From Jochen Klein.

Update in TRD visualization
- correct setting of HC id in trd_tracklets.C
- change sign of tracket deflection
- change colour of trackletMCM in visualization
- check before destruction of children

AliITStrackerSA.cxx: minor fix for cosmic reco + adding debug prints with AliLog. AliITSRecoParam.cxx: minor change (radius for propagation inside SPD inner layer changed from 3.7 to 3.5 cm)

Fix wrong commit of July 1st

added option to calculate dca relative to TPC vertex

PID LUT from TH2F
    - Add Setter for PID LUT from 2-dim histogram
    Bugfixes
    - Fix access via ADC column
    - Fix deflection sign in GTU TMU
    Add PID calculation for GTU tracks
    Updates for GTU simulation
    - Debug output in TMU
    - setting of correct HC id in gtuSim
    Removal of AliTRDmcmTracklet
    Bugfixes in visualization
    - correct setting of HC id in trd_tracklets.C
    - change sign of tracket deflection
    - change colour of tracklet MCM in visualization
    - check before destruction of children
    Additional baseline, zs-reading and check for no. of timebins
    - Additional baseline to be added/subtracted during reading/writing
    - Read back the ZS mapping
    - Check for no. of timebins
    Included changes from gridikp
    - Add GetPID(q0, q1)
    - add NHits ... to trackletMCM
    - add default PID LUT
    - add possibility to change LUT
    Adaptation to latest fitred.asm
    - decimal places for ndrift
    - calculation of y-offset, scaleY, scaleD from MCM position
    - corrected sign of deflection
    - changed position where deflection cut is applied
    - changed calculation of min/max-deflection

Technical fix: run the vertex finder even in case the local reco for ITS is off. Does not affect default behavior of the reco - it is useful only in the very particular case when the reco-points file is already produced and one wants to replay only the vertexer and tracking (Andrea D.)

Technical fix: sort the scalers records as they appear to be sorted incorrectly in the GRP preprocessor.

Added protection for empty data blocks (blocks where only the CDH is present) in the component.
Bugfix: Clustercandidates was not checked properly if they where used or not.

- fixed transformation of Y coordinate of clusters
- added temporary fix for reading out of array boundaries

Changes needed for cuts optimisation task (Francesco)

Added phi variable; added check for D0 from c (Chiara Z)

const added to GeoMatrixes; bug with matrix overwriting fixed

Call gEve->DisableRedraw() when their so no more chance to get an
exception. This potentially blocked EVE 3D redrawing.

skipped creation of empty QA folders/images

Print format in log messages corrected in different places

In QA:
- Store TH2F instead of TH3F in expert mode (for easier visualization)
- Bug fixes.
(Diego)

histogram binning changed, bug fixed

Add PID to HLT tracker and remove harmfull condition

Added script to draw calibrated raw data
Added possible use of FMD RecoParam
Implemented FMD RecoParam

Adding names of detector experts in the log in case of failure.

Printout fixed.

comenting some prints, removing commented lines

Stuff from aldaqdqm09

Recommit after correction of coding rule violations. (A. Sevcenco)

Technical fix: correct initialization and reset of pointers. From rev. 33801

Update for forced Lambda_c hadronic decays (Rossella Romita)

Update for Lambda_c (Rossella Romita)

New purely virtual methods from the base class implemented.

QA for the on-the-fly V0 (ana marin)

QA for the on-the-fly V0 (ana marin)

QA for the on-the-fly V0 (ana marin)

QA for the on-the-fly V0 (ana marin)

QA for the on-the-fly V0

QA for the on-the-fly V0

QA for the on-the-fly V0

QA for the on-the-fly V0

Deleting unnecessary files in OCDB for ACORDE and uploading previous version

Correction of the offset settings in Rec and Sim QA for each EventSpecie.  IsEQual changed to AreEqual to remove compilation warnings. Correction of the computation of the radius in FillRecPoint. Add GetEventSpecie in QASim (Melinda Siciliano)

small bug fixes

Add shared pads also to dictionary and signal array

Getter for Interaction record added

Fix in FillTriggerESD()

added a few more variables to AliEMCALCalibTimeDepCorrection to make the info there self-sufficient

PID parameters tuned for low and high flux environments (Marie Germain)

MCEvent and MCEventHandler can be used as containers. This allows us to compose MC events from different sources.
Main use case: analysis of merged events.

unused SetLayersNotToSkip() removed

Bug fixed: Removing casting to a TString when not dealing with a pointer.

array was not properly initialised

Added entry for AliPHOSAodCluster.

Added entry for AliPHOSAodCluster.

AOD CaloCluster in PHOS.

New Calorimeter Calibration directory, now only PHOS
AliAnaCalorimeterQA: Correct the pi0 tagging

Small update (number of bins)

Fixes from P2.  Allow pre-setting cuts and factor in display.

ITS RecoParam object built with AliITSRecoParam rev. 33662

Fix from rev. 33763

Added missing initialisation

Updated configuration (run 2009)

Compilation with icc

Always return error messages if not successful

AliAnaPhoton: Added histograms to correlate reconstructed and generated energy.
AliAnaParticleHadronCorrelation: Added histograms for UE studies with neutral triggers.

Adding integrator flag to raw data. Small fixes.

Updated D+/- decay table (Martin Poghosyan <Martin.Poghosyan@cern.ch>)

adding class AliAnalysisTaskJFSystematics

A new function that calculates the chi2 of one track with respect to other

new task for systematic studies of jetfinders

Removed methods with manager and container as argument, obsolotewith new AF version on proof and grid

Correct accessing tower equalization coefficient array

RecoParam object provided to comply with standars reconstruction

Bug coreected in PTM gain array indexes

Moved GetClosestJets() method to helper class

New production requests (Nicole)

Macro for SDD event display updated to deal with new raw data format

forgot to include baseLinkDef file update in yesterdays commit; sorry, and thanks to Chiara Oppedisano for alerting me to the problem

Fixes to AliFMDDisplay and AliFMDPattern for use in DQM environment.
Similar fixes for AliFMDInput.
Introduce ReadFromFile methods in AliFMDCalib{Pedestal,Gain}.
Allow setting AliFMDCalib{Pedestal,Gain} in AliFMDParameters.
Added DQM scripts to SVN for storage

Add missing file closure in SDD preprocessor (F. Prino)

 changes in Rec QA needed for monitoring

removed printout

Corrected PMT gain settings

bugfix: the number of tracks was missing one track in case of the input from HLT tracks. Counter correctly set to 0 if the first block of this data type is found

Adding kAliHLTDataTypeTrack as valid input. Conversion of the input data to
AliKalmanFilter objects is done by using AliHLTGlobalBarrelTrack. Adding the
correct library dependencies because the trigger lib now needs the Util lib.

Added argument scan and default OCDB entry for AliHLTTriggerBarrelMultiplicity component.

Correcting compilation warning in AliHLTTriggerAgent.

bugfixes: skip empty tokens in the argument scan of the configuration, correcting a seg fault in log message cause by misplaced ')'

bugfix: correcting typo (origin TPC -> ITS) in the handling of ITS track data blocks

first version of new classes for time-dependent corrections; not yet used in Preprocessor - more work on debugging/testing needed/foreseen

minor: added a few more variables and comments

start signal is removed from time calculation

1st update of raw data streaming class

Cosmetic changes and correction of comments with use case.

Memory leak in AliPHOSRawFitterv0 is fixed.

Updated PMT gains to calculate response in p-p

Previous commit had the bad side-effect of changing the behaviour of Raw QA to compute uncalibrated occupancy, instead of calibrated one.

Setters for the energy (Gustavo)

Return pseudorapidity instead of multiplicity (Christian)

Removing useless printouts.

Roberta

Make the right number of frames in Canvas

The total mult in V0 became float number.

Using kMinClFullTrk as minimum number of clusters per track (A. Marin)

Possibility to store GeoMatrixes in ESDRun and get them back added

Updates in SDD DAs for AMORE monitoring: a TObjArray of TH1F objects is published for DQM (F. Prino)

Special DAQ events considered always as calibration events. Correctly spotted by Laurent.