

Suppress unnecessary log output

Add AliFemtoCorrFctn to CINT

Add protections for CINT

Update runBatch.C for the new AddTask.C macro

Corrected method name semantics. Corrected TRD trigger input creation. Correct description of the AssignInputs method.

Remove compiler warnings in AliMUONTrigger

Removing compiler warnings from  AliMUONGain, AliMUONPedestal.
(Jean-Luc)

Removing compiler warnings from AliMUONRawStreamTriggerHP.cxx.
(Artur)

Compilation warning in CreateInputs is fixed

Warning removal

Fixing compiler warnings

Warnings corrected.

bugfix: propagate CF output to ESD converter in order to fill the MC information

compilation warning corrected

Extension to L0 and L1 trigger classes

- added the offline transform function that takes care of the pad and cluster corrections from the OCDB
- included the testing macro for the translation component from HW to SW clusters

fix bug in considering t0 correction for cluster local drift length
estimation.

 AliFlowCommonHistLYZ1 => AliFlowCommonHistLYZ1SUM

bugfix: following the implementation of AliMagF, the abs value
of AliMagF::SolenoidField has to be taken

Major change in the setup of HLT simulation:
making CA tracking and merging the default TPC online reconstruction.

In order to also propagate the MC information, the reconstruction
needs to run from digits, which is at the moment done when no
raw data is simulated (AliSimulation::SetWriteRawData not used).
Note: the online reconstruction is chosen at the level of
AliSimulation, not AliReconstruction. It is planned to simulate
both the HLT chain running on digits and simulated raw data.

protect against presample clusters in cosmics

AliTPCcalibDB::GetGoofieSensors

GetGoofieSensors were deletd by mistake.

Added workarounds for bugs #51285 and #51281: if the AliMagF instance
is not available, the GRP/Data is used to create the entries for
component initialization. The SolenoidBz entry is unloaded from cache
in order to make the latest version available for components.

Preparing to fix #48360 by setting local storage for transient HLT
OCDB entries

Bug fix
Data member correctly initialized in constructor
+
Possibility to cache gain for many runs

(Alexander)

Quick fix so that TRD can implement properly the separation of L0 and L1 trigger processors.

Fixes in order to have the merged QA data file as an output from PROOF-based reco. 1. Extension of the method to merge the QA files to custom output filename. 2. Adding the merged QA file to the selector output list. 3. Do not remove the raw-data QA task in case the reco is run within PROOF. One additional fix needed for the trunk - correct destructor of the mag field that is sent via the selector input list.

Adding Cascade performance task to PWG2spectra

CRITICAL COMMIT for RSN package:
- modified structure of AliRsnFunction:
--- output is THnSparseD instead of TH*D, with the possibility to have as many axes as one wants
--- AliRsnHistoDef becomes obsolete and will be removed from package when dependencies will be fixed
--- output histogram axis are defined by AliRsnFunctionAxis objects
--- RsnConfig.C macro has been updated with the new package version

fixed the behaviour of these classes

Changes to obey modified coding convention RC6 (R. Shaoyan)

New macro for checking Cascade reconstruction (A.Maire)

optimize range for LeeYangZeroes to find zero

AliESDtrack flags update during the TOF matching procedure. Now, (1) when a TPC/TRD reconstructed track has been successfully propagated to the inner TOF radius (rho=372cm), AliESDtrack::kTOFin flag has been added; (2) when a reconstructed track has been matched with a TOF cluster, AliESDtrack::kTOFout flag has been added. This procedure does not take into account the particle decay probability in between the outer TRD/TPC and the inner TOF sufraces.

small bug fix when returning zero

Mods in QuadraticRoots

correct the implementation of deleting tracker containers

add total removal of containers for usage in HLT

Preventing automatic compilation of trace statements into debug build.

TOF preprocessor behaviour modified when trying to compute online delays with not enough statistics. in this case now it stores the previous value, retrieved from last valid CDB file

adding common data type kAliHLTDataTypeClusters {CLUSTERS:ANY }, adding data type for ECS parameter block {ECSPARAM:PRIV} to be sent within SOR event

In AliMUONTrackExtrap:
Maintain the covariances between inverse-bending-momentum and other variables
to 0 when there is no magnetic field, to make sure that this variable is not
adjusted by the Kalman.
(Philippe P.)

