Removing extra line, adding EINCLUDE

Exporting AliRawReaderRoot.h

AliESDCaloCluster.cxx,.h: Removed fM11 and related getter and setter,
added fTOF and related getter and setter, increased the class def to 8
AliAODCaloCluster.cxx,.h: Added fTOF and the related getters and
setters, increased the class def  5 . Added the method
GetMomentum(TLorentzVector, Double v) like the one in ESDCaloCluster

AliAODCluster.h: Added a Getter to return fLabels array

AliAODEvent.cxx.h: Added methods to get the list of aodCaloClusters of
PHOS or EMCAL separately, as it is done in AliESDEvent.

AliEMCALReconstructor.cxx, AliPHOSReconstructor.cxx: Removed  filling
of  M11 and added filling of TOF

AliAnalysisTaskESDfilter.cxx: Added TOF and track matching information
to CaloClusters.

AliHLTPHOSESDMaker.cxx: Remove setting of fM11 (the fTOF should be added)

Gustavo

Changes in the ACORDE libraries to compile on Windows/Cygwin

doing backward compatibility correctly

hunting memory leaks

code documentation

Signal propagation delay value: changed according to a measurement result (5.13 ns/m instead of 4.35 ns/m)

Changing fitting formula (Marian)

Loop over mc and aod possible. (A. Mastroserio)

New representation of the raw TRD PID signal in ESD (Alex, Yuri)

get rid of compilation warning

using the new ESD assignment operator to merge ESDs

Massive commit to flesh out the geometry in more details.
Most of the geometry is there.  Missing - if at all relevant are only

- Cooling pipes in FMD3
- Cooling fin in FMD2

Although all volumes are there, it should be noted that the
geometry should really be checked against CAD drawings and
installation/assembly notes.  This will, however, take some
time to do, and I need some information from the relevant
parties.

What has been added to the geometry is

- Support of FMD2 - barrel, covers, and flanges.
- Support of FMD1 - both the upper and lower saucers are there.
- Digitiser cards on all half-rings.
- Cooling plates on FMD3

What has been changed in the geometry is

- Sensors are now put into an assembly together with the hybrid
  cards and the stand-offs.  This is to make it easier to have
  enough clearance for alignment, and it is, after all, more likely
  that the mounting of a module (sensor+hybrid+stand-offs) to the
  honeycomb plates is less precise than the compound itself.
- The cone of FMD3 is now made as a composite shape of a cone minus
  the openings where the cooling plates sit.
- Computations done more robust - gone are a lot of stupid fudge
  parameters.

Other changes are for the display and alignement macros and similar.

Possibility to fix some of the parameters. New method to get the number of free parameters (Andrea)

added converter for offline cluster format; added histogram handler (Kelly)

Removed dependency on the PWG0
(Jacek)

Trivial error correction

Added a getter method for the private variable fGeom

Bug fix - Teminate - as virtula function

In alignment - use the hyperplanes fit

(Marian)

Updated macro for ACORDE raw-data visualisation. We use now the ACORDE sym.names and PN entries (Matevz + Cvetan)

Correct treatment of single and multi muon information (raw->digits and digits->raw fixed)

As agreed - we will keep the timing information in the digit (for future usage), but will not fill it in the digitizer

enable keyword substitution

test and bugfixes of HLT preprocessor and HLTCompModule preprocessor (Jenny)

Detecting endianess of platform at runtime and generating warning if not on a little endian machine.

Improving output format of the program.

First step towards reading of the new RCU firmware trailer. Thanks to Luciano we now have an opportunity to decide automatically whenever we get old or new (v2) firmware format. That is why all the SetOldRCUFormat methods have been removed from RAW, TPC, FMD, PHOS, EMCAL and HLT modules.

Alignable TOF sensitive volumes: new enumeration (R.Grosso)

reducing macro to minimum AliReconstruction functionality, disable QA and TriggerESD because of crashes

using persistent ESD object in order to reduce memory consumption

Use FlowVector

Implemented Copy() function for all esd objects to allow for assignment of AliESDEvents (based on the list of objects), fixed some assignment operators

For primary tracks, when mother-particle is defined, add label and
pdg-code of the mother to the tooltip.

