Access to the chain of tags

Additional protection

Macros directory added. Contains analysis train and configuration macros.

Wrong correlation between vz and tof.

Small printf correction in the analysis macro generated by the alien plugin

Replacement of AliMpIntPair object with algoritmic
encoding of pair of integers (proposed by Laurent);
this speeds up all Segmentation search functions
(see timeMapping2.out in mapping/macros).

Ivana & Laurent

Error message removed when data is posted by other than the owner.

Next step towards supporting multiple primary vertices in ESD. Every primary vertex keeps now its ID (ID=-1 means the main vertex, the one with the biggest number of contributors). Every ESD track has now its VertexID, the ID of the vertex this track belongs to (VertexID=-2 means an orphan track).

- New methods added to AliAnalysisAlien:
   SetDefaultOutputs(Bool_t flag) - to force the plugin using the output files from the analysis manager session
   SetMergeExcludes(const char *names) - the file names (separated by blancs) will not be merged
   SetNtestFiles(Int_t nfiles) - Number of entries used for the test case

New FMD reference distributions for low mult

New FMD reference distributions for high mult

A. Dainese updated the method MatchToMC, now it works also for resonant decays,
e.g. Ds -> phi(->KK) pi.

Spiecify that AOD-analysis is needed.

vertex from tracks

dependence on ANALYSISalice

Minor changes

Adding slats.h
(Laurent)

Removing obsolete mapping macro

In Mapping/macros:
- Renaming macros for station 345: all start now with the prefix testSt345
and making them working again.  (Laurent)
- Adding an alternative macro timeMapping2.C (Ivana)

Added minimum probability threshold for PID

Class def updated

Energy calibration coefficient in GeV

New class to analyze unlike-sign and like-sign background for Jpsi from B (Carmelo)

Example train to produce HF candidates

Use method AliAODRecoDecay::MatchToMC()

Kelly:
- committing testing macro for testing the noise map component together with the histogram handler
- added doxygen style documentation in the header and the testing macro
- small histo additions (axis names etc)
- removed compilation warning message

Changed to new naming scheme for histograms, added functionality to the analysis task to do combinations without applying any cuts to the v0. Added more cuts. Changed to use better values for cuts.

Updated list of classes (cmake)

I should not commit with no sleep... I should not commit with no sleep... I should not commit with no sleep... I should not commit with no sleep...

Update the DCA calculation for V0 daughters (for consistency)

Updated lists of files (cmake)

Updated lists of files (cmake)

ESD or AOD analysis can be chosen with the constructor.

Accidentally added SRC removed.

bug fix #48587
Artur Szostak <aszostak>

First set of modifications for size reduction of MapsTimeSDD objects in OCDB: new classes added, for the moment not included in compilation (F. Prino)

Make TRefArrays transient to avoid crashes on proof when ProcessID is missing

Use MultiEventHandler instead of MultiAODHandler
Allows mixing of esd events.

AliExternalTrackParam moved.

AliExternalTrackParam moved.

pdgcode from MCtruth corrected. (A. Mastroserio)

GetTPCTrackLength as acceptance criteria for trackable particles added. (M. Ivanov)

Drift speed correction from Millepede stored in the OCDB

Modifications to store in the OCDB the drift speed corrections (Delta Vdrift) from Millepede. SDD clusterfinder has been modified to use this correction (F. Prino)

Adding function to calculate TPC track length in active volume of TPC

Float_t  AliGenInfoTask::GetTPCTrackLength(const TClonesArray& trackRefs, TParticle*part, Float_t bz,  Int_t &counter, Float_t deadWidth){
  //
  // return track length in geometrically active volume of TPC.
  // z nad rphi acceptance is included
  // doesn't take into account dead channel and ExB
  // Intput:
  // trackRefs
  // bz - magnetic field
  // deadWidth - dead zone in r-phi
  // Additional output:
  // counter   - number of circles

Fixing bug with skipped regional structures by filling in empty structures, similar to fix in revision 31577.
(Artur)

remove obselete clean QA macros command

Modified initial comments, since this DA should not be used for run type
DAQ_FO_UNIF_SCAN, as originally planned.
Removed the temporary patch of reading chip present information, which
 is no longer needed.
Mean threshold scan header format changed. The current DAC value will now be
replaced by RowSpan and current DAC value should be taken from TPLow,
assuming it is the same for all (active) half-staves of a half-sector.

Henrik Tydesjo

fix warning

- correct calculation of the radial position of clusters by using
  "meaningful" variables:
  - the anode wire position in the local chamber coordinate system
  - the rising time of the TRF (fit)
- update "non-liniar" radial shifts of clusters (fit)
- restructured cluster resolution task

Dummy implementation of the method GetFitResult is added.

