Adding TDC channel delays to the calib object.

Merge branch 'devel'

* devel:
  Set trackDx, trackDz in the HLT ESD

Merge branch 'devel'

* devel:
  forgot the header file
  compilation warning

Merge branch 'devel'

* devel:
  Fixed the TRD histogram processing

Possibility to have a software trigger on multiplicity.

Adding variable comments

Add SPD multiplicity selection and monitoring

Fix coding convention violations

set by default collision selection

Macro to plot OCDB pedestal behaviour vs. run no.

Merge branch 'devel'

* devel:
  bugfix in AliHLTEveTRD.cxx

adding option to skip some of the std content of the ESD, by default
AliESDZDC,AliESDFMD,Cascades,Kinks,AliRawDataErrorLogs,AliESDACORDE are skipped
component argument '-skipobject=name1,name2' can be used the change the list of
objects, names refer to the ESD std object identifiers.

Speedup for pp min bias 2.5, for Hijing 1000 PbPb 1.4

added a protection for missing raw reader instance (Gaute)

Protection against uninitialized array of bad channels.

fixes coding violations

Increased cluster histogram binnin

Cleanup and changing of cuts (Ana)

more standardizing of result return codes + always return tmax info + loose parameter limits and consistency checks + ADC smearing for no fits + try-catch for possible minuit exceptions

JetCorrel correction of coding violations, and other style and memory consumption fixes(Paul Constantin)

Allow fixing of local parameters for solver

More detailed sys. info

Using TMath::Abs instead of fabs

Fix tru index calculation (Nicola and Rachid)

Technical hotfixes for the event display in ACR.

Coding conventions

Implementation of a method (RemoveGraphDuplicates) to take away
graph points falling within a specified tolerance of the
previous measured point. (Haavard Helstrup).

use tilt rotation to correctly calculate cluster & tracklet residuals
new plot for pt resolution @ DCA

PMT signal shape added to the digitizer. The shape is extracted from real data using TDC leading and trailing times.

call back function to fill 0 bin

new functionality added

restoring backward compatibility after changes in AliTRDseedV1 r39693

adding check for AliTRDseedV1 r39693

Coding violations

AliQASPDChecker : Checks for Raw QA implemented [first version] - AliQASPDDataMakerRec : online histograms for FastOr added within offline QA framework (A. Mastroserio)

Merge branch 'devel'

* devel:
  fixed bug in AliHLTEveHLT.cxx, reenabling some histos

define monitoring External Track Param for TRD track as follows
1. TRDin - track from TPC, propagated to first TRD point, before TRD
update
2. TRDout - track refitted after the last TRD update, before propagation
to TPC

added monitoring histograms for these parameters
update run macro for changes in the Analysis framework

more constant functions and parameters

removing unused code

New task for D* pt-dep analysis (A. Grelli)

coding conventions

Compilation warnings (Fiorella)

making const what wants to be const

adjusting function names

New addTask with selection options (B.Hippolyte)

Coding Conventions

fix https://savannah.cern.ch/bugs/?64481

Update SPD PIT Conditions - Savannah bug #63729 (A. Mastroserio)

Updating test files.

Option for patching of the omega dalitz decay.

Merge branch 'devel'

* devel:
  bugfix, only draw TPC histo of filled
  resolved cluster handling for PHOS

resolved cluster handling for PHOS

Storing the timestamp of the second measurement in case the Machine Mode or the
Beam Mode change during the run.

Confusing print changed

fixing a warning

Savannah bug #63729, SPD Dead Map and PIT Conditions...(A. Mastroserio, D. Elia)

reverting r39713 due to problems it caused with some compilers

making const what wants to be const

Move sub-classes AliEveHOMERSourceMapByDet and
AliEveHOMERSourceMapByType to their own h/cxx files.

Coding conventions

HV.and.LV status maps: off data collection. TOF channel status stored in OCDB: RO.andLV at SOR

Correct compiler warnings

moving some files for the pendolino module around in order to prepare merging of external module

Including "-y" option in find for OCDB queries. Including new tag values
when adding a file to the OCDB (using the return code of TAlien::Mkdir()).
(Chiara + Raffaele)

omega mass is invariant mass of parent.

correct warning

Cast to AliMCParticle

warning fixed

fix warning

Updated CM material and added OFC and OCV segmentation.

Fixed warnings

Warnings fixed.

Fix warnings

switching for HLT.
use seeding pt from vertex constrained fit for HLT application
use Riemann tilt fit for barrel applications

Preprocessor modified not to send the correct gain file

Fixing conventions (Andrey Ivanov)

new design for performance plots of the resolution task
fully integrated with forking analysis on track quality

- fixes for bug 63765 - see for details the post
- heavy modifications to the algorithms of track seeding
- fully tested against simulations

Remove class AliPtMothFromPtDaugh, which introduced unwanted dependency on libSTEER

Fix coding convention violations 2

Fix coding convention violations

Changes for #64259 Request for including the new class AliTRDresponse in STEER and porting this to the release

Merge branch 'devel'

* devel:
  enbable calo clusters display

Method to set the friend file name added.

- something went wrong with previous commit...

- adding module to the internal calo cluster struct

Adding AliHLTMUONTrack object to store ROOTified internal dHLT track data in new format.

Minor fixes to documentation and printed messages.

Coding conventions

- small changes to macro

- fixing bug in resizing of array/buffer in clusterizer

- adding cell info to ESDs

- small change

reconstruction vertex using calculated calble and electronics delays for both sides

In the clusterizer and rawData the creation of the tracklet loader and
tree creation was changed, making the methods
AliTRDclusterizer::OpenTrackletOutput, AliTRDrawData::OpenOutput
obsolete. Thus, they have to be removed from the TRDReconstructor.

Friend reading can be switched off.

bug fixes

void SetBin0CallbackViaPointer( Bin0Callback_t cb)
added

(M. Floris)

remove assignment operator, not needed and could caus problems due to the TLists

Merge branch 'devel'

* devel:
  Fixed bug with the tcp qa canvases
  Added esd track qa histograms

- corrected casting of the block iterator from TObjArray to TClonesArray