Handle missing rec-point tree in a uniform way: return null pointer to TEvePointSet.

Minor changes

Update of HP decoders:

1) Added GetDDLTracker and GetDDLTrigger methods to AliMUONRawStreamTrackerHP
and AliMUONRawStreamTriggerHP respectively to create the DDL payload objects
on the fly. This was done to improve the compatibility of these classes to their
existing counterparts. These methods should however only be used in some rare cases
where one needs the payload object to modify the data and write it back to another
DDL file. Otherwise the existing interface methods of AliMUONRawStreamTrackerHP and
AliMUONRawStreamTriggerHP are much faster.

2) Modified AliMUONDigitMaker and AliMUONReconstruction to handle the new trigger
DDL decoder also. The fast decoders are now enabled by specifying the USEFASTDECODERS
option in the reconstruction options. To make the digit maker use just the fast tracker
DDL decoder use the USEFASTTRKDECODER option. Similarly for just the trigger decoder
you use the USEFASTTRGDECODER option.

Minor fix:
Fixed some documentation in AliMUONVRawStreamTrigger.h

(Artur)

Cut class for the filtering of ESD V0s (Boris Hippolyte <hippolyt@in2p3.fr>)

Fill correctly the PID for CaloClusters (Gustavo Conesa Balbastre <Gustavo.Conesa.Balbastre@cern.ch>)

Final TOF version: 18 modules with holes for PHOS (Annalisa)

AliAODCluster.h: PID particle types like in ESD but with two more for FMD/PMD kCharged and kNeutral. fPID array size
increased to 13. Setter of PID added to set PID array from ESDs which is 2 units smaller.
AliAODCluster.cxx, AliAODCaloCluster.cxx, .h: Size of PID arrays increased to 13
(Gustavo Conesa)

AliAnalysisCuts::IsSelected(TList*) added to cuts interface. Needed by V0 selection.

Improving TClonesArray handling - using static dummy TClonesArray.

Moved from TDPMjet.

AliGenDPMjetEventHeader.h removed.

Moved to STEERBase

DCS points reading switch to TRUE to test this part

Initial HLT-EMCAL components.

New version with the right DA Type field (LDC)

Delete arrays in FillESD

Add track time to stack photons

Proto version of GUI for event-manager.

Compilation with gcc 4.3.0

Fixed error with trigger name at method SetInput

Made changes to use common online/offline fast decoder.

Bug fix. There was a comma in a variable parameter list function that should not be there. Would have caused run time crashes in some rare cases.

Updated ideal geometry, including ACORDE

Delete temporal arrays with AbsId

Replication of arrays in setters. (G. Conesa Balbastre)

Correct number of tracks in the header. (M. Gheata)

From Alex: updated and new macros for TRD.

Compilation with gcc 3.2.3 (Artur)

Improving handling of TClonesArray objects - using Clear() instead of Delete()
for data members, and making static the TClonesArray objects.

Added option to reuse list in AliESDEvent, avoid delete/new whenever possible in FMD assignment

Implemented checker subdetector splitting with subdetector offsets. Checker enabled

Additional functionality added
in order to use OFFLINE tracking in HLT
components (Jacek)

Cleanup of documentation and code.
Splitting AliHLTMUONEvent from AliHLTMUONRootifierComponent.cxx file. The AliHLTMUONEvent class was a temporary solution, but it works so well we are making it permanent.
Adding the dHLT trigger decision component that actually calculates the dHLT trigger scalars from the reconstructed tracks.
Also added the corresponding ROOT AliHLTMUONDecision object for testing.
AliHLTMUONRootifierComponent now generates the AliHLTMUONDecision from raw dHLT internal data.

Changes to remove overlaps (M. Sitta)

examples for AliRsnReaderTask usage

Code upgraded;Added reader for AOD/MC;Added AnalysisTask

Changes in code and adding task

Changes in code and adding task

Changes in code and adding task

Fixed a problem in the geometry.  The sensors where added multiple times
to the virtual module volumes.  Fixed.

printf hidden by debug flag.

fFileA->ls(); removed.

Copy arrays in assignment instead of the pointer; avoid double delete.

0. Adding correction for edge effects
1. Adding debug stream for alignment visualization
(Marian)

Do not use mean vertex constraint (Andrea)

Additional protection

tpc_clusters.C - return null pointer if tree can be obtained from run-loader.

visscan_init.C - handle null pointers returned from xyz_clusters.C.

