Destroy method in case we decide to switch to the QA-manager singleton in AliReconstruction

set specific storage for the GRP entry to the local directory folowing the policy of the normal simulation

bugfix: move access of AliTPCcalibDB to DoInit. Otherwise the instance
is created before the OCDB is set up in the online system

Fixed warnings (Markus)

Fixed warnings, coding conventions, updates (Ionut, Ludmila)

Correcting the comment

Making the numerical protections against 0 magnetic field work correctly (thanks to Ruben)

Add macro for the LRC (Andrey Ivanov)

Added a check for the existence of OCDB entries used by AliTPCTransform. These are TPC/Calib/PadTime0 and TPC/Calib/Partameters, and are used for t0 and drift corrections.

Updated documentation.

First set of modifications to handle in SDD DAs the information about ADC sampling frequency (F. Prino)

From Davide Caffarri: fix coding convention violations and some other minor corrections.

Backward compatibility (thanks to Ruben for spotting the problem)

1. Adding possibility to mask the transforamtion in Dump procedure
2. Monitoring of the RMSy and RMSz in QA plots

(Marian)

AliTPCTransformation.h AliTPCTransformation.cxx
Adding new formula - Z rotation
+
Using of parameters in transformations -Lx,Ly,Rz
+  // param[0]= n  - cos(n *alpha)
+  // param[1]= n  - sin(n *alpha)
+  // param[2]     - indication - 0 - the same for IROC OROC 1 - opposite

(Marian)

GetBZ (using in real tracking) was returning hardwired 5kGauss for +30kA etc. Changed to fitted Bz value at xyz=0,0,0

Putting some order on usage of the sign of B field in reconstruction.

Added possibility to resume merging (automatic).
Added possibility to specify the number of runs to be processed per master job via SetNrunsPerMaster().

new round of documentation
- cluster position reconstruction
- cluster error parameterization

In AliMUONTrackReconstructorK:
  - Correct computation of local chi2 at first cluster.
In AliMUONQADataMakerRec:
  - change computation of local chi2 (X,Y) at cluster.
  - add histo of local chi2 (~0.5*(chi2_X+chi2_Y)) at cluster (this is what
    is used to select clusters during the track improvement at the end of
    the tracking procedure).
  - add histo of ThetaX and ThetaY angles of the reconstructed track (not
    corrected for MCS in absorber)
  - move summary histograms in the no-expert list
(Philippe P.)

Any path structure in alien is now supported (Andrea R)

In AliMUONPedestal.cxx:
Adding missing newline at the end of file

new ratio plots to compare

Always return kTRUE as the reconstruction status of the smeared MC primary vertex (F.Prino)

matching new names

Set title of vertex created with AliITSVertexerFast (to be used to check the vertex status)

Use Riostream.h instead of iostream.h

Updating dEdx treatment during tracking (F.Prino)

changed axis titles in QA plots

Updated list of files

New analysis added, Neutral meson invariant mass measurement: pi0, eta, omega,
and temporal class for Calorimeters QA analysis, to be moved to QA frame.

AliTOFFEEReader modified in order to deal also with TOFFEElight data. The methods LoadFEElightConfigand ParseFEElightConfig provide the same functionalities as LoadFEEConfig and ParseFEEConfig, but shall be used when dealing with a TOFFEElight object. An input TOFFEElight file has been added as well in order to carry out test. The file has been created on the basis of a TOFFEE (see complete file name) file, reading and parsing it with AliTOFFEEReader, then creating the TOFFEElight file using the CreateFEElightConfig function.

 better picture for the documentation
--This line, and thos  below, will be ignored--

M    clusterSigmaMethod.gif

- developed calibration algorithms
- documentation

- adjusted error parameterization
- default to LUT r-phi method
- documentation

define roads dynamically when attaching clusters based on
- variance of the Kalman track for barrel tracking
- variance of Riemann fit for stand alone tracking
- variance of the *standard* TRD cluster corrected for tilt

added TOFFEElight configuration file. TOFFEElight is a new data structure passed by the TOF FEE configuration DB (DCS side) to the TOF preprocessor (SHUTTLE). The aim of this new data structure is to summarize in a compact and portable way the TOFFEE data. TOFFEE data are just the dump of the FEE configuration DB, therefore the data structure is strongly related to the DB structure. Any change in the DB structure would require a change in the routines which read the TOFFEE. Using the TOFFEElight we do not read the TOFFEE anymore in the TOF preprocessor, but we only read the TOFFEElight. TOFFEElight is constructed directly by the TOF FEE configuration manager parsing the TOFFEE. Any change in the TOF FEE DB structure must not be visible in a TOFFEElight object which must always preserve its structure if no more data are needed. In this way the TOF preprocessor is completely independent from the TOF FEE DB structure.

Fixing logic bugs for removing duplicate tracks.

disable HLTOUT handler for component statistics due to bug https://savannah.cern.ch/bugs/?51359

update by Gaute:
- adding new data struct for transport of ITS clusters within HLT
- ITSClusterFinderSPD is now using the new data format as output
- adding histogramming component which rebuilds AliITSRecPoint objects
  from the proprietary data and creates histograms

Adjust matching rules for queued output buffers which have not been used
during the last events. A better buffer handling is in preparation. This
fix should reduce a slight increase in memory consumtion if requested buffer
sizes vary a lot for the individual events. A statistics info has been added
at the end of AliHLTSystem::Run (requires 'frameworklog=0xfc')

Disable writing of individual ESD files for the different origins. It was
the first attempt and has been a debugging feature after proper implementation
of ESD merging. Writing of individual files has now been identified to cause
increasing memory consumption and slow down of reconstruction.

