Coding conventions (Annalisa)

Removing wrong inline from the implementation file

Patch from Christian Holm

New FMD calibrations from Christian Holm

Additional protection

Fix to avoid problems in the fit of clusters (K.Shileev)

Coding conventions (C.Blume)

Corrected initialization of time and adc arrays in a loop

Coding conventions (A.Pavlinov)

Corrected path to the default CDB storage (A.Colla)

Removing memory leak in case of cached CDB entries

Coding conventions

Additional protection

Improved, numerically stable, formula (Yu.Belikov)

Removing obsolete classes (J.Klay)

Coding conventions (J.Klay)

Zero misalignment

Fix warning

Zero misalignment

Using AliVZEROv7 by default

Getters needed by the visalization (Matevz)

Updated version of the TRD calibration files (Alberto)

Set of modifications:
- Besides the overlapped 4x4 cells sum, now we consider also the not
overlapped 2x2 sum, necessary to do the selection of the L0 trigger.
- The maximum sums and cell positions for the 2x2 and 4x4 sums are
calculated and they are kept.
- The maximum amplitudes are transformed in Raw adc samples. Each time
bin of the sample is compared to the trigger threshold until the bin
sample is larger. The adc sample array is also kept.
- Defined a bool, fSimulation, if True, it loads the digits from the
trigger code, if False, the TClonesArray with the digits must be
provided to the Trigger when we call it.
Gustavo

Trigger method FillTRU (for PHOS it is in AliPHOSTrigger) modified and
added new method GetCellPhiEtaIndexInSModuleFromTRUIndex()
Gustavo

- Constructors: Correctly charge the geometry to avoid crash when opening a
different aliroot session from RecPoints to ESD
- New method GetPrimaryIndex that finds the index of the particle in the
kinematics tree that probably generated the reconstructed cluster.
Gustavo

RawSampledResponse() made public because it is needed by the trigger (Gustavo)

The modification of the loader requires to change calls loader->LoadDigits() to loader->LoadDigits(EMCAL) (Gustavo)

Calls to LoadXXX() modified to try to avoid  wrong 0 event (Gustavo)

- FillESD: Reject digits with time larger than 256*256/1e9*100 and diminish
correspondingly digits multiplicity)
- FillESD: Fill the methods GetM02 = lambda02 and GetM20=lambda12
- FillESD: Added the call to AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex to fill
the AliESDCaloCluster::GetPrimaryIndex.
- FillESD: Shower Shape methods only filled if the cluster is not a pseudo
cluster.
Gustavo

Default calibration parameters generatedd using macros/CalibrationDB/AliEMCALSetCDB.C (Gustavo)

Correct the zero calibration parameters, they were the PHOS ones (Gustavo)

Additional protection (Yu.Belikov)

Temporary fixes in case the Minutit fit doesn't converge (K.Shileev)

Streamlining polynomial evaluation

Simplification of Makefile and some small corrections

Optional stream level for debugging purpose. By defualt no debug output. Enable it by calling AliTRDreconstructor::SetStreamLevel(1) (M.Ivanov)

Print method renamed to PrintPID

SOme methods made virtual (M.Ivanov)

GlobalToDetector method. Reading transformation form TGeoManager (M.Ivanov)

Applying TGeoManager transformation. Coding convention (M.Ivanov)

Correct treatment of alignment data in case one loads and try to apply alignment data for detector which has not been simulated

Coding conventions (Ivana)

dos2unix (Solaris x86)

New SPD simulation (Massimo):
- speeding up of the diffusion code (Bjorn)
- creation  of CDB file with the dead channels, implementation
of the CDB reading, check of  the code (Henrik, Giuseppe, Domenico)
- final tuning of the diffusion model parameters (Romualdo)

Initialization of some variables (Bogdan)

Initialization of hadronLowPt and hadronHighPt

Removing obsolete class

Recreate the rec. points in the beginning of the session

Coding conventions (Christian)

Correct raw data reconstruction in case of trigger

Improved version (F.Carminati)

Coding conventions (A.Pavlinov)

Use run 0 if the CDB run is set to -1 (A.Colla)

Internal run number set to -1 (A.Colla)

Implementation of the latest upgrades in AliCDBManager (A.Colla)

Run number in query set to -1: forces AliCDBManager to use its run number (A.Colla)

Checks on cache status before deleting calibration objects (A.Colla)

Do not delete AliCDBEntry if cache is active A.Colla)

Cache flag initialized to kTRUE. Run number initialized to -1 (A.Colla)

run number in query set to -1: forces AliCDBManager to use its run number (A.Colla)

Default calibration (A.Colla)

Updated version (Panos)

- Class description on 5 lines (Coding conventions)
- Adding third slash to all member function comments (for Doxygen)
(Ivana)

Class description correction/addition/cleanup (Ivana)

Ideal calibration coefficients for PHOS EMC and CPV (Yu.Kharlov)

Default constructor creates CDB storage with centrally set run number (Yu.Kharlov)

Typo

Correction in the volume path

Zero misalignmentr (C.Oppedisano)

Removing extra space in the name of the shape, which caused serious problems on Mac

Adding the full covariance matrix for the TOF space-points

Adding the full covariance matrix for the ITS space-points

Adding zero misalignment for PMD (C.Cheshkov)

Removing obsolete code (C.Cheshkov)

Coding conventions (A.Szostak)

Using look-up table to calculate the integrated spectrum (Valgrind)

Updated version (Bogdan)

Bug fix (Chiara)

Coding conventions (Brigitte)

Coding conventions (Ivana)

In GenerateNoisyDigitsForOneCathode():
Corrected the probality that the noise is outside NSigma
(Alexandre)

Moving the misalignment to AliSimulation and AliReconstruction (Cvetan)

Default run number -1 (Cvetan)

Zero mis-alignment parameters for FMD (C.Cheshkov using AliFMDAlignFaker)

Corrected behaviour in case the volume was already misaligned

Working version of the class for the TOF Trigger. For the time being,
it includes the four TOF level zero triggers (pp Minimum Bias, Multi-Muon
cosmic trigger, High Multiplicity trigger and ultra-peripheral collision
trigger; the level 1 trigger for the jet topology is still missing)
Chiara and Silvia

Distinguish between the reconstructed and default vertexes (Panos)

Modifications needed to do the following:

1) if the run number stored in the CDBmanager is negative, the CDB is accessed with run 0. The cache for ITS is temporarily disabled and the calibration objects, stored in AliITSDetType* are deleted by the container class destructor.
2) if the run number is >=0, the cache is enabled and the calibration object are not deleted by the ITS container destructor
3) if the GetCalibration method is called more than once per run, the access to CDB is not attempted more than once
Massimo

Updated code for PDC06 (Alla)

Fix in rigger logics (Alla)

Code cleanup, removing debug printouts (Alla)

Coding conventions

Removing meaningless const (icc)

Removing meaningless const (icc)

Removing meaningless const (icc)

AliTRDcalibDB class adjusted to the latest changes in AliCDB (Jan-Fiete)

Trigger: changes in the electron identification (B.Vulpescu)

Coding conventions (Ivana)

Adding commented lines for setting local misalignment data
in simulation
(Ivana)

LoadTransforms(): adding protection if no geometry is passed
(Ivana)