Various radii updating in the TOF reconstruction code according to last changes on the TOF geometry radial position (1cm more)

Cleaning up warnings and making some changes to memory handling to be more robust during error conditions.

With Boris and Antonin:

AliEveV0 - new implementation of V0 visualization class, preliminary
version.

esd_V0.C - macro to display the V0s.

SplitGLView.C - bypass crash during extraction of event summary table.

added an event range taken from AliReconstruction to QAdataMakerSteer

Compilation on Windows/Cygwin

Compilation on Windows/Cygwin

Compilation on Windows/Cygwin

Removing the troublesome / from the names of histograms

Conversion of light ion codes (d,t, h3, alpha) to internal fluka id added.

Use OCDB values in reconstruction  - (Marian Ivanov)
AliTPCClusterParam  -
1. Error parameterization
2. Shape parameterization

Update to new method names in AliESDv0, load them in visscan_init.C.

Two overlaps removed. Obsolete volume ITSD removed (M. Sitta)

Fixing the PWG2femtoscopyUser PROOF-INF directory

First implementation of QA checkers (P. Cerello)

Parameters for track finding in AliITStrackerSA added to AliITSRecoParam (F. Prino)

First implementation of QA checkers (P. Cerello)

Parameters for track finding in AliITStrackerSA added to AliITSRecoParam (F. PRino)

Getting the geometry file from GRP - needed to determine the DDL mapping  (Panos)

Compilation on Windows/Cygwin

New schema for pedestal files to be processed.

Method to calculate the centroid of spectator neutrons over the ZN front face. It will be used to determine v1 from spectator direct flow (Chiara)

Compilation on Windows/Cygwin

Updates of the DAQ DAs

adding utc time stamp

Remove obsolete generator

added protection and initilisation

Set of the flag in case of big clusters

UserCut removed from OCDB (not more necessary). Now UserCut from RecoParam or defaults

Adding base class for calibration components
using Tracks (Marian)

Protection for big cluster size (even in case of non zero suppression)
From now cluster deconvolution is on

Protection for ClusterSize=0

Added Darc error word for disable or not connected regional boards
(Christian)

adding TPC Krypton CF to build

Added functionality to fill  histograms and push them to the output, code cleanup (Kenneth)

Adding base class for TPC calibration components
(Marian)

Adding par file generation scripts for PWG2femtoscopyUser

Re-calculate regional/global trigger decision from local triggers

Updated the fast decoder to take into account the end of DDL
(0xD000000D) trailer words which are generated by our readout electronics.
The decoder auto-detects this trailer and does not
complain if it is missing (unless it is corrupt). This can be turned off by
setting the fAutoDetectTrailer to false. Then one can tell the decoder if it
should expect the trailer or not with the fCheckForTrailer flag.
fCheckForTrailer = true for the read data (or new AliRoot) and
fCheckForTrailer = false for old simulated data.
(Artur)

changing name of ECS DIM trigger, printing run that was triggered

New analysis par file added

Some comentaries and options added

New way to get xsection from files, more options and comentaries

minor

Protection if UserCut not present in OCDB (Sigma=3 as default)

AliEveEventManager
==================

Add support for loading of raw-data, symmetric to loading of other
event-data (via run-loader and direct ESD reading). This adds
dependence of EveBase to RAW.

Event-navigation via gAliEveEvent->Goto/Next/PrevEvent() works fine.

As a temporary fix, unlock geo-manager after the loading of THE
geometry as simplified geometries can be loaded at a later time.

alieve_init.C
=============

Change script arguments so that all relevant parameters can be set
therein.
void alieve_init(const Text_t* path   = ".", Int_t event=0,
                 const Text_t* esdfile = 0,
                 const Text_t* rawfile = 0,
 const Text_t* cdburi  = 0,
 Bool_t assert_runloader = kFALSE,
                 Bool_t assert_esd       = kFALSE,
                 Bool_t assert_raw       = kFALSE)

ITS-raw/digits
==============

Use raw-data as provided from AliEveEventManager. Put code
that is common to raw/digi dicplay into its_common_foos.C.