Code clean up (F. Prino)

Fix import of track-references. Apparently they are now stored in a
single branch, one entry per particle (not primary). Also, the way how
decay in flight is tagged has changed.

silvermy@ornl.gov - basic interface to calibration info for testbeam (CERN 2007) data

Implementation of the ACORDE reconstructor and ACORDE ESD object. The ACORDE digits should be revised, because the information they contain does not fully correspond to the raw-data contents (Mario and Cvetan)

Some cleanup, corrections to the log messages and removal of possible leaks

New constructors and print method (Mario)

Update version number in order to avoid warnings from root

For some reason the plastics copy id is either 5 or 6 (instead of 1 and 2). Temporary fix in order to fill properly the digits. Should be corrected!

Updated digitzer code (Mario)

Corrected detector name (Mario)

Create the rec-point branch even in the case of no digits. Please review and fix if needed! (Cvetan & Jouri)

Geometry should not be read from gAlice. For the moment we keep it only for backward compatibilty. Please fix! (Jouri & Cvetan)

Bug fix

Minor changes

Tune hists for jet trigger

Possibility of fast simulation of decalibration added

Distance to bad channel accounts module edges now

AliEveEventManager::AssertGeometry() - consolidate with changes in
TEveManager::GetGeometry(), assign the geo-manager to gGeoManager as
well.

SplitGLView.C - disable summary html view for now (it was not populated).

acorde_raw.C, geom_acorde.C - minor cleanup while trying to get ACORDE
geometry from CDB.

suppressed closing the file after each QA maker call

Adding expansion of file name - necessary for testing the preprocessor.

Updates Ds cuts (Francesco, Sergey)

Add task to update the already existing AOD with femto specific information from the ESD

Bug in ZDC geometry

Put trigger jet information to ESD

removed possible division by zero

Removed the use of FM11 (second geometric moment)

Typo corrected

possibility to test a single subdetector

Adding constructor TNamed - (Marian)

Additional protection: no update of V0 momentum without mag. field

disable doxygen latex output

added private empty copy ctor and assignment op

Fix memory leaks

copy ctor's

reconstruction of arbitrary number of modules

Commented out the use of fM11 (second mixed moment)
due to change in AliCaloCluster

Update by Sylwester

asignment operator fix

Adding and removing  files from build system

1) Cosmetics, pluss 2) first iteration in phasing out
AliHLTPHOSProcessor.

Replacing "is a" with a "has a" relationship
for several componets that "has" a RCU processor property
but wich "is not" a RCU property. In addition this componenet was needed
for the calibration processor since both the AliHLTPHOSRcuProcessor
and the AliHLTCalibrationProcessor inheriths from the
AliHLTProcessor, i.e ambigious inheritance that would have
been quite ugly to clean up.

Adding new components to the linkdef file

DA component using exactly the same DA
as offline (political issue)

DA component that makes calibration  data on per module
basis. This component will be factored out in near future
(calibration data will be accumulated on per ddl basis)
however it is commited now to make our local project
consistent with aliroot and to avoid braking the compilation by accident.

Componets for validation of PHOS electronics.
Pattern can be loaded too altros and replayed by electronics on arrival
of L2 trigger (pattern generator is replacing physical signal) .
The Patterntes classes validates the electronics by
comparing the input patternt (too the electronics) with the pattern
actuallay read back, making statistics on the  number of patterns obeserved and so on ..

Pattern class for validation of electronics

Tracks that can be removed from ESD by the cleaning procedure are not anymore included in the list of reconstructable tracks

Error message in case of negative segment number and additional protection

Convert some warnings to debug printouts

Uncommented method arguments for debug usage.

Updated geometry including v11Hybrid ITS geometry

TCLonesArray of AliITSpListItem objects replaced with an array of AliITSpListItem

adding script to retrieve all datapoints for testing purposes

Fixed memory leaks (Marian)

Support root-5.19.2 and 5.19.2a.

adding functionality to retrieve trigger configuration from the DAQ logbook

New class AliPHOSRcuDA1 introduced.

Using directly 1/Pt without constrain to estimate the resolution. Use the MC momentum in the representation of the PID resolutions (dE/dx and TOF)

Update of the class ESDMuonFilter. New marcros for creating AOD with muon information locally and in the CAF (Roberta)

adding macro that applies the corrections and visualizes the result

Standard quality cuts added.

added copy ctor and assignment

Possibility to create arbitrary number of PHOS modules added

Fixed GetTriggerAmplittudes

Added documentation on geometry (M. Sitta)

SSD services on the cones (E. Cattaruzza). Removed SSD relate overlaps (M. Sitta)