AliESDtrack flags update during the TOF matching procedure. Now, (1) when a TPC/TRD reconstructed track has been successfully propagated to the inner TOF radius (rho=372cm), AliESDtrack::kTOFin flag has been added; (2) when a reconstructed track has been matched with a TOF cluster, AliESDtrack::kTOFout flag has been added. This procedure does not take into account the particle decay probability in between the outer TRD/TPC and the inner TOF sufraces.

QA for SPD digits in reconstruction (M. Nicassio)

Small fix w.r.t. rev. 32687

Macro for alignment/calibration of TPC
(Marian)

New QA checking procedure by Sylwester

Tighter cuts for charm->3prong (Renu, Francesco)

libTPCbase.pkg TPCbaseLinkDef.h -
Adding kalman fit

AliTPCTransformation.h AliTPCTransformation.cxx -
Adding new types of TPC transformation
+
Possibility to enable/disable transformation

AliTPCkalmanFit.h AliTPCkalmanFit.cxx -
Add function for merging of results
+
Filtering of transformation  - SetStatus
+
DumpCorrealtion and DumpCalib - Possibility to specify transforamtion mask

(Marian)

New package for heavy flavour electrons analysis (M.Fasel)

New package for heavy flavour electrons analysis (M.Fasel)

New package for heavy flavour electrons analysis (M.Fasel)

TOF preprocessor modified in order to use cosmic-ray calibration parameters (from AliTOFcalibHisto) when online delays are not computed. the old behaviour (use cable-lengh map) has been kept inside the FillWithCableLengthMap function, but not used

header to changed cxx

bugfix following commit 32699: removing the MCGenerator from the libAliHLTUtil agent

1. Using the CHECK_HLTMODULE macro to check required libraries for the libAliHLTUtil in order to fix bug #51178. However, the list of libraries was too long, I had problems to find the full list of libraries. 2. reducing warnings of autoreconf

Bug fix: proper place to reinitialise the generic MC histos in the switch -> no crash for the events containing more than one generated cascade of the same type (A.Maire)

removed MCGenerator from build ( aliroot+cmake ) due to my not understanding the HLT buildsystem

update

fix product method with <M> and better error messages macros

Bug fix - creating of random chains
(Marian)

Compilation warnings

added a method allowing to retrieve only one QA data list for a given specie

fix error in calculating the drift length bin
- make algorithm robust against pad row cross
- use default drift length bin from calibrated time bin 14
thanks to Raphaelle for pointing it out

do minuit fit only on request

Added possibility to to merge in chunks of files and one can specify the number of files in a chunk via SetMaxMergeFiles() function of the plugin.

Changes to obey coding conventions (R. Shaoyan)

Fixing compilation warnings

Corrected name of the SPD fast-or minimum bias trigger input (Annalisa)

New defaults for Vertexer 3D (F. Prino)

Updated READMEmapping

In mapping:
Adding pad offsets for station2:
bending_plane:     x: -1.0   y: -0.75
non-bending plane: x: -0.625 y: -0.5
(Sanjoy)

fixed warnings from Federico mail

last macro to incorporate new names

delete obsolete directory

Updated DAs

Updated trigger configuration (A. Mastroserio)

In AliMUONTrackExtrap:
- Modify LinearExtrapToZ(...): propagate only the track parameters
- Add LinearExtrapToZCov(...): propagate the track parameters and the full
  covariance matrix
(Philippe P.)

added first version of the CA tracker evaluation macro

Added test macro for MC Generator Component

also new names in macros

more name changes to enable product and sum LYZ to run simultaniously

compilation warning corrected

Adding the SSD charge ratio needed for the calibration of the detector (Marek)

fixed warnings

added verbosity to QA histograms (Yves)

fix include file dependences and correct some inline methods

Warning corrected about fSuperModules not initialized in member initialization list

Variable shadowing corrected.