Update on calibration classes by Raphaelle

- Bug fix in AliAnalysisDataWrapper::Merge(). Merging failed on PROOF in case of collections.
- Fixed the way the AliAnalysisSelector is called from AliAnalysisManager:
   chain->Process("AliAnalysisSelector");

AliITSMultReconstructor: correction for a shift in the phi of clusters, tracklets. Multiple use of clustersLay2 for building tracklets is avoided by default. AliITSTrigger: changed high multiplicity trigger threshold

Updated with modifying AliMpDDLStore by Christian

Update detection element name for chamber 6 (Christian)

Add number of manus per buspatch module for station 2
(Christian)

File for buspatch cable length (Christian)

Update serial number (Christian)

Add buspatch length & change patch module interface needed for station 2
(Christian)

Add methods to set/get cable length & change patch module interface needed for station 2
(Christian)

Add path for buspatch cable length file
(Christian)

Added function to draw given range od 2d sectors.

- Added new static function ReadData() for loading from ASCII files
- Instance() does not load data automatically anymore,
  but client has to take care of it

Adding AliMpCDB class

Added loading mapping from CDB, now obligatory,
as AliMpSegmentation::Instance() and AliMpSegmentation::Store()
do not load mapping automatically anymore.

New class for CDB IO

Mapping objects in CDB

Removed unused variable

Update on calibration classes by Raphaelle

Fix for 64-bit platforms

Removing the unnecessary header

DA for EMD events to produce energy calibration data

Updated algorithm

correction lokk-up table online

Geometry now properly loaded

Adding comments (Laurent)

Correcting a format error in AliError (Laurent)

New class to generate fake gain runs (Laurent)

Updating gains and make it easier to test different runtypes (Laurent)

Updated for Gain generation (Laurent)

Moving PedestalEventGenerator from shuttle to sim, and adding GainEventGenerator (Laurent)

Moving PedestalEventGenerator from shuttle to sim (Laurent)

Adding some protections. Adding some timers. (Laurent)

Make the decalibration a static method that can be reused in e.g. GainEventGenerator.
Replace internal timers by AliCodeTimer
(Laurent)

Reorganization of the code. Can now easily be used to create calibration
data objects for several runs
(Laurent)

Updated the diff and plot methods. For debug purposes, can now limit the number
of channels used to generate ped and gain stores
(Laurent)

No more misaligned_geometry

Coding conventions

Compatibility with G4 (from A.  Gheata)

Additional protection for cast from Double_t to Short_t

Macro to generate the CDB entry with the ideal geometry (Raffaele)

Updated ideal geometry using the macro from Raffaele

Coding violations corrected.
(the remaining are related to the usage of templates and the use
of _t for enum types).

New method to calculate correctly the track extrapolation on a reference frame. Or, in other words, the method finds the point of the closest approach between two space-points

Remving, the info moved to READMEtrigger
(Gines)

Replaced with READMEcalib

Adding general description + some info from README
(Gines)

Updated title only

- Updated test script description
- Extracted some texts into new README files per libraries
(Gines)

New README files extracted from README
(Gines)

Bug fix (Haavard)

Possibility to set the maximum energy loss
and maximum amount of radiated gluons during quenching.

Adding macros runSimulation.C, runReconstruction.C

Adding includes (Laurent)

update Lookup Table for online usadge

Pedestal suppressed

AdcThreshold set to MIP/2

Pedestal added to data from simulation when digitizing

Tracking2LocalCS matrices corrected for CPV.

Usage of new GetTimeStamp() functionality

Change for T0 raw data reading

Online/offline mode selected in the constructor

- Removing macro MUONdisplay.C
- Adding macro MUONTriggerChamberEfficiency.C
- Commented out macros which has to be updated with AliMUONData removal

UPdated for changes in geometry classes

- Coding conventions
- Display method for calculated trigger chamber efficiency map
(Diego)

Correct way to get the geometry even in case of no galice.root (raw data)

- Macro to get the trigger chamber efficiency map from reconstruction and
plug it into next simulation
- usage explained in README
(Diego)

Possibility to activate noise on trigger chambers
(Diego)

- Coding conventions
- Display method for calculated trigger chamber efficiency map
(Diego)

Adding NofCathodes() method.

Making V2S the default DigitStore (as it is more compact on disk)
(Laurent, Philippe P.)

Fixing (once more!) the Compare method
(Laurent, Philippe P.)

Test existence of files, and not of option, when doing checks
(Laurent, Philippe P.)

Added BCM library.

root moved to v5-16-00. TFileMerger->Cp moved to TFile::Cp.

New DA for SDD injectors (F.Prino)

Hide existing geomanager before importing ALICE geometry.

Updated macro to visualize phos clusters, finally a good one (Matevz+Cvetan)

Missing include

Use TFile::cp instead of TFileMerger::cp (Matevz)

In UpdateTrack(): fixing a small bug in the tracking algorithms that might cause
reconstruction crash
(Philippe P.)

Bug fix in CPV local coordinates

preprocessor is run in a temp directory that is removed when process is finished.

Bug fix (S. Gorbunov)

Replaced with AliCodeTimer (Laurent)

new macros to be used together (or not ;-) ) AlirootRun_MUONtest.sh script (Laurent)

Alternative implementations of preclusterfinder (currently under test)
(Laurent)

More efficient implementation(s) of AliMUONVDigitStore (Laurent)

AliMUONStopwatchGroup replaced with AliCodeTimer (Laurent)

Non-linear correction was incorrectly applied (Laurent)

Changes due to ownership policy changes in DataInterface (Laurent)

Adding new classes (Laurent)

Rewritten to allow more flexilibity (Laurent)

Allow selection of concrete digitStore class, and change the default one from V1 to V2S
(more compact on disk) (Laurent)

More options to select (pre)clusterizer and digitStore to be used
(the latter default changed from V1 to V2R, more compact).
Fixing the location of the Raw2Digits timer.
(Laurent)

Getting rid of setprecision in Print and changing Compare method (Laurent)

Adding some important comments (Laurent)

Correcting Compare method (Laurent)

Changing ownership of clusterfinder (Laurent)

Let the preclusterfinder be a parameter in ctor (Laurent)