ACORDE macros
=============

First version of acorde_raw.C using data from AliEveEventManager.

Use new geometry hierarchy of ACORDE. There are two things to
investigate about this:

1. Is this really the geometry in AliRoot; why is ACORDE not used
in (some/most?) test macros, as in 'Int_t iACORDE = 0;'.

2. Excessive use of geo-assemblies.

Example for analysis on kine tree.

Compilation on Windows/Cygwin: moving the non-implemented/dummy copy constructors and assignment operators to the private part of the class

Protection in case we read older data.

Update to trunk.

QA with real checking

Obsolete.

Obsolete.

updating apd and fee parameters

additional updates relating to geometry cleanup

Getters added.

Adding changed from Indra to use common online/offline decoder and take care of gain and pedestal correctly. (Indra)

Minor cleanup of code.

Tasks derive now from AliAnalysisTaskSE

Library libANALYSISalice added

New ANALYSISalice added, reduce default number of messages from task manager

Pedestal suppression implemented

bug

Added run type DAQ_GEN_DAC_SCAN (H. Tydesjo)

Corrected a bug that caused class to work only in diagnostics mode

set the default CDB storage only id not ser previously

set the default CDB storage only id not ser previously

allow check in absence of reference data

Possibility of activate/deactivate unfolding in SDD (J. Belikov, F. Prino)

Replace AliITSgeom with AliITSgeomTGeo.  Possibility to select the event to be displayed (F. Prino)

Updated radial position of TOF. (A. de Caro)

Adding new documentation page on Tracking DA
(Alberto)

Compilation on Windows/Cygwin

finish clean-up of EMCAL geometry

AliACORDERawStream fixed

AliACORDERawStream fixed

code cleanup in TPC Krypton CF (Kenneth)

Removing extra semicolon

Removed obsolete additional parameters  (Marian Ivanov)
AliTPCtrackerMI::AcceptCluster - corry,corrz,factor

Updated QA (Sylwester)

Removed obsolete function used for old comparisons (Marian Ivanov)
-  void SetIO();  //set default IO from folders
-  void SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESDEvent * event);

Removed obsolete data members and function (Used before for performance study)  - Marian Ivanov

void RebuildSeed(); // rebuild seed to be ready for storing
-     void SetPoints(TClonesArray* p) {fPoints=p;}
-     void SetEPoints(TClonesArray* p) {fEPoints=p;}
-     TClonesArray * fPoints;              //!array with points along the track
-     TClonesArray * fEPoints;             //! array with exact points - calculated in special macro not used in tracking

Removing obsolete function - WriteTracks (Marian)

Revert back the change in destructor (Marian)

Bug fix in destructor (Rene Brun)

Macro for Bitpattern's reading, generates histograms

Update of class AliACORDERawStream

Update: added GetNEvents variable

New file: Track fitting demo.

Structural improvements.

PHYSICS RUN AddedAliACORDEPreprocessor.cxx

Removed overlaps between SSD cone and SPD thermal shield (M. Sitta)

Added selection cuts for fitting drift speed vs. anode. Upgraded naming scheme for methods (Francesco Prino)

SPD services on the cones (A. Pulvirenti)

Possibility to reconstruct tracks with 1 point + vertex, and possibility to reuse clusters already used by AliITStrackerMI (Andrea)

Improved efficiency (Andrea)

Removing compilation warning in the ESDMuonFilter task (Roberta)

- bugfix component handler: library load via gSystem pretended to fail in some
  case although it was ok
- bagfix AliHLTEsdManager: corrected list handling, copying of ESDs and merging
  of separate event ESDs into one still needs some fix in AliESDEvent
- TPCEsdWriter: add ESD to user info in order to save the actual ESD layout

minor changes in code documentation

minors

MUON task for the analysis train to fill the muon information in the generic AODs (Roberta)