Memory leaks

Separate task for muon tracks added. (R. Arnaldi)

documentation

Switch off the QA

Put back the optimization

From v4-12-Release: updated beam size and PHOS simulation parameters

Bug fix: adding SHLIB to SYSLIBS (C.Holm)

A side LHC magnet fields. (Chiara Oppedisano)

Better discovery of optional ROOT components (C.Holm)

No need for TGLObject.h (C.Holm)

No need for libFTGL (C.Holm)

- changed: tree->SetAlias("memUSED", "pI.fMemVirtual"); for getting report on virtual memory

Include needed header files (C.Holm)

More flexible map flag than only for high and low gain (David)

finalization of the TPCNoiseMapComponent (Kelly)

Added misalignment of ITS w.r.t. TPC (A. Dainese) - Correct casting to TString added (R. Grosso)

Bad channel treatment in SSD simulation and reconstruction (E.Fragiacomo)

- disable use of SDD correction maps in calibration objects
- set an average value of drift speed for modules with bad injectors
F. Prino

new implementation of bad channel map (E. Fragiacomo)

Additional protection

Possibility to add SDD points to cosmic muons tracks (A. Dainese)

 additional alignable volume from Tomek

TMatrixF *fLocPosM is removed as unnecessary. Memory leak is fixed.

Adding the fitting for transformation with
9 and 6 parameters (Marian)

Removed Memory leak
Instead of TObjArray TIterator use simple loop
(Marian)

Memory leak problems (TLinearFitter)- way around
Using static function TF1 instead of
TLinearFitter formalas (Marian)

Using TClonesArray::Clean instead of deleting of the
arrays (Marian)

First step to reduce the memory fragmentation
Next step - AliTPCtrackerMI

Bug fix in assignment (Marian)

AliPHOSTrackSegmentMaker, AliPHOSPID, TClonesArray of EMC and CPV
recpoints are created once per run in corresponding constructors,
instead of creating them once per event. Memory leaks of
AliPHOSEmcRecPoint, AliPHOSCpvRecPoints, AliPHOSRecParticles are
fixed.

The type of fTRDnSlices should be Int_t

CPV alignment creation corrected

Fixing part of the Coding violation
Adding comments
Adding Getters for histograms (Marian)

Removing extra line, adding EINCLUDE

Exporting AliRawReaderRoot.h

AliESDCaloCluster.cxx,.h: Removed fM11 and related getter and setter,
added fTOF and related getter and setter, increased the class def to 8
AliAODCaloCluster.cxx,.h: Added fTOF and the related getters and
setters, increased the class def  5 . Added the method
GetMomentum(TLorentzVector, Double v) like the one in ESDCaloCluster

AliAODCluster.h: Added a Getter to return fLabels array

AliAODEvent.cxx.h: Added methods to get the list of aodCaloClusters of
PHOS or EMCAL separately, as it is done in AliESDEvent.

AliEMCALReconstructor.cxx, AliPHOSReconstructor.cxx: Removed  filling
of  M11 and added filling of TOF

AliAnalysisTaskESDfilter.cxx: Added TOF and track matching information
to CaloClusters.

AliHLTPHOSESDMaker.cxx: Remove setting of fM11 (the fTOF should be added)

Gustavo

Changes in the ACORDE libraries to compile on Windows/Cygwin

doing backward compatibility correctly

hunting memory leaks

code documentation

Signal propagation delay value: changed according to a measurement result (5.13 ns/m instead of 4.35 ns/m)

Changing fitting formula (Marian)

Loop over mc and aod possible. (A. Mastroserio)

New representation of the raw TRD PID signal in ESD (Alex, Yuri)

get rid of compilation warning

using the new ESD assignment operator to merge ESDs

Massive commit to flesh out the geometry in more details.
Most of the geometry is there.  Missing - if at all relevant are only

- Cooling pipes in FMD3
- Cooling fin in FMD2

Although all volumes are there, it should be noted that the
geometry should really be checked against CAD drawings and
installation/assembly notes.  This will, however, take some
time to do, and I need some information from the relevant
parties.

What has been added to the geometry is

- Support of FMD2 - barrel, covers, and flanges.
- Support of FMD1 - both the upper and lower saucers are there.
- Digitiser cards on all half-rings.
- Cooling plates on FMD3

What has been changed in the geometry is

- Sensors are now put into an assembly together with the hybrid
  cards and the stand-offs.  This is to make it easier to have
  enough clearance for alignment, and it is, after all, more likely
  that the mounting of a module (sensor+hybrid+stand-offs) to the
  honeycomb plates is less precise than the compound itself.
- The cone of FMD3 is now made as a composite shape of a cone minus
  the openings where the cooling plates sit.
- Computations done more robust - gone are a lot of stupid fudge
  parameters.

Other changes are for the display and alignement macros and similar.

Possibility to fix some of the parameters. New method to get the number of free parameters (Andrea)

added converter for offline cluster format; added histogram handler (Kelly)

Removed dependency on the PWG0
(Jacek)

Trivial error correction

Added a getter method for the private variable fGeom

Bug fix - Teminate - as virtula function

In alignment - use the hyperplanes fit

(Marian)

Updated macro for ACORDE raw-data visualisation. We use now the ACORDE sym.names and PN entries (Matevz + Cvetan)