Function SigmaCut and Trigger introduced (with their Set)

Adding options to suppress extra decision information and only generate summary scalars.

added skeleton for HLTpendolino library

adding libSTAT to TPC library dependencies (new dependency introduced in revision 27645)

Run number is stored as a file <run#> among the DDL files. AliRawReaderFile looks for this file and sets the run number.

Run number is stored as a file <run#> among the DDL files. AliRawReaderFile looks for this file and sets the run number.

Detector pattern created from the list of existing DDL files

Fixing treatment of fOffset value in input data blocks.

Adding function to retrieve Q normalization
(Marian)

Removal of obsolete AliESDs.old.root and associated old TFile and tree.

Macro to create alignment object for the PHOS module 2 surveyed in May 2008.

Adding code to check if the data block is a raw DDL data block before processing the specification in the CDB initialisation option.

fesfileid corrected.

Initialization of debug streamer only on demand (Jacek)

Instantiate debug streamer only on demand
(Jacek Otwinowski)

Adding the new AliRawReaderChain to the Create() mactory method. The URI syntax is 'collection://<file_with_the_list_of_raw-data_files'

bug fix

New raw-reader from root chain.

First attempt to provide an interface to the correction framework

adding DCS buffer delay
adding word 'CRITICAL' to subject of mail alerts (request from DCS)

Updated misalignemt macros (Tomasz)

Fixed wrong PGon shape (M.Sitta)

Added beam-tube tension boxes and wires.

Memory initialization protection and change in the link monitor error scheme

Commit of new FMD3 geometry and other geometry related issues.

- The FMD3 geometry is defined as per the final drawings of
  that sub-detector.  See also http://fmd.nbi.dk/fmd/drawings/.

  - No more any detectable overlaps with ITS.
  - Overlaps _are_ present by not found by automatic tools in ROOT.
    - It seems that there's a misunderstanding between ITS and FMD.
      The FMD3 flanges are sitting at 45, 135, 225, and 315 degrees,
      but ITS has stuff there.
    - I've put in the precision holes that aligns the FMD3 with the
      ITS.  If the ITS will implement in their geometry similar holes
      or spikes, then we can use these to determine what is wrong.

Also in this commit:

  - FMD2 moved back 2.5cm to avoid overlaps.
    - When I get the drawings of FMD2 I will check if this is real.

Adding position dependendent Q normalization (Marian)

Change documentation lines (Marian)

Adding new calibration parameters
Normalization of the charge
(Marian)

Change of the debug level (Marian)

Adding dependence on libSTAT (Marian)

Possibility to specify error expression
in FitPlane method

(Marian)

Propagating the detector pattern from simulation to dateStream, so that it finally arrive in the root raw-data file.

Wrong define statement fixed (Marian)

Removal of extra semicolon

some polish in the init

added support for correction framework in cumulants

added missing parameter in init of datamaker

enable keyword substitution

these f... RecoParam

code cleanup, get rid of compilation warning (Kenneth)

strengthen AliHLT_C_Component_WrapperInterface unit test

Fix fixed-string length bug

bugfix: external interface was calling AliHLTComponent::Init twice since r27483

Adding AliGlbalQAChecker

Corrected offsets in the lists of QA histograms (Yves)

Allow to set jet energy after standard construction

Populating a fake event header in case of readinf of raw data from DDL files. Some of the fields are fill, others are left empty with a possiblity to set them from outside.

In AliMUONQADataMakerRec:
Adding a protection in EndOfCycle for a case fTrackerData is not
defined

Do not search for external template definitions in the implementation files

Using TMath::Log instead of log

Intermediate string to avoid ambiguos conversion (Solaris x86)

Provide dummy __FUNCTION__ on Solaris x86

Provide return value to the assignment operator

wrong loop argument

Obsolete methods removed - new plots added (C. Bombonati)

Restoring the storage of trigger into in the ESD. It was lost in translation... Thanks to Bogdan for spotting it

Reducing the information printed in the log file.

Moving set/get energy in cms, projectile, target propertie to the very base AliGenerator class. Now all this is available to AliSimulation in order to write correctly the GRP entry. Please note that in case of generators which do not derive from AliGeNMC the user has to setp explicitly energy in cms, projectile and target in order to get a correct GRP entry.

