Coding violations corrected.

- fixing coding violations

Timing corrected, warnings corrected

Updated DA from Brigitte. Steerable clock range for pedestal evaluation - default from 16 to 19. Better handling of configuration file.

Updated Calibration Object

Updated Trigger Object

Updated Calibration Object

CHANGES:
a) TPC/CalibMacros/CalibPID.C --> should now work automatically (!)
b) TPC/AliTPCseed.cxx --> enable switch in AliTPCseed.cxx to use analytical

Alexander Kalweit

fixing warnings (Federico C.)

small update to print the results

protection from old OCDB object

correct to make it work on amore agent (Yaxian)

Fixed naming when selecting tracks for FF

added FMD offline trigger

Deacresing the size of the log file output (Christian Klein-Boesing)

Initialization of HV data arrays (Raphael)

Bug fixed.

1. Bug fix in pedestal subtraction. The channel was taken from the index of the digit which does not work in case only digits above pedestal are written. 2. BB and BG flags are taken from the start of the searching window to the max adc. Should be more precise than the existing code that takes them at adc max only. Agreed with Jean-Yves.

Debugging of code

Fix for Bug: 58726 including a new QA histogram for ACORDE ESDs (Multiplicity of modules) and QAChecker for empty events

remove empty method and make two methods public (last fix needed to run package under windows with vc++ 2008)

added ZDC trigger

fix formatting for microsoft compiler

Improving printout.

Correct problem in pp and PbPb bench, add comments

Add possbility to read also the RecPoints

ITS tracking analysis macros

Update of ITS tracking check task and related macros

explicit conversion and change of order arguments macro

Fix compilation on mac

fixes how common configurations are set

improved monitoring

adding class to trigger offline on content of the ESD
adding task to evaluate triggers vs. timestamp (for background analysis)

New RecPoint container class. Access to RP through this class implemented for vertexer3D, vertexerZ and multiplicity reconstructor

Bug fix - the array ax was too short. Thanks to Andrei Gheata.

- fixing compilation warnings
- fixing missing symbols in CALO/EMCAL libraries (still a problem left)

Printing the warning only if sin(phi) is significantly bigger than 1.

adding subevents onthefly

correct name for the mapping file

If using par files, add line:
export LD_LIBRARY_PATH=.:$LD_LIBRARY_PATH
to executable script not to take compiled AliRoot libraries first.

limit print out

 fixed exclusion of all but DA

Added static method to convert track-points back to the ideal geometry

Fix

protection against exidental writing

new amplitude calibration  up to 50 MIPs

Warnings corrected.

DA_PED: clean up of the code
DA_GAIN: modification of the conditions (second order parameter) to validate gain values
And relevant documentation update.

(Jean-Luc Charvet)

fixed warnings

Adding HLT trigger component for the muon spectrometer to fit within the HLT trigger framework.

Remove obsolete comments about TTree::Refresh() not working.

Try Refresh() also in GotoEvent() when event requested is bigger then
number of events in currently used ESD tree header.

Fixing compiler warnings

Explicitely printing out the DPs that give problems in the GRP.

Change the definition of distance variables from int to float

Changing AliError to AliWarning.

remove old datamembers

modifications for subevents

simple run macro which we adapted for cosmics (Markus)

protection against negative diagonal covariance matrix element (simone schuchmann)

macro to create First Physics reco Param (Markus)

new setter for RoadzMultiplicator

Fix for backward incompatibility of fDeltTh data member. Class version was correctly increased, but inlined getter accessed the array without checking its availability. The check is now done and a negative value returned if not there (error message posted).

move back noise from 4 to 3

remove print

Some print commented

Correct array size

Removing redundant includes

Fit Raw signal high-low gain and not TRU

Adding some const

removed .so from loadlibs

Add run number and timestamp to ntuple

 added argument for setting of the filtermask for aodtracks

 limit printouts

allow for writing to a AOD extension also if we have a non standard AOD on the standard output

Mods from Chiara

Update on config macro for analysis task

- bug fixes in the handling of digits

- small changes in CALO

Updated the code to use new argument/ocdb entry reading schema. Added the corrections which are applied in the software clusterfinder

Need to load libTENDER before libPWG1

da documentation page is defined in the Link

added documentation

fix to run also in root under windows

Updated QA histos for raw data

add new line at end of file

Changes to comply with analysis train naming

Correct the way the standard AOD are cleaned, when used as temporary containers.
Now not done by default, only cleaned when requested, done in example config.
Option to copy Std AOD in output only in case of AODReader

Set default ntimebis = 30 in simulation and check for -1 in OCDB

Forgotten commit.
Marian

Technical fix: corrected ownership of the calibration objects

Memory leaks removal
Problem with full statistic merging
(Marian)

Updating ldap configuration files for both the test setup and P2.

add special function to set the number of time bins

use digits param to extract no of time bins
add on/off setters in reco param

add option to use / neglect clusters which are not in chamber
update macro run.C to load also libTENDER.so

Correct handling of unsuccessful creation of raw-data reader.

a simple example of plotting the eccentricities from the ntuple

New macro to visualize SSD noise and pedestal from OCDB + mods to existing SSD macros (Panos)

document a few settings

Update by Dariusz

Add a consistency check for the number of time bins