Error in AliZDCQADataMakerSim corrected

- added libPHOSshuttle to PHOS libraries
- added unit test for AliHLTEsdManager
- added default CDB entry for solenoid field
- bugfix in FileWriter: include block no in the generated file name
  (according to the class documentation)

Limitation to one user defined ion removed.

header file changes missing in 25236

- workaround for copying and merging of ESDs: The HLTOUT contains ESDs for every event
  which need to be merged and copied. There is no other way to copy ESDs than writing
  to a temporary tree and reading it back into the target, even that might cause a crash
  in the subsequent TRee::Fill -> workaround: TChain and temporary files
- correct initialization of the magnetic field in TPC ESD writer/converter

Support for heavy ions as primary in source.cxx

IOIOCM common block added.

remoe duplicate QA initialisation and do ESD QA for same detectors as RecPoint QA

Compilation on Windows/Cygwin

do init of QADatamaker at one place only

do init of QADatamaker at one place only

Compilation on Windows/Cygwin

Changes needed to pass the failover tests (F. Prino)

do init of QADatamaker at one place only

Obsolete files

Code cleanup

Major upgrade (P. Cerello)

Next iteration of V0 visualization.
Preliminary editors for V0 and V0-list.

Bug fix in Tracking2Local matrices of the SPD inner layer (A. Dainese)

Code clean-up: un-necessary messages removed (A. Dainese)

Classes for QA

HV sector finder optimized + QA histograms added

Protection on missing pedestal files.

Bug fix in propagating ESD tracks to the DCA to primary vertex

Disable the digitization of the modules which are not present in the DDL map (F. Prino)

Added protection in case gGeoManager is a null pointer

Classes for QA

setting default storage for QA in Checker

Support for user defined primary ions.

Class for user defined primary ions.

First initialize CDB then call Init

Moving CDB dependence from AliQA to AliQADataMakerSteer

Updated verison using only gshell (Marco)

The turbo version of decoding now as option for DA.

set default OCDB storage when QA ref dir is set

Constructor added

Various radii updating in the TOF reconstruction code according to last changes on the TOF geometry radial position (1cm more)

Cleaning up warnings and making some changes to memory handling to be more robust during error conditions.

With Boris and Antonin:

AliEveV0 - new implementation of V0 visualization class, preliminary
version.

esd_V0.C - macro to display the V0s.

SplitGLView.C - bypass crash during extraction of event summary table.

added an event range taken from AliReconstruction to QAdataMakerSteer

Compilation on Windows/Cygwin

Compilation on Windows/Cygwin

Compilation on Windows/Cygwin

Removing the troublesome / from the names of histograms

Conversion of light ion codes (d,t, h3, alpha) to internal fluka id added.

Use OCDB values in reconstruction  - (Marian Ivanov)
AliTPCClusterParam  -
1. Error parameterization
2. Shape parameterization

Update to new method names in AliESDv0, load them in visscan_init.C.

Two overlaps removed. Obsolete volume ITSD removed (M. Sitta)

Fixing the PWG2femtoscopyUser PROOF-INF directory

First implementation of QA checkers (P. Cerello)

Parameters for track finding in AliITStrackerSA added to AliITSRecoParam (F. Prino)

First implementation of QA checkers (P. Cerello)

Parameters for track finding in AliITStrackerSA added to AliITSRecoParam (F. PRino)

Getting the geometry file from GRP - needed to determine the DDL mapping  (Panos)

Compilation on Windows/Cygwin

New schema for pedestal files to be processed.

Method to calculate the centroid of spectator neutrons over the ZN front face. It will be used to determine v1 from spectator direct flow (Chiara)

Compilation on Windows/Cygwin

Updates of the DAQ DAs

adding utc time stamp

Remove obsolete generator

added protection and initilisation

Set of the flag in case of big clusters

UserCut removed from OCDB (not more necessary). Now UserCut from RecoParam or defaults

Adding base class for calibration components
using Tracks (Marian)

Protection for big cluster size (even in case of non zero suppression)
From now cluster deconvolution is on

Protection for ClusterSize=0

Added Darc error word for disable or not connected regional boards
(Christian)

adding TPC Krypton CF to build

Added functionality to fill  histograms and push them to the output, code cleanup (Kenneth)

Adding base class for TPC calibration components
(Marian)

Adding par file generation scripts for PWG2femtoscopyUser

Re-calculate regional/global trigger decision from local triggers

Updated the fast decoder to take into account the end of DDL
(0xD000000D) trailer words which are generated by our readout electronics.
The decoder auto-detects this trailer and does not
complain if it is missing (unless it is corrupt). This can be turned off by
setting the fAutoDetectTrailer to false. Then one can tell the decoder if it
should expect the trailer or not with the fCheckForTrailer flag.
fCheckForTrailer = true for the read data (or new AliRoot) and
fCheckForTrailer = false for old simulated data.
(Artur)

changing name of ECS DIM trigger, printing run that was triggered

New analysis par file added

Some comentaries and options added

New way to get xsection from files, more options and comentaries

minor

Protection if UserCut not present in OCDB (Sigma=3 as default)

AliEveEventManager
==================

Add support for loading of raw-data, symmetric to loading of other
event-data (via run-loader and direct ESD reading). This adds
dependence of EveBase to RAW.

Event-navigation via gAliEveEvent->Goto/Next/PrevEvent() works fine.

As a temporary fix, unlock geo-manager after the loading of THE
geometry as simplified geometries can be loaded at a later time.

alieve_init.C
=============

Change script arguments so that all relevant parameters can be set
therein.
void alieve_init(const Text_t* path   = ".", Int_t event=0,
                 const Text_t* esdfile = 0,
                 const Text_t* rawfile = 0,
 const Text_t* cdburi  = 0,
 Bool_t assert_runloader = kFALSE,
                 Bool_t assert_esd       = kFALSE,
                 Bool_t assert_raw       = kFALSE)

ITS-raw/digits
==============

Use raw-data as provided from AliEveEventManager. Put code
that is common to raw/digi dicplay into its_common_foos.C.

ACORDE macros
=============

First version of acorde_raw.C using data from AliEveEventManager.

Use new geometry hierarchy of ACORDE. There are two things to
investigate about this:

1. Is this really the geometry in AliRoot; why is ACORDE not used
in (some/most?) test macros, as in 'Int_t iACORDE = 0;'.

2. Excessive use of geo-assemblies.

Example for analysis on kine tree.

Compilation on Windows/Cygwin: moving the non-implemented/dummy copy constructors and assignment operators to the private part of the class

Protection in case we read older data.

Update to trunk.

QA with real checking

Obsolete.

Obsolete.

updating apd and fee parameters

additional updates relating to geometry cleanup

Getters added.

Adding changed from Indra to use common online/offline decoder and take care of gain and pedestal correctly. (Indra)

Minor cleanup of code.

Tasks derive now from AliAnalysisTaskSE

Library libANALYSISalice added

New ANALYSISalice added, reduce default number of messages from task manager

Pedestal suppression implemented

bug

Added run type DAQ_GEN_DAC_SCAN (H. Tydesjo)

Corrected a bug that caused class to work only in diagnostics mode