Fix to avoid deleting cached CDB objects - modified fix by Peter.

Commenting unused parameters (to avoid compilation warnings).

read track model data block

introducing a variable length array of global parameters for coordinate transformations

couple of protections for calculation of slice from angle; reading of track block and calculation of trackpoints; write sign bit after the pad and time residual values (easier decoding)

couple of protections for calculation of slice from angle; reading of track block and calculation of trackpoints; write sign bit after the pad and time residual values (easier decoding)

separate function to calculate track points from local settings

Updates D* cuts for peripheral PbPb events

Move per-run histogram initialization at the beginning of UserExec().
Replace Info, Error, Warning, Fatal by AliInfo, AliError, AliWarning, AliFatal.

- Update thresholds with online values
- Improve treatment of histograms with 0 entries
- Improve box display
(Diego)

- Disentangle masks effect from trigger chamber efficiency estimation.
  The resulting efficiency can be plugged in simulations together with RAW masks:
  no more specific storages needed in anchor runs simulations.
(Diego)

libANALYSIS must now be before libSTEER ... ?

AddTaskDplus adapted to central train (Zaida, Renu)

Possibility of using an eta gap between subevents + VZERO plane updates (Robert, Giacomo)

in cells analysis, apply time calibration if it was set and not if energy calibration was set

If input already calibrated and calibration or pedestal maps not passed, the time cut was not taken into account, now cut applied first thing and before any check

Added possibility of using * wildcard in histo names to clone (Diego)

enabling track references for Momentum array (M. Estienne)

adding ReverseAlignment function, calculation of adjugate rotation; deleting implementations of copy contructor and alignment operator which have been private anyhow

Removed TObject::SetObjectStat flag settings

From Christian: Install scripts when ALICE_ROOT does not point to sources

Changes for Pb-Pb DQM QA

added protection against division by zero for pp

Protection added against files from DQM were found in the DAQ FXS, but no raw tag data files were there.

First version of an analysis code for Spectra analysis on AODs. The code was developed in Summer 2011 by 2 summer students (Philip Versteeg, UU, Redmer Bertens, UU) under the supervision of Michele Floris. It can serve as a starting point for AOD analysis.

creating the AliHLTGlobalPreprocessor from the agent

adding AliHLTGlobalPreprocessor to build

adding the 12 month old draft of the preprocessor plugin for HLT StreamerInfo

prtotect against missing QA projections in mass production

fixes and extensions:
1. Fix wrong sign of x*rho in track
2. Fix operator=
3. Store "quality" of tracklet for PID in ESDtrack (TBoccupancy and
TBcross)
4. modification of tracklet interface for TB occupancy

fix coverity

introduced in the event selection cuts to reject pileup events (Francesco, Ruben)

Bunch crossing ID added

correct binning of hNCellsMod histogram, set remaining TH3 histogram to be filled if requested

Clusterizer: Move the setting of the AOD event keeping after the event is accepted or rejected
QA: Check cells if there is at least one cluster in the event (avoid rejected events by clusterizer)

Dstar updates to run in central train (Alessandro)

Better starting value for estimate of covariance matrix (Maksym, Silvia)

DQM histograms for shifters updated

Centrality selection can be set from outside (Andrea

add one more condition on SM4 to reject LED events

full resolution monitoring for clusters, tracklets and trackIN

- bugfix for reporting of active half-chambers to AMORE

Removing AliGammaConversionAODObject

fixing warnings

Fixing warnings

Merging gsi train and aliroot trunk

bug fix error calculation

Update IncludePath (Chiara)

 crash of T0 QA Agent fixed

Changes in recoutils to go with reworked tender: 1. Enable accepting kink daughters in loose track cut; 2. Change MaxSnp in extrapolation from 0.99 to 0.8

Added (partial) LHC11e period

adding TRU/L0 plots for shifter and logbook image - code from Francesco B.

removed hard-coded disabling of kinks and cascades by Laurent and added them as parameters

modifications to BC and trending (Ionut)

TString comparison not done with strcmp

- Disentangle masks effect from trigger chamber efficiency estimation.
  The resulting efficiency can be plugged in simulations together with RAW masks:
  no more specific storages needed in anchor runs simulations.
(Diego)

memory leak fixed

adding reading of compressed data in the monitoring

correcting arguments for the huffman training configuration to run track model compression

correcting the drift time transformation; optional output of cluster id array in verification mode

write optional array of cluster ids for mapping and verification of compressed data

default HLTOUT handlers for cluster id arrays added: {'REMCLIDS':'TPC '},{'CLIDSTRK':'TPC '}

new data types for arrays of cluster ids used for verification of data compression

Histo titles

- propagate trigger flags to ESDs also without digits conversion

QA: Move print to debug mode
Pi0: correct wrong comparison of calorimeter name in if statement

Improve LED events rejection, based on Rongrong studies
Add it to PartCorr frame.
Selection in 3 different places, to be moved to common place, maybe AliEMCALRecoUtils

Adding new TRD cosmic triggers.

o remove unnecessary printout

- propagate trigger flags to ESDs

Correction for references.
Gustavo Conesa

Coverity fix

o exchange printf with AliInfo

delete pid utils in destructor

changes to warn when delete on global object is called, and init variables

changes to warn when delete on global object is called, and init variables

update with track matching and track producer

Possibility to make PT sorting (Jochen)

Implementation of TRD trigger flags (Jochen)

correct wrong default initialization of time recalibration histograms content

First implementation of the time calibration for analysis in AliEMCALRecoUtils
All the other classes addapt to this change
AliAnaCalorimeterQA: Some minor fixes, put back the track matching related histograms
AliCalTrackReader: Add a swich to recalculate the clusters or not, even if the AliEMCALRecoUtils switch are on, avoid multiple aplication of calibration parameters in case of using clusterization task.
AliAnalysisTaskEMCALClusterizer: Possibility to add matched tracks in AODCaloCluster added, this needs a patch in AliAODCaloCluster not committed yet.

Fix for DA's

Radiator trasparency calculation updated

Fixes for #87003: Drift velocity calibration + Bug in the AliExternalTrackParam (Ruben)

From Levente: Require z vertex within ± 10 cm and require ITS+TPC refit for tracks

Fix for #85144: Memory leak in SPD DQM agent (Annalisa)

corrected obvious typo. which value to chose between 0.045 and 0.050 is a bit matter of taste so I just fixed the obvious typo

set br names

Add dependency on EMCAL for TenderSupply par file creation

Correcting the previous commit. AOD analysis added. First step of the inclusion of a new task, temporarily disabled

AOD analysis added. First step of the inclusion of a new task, temporarily disabled

Updating DA to store TDC offsets

STEER/STEER depends on ANALYIS

simplified

extending interface of AliHLTDataInflater by reading method NextValue; moving data inflation and parameter decoding to specific inflater implementations

dedx method is float but variable declared int, corrected

Reintroduction of AliAnaElectron for Shower Shape studies
Clone of AliAnaPhoton plus specific selection criteria for electrons
Some corrections in AliAnaPhoton and removal of some histograms

Setting new FXS for DQM.
Implementing the necessary changes in the SHUTTLE Framework (to be tested in the nightly tests), and a
"trivial" example in the GRP pp reading the "TriggerClassesAndHistosToClone" entry to test the
new FXS (the processing is always successful for testing purposes).

libSTEER depends on libANALYSIS

Possibility to run analysis train inside AliReconstruction (Andrei)