Example: dedx correction for the pad and time bin posiotion
(Marian)

Debug output (Printf) changes
Possibility to use  "external" gain map  (Marian Ivanov)

M      AliTPCcalibTracks.cxx        - Increase debug level for printf
M      AliTPCcalibTracksGain.cxx    - Adding optional gain normalization
M      AliTPCcalibTracksGain.h      - Adding optional gain normalization
M      AliTPCAnalysisTaskcalib.cxx  - Disable Printf
M      AliTPCcalibCosmic.cxx        - Increase debug level for info messages

Print the reconstruction parameters for all detectors.

the initialisation of data makers was a the wrong place

Changed the format of fQATasks

Changed the format of fQATasks

AliITStrackV2::ResetClusters reimplemented for alignment (J. Belikov)

Mainly changes related to the added treatment of inactive detector parts in
SPD online dead pixel search:
* ITSSPDPHYSda and AliITSOnlineSPDphysAnalyzer:
Modified algorithm for finding dead pixels (now also including information
about inactive parts).
* AliITSOnlineCalibrationSPD:
Added information on which equipments, half-staves, chips are active.
* AliITSOnlineCalibrationSPDhandler:
Added functionality to treat inactive detector parts. The inactive or dead
pixels are referred to as "silent" in the code.
* AliITSPreprocessorSPD:
Using silent (=dead+inactive) pixels instead of dead.
* AliITSRawStreamSPD:
Added members to keep track of which equipments and half-staves are active.
This information needs to be accessed externally after the "Next" method has
been called for the event. Included two more consistency error codes, only
relevant for SPDmood.
Removed check on header and trailer count. Added method to get event counter
 value
* AliITSRawStreamSPDErrorLog:
Increased the maximum number of error codes.

Henrik Tydejo

SDD extrusions eliminated (M. Sitta)

Typo corrected

ooooooooooops

QA tasks are performed by AliQADataMakerSteer

dynamic cast replaced by static cast in order to avoid undefined reference to typinfo of AliGenMC. Correct initialization of the new member of AliGenMC.

delegating the qa task to AliQADataMakersteer

Fixes for SSD detector algorithms and preprocessor (Panos)

Updated online raw data QA for the SSD - occupancy calculation per module (Panos)

Small correction for shifts in SSD (M. Van Leeuwen)

Do not use special characters in AliWarning

Possibility to select SPD modules used in vertex calculation (F. Prino)

New default values for baselines (F.Prino)

updated with correction framework

More methods ready for CAF

Filling the GRP entry inside ALiSimulation. Can be swtiched off/on via SetWriteGRPEntry() method. All the information filled in the GRP is taken directly from the objects (generator,field,detector list etc) in gAlice. To be extended if needed by filling luminocity/intensity in case of pileup simulations. For the moment the cocktail,box,cosmic generators will produce an unknown beam energy and type.

Better estimate of production point

Move SM status to AliTRDCommonParam to have the information available in AliTRDgeometry::CreateClusterMatrixArray()

bugfixes in HLT build system: /prog/versions_AliRoot/AliRoot_HEAD_2008-07-17/PHOS added for PHOS configure check

bugfixes in HLT build system: /prog/versions_AliRoot/AliRoot_HEAD_2008-07-17/PHOS added for PHOS configure check; test macros corrected in order to load library from actual build to get distcheck working

V0 selection added.

Getter for kinematics cuts added (R. Diaz Valdes)

Incrementing library version number.

Exec changed to UserExec.

Fixes in MUON:
- Fixing how the stores are reset in AliMUONDataInterface and adding some detail
  to the documentation.
- Fixing bit packing bug in AliMUONRawWriter.
- Adding protection code to AliMUONRecoCheck to check if the TParticlePDG*
  ppdg pointer is NULL or not.
(Artur)

(Marian Ivanov)

AliTPCCalPadRegion  -   ::SetObject - Expand to max size
AliTPCAnalysisTaskcalib  - Remove unneccessary printing
AliTPCcalibTracksGain    - Adding angular and dr attenutaion fit - without chameber gain alignment

 AliTPCClusterParam  - Cosmetic change

Reset rawReader in MakeRaws (Yves)

Updated alignment code (Mikolaj)

new recoparam setter

Setting the reco-params for the QADataMakerRec objects. At least we managed to remove the static methods.

error in comment

added RAW methods

Deleted old deprecated macros.
Fixing bugs in reconfiguration from CDB in HitReconstructor component.
Adding CDB entrues for the TriggerReconstructor and MansoTrackerFSM components.
Fixing minor message printing bug in AliHLTMUONProcessor.

Fix bug in tracklet reconstruction and add option to AliTRDfeeParam

Comments for Doxygen