Checking for and removing track duplicates.

added detailed documentaion on cluster error parameterization

Bug fix to correctly fill in the cluster resolution in the ESD.

cluster position calibration plots

Header is created and passed to gAlice

correct calculation of cluster error for Riemann fit

A new function for tracking in the B field arbitrarily oriented in space.

First version of the HLT ITS tracker

Fixing a compilation warning

Update Kink Analysis from Evi Ganoti

Removing warnings pointed out by FC. Thanks

Make ACORDE modules transparent.

redefinition of the exception to the rule of incremental versioning for the specific case of GRP entries with version explicitly set

Use of PID info (ESD combined PID and/or MC PID) for Inv Mass histos (A.Maire)
Priors for Xi (0,0,2,0,1) and for Omega(0,0,1,1,1).

Revert changes made in revision 32751

Fixing output block type return values and documentation.

sdigits reading macro cleaned up

restructure error calculation :
  - move all cluster error parameterization to AliTRDcluster
  - re-implement leading cluster method for radial calculation of pad
    row cross tracklets
  - implement pull plots for cluster calibration
fix minor errors in performance tasks
update documentation

Removing warnings.

remove obsolete protection

Revert previous commit on AliMUONTrigger

More unnecessary log output

Suppress unnecessary log output

Add AliFemtoCorrFctn to CINT

Add protections for CINT

Update runBatch.C for the new AddTask.C macro

Corrected method name semantics. Corrected TRD trigger input creation. Correct description of the AssignInputs method.

Remove compiler warnings in AliMUONTrigger

Removing compiler warnings from  AliMUONGain, AliMUONPedestal.
(Jean-Luc)

Removing compiler warnings from AliMUONRawStreamTriggerHP.cxx.
(Artur)

Compilation warning in CreateInputs is fixed

Warning removal

Fixing compiler warnings

Warnings corrected.

bugfix: propagate CF output to ESD converter in order to fill the MC information

compilation warning corrected

Extension to L0 and L1 trigger classes

- added the offline transform function that takes care of the pad and cluster corrections from the OCDB
- included the testing macro for the translation component from HW to SW clusters

fix bug in considering t0 correction for cluster local drift length
estimation.

 AliFlowCommonHistLYZ1 => AliFlowCommonHistLYZ1SUM

bugfix: following the implementation of AliMagF, the abs value
of AliMagF::SolenoidField has to be taken

Major change in the setup of HLT simulation:
making CA tracking and merging the default TPC online reconstruction.

In order to also propagate the MC information, the reconstruction
needs to run from digits, which is at the moment done when no
raw data is simulated (AliSimulation::SetWriteRawData not used).
Note: the online reconstruction is chosen at the level of
AliSimulation, not AliReconstruction. It is planned to simulate
both the HLT chain running on digits and simulated raw data.

protect against presample clusters in cosmics

AliTPCcalibDB::GetGoofieSensors

GetGoofieSensors were deletd by mistake.

Added workarounds for bugs #51285 and #51281: if the AliMagF instance
is not available, the GRP/Data is used to create the entries for
component initialization. The SolenoidBz entry is unloaded from cache
in order to make the latest version available for components.

Preparing to fix #48360 by setting local storage for transient HLT
OCDB entries

Bug fix
Data member correctly initialized in constructor
+
Possibility to cache gain for many runs

(Alexander)

Quick fix so that TRD can implement properly the separation of L0 and L1 trigger processors.

Fixes in order to have the merged QA data file as an output from PROOF-based reco. 1. Extension of the method to merge the QA files to custom output filename. 2. Adding the merged QA file to the selector output list. 3. Do not remove the raw-data QA task in case the reco is run within PROOF. One additional fix needed for the trunk - correct destructor of the mag field that is sent via the selector input list.

Adding Cascade performance task to PWG2spectra

CRITICAL COMMIT for RSN package:
- modified structure of AliRsnFunction:
--- output is THnSparseD instead of TH*D, with the possibility to have as many axes as one wants
--- AliRsnHistoDef becomes obsolete and will be removed from package when dependencies will be fixed
--- output histogram axis are defined by AliRsnFunctionAxis objects
--- RsnConfig.C macro has been updated with the new package version

fixed the behaviour of these classes

Changes to obey modified coding convention RC6 (R. Shaoyan)

New macro for checking Cascade reconstruction (A.Maire)

optimize range for LeeYangZeroes to find zero

AliESDtrack flags update during the TOF matching procedure. Now, (1) when a TPC/TRD reconstructed track has been successfully propagated to the inner TOF radius (rho=372cm), AliESDtrack::kTOFin flag has been added; (2) when a reconstructed track has been matched with a TOF cluster, AliESDtrack::kTOFout flag has been added. This procedure does not take into account the particle decay probability in between the outer TRD/TPC and the inner TOF sufraces.

small bug fix when returning zero

Mods in QuadraticRoots

correct the implementation of deleting tracker containers

add total removal of containers for usage in HLT