Bug fix:

Gain map and the noise map not used in the simulation in the case of
Hits2Digits

(Marian)

Trigger related changes :
 - store hit pattern also for "ghost tracks" i.e. trigger tracks which does not match tracker. This is useful to increase statistics for trigger chamber efficiency determination in cosmic runs.
 - Correctly initialize the parameters for trigger chamber efficiency determination in cosmic runs (in AliMUONRecoParam).
Also:
 - Move trigger digits creation from local trigger store in AliMUONDigitMaker (more appropriate than in AliMUONTrackHitPattern).
(Diego Stocco)

* binalieve.pkg:
Link against ANALYSIS & ANALYSISalice.

* alice-macros/esd_tracks.C:
AliAnalysisTrackCuts was renamed to (or superseeded by)
AliESDtrackCuts.

change of the cdb entry name

added some control histos, adapted the eta range and removed dependcies on generated jet energy for correlation matrix

The component path in CDB changed - probably it was wrong before.

Total amount of used memory has been optimised

Fast ALTRO fit (A.Pavlinov)

AliHLTTPCCATracklet.h added to compilation

Update of the CA tracker

Ensure that the ADC array is only called for valid entries (AliTRDmcmSim) and bug fix (AliTRDfeeParam)

Corrected destructors (J. Thaeder)

pdfset added.

 fixing coding violations

Delete GL annotations when going to a new event.

Fix coding convention violations.

update QA of RecPoints with histograms taken from QA of ESD, namely:
- map of cluster position per chamber
- averaged multiplicity and charge per chamber and per DE
- multiplicity and charge dispersion per chambre
(Philippe Pillot)

added a protection in FillTriggerDCSHistos when DCS map is not there
(which is currently the case with real data)
(Laurent)

including libAliHLTJET library into HLT build system
- configure now checks for fastjet package specified in option --with-fastjet=<path> or from $FASTJET environment variable
- compilation with fastjet can be disabled like --with-fastjet=no to override environment variable
- NOTE: compilation together with fastjet remains to be checked !!! Presumably more adjustments needed

Protection added.

Added new function to get index of current particle

fixed a problem with writing the expert QA Data. Added a method in simulation and reconstruction to control the writing of QA expert data

Macro to study the effects of fake tracks on the dimuon spectra.
Results are saved in the rootfile DiFakes.root.
Results are relevant provided that you use the same recoParams as for the reconstruction.
(Philippe Pillot)

Macro to study fake tracks by comparing reconstructed tracks with TrackRefs.
Results are saved in the rootfile Fakes.root.
Results are relevant provided that you use the same recoParams as for the reconstruction
(Philippe Pillot)

correcting compilation warnings and a typo so far without consequences

Change names of sections to avoid confusion with MCH DA sections

making the HLT build system working again: adding libXMLParser to the list of required ROOT libraries due to new functionality in libCDB (r 31411)

Save the simulated track ID in the UniqueID of AliMUONTrack (Philippe Pillot)

Quenched pythia code in separate library and directory

Moved to QPYTHIA

Rollback since problems with Mac

Fix for bug report #48432: Consistent size of the PID array in the base and derived classes

- Correct calculation of tracklet-track pulls by considering the full
covariance matrix in the yz plane. To be followed.
- Documentation

Updated geometry including fixes in ITS and FMD

Adding default performance histograms (Marian)

- Prepare covariance matrix manipulation in the tracklet for resolution
studies
- protect CookLabel function in the TRD track
- fix warning in the SA tracker

changes AliTRDSignalIndex
 - remove obsolate function
 - remove unused virtual

changes AliTRDdigitsManager
 - remove unecessary dependency

* Added HLT classes for Jet reader and Jet reader header
** classes are supposed to be used for Kine, ESDs and AODs
** inherited from JETAN classes
* Add HLT class for track cuts
** class is supposed to be used for Kine, ESDs and AODs
** inherited from AliAnalysisCuts
* Update of test macro
* Usage of HLT jet reader in both JetFinderComponent
* Update pkg and CMake file

* Update of on-line MC event
* update of filling in publisher

 Fixes of warnings pointed out by FC

Fix warning

Fix warning

Fix warning

Fix warning

Fix warning

Fix warning

removed redundant memory allocation

AliTPCPointCorrection.cxx  - warning removal
AliTPCcalibAlign.cxx AliTPCcalibAlign.h - Kalman filter for alignment
warning removal

Warning removal +

AliTPCcalibPID.h AliTPCcalibPID.cxx -
More ratio histograms - Ration dEdxfrac/dEdxfull

AliTPCcalibUnlinearity.h AliTPCcalibUnlinearity.cxx
Adding Quadrant alignment
Edge effect histograms

AliTPCTransform.h  - removing warning visible in
gcc version 4.2.4 (Ubuntu 4.2.4-1ubuntu3)
not in
gcc version 3.3.5 (Debian 1:3.3.5-13)