fix pad masking settings for clusters (Markus)

-1. Possibility to call FindMultiMC in the debug mode AliTPCReconstructor::StreamLevel()>2

0. Adding Function IsFindable
   + bug fix - tracks outside of z acceptance

1. Removing obsolete functions
//Int_t FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf=0, Int_t step=1);
//Int_t FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr);

2. Modifying MakeSeed3 - removed explicit call of destructor

Updated macro to display SDD calibration (F. Prino)

Allow an empty past-future protection with a label NOPF (according to the new trigger naming scheme)

fixed usage of SSD bads from OCDB; added protections;introduced AliDebug messages (A. Dainese)

Bug fix - Use the proper z vertex
for TOF correction
-  dist+=(fPrimVtx[0]-x[2])*(fPrimVtx[0]-x[2]);
+  dist+=(fPrimVtx[2]-x[2])*(fPrimVtx[2]-x[2]);

Removing unused code

Changes to use a collection of AODs as input (Renu)

Removing UNICOR code

Added seperate methods to write histograms to a file when not using the task framework

check and warn if directory list is empty

Forcing the TPC tracks to be related to the TPC vertex (Mikolaj)

added calibrated time information for the clusters

added a common macro to run on local kine only files

add clusterInfo functionality to the residuals

Small fix to copy ctor

Forcing the TPC tracks to be related to the TPC vertex

Improve copy and assignment operators

Matching new and delete of arrays

Bug fix by Hermes

The vertexer is now set from GRP

Check the status of the command pipe, it might be 0x0 if the process cannot allocate enough memory

Enalrged size of char arrays

Updated reco. parameter using the latest version of MakeITSRecoParam.C

In MUONTRGda:
Replace the structure used for the DA configuration with a class, in order to
comply with the AliRoot coding rules
(Bogdan)

Create the verxer inside the event loop. In this way we can handle correctly the reco-params which may change from event to event and therefore may force the usage of different vertexers depending on the event type. That fix should allow to remove the remrands of the reco-params init in the PbPb rec.C

Update of the READMEmuon file (Bogdan)

Removing useless Expand of digits

AliFastGlauber is a singleton.

Analysis Taks for RecoCheck muon code (Bogdan, Nicole)

Relocatable compiler position

update of the HLT TPC test macro (Gaute)
- adding TrackDump and TrackHisto chains
- macro serves multiple chains, selected by an argument string
- updated time bin range of CF components to 1001 following update of
  TPC/Calib/Parameters in rev. 29713 (Nov 5 2008)
- updated documentation

Cc ciolations corrected

Adding a protection in the EndOfDetectorCycle method: it avoids to perform
operations related to ESDs when the task is not AliQA::kESDS
(Guillaume)

Fix problem with SDD cluster finder efficiency by upgrading noise suppression algorithm (F. Prino)

Corrected volumes names in St2V2, Slat and Trigger geometry
builders to follow the ALICE naming conventions
(all volumes in MUON module start with 'S')

Removing dependence on ESD files and new possibility for selecting muon multiplicity in the forward region (Enrico, Roberta)

Creation of AOD tag file using the new development of Andreas Morsch (Enrico, Roberta)

Removing obsolete files

adding explicite dependencies of libAliHLTTPC in order to make macro work with libraries from AliRoot build

extending the CompStatCollector: added scalers for the object publishing, added file writing mode

Introducing the getters (setters) for local covariance matrix from (to) the global one stored as data member (thanks to Andrea Rossi)

added linkdef and pkg for UNICOR in PWG2

fix for memory leak after using selections

Added AliAnalysisAlien::EnablePackage(const char *package) to be able to work with par files via the AliEn plugin. Currently if used has to be called for ALL analysis framework packages in the right order: STEERBase, ESD, AOD, ANALYSIS, ANALYSISalice + user par.
(M. Gheata)

Coding conventions...

Coding conventions...

modifications to satisfy  the coding conventions

Added a new methods (fitting of Q vector distribution)

bugfix: corrected argument increment in the parsing loop of DoInit, ScanArguments result was not considered correctly

improved verbosity

extend functionality for HLT usage and improved verbosity (Kostya Alex)

In Notify, correct handling of the local case where the path is empty. (R. Arnaldi, AM)

Thermal Photon fast Generator (Serguei Kiselev)

Temporary fix for a problem with SSD bad modules and chips (Dainese/Prino)

Moving UNICOR to PWG2

Adding trigger domain and trigger decision classes. AliHLTTrigger now produces an AliHLTTriggerDecision object as its result.
Also adding a skeleton class for the global HLT trigger component.
Cleaning up some documentation.

linked loaders at clusters level

Fixing problems during merging

Protection in case of not existing objects (Marian)

Using GRP instead of local setters.

Using sh instead of csh

not needed anymore

AliMUONRecoCheck udate:
- Add a new constructor which is used by the analysis task
AliAnalysisTaskRecoCheck (from PWG3/muon), with input from files
stored on the grid.
(Bogdan)

Changing invalid value for floats.

Using GRP instead of local setters

Updated list of libraries

Adding the domain entry class which will be used for the trigger domain, and adding the readout list class which is basically just a C++ wrapper around the AliHLTEventDDL structure, but it implements required operator
functionality.

Using GRP instead of local setters. Check of the created ESDs, production of standard AODs.

correct coding violations

Using GRP instead of local setters. Check of the created ESDs, production of standard AODs.

reset track points before usage

Creation of AOD for from the RAW ESDs. No need for geometry.root in the reconstruction of RAW

Using GRP instead of local setters. Creation of AOD for from the RAW ESDs. No need for geometry.root in the reconstruction of RAW

added comment on specious initialization, which is in fact correct

For branch replication copy the content of simple objects header and tracklets, not the pointers.

inserted the first calibration task for reconstruction algorithms
- task for cluster error parameterization (first version)
- helper class for matching TRD clusters with global tracking info
- updates in the tracking resolution task

Now it is possible to select kPyCharmppMNRwmi
or kPyBeautyppMNRwmi events with at least an electron from
c or b within given cuts. (A. Dainese)

Now it is possible to select kPyCharmppMNRwmi
or kPyBeautyppMNRwmi events with at least an electron from
c or b within given cuts. (A. Dainese)

fix fitting procedure for measured data

protect task against missing MC info

removed old online gui. Wasn't used for a long time. As AliEVE should be used.
-> This done to eliminate the coding violations

Adding document for performance study (marian)

Remove empty spaces in the beam type string

Coding rule violations fixed.

AliWarning instead of AliFatal

AliWarning instead of AliFatal

Fixing a bug in the QA and some updates in the visualization macro

Using GRP instead of local setters

Fixing coding conventions violations
(Javier)

Expand raw-data pathname (Laurent)

Correcting the handling of TObject in constructors and assignment operators.

removing obsolete classes

bugfix for 64bit systems (invalid cast)

updated logging concept
- global method to set the local logging default
- updated documentation
- logging key for components set from chain id local

Introducing the charge of reconstructed cascade particles (B. Hippolyte)

Single muon analysis from ESD using for the production PDC08/LHC08t (Bogdan, Nicole)

Single Muon Analysis from generic or muon-selected AOD's (Diego)

finalizing DataGenerator component producing fake data for benchmark purpose

Update of Constants for the Acorde's Geometry

removing obsolete files + fixing some doxygen warnings + added some documentation