Do not allocate fixed size arrays via new

Moved destructor to cxx to suppress complaint about fwd decl.

Fixed initialisation of histgrams

possibility to switch between event vertices

config macro for TPCITS task

fix bookkeeping of RPs when de-tagging

kPsiPrimeJpsiDiElectron added
Moritz Pohl

- removal of obsolete members and methods
  TRAP configuration settings are all in trapConfig

Fixes for report #68312: Improper usage of TClonesArrays in ITS

Added TObjArrays to avoid warnings at runtime (Christian)

added a directory with user macros

Add flag to switch on multiplicity calculation in ITS Vertexers (to be used in the mean vertex DA)

Fix for neg. crossing angles.

Added histogram for ITS-PID cluster selection

Setters for ZDC configuration added in AliZDC

Problem in 1 histo retrieving during reco solved

changed name to DA source files

Possibility to propagate tracks to the DCA to the primary vertex at the AOD level (A. Dainese)

fixed build error

turn off online readout efficiency in pre-processor while waiting for new DA validation at P2

Fixed bug in enum ESDClu_t, to make it identical to the AliESDCaloCluster version

using reference multiplicity

Correcting Chromium A in ITS_INOX - Savannah bug 68603

- updated documentation explaining the new arguments

- added the possibility to take as input a *.txt file containing a list of ESD files to be chained
- updated documentation

work on documentation and verbosity during measured data processing

-Added base Calo QA class.
-Moved Phos functionality to Calo
-Added Emcal class
-Added the output of the HLT Calo physics histogram producers to QA

Added method to recalculate the primary vertex without the daughter tracks

Fix: temporary array expansion

Adding GetGeometryFromOCDB method

removed obsolete methods

Adding GetGeometryFromOCDB function to retrieve geometry (from GRP/Geometry/Data) for current run from any preprocessor.

Correct conversion from Int_t to UShort_t

Changes for report #68133: Filtering of ESDFriends at reconstruction level. The default fraction is fixed at 4%

-mavoid creation-deletion of TClonesArray per event

added detector acceptance effect in AliFlowEventSimple + removed AliFlowEventSimpleMaker dependence from the runFlowAnalysis.C macro

Bug fixed when creating AliCDBGridParam and the cache folder is not set.
Related to bug #68721.

Added protection against missing ESD pointer

Tender now derives from AliAnalysisTaskSE to be able to use the SelectCollisionCandidates functionality.

Methods to verify the if the tracklet/single cluster is used by ESD track.

Modified trackleting: AliMultiplicity stores info if the clusters
used by the tracklets or "singles" are used in tracks.
The trackleting step is moved from the vertexer to the end of
reconstruction loop.

changing smoothing sigma for AliRelAlegnerKalman
(marian)

correct memory leak in digitizer, put protection in AliEMCALDigit dtor

Last files needed for centrality reconstruction @ 1.38+1.38 A TeV

1. SetDefaultOutputs(kTRUE) used by default. This will automatically archive the analysis outputs. In this case, calling SetOutputFiles and SetOutputArchive is now forbidden and will produce a fatal error. To use arbitrary output files and archives, one has to manually reset the SetDefaultOutputs flag.
2. Specific SE's are not allowed anymore via the plugin.
3. To specify the number of replicas for the output archives, one should use SetNumberOfReplicas(n) where the default is 2 and the maximum allowed is 4.
4. stdout and stderr files are not registered in the catalog in case a job enters in DONE state.

AliCollisionNormalization:
 - Adding member for energy and pointer to stat histogram (all events)
 - Some more printout in ComputeNint
 - Using energy in GetRelativeFractions

AliCollisionNormalizationTask:
 - Using the bin0 callback
 - Explicitely setting ntracklet = 0 in MC if the event is not selected

runProofNormalization.C:
 - Changes to run on the new CAF

plots (DDL data size and DDL occupancy) scaling corrected

use OpenFile for TTree saving (suggested by Andrei)
use AliESDInputHandlerRP for linking the data in private train steering
macro

there have been some changes in the on-line tracklet and GTU track
implementation which require adaptations also of the visualization
code (Jochen)

Added event-level selection (Chiara)

Updates for TPC TenderSupply (Jens)

Add protection against an AliWarning appearing when getting the track status in AliITStrackeMI::RefitAt

GPU tracker update

- return pad centre for z-position (before pad edge)
- additional methods to provide ROB/MCM position for real tracklets

fill the refmult

Possibility to copy the number of the TPC clusters from an AOD track to an ESD track (A. Dainese)

- adapt tracklet reading for tracklets from simulation or real data
- output to tree (instead of branch)

 adding spectra tasks for R = 0.7

Adding some histograms for jet shape

Update of the GPU tracker

Introduction of summable digit class. The implementation of SDigitization and RAW2SDigits will follow.

added calibrate esd flag

Increase class version, forgotten in the previous commit.

Update by Jochen concerning HC header treatment, including:
- error output generated in error functions with debug level
  (configurable at compile time)
- set error flags to steer further reading (run-time configurable for
  every error type)

Finally removal of the last left-over from the previous implementation of the vzero digit.

Adding a bit that specifies if the online (beam-beam,beam-gas) flags are filled (correctly) in the ESD. To be used in AliTriggerAnalysis in the replay of the online trigger.

Added eta cut and minTPCcls for single tracks

Coding rules (Rossella)

- fix bug https://savannah.cern.ch/bugs/?68562
- fix bug in filling cluster charge histogram

Warning corrected

fix pointer allocation suggested by Andrei

changes for JETCorrel from Paul

Return supermodule number from eta and phi, taking into account the number of supermodules of the selected geometry

added option to create flow event from SPD tracklets

Gap between paderow used for seeding as parameter in AliTPCRecoParam

(Marian)

Some theoretical consideration:

The track seeding efficiency depends on the cluster finder efficiency - ceff.
ceff is dEdx dependent, in mean is about 0.8 for MIP is about 0.75
The probability to find a seed=
pseed = ceff^3
Probability to find a track in nseedings
ptrack = (1-(1-pseed)^nseeding)

nseedin = npadrows/gap.
Until now we were seeding in outer sectors with gap 6 and 10 pad-rows (r dependent).

For tracks crossing the full TPC the track finding efficiency is
( you can draw it using TF1 f1("f1","(1-(1-0.75**3)**((160.-64.)/x))",1,10))
99.5% once the gap 10 pad rows is used.

For short tracks = kink decays e.g 30 cm from the end of TPC it is about 65% for gap 10 pad-rows, 85% for 5 gap 5 and 95% for gap 3 pad-rows.
(see function
TF1 f1("f1","(1-(1-0.75**3)**((20.)/x))",1,10))

- AliITSv11GeometrySPD.h : changed signature of method CreateConeModule

- AliITSv11GeometrySPD.cxx : mods in CreateConeModule to prolong cooling tubes where they were missing and to add freon
inside tubes; CreateCones has been modfied to add new volumes

- AliITSv11GeometrySupport.cxx : mods in SDDCone to add cables inside the holes of the SDD cone;
  mods in SPDCableTraysSideA and SPDCableTraysSideC to add HV cbles in the trays and freon in the cooling tubes

- AliITSv11Hybrid.cxx : mods in CreateMaterials to define gaseous Freon and the average material for SPD HV cables.

Mario Sitta

Fix warnings

Protection + correction for dimensioning of pointer data members

Wrong path was stored inside of the AliCDBEntry
This was probably the reason why it enters to wrong directory

(Marian)

Produce fatal also when wrong currents configuration is requested

AliMagF will produce AliFatal instead of AliError if loading of field fails

- speed up T0 average calculation significantly
- remove unused data member

fix for bug #66294

Fixing coding conventions (const arguments in functions)
(Ivana)

Cuts updated.

Added macro for analysing output of AliAnalysisTaskHardSoft

Reduced RAW histograms and revisited DQM histograms (A. MAstroserio)

Protection added (Giacomo)

Correctly reset the total number of events (for Amore)

Bug fix with matrix inversion in SetProductionVertex(); sign of GetDistanceToVertexXY() fixed; GetDecayLengthXY() and GetErrDecayLengthXY() methods added (S. Gorbunov)

method to mark RP and POI's

Additional separate histograms for hard and soft events

Fix for report #66086 Remove gstpar calls and put parameters in galice.cuts --HMPID

- speed up HLT tracking by moving ReimanFit to MakeTrack
- remove some unnecessary code

- speed up HLT tracking by moving ReimanFit to MakeTrack
- remove some unnecessary code

option to also calculate generating function cumulants versus multiplicity

Bug fixes (Sadhana)

updates on TOF software:

- added new TOF raw data decoder (enhanced decoder)
- enhanced decoder enabled as default in reconstruction
- TOF raw data policy updated
- all calibration code in AliTOFcalib class
- updates on TOF-T0 classes
- DA for physics runs split for physics and calib events
- DA-physics computes readout+decode efficiency
- PreProcessor put readout+decode efficiency in OCDB
- readout-info object added (Reference)
- changed online T0-fill measurement in PreProcessor
- added online resolution measurement in PreProcessor
- added ResponseParams class and file for TExp correction

Major fixes in the digits and raw-data reco. Now both are equivalent. To be propagated to the release. The trigger inputs bit mask is filled in the friend only in case of raw data. Will be fixed when we switch to the new trigger framework. It is not clear now where to put this data.

added reference mult