Added two missing includes to allow macro compilation (thanks to Laurent for remarking it).

Added several set methods and some minor corrections for testing fast
fitting procedure

improved mult cuts for POI

Reseting the MC label to a default value of -1 before evaluating them (Philippe P., Roberta)

Invert bits in regional response according to hardware

Analysis of muon and dimuon kinematical distribution for the official analysis train ESD->AOD (Roberta)

Add default value for tracklet line width argument.

Generation of muon filtered AOD files from standard AOD files (Roberta)

Update of Single Muon analysis to be included in the official ESD->AOD analysis train (Diego)

Update of Single Muon analysis to be included in the official ESD->AOD analysis train (Diego)

updated errors

fix compilation warnings (Markus Heide)

Added extra histograms and some functions to fill them. (Ana)

Using AliExternalTrackParam::PropagateBxByBz(). Savannah bug 55857. (A.Dainese)

New version of SPD tracklet visualization.
Each tracklet is represented by an individual Eve element.
Somewhat preliminary - requires input from Domenico.

Reverting commit 35237, it causes crash in the reconstruction of simulated data

Technical fix: reducing the virtual memory consumption

Missing protection added.

Visualization scripts (Jens Wiechula)

Adding helper macros for calibration visualization
(Jens Wiechula)

Class version increased.

Better handling of preferred storage

Small fixes

-fixing typo in libAliHLTTPC.pkg

- fixing wrong naming in class
- adding files to build system

Small change in filling weights for consistency with D0Mass task (Chiara B)

Added possibility to read like-sign pairs (Chiara B)

== instead of & gives more flexibility

It sets the existing but unused before AliAODHeader::fMuonMagFieldScale
by the value from the updated AliESDRun.
 Ruben Shahoyan <ruben.shahoyan@cern.ch>

Remove extra comma gcc 3.4 does not like

Adding configuration for Trigger in the test setup.

Upgrading mchview with new features :

- adding Status and StatusMap as possible sources (from OCDB)
- adding one convenience computed dimension for the Gains (=1/a1/0.2 in mV/fC)
- adding --de and --chamber options to start the display on a given part of the detector, instead of the global view of all the chambers
- chamberId in the text label is now starting at 1, to avoid confusing (as anywhere else we're used to start at 1 when naming those chambers)

Also fix a bug for the contour computation (AliMUONContourMaker), and reorganized it a bit (AliMUONContourHandler, AliMUONPainterHelper)

Replacements of "new AliMagF(..." with accessing field
via AliGRPManager - Savannah bugs 56450
(Alessandro)

Forgotten files from the last commit

- refactoring code to CALO library (Per Thomas)
- bug fixes (Per Thomas)

Eliminating gsi specific lines
Also from examples
(Marian)

Fix.

Updating the RecPoints QA to detect more easily illegitimate mono-cathode clusters

Bug #55488 (Technical fix): Resizing of the event info tab so that one can see all the lines.

Changing the number of lines in the DAQ logbook_shuttle table
(was reset to the old value by mistake in the latest commit).

Cosmetics

EMCAL specific shared memory interface

Default constructor needed by the plugin manager

- added histograms for track multiplicity, multiplicity averaged over a certain number of events and energy deposition as a function of p (Zhongbao Yin)
- added function for calculating track length (needed for the latter histogram)
- the cluster residuals still take bizarre values, the respective function needs further investigation or even replacement by the offline one

update calibration macros

Autorun functionality added (Matevz)

Autorun functionality added (Matevz)

gpu patch

Updated geometry. New numbering of ACORDE arrays [0-59] instead of [1-60]

update from David Rohr: the CATrackerComponent now supports multiple slices

Fixing warning (and increasing ClassDef)

New module TRIGGER (Chiara, Annalisa)

Bug #56691: Switch off vertex finder only in case ALL the ITS detectors are off (Andrea D.)

changing paths to match new directory structure

Treatment of shared pads

Avoiding setting Default Storage to local://$ALICE_ROOT/OCDB if
in the CDB manager instance the flag fRaw is set (--> the
default storage will be set after setting the run number).

trend plots for DET and ESD performance tasks

Adding scripts for filtering
All scripts assume we are working in some workspace-
Predefined directory structure

makeWorkspace.sh   - create workspace directory structure
filterCorrupted.sh - filter esd and rows  - create two files - *.Good and *.Bad
filterRecLog.sh    - finds the amount of seg. fault
                   - create a summary log for files with seg.fault
filterMissing.sh   - create a list of missing runs

Moving the FMD analysis to PWG2

Adding new macro, loadFromOCDB.C, for loading magnetic field, mapping and
reconstruction parameters from OCDB
(Philippe P.)

Add protection against null pointer to ITS RecPoint branch in VertexerZ; updated AliLog messages in Vertexer3D

make trending variables

LASER DA tested on new raw data

Minor change

updates to save info about D-jets, more details in p/E and E/p histograms, etc.

change default max p/E cut

fix broken compilation in adding macros

restrict the DVM btag to filter out more bkg

First working version of EMCAL On-line debugging event display

Coding conventions, simplifications

Some cleanup in the makefiles

Small performance fix

Faster Makefile

fix histograms

Possiblity to check HLT trigger response

Bug fixed #55858: using the Bx, By and Bz in track matching with TOF

fixing compilation problem

Revert " - keeping both local and crystal coordinates in digits"

This reverts commit 13d3832f590d512fdb294fe952576d6712e6d2eb.

 - keeping both local and crystal coordinates in digits

Cleaning field info in Reset() method

py2ent added.

ESD can init the Bfield via AliESDRun::InitMagneticField()
1) Added currents/beam info to AliESDRun and the method
to AliESDRun::InitMagneticField() (+ alias AliESDEvent::InitMagneticField())
2) AliReconstruction will fill needed Bfield info in AliESDRun
3) AliMagF got a "static CreateFieldMap" to create a map from the
currents. All classes which create the field (AliGRPManager,
AliReconstruction, AliESDRun) will use this method

pythia8130 distributed with AliRoot

Remove old pi0 calibration classes, new class in PWG4/CaloCalib/AliAnalysisTaskEMCALPi0CalibSelection

- added v0 functionality (Markus Heide)
- fix backward compatibility for AliTRDcheckDET
- remove warnings

Recover previous version of RawUtils, newer produced crash.

- include missing header TObjString.h

fix requested by Laurent Aphecetche to clean up the memory properly during simulation of raw data

Fix for report #56016: Remove Calib code from EMCAL

Updated version

Move from THnSparseS to TH2S and changes due to shared pads and baseline subtraction

update macros for displaying performance/calibration results

- added macro for testing the combined ITS-TPC tracking (Gaute)

bug fix ( was "==" instead of "=" in an assignment)

correcting implementation of CTP trigger handling in the GlobalTrigger object, reverting changes of r35128 and r35129
- the TClonesArray of trigger decision objects designated for the CTP triggers is now owned by the trigger component
- proper fix for the header include problem (https://savannah.cern.ch/bugs/?56302): in case of HLT build system, include files are taken from the include directory of the installation
- minor bugfix AliHLTGlobalTriggerComponent command arg parsing: -debug skipped next argument
- bugfix AliHLTGlobalTriggerComponent: the -skipctp option is now only applied on the level of adding CTP info to the output trigger decision object. The CTPData object is needed in any case to perform the masking of the readout
list according to the detectors of the CTP trigger class
- added option '-cint' to switch to CINT interpretation of the generated trigger code instead of runtime compilation, some fixes regarding this, but did not get it working so far

Protection against non-default geometry name. The name shouldn't change i nthe future, but anyway the protection will not hurt. The fix should be ported to the release as a technical fix.

Replacements of "new AliMagF(..." with accessing field
via AliGRPManager - Savannah bugs 56407 and 56455
(Javier)

adding functionality to calculate the readout list from the trigger pattern and from the internally stored trigger pattern

adding common HLT data type definitions to HLTbaseLinkDef

correcting HLT build system
- sub-class AliHLTGlobalTrigger::Factory added to dictionary
- installation